| Definition | Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012588 |
| Length | 2,608,832 |
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The map label for this gene is 227828821
Identifier: 227828821
GI number: 227828821
Start: 2414903
End: 2416492
Strand: Direct
Name: 227828821
Synonym: M1425_2595
Alternate gene names: NA
Gene position: 2414903-2416492 (Clockwise)
Preceding gene: 227828818
Following gene: 227828822
Centisome position: 92.57
GC content: 36.1
Gene sequence:
>1590_bases ATGCCAGATAAAAACCAATCTGTTTTCATAAGACGATCCTCTGGTTTAGTAAGAGAAGTTAGTCCTTGGGCATCATTCTT CGCTACATTTGGACTGGTAACGGGTGGAATACCTATATTAATAGTATCATGGCTTTATCTCGCTCCGGGGGCAAATTGGA CCTTATCTTACTTAATATCACTATTACCCACTTTAGGAATGGCATTTCTTTTTTACGTTGCGTCAATCTCAACCCCTAGA TCAGGTGGAGATTACGTATTTCAAGCTAGATCATCACATCCCCTAGTTGCATTTGTCAATTATTGGGCGTTATGGATAGC CTTTGCGCTATCCTTGGGATTATATAGCTATTTAGGCGCGCAATGGTTTGCTTATTTATTTAGTGGCTTAGGGCTTTTTT ACAATGATCAAGCATTAATAAACTTAGGCTCGTTTTTTACCACAACTCTAGGAAGTGTAATAGTAGGTATTATCATATTG ATTATGGGGGCAATCGTAGCCTCTATAGGAAAATACGGTTGGAGTTTTGTATTTGTAACTGGTATTATATCGATACTCTC AACGATTGTAACATTCGTGGCTTTAGCCCTAATAAGTCCTTCACAGTTCTCTAGTGCATTATCGTCTTTTACTGGAGTAA ACAATGCATATGACGAAGTAATATCAACCACTACTTCAAATGGCTTAAGTTTCGTATCACCATTTTACGGAGCCTTACTA GCAATTCCAGTAGTATGGTATTATTATGTATGGTATAATTTACCAGCATCTTGGAGTGGAGAGATGAAGAAAGTAAAGTA TAATTCACTACTAGGTATAGTGGTTGCAGTACTATTCATAGGAGTCTACTATATTCTATTTACCTCCCTTAATCTCCACG CCTTTGGTGAGAGATTTTTAACATCTTGGTCATACATTTCCGCAAATTCGTTAAATAGTACAGTTTATAATGATTTAAGT ACCATGGGTACGTTCACTCCCTTTTTTGCCTTATTAGTAAACCACAACGTATTCTTATACATTATAATGTGGATAGCATT TTGGCTACCCAATTTCTATAGCAATCCTCCCTTAGTTGTTTCCCTAACTAGATATCTCTTTGCATGGGCGTTTGATAGGA TAATGCCAGAGAAATTGGCTGATGTAAATGAAAGGTTTCACATACCATTAATCTCTACAATAATTACTGTAATTGTTGGT TTAATAGGAGTACTACTTTACGCATATGTGTCGTCAATATCAATCGTAGATGTAACAGTGATATTCGAAATAAGCTATGG AATTTTCGCCTTAACTACTGCGTTATCACCTTTCATAAAGAGGAACTTCTTCAACAGAGCTGTCCCTATTAAAAATATAG GTGGCATTCCCATAGTATCTCTGATAGGGTTTCCAGTATTTGGATTCCTTCTTTACGCGTTATATCAAACTTGGGGAAAT CCAGTGTTACTACCAATAAACTTTCCTACAATACTTTCATTAGTAATAATATATGCAAGCGGAATTATGATTTACGTAGC ATCATACATCATTAATAAGGAGAGAGGAATTCAGATGAACTTGATTTTTGAGGAAATACCACCAGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTCAAAAAAAGAAAATTCGAATCCACATATAACTTTAAATACTTTAAAAATTTGATAGTAGTAAGGTTTTTAAGCACTT TACATACCACACTACTTAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GTTAACTCTTTTCTTTTATTCTTTCATCTTCTTTTTAGATATTTAATTTTAAATATGAGTTAATGCGAGTTTAACACTTG TGGGACTATTCAAAAGGAAT
Product: amino acid transporter
Products: NA
Alternate protein names: Amino Acid Transporter; Amino Acid Transporter-Like Protein; Amino Acid Permease Superfamily
Number of amino acids: Translated: 529; Mature: 528
Protein sequence:
>529_residues MPDKNQSVFIRRSSGLVREVSPWASFFATFGLVTGGIPILIVSWLYLAPGANWTLSYLISLLPTLGMAFLFYVASISTPR SGGDYVFQARSSHPLVAFVNYWALWIAFALSLGLYSYLGAQWFAYLFSGLGLFYNDQALINLGSFFTTTLGSVIVGIIIL IMGAIVASIGKYGWSFVFVTGIISILSTIVTFVALALISPSQFSSALSSFTGVNNAYDEVISTTTSNGLSFVSPFYGALL AIPVVWYYYVWYNLPASWSGEMKKVKYNSLLGIVVAVLFIGVYYILFTSLNLHAFGERFLTSWSYISANSLNSTVYNDLS TMGTFTPFFALLVNHNVFLYIIMWIAFWLPNFYSNPPLVVSLTRYLFAWAFDRIMPEKLADVNERFHIPLISTIITVIVG LIGVLLYAYVSSISIVDVTVIFEISYGIFALTTALSPFIKRNFFNRAVPIKNIGGIPIVSLIGFPVFGFLLYALYQTWGN PVLLPINFPTILSLVIIYASGIMIYVASYIINKERGIQMNLIFEEIPPE
Sequences:
>Translated_529_residues MPDKNQSVFIRRSSGLVREVSPWASFFATFGLVTGGIPILIVSWLYLAPGANWTLSYLISLLPTLGMAFLFYVASISTPR SGGDYVFQARSSHPLVAFVNYWALWIAFALSLGLYSYLGAQWFAYLFSGLGLFYNDQALINLGSFFTTTLGSVIVGIIIL IMGAIVASIGKYGWSFVFVTGIISILSTIVTFVALALISPSQFSSALSSFTGVNNAYDEVISTTTSNGLSFVSPFYGALL AIPVVWYYYVWYNLPASWSGEMKKVKYNSLLGIVVAVLFIGVYYILFTSLNLHAFGERFLTSWSYISANSLNSTVYNDLS TMGTFTPFFALLVNHNVFLYIIMWIAFWLPNFYSNPPLVVSLTRYLFAWAFDRIMPEKLADVNERFHIPLISTIITVIVG LIGVLLYAYVSSISIVDVTVIFEISYGIFALTTALSPFIKRNFFNRAVPIKNIGGIPIVSLIGFPVFGFLLYALYQTWGN PVLLPINFPTILSLVIIYASGIMIYVASYIINKERGIQMNLIFEEIPPE >Mature_528_residues PDKNQSVFIRRSSGLVREVSPWASFFATFGLVTGGIPILIVSWLYLAPGANWTLSYLISLLPTLGMAFLFYVASISTPRS GGDYVFQARSSHPLVAFVNYWALWIAFALSLGLYSYLGAQWFAYLFSGLGLFYNDQALINLGSFFTTTLGSVIVGIIILI MGAIVASIGKYGWSFVFVTGIISILSTIVTFVALALISPSQFSSALSSFTGVNNAYDEVISTTTSNGLSFVSPFYGALLA IPVVWYYYVWYNLPASWSGEMKKVKYNSLLGIVVAVLFIGVYYILFTSLNLHAFGERFLTSWSYISANSLNSTVYNDLST MGTFTPFFALLVNHNVFLYIIMWIAFWLPNFYSNPPLVVSLTRYLFAWAFDRIMPEKLADVNERFHIPLISTIITVIVGL IGVLLYAYVSSISIVDVTVIFEISYGIFALTTALSPFIKRNFFNRAVPIKNIGGIPIVSLIGFPVFGFLLYALYQTWGNP VLLPINFPTILSLVIIYASGIMIYVASYIINKERGIQMNLIFEEIPPE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58808; Mature: 58676
Theoretical pI: Translated: 8.75; Mature: 8.75
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPDKNQSVFIRRSSGLVREVSPWASFFATFGLVTGGIPILIVSWLYLAPGANWTLSYLIS CCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH LLPTLGMAFLFYVASISTPRSGGDYVFQARSSHPLVAFVNYWALWIAFALSLGLYSYLGA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QWFAYLFSGLGLFYNDQALINLGSFFTTTLGSVIVGIIILIMGAIVASIGKYGWSFVFVT HHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIISILSTIVTFVALALISPSQFSSALSSFTGVNNAYDEVISTTTSNGLSFVSPFYGALL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH AIPVVWYYYVWYNLPASWSGEMKKVKYNSLLGIVVAVLFIGVYYILFTSLNLHAFGERFL HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH TSWSYISANSLNSTVYNDLSTMGTFTPFFALLVNHNVFLYIIMWIAFWLPNFYSNPPLVV HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHH SLTRYLFAWAFDRIMPEKLADVNERFHIPLISTIITVIVGLIGVLLYAYVSSISIVDVTV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEE IFEISYGIFALTTALSPFIKRNFFNRAVPIKNIGGIPIVSLIGFPVFGFLLYALYQTWGN EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PVLLPINFPTILSLVIIYASGIMIYVASYIINKERGIQMNLIFEEIPPE CEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHCCCCC >Mature Secondary Structure PDKNQSVFIRRSSGLVREVSPWASFFATFGLVTGGIPILIVSWLYLAPGANWTLSYLIS CCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH LLPTLGMAFLFYVASISTPRSGGDYVFQARSSHPLVAFVNYWALWIAFALSLGLYSYLGA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QWFAYLFSGLGLFYNDQALINLGSFFTTTLGSVIVGIIILIMGAIVASIGKYGWSFVFVT HHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIISILSTIVTFVALALISPSQFSSALSSFTGVNNAYDEVISTTTSNGLSFVSPFYGALL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH AIPVVWYYYVWYNLPASWSGEMKKVKYNSLLGIVVAVLFIGVYYILFTSLNLHAFGERFL HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH TSWSYISANSLNSTVYNDLSTMGTFTPFFALLVNHNVFLYIIMWIAFWLPNFYSNPPLVV HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHH SLTRYLFAWAFDRIMPEKLADVNERFHIPLISTIITVIVGLIGVLLYAYVSSISIVDVTV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEE IFEISYGIFALTTALSPFIKRNFFNRAVPIKNIGGIPIVSLIGFPVFGFLLYALYQTWGN EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PVLLPINFPTILSLVIIYASGIMIYVASYIINKERGIQMNLIFEEIPPE CEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA