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The map label for this gene is 227826590

Identifier: 227826590

GI number: 227826590

Start: 156845

End: 158695

Strand: Direct

Name: 227826590

Synonym: M1425_0180

Alternate gene names: NA

Gene position: 156845-158695 (Clockwise)

Preceding gene: 227826589

Following gene: 227826591

Centisome position: 6.01

GC content: 33.98

Gene sequence:

>1851_bases
ATGAGTATATTTAATAAGCGTAATAACAAACAAGCTGTTAACAATCAAGGTCCATCAAAAATTGAATTACTATTTTACAA
TTCCAGTCTAATCAATAGTTTAGTTAAAAGTGTAGACATAAAGATGAAAAAAGCTGGAATAAACCAAGATCCACGTTTAT
TTGCATCTAGGCTATTTCTTACTCTTATATTTTCAATTGCAATTTCCGTAATGTTAGTAGTGTTTGCTGTAAGGTTCTTT
GAGATATACAAATTGACATTACTTACAAAATATTTGGCAGGATTTTTGACGATGATGATATTTGGCATAATAATACCACC
TGTAGTTTATTTGATGCAGATTCTTCAGTTATCACAATTAACTGAAAATAGAAGAATAGGTTTAGATAGTGAAGCTCCAG
CATTCGCTGCAGTATTTAATGTTTTCTTAAGGTCTGGGTTAAGTGCAAGATACGTTTTCGATTACTTATCTAAATCTACA
GCAATGCAATACGCTAGCCAAATTGCCTCATATGTTAATAAGAGAGTTAAATACTTAGGAGAGGGTGTAGAAAGTGCCAT
AGTTGAATCATTAAATTACTCACCTTCGAAAATATTCAATGAATTTTTAACAACTTACGTTACGGCAGTTAGAACTGGAG
CACCAGTTTTAGATACGATGGAAGCTAAGACTAAAGATATCCTTAAGAATATAGAAACTTTAGCGTCTACTGCTGCGGAG
AACTTGTCCGGAATAGCTGAAGGTTTCGTAATTTGGCTTTCATCTGGTTTCATCACATTCTTTCTTGTTTTATTGTTGCA
AGCGATATTTCCATCTCTCTTCGGTTCAGTCCCATTCCCAATAATGGCTATTTTCGCAATGATAATGATACCATTAATAA
ATCTATTATTCATATGGGTCGTTGACCAGATACAATTTAGATTCCCTGAGAGGTCTTTAAAAGCATACAAGATATTTTAC
GTTACATTTCCTATAGGGTTAGTTGTCTCTTTTATCATACTATATTTAATAAAGGAACCAATACCTCTTCTTTTAAATCT
CCTTTTCCTAAATGCAGGCGTACAGCAAATACCATTATCCGTATTAGCATTTACAATAGGTCTATTAATAGCTGTCATAC
CCCCAGCAGTAATTGCAGTTAGGGAATTAAGGGAAGGAACAGGATATGATGTTTATGTTGTATCTTTTTTAAGAGCAGTT
GCTGAGGGATTAAGAGCTGGGCTAAATCCAGCTACGGTAGTTAGAAACTTAAAGGATTCCCCAGAAATGGGAAAGTTTAG
AGATATACTAAATACAATATATGCTTATTCTCTATTAGGAGTCCCTATAAAGGATGCCTTTAGGATAGCTTCAGAGAGAA
TATTGGACTTTTCTAGTAAAGTTTCCTTAATTTCACTAGCGGATATGATAGAAATTGGTAGTCTGACTCCCGAAACTGTT
GAGTCATTAGCAGAACAAGTTGATGCTCAAATAAGGATAAGGAGAAACTATAACGCCAAAATAAGAGTGTTACTATATGC
GCCGTATATAGGTATTATTTTGGCATTAGTAGCATCTATTCTATTGGGTAATGCTATGTTTACTCTAATATCTCACCAAT
CTTATTCTTTATCTTATGGACCGTTGTCCAATGCTGCTGTGATCTTGCCTAAATCCCTCTACATCATCTCAATTTCGGCA
CTCTTTAATTCATTTTTAGCTGGATTGCTAGTAGGGAAGATAGGTTATGGTAAAACAGCAGCGGGCTTTATTCATTCAGC
GATTTTAGTAGTTATAACTGCAATCTTAGTTGTCATATCATTACATATATCCCTAATACCTTCTATATCTCCATCATCAA
CATCTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCACATGTTCTAGAAGATAAAGACATAGTTGAGATCCATGCAAAGTGAGATTTTCTATATATAAGTTTAAGTATTAGTT
TATAAGAAAGTAACAATAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTAGATGGAAGAGTGATATATAATGAGTAAAGTTTTCAAATCTCTCTTGCCAAAAGGCAAACCTAATGTGAAGCAATTA
CCTATCACAGAACTACCTAT

Product: type II secretion system protein

Products: NA

Alternate protein names: Type II Secretion System F Domain-Containing Protein; Type II Secretion System F Domain Protein; Type II Secretion System F Domain

Number of amino acids: Translated: 616; Mature: 615

Protein sequence:

>616_residues
MSIFNKRNNKQAVNNQGPSKIELLFYNSSLINSLVKSVDIKMKKAGINQDPRLFASRLFLTLIFSIAISVMLVVFAVRFF
EIYKLTLLTKYLAGFLTMMIFGIIIPPVVYLMQILQLSQLTENRRIGLDSEAPAFAAVFNVFLRSGLSARYVFDYLSKST
AMQYASQIASYVNKRVKYLGEGVESAIVESLNYSPSKIFNEFLTTYVTAVRTGAPVLDTMEAKTKDILKNIETLASTAAE
NLSGIAEGFVIWLSSGFITFFLVLLLQAIFPSLFGSVPFPIMAIFAMIMIPLINLLFIWVVDQIQFRFPERSLKAYKIFY
VTFPIGLVVSFIILYLIKEPIPLLLNLLFLNAGVQQIPLSVLAFTIGLLIAVIPPAVIAVRELREGTGYDVYVVSFLRAV
AEGLRAGLNPATVVRNLKDSPEMGKFRDILNTIYAYSLLGVPIKDAFRIASERILDFSSKVSLISLADMIEIGSLTPETV
ESLAEQVDAQIRIRRNYNAKIRVLLYAPYIGIILALVASILLGNAMFTLISHQSYSLSYGPLSNAAVILPKSLYIISISA
LFNSFLAGLLVGKIGYGKTAAGFIHSAILVVITAILVVISLHISLIPSISPSSTSL

Sequences:

>Translated_616_residues
MSIFNKRNNKQAVNNQGPSKIELLFYNSSLINSLVKSVDIKMKKAGINQDPRLFASRLFLTLIFSIAISVMLVVFAVRFF
EIYKLTLLTKYLAGFLTMMIFGIIIPPVVYLMQILQLSQLTENRRIGLDSEAPAFAAVFNVFLRSGLSARYVFDYLSKST
AMQYASQIASYVNKRVKYLGEGVESAIVESLNYSPSKIFNEFLTTYVTAVRTGAPVLDTMEAKTKDILKNIETLASTAAE
NLSGIAEGFVIWLSSGFITFFLVLLLQAIFPSLFGSVPFPIMAIFAMIMIPLINLLFIWVVDQIQFRFPERSLKAYKIFY
VTFPIGLVVSFIILYLIKEPIPLLLNLLFLNAGVQQIPLSVLAFTIGLLIAVIPPAVIAVRELREGTGYDVYVVSFLRAV
AEGLRAGLNPATVVRNLKDSPEMGKFRDILNTIYAYSLLGVPIKDAFRIASERILDFSSKVSLISLADMIEIGSLTPETV
ESLAEQVDAQIRIRRNYNAKIRVLLYAPYIGIILALVASILLGNAMFTLISHQSYSLSYGPLSNAAVILPKSLYIISISA
LFNSFLAGLLVGKIGYGKTAAGFIHSAILVVITAILVVISLHISLIPSISPSSTSL
>Mature_615_residues
SIFNKRNNKQAVNNQGPSKIELLFYNSSLINSLVKSVDIKMKKAGINQDPRLFASRLFLTLIFSIAISVMLVVFAVRFFE
IYKLTLLTKYLAGFLTMMIFGIIIPPVVYLMQILQLSQLTENRRIGLDSEAPAFAAVFNVFLRSGLSARYVFDYLSKSTA
MQYASQIASYVNKRVKYLGEGVESAIVESLNYSPSKIFNEFLTTYVTAVRTGAPVLDTMEAKTKDILKNIETLASTAAEN
LSGIAEGFVIWLSSGFITFFLVLLLQAIFPSLFGSVPFPIMAIFAMIMIPLINLLFIWVVDQIQFRFPERSLKAYKIFYV
TFPIGLVVSFIILYLIKEPIPLLLNLLFLNAGVQQIPLSVLAFTIGLLIAVIPPAVIAVRELREGTGYDVYVVSFLRAVA
EGLRAGLNPATVVRNLKDSPEMGKFRDILNTIYAYSLLGVPIKDAFRIASERILDFSSKVSLISLADMIEIGSLTPETVE
SLAEQVDAQIRIRRNYNAKIRVLLYAPYIGIILALVASILLGNAMFTLISHQSYSLSYGPLSNAAVILPKSLYIISISAL
FNSFLAGLLVGKIGYGKTAAGFIHSAILVVITAILVVISLHISLIPSISPSSTSL

Specific function: Unknown

COG id: COG2064

COG function: function code NU; Flp pilus assembly protein TadC

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67931; Mature: 67799

Theoretical pI: Translated: 9.91; Mature: 9.91

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSIFNKRNNKQAVNNQGPSKIELLFYNSSLINSLVKSVDIKMKKAGINQDPRLFASRLFL
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
TLIFSIAISVMLVVFAVRFFEIYKLTLLTKYLAGFLTMMIFGIIIPPVVYLMQILQLSQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TENRRIGLDSEAPAFAAVFNVFLRSGLSARYVFDYLSKSTAMQYASQIASYVNKRVKYLG
HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EGVESAIVESLNYSPSKIFNEFLTTYVTAVRTGAPVLDTMEAKTKDILKNIETLASTAAE
CCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLSGIAEGFVIWLSSGFITFFLVLLLQAIFPSLFGSVPFPIMAIFAMIMIPLINLLFIWV
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VDQIQFRFPERSLKAYKIFYVTFPIGLVVSFIILYLIKEPIPLLLNLLFLNAGVQQIPLS
HHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
VLAFTIGLLIAVIPPAVIAVRELREGTGYDVYVVSFLRAVAEGLRAGLNPATVVRNLKDS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCC
PEMGKFRDILNTIYAYSLLGVPIKDAFRIASERILDFSSKVSLISLADMIEIGSLTPETV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
ESLAEQVDAQIRIRRNYNAKIRVLLYAPYIGIILALVASILLGNAMFTLISHQSYSLSYG
HHHHHHHCHHEEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
PLSNAAVILPKSLYIISISALFNSFLAGLLVGKIGYGKTAAGFIHSAILVVITAILVVIS
CCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LHISLIPSISPSSTSL
HHHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SIFNKRNNKQAVNNQGPSKIELLFYNSSLINSLVKSVDIKMKKAGINQDPRLFASRLFL
CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH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HHHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA