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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 227817631

GI number: 227817631

Start: 4613698

End: 4615485

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: BAMEG_5125

Alternate gene names: 227817631

Gene position: 4613698-4615485 (Clockwise)

Preceding gene: 227817630

Following gene: 227817632

Centisome position: 88.21

GC content: 32.66

Gene sequence:

>1788_bases
ATGACAATTTCAGAAGTTGTCATCGTATTCTTTTCATTTTTCTTTTTACTATATTCAATCGGTACTTTCCTAAAAGTGCG
AAAAAAGCAATTTGGGATTTTAACAGTACTTGGCATCTCTCAAAAACAATTAAAACGACTCATATTTATAGAAAACATGT
TAATTGGTGTTCTTTCTATATTTTTTGGCATTCAACTTGGACTTGTCTTTTCACAGTTCTTTTTATTAGTTACCGCCAAA
ATTACACATGTACCTGGTTTATATTTATATTGGCCTACAAGCGCCATTATTTTAACTATCATCATCTTTCTCGGACTCTT
TATTCTCGTATCATCTTTTACACCGATGCTCATTCGTACGAGAAAAGCTGTACGTCTTTTAAAAGAAGGAACAAAACAAA
AAGAAAGAAAAGCATCTGTGCTCATCTCTCTATTTGGTGCGATATGTTTAATATCAGGATATGCGTTAGCCGCAAATCCA
TTATACTTTCTATCGCTAGGTGACATCATTGGGCTTTTATATGCCATCTCTAGTATATTTGTCATCCCATCGCTTATTGC
AGCTGGAACATATTTTTTCTTCTCACAAATTAGCTTTTTACTCATTCGTATATTAAAAGCGCGAAGAACGTTTTATATGA
AACGCATTAATATGCTTTGGATTTCTGATTTAGCATCACGCATTCGAACGAATATTAATATGCTTTTTATTGTAGCGATG
CTATCAACACTCGCTTTTACAATGATTACATTCTTATACGGTTTTGGGAAATTTACAAAGTTTGATGCGATAAGGGAAAA
CCCTTTTCCTTTTACATATTTATCACATACTGAAAATACGTTAGCGGATGAACATTTAAACTGGTTAGAGCAGAAGTTGA
ATGAAGAACACTTTACTTATACAAAATTTAAAACGGATATATATGAAGTATCTTCAGCTGAAAATAATACGCAACTCTAT
TACGCAATTAAACAAAGTGACTATAATGTACTTGCTAAGGCTTTAAATTGGGAAACACTCACGGTAAATAAAAATGAATC
TTATATTCTTATGAAAGACTTAGATGACCAAGTTATTGGAACACTTCACAATAAAGAACAGAAAAATACTCTTACACTTA
CTCAAAACAATTTACAACTACAAGTGAAAGAATATAAAAGTTATAGCCCATTCCCAAACAGCTTAATATATCAATTACTC
ATACTATCTGATGAAAATGTAGAAGCCTTATCGACCGTTTCCAAGCAAATGAGTGTATATAACTTCAAAGTTACAGATTG
GGAAAAAGCACATAATATCGGTTCATCGTTTATAACAAAAATCCATAACGACAATGCAGCAATTCAAGCAGAGCACCCTC
CTTTCCATGCAAGTGAAGCGAGCGATTCTCTATATAAAACAAAACTAAATGTCGCTTCATTTTTCTTAATTGGTACTTTC
TTAGGTGTTATTTTCTTTATCGGAGCTGGCAGTGTTCTTTACTTCCGGATGTATACAGATTTAACAAACGAGCAAGAAAA
ATATATAACGATTACGAAAATTGGCTTAACGGAAACTGAAATGAAACGTTCAGCGACAATTCAGCTTGCGATTCTTTTCT
TCGTGCCTTACATTATGGCATCCATCCATACGATGTTCGCGACAAAGATGTTACAAGAAGTTTTACATCTCTCGTTCTTC
GCTGAGATTACAGTCGTTCTTATGATTTTTGGAACAGTTGAAATTTTATTTTTCCTTTTAATTCGTTCCTTTTATATGCA
AAAATTATCACAACACATTAAGTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGCAGCGCGTTTTCTATTGCAATTTTTTTCTCATTTGCAGTTTACTTATTTCATCCTAAATTGCATATGACCGACGTAA
ATTATGCTCTGAACATATTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATAGAAAGGTGATTATGATGGAAGAAGTATTACACATAAAAAACGTCTCGAAAGTGTATGAAGGAAAAGTCCCTCAT
ACTGCTTTAAAAAATATAAA

Product: putative permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 595; Mature: 594

Protein sequence:

>595_residues
MTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAK
ITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANP
LYFLSLGDIIGLLYAISSIFVIPSLIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAM
LSTLAFTMITFLYGFGKFTKFDAIRENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKLNEEHFTYTKFKTDIYEVSSAENNTQLY
YAIKQSDYNVLAKALNWETLTVNKNESYILMKDLDDQVIGTLHNKEQKNTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLL
ILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKVTDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTF
LGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFF
AEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF

Sequences:

>Translated_595_residues
MTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAK
ITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANP
LYFLSLGDIIGLLYAISSIFVIPSLIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAM
LSTLAFTMITFLYGFGKFTKFDAIRENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKLNEEHFTYTKFKTDIYEVSSAENNTQLY
YAIKQSDYNVLAKALNWETLTVNKNESYILMKDLDDQVIGTLHNKEQKNTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLL
ILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKVTDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTF
LGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFF
AEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF
>Mature_594_residues
TISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAKI
THVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPL
YFLSLGDIIGLLYAISSIFVIPSLIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAML
STLAFTMITFLYGFGKFTKFDAIRENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKLNEEHFTYTKFKTDIYEVSSAENNTQLYY
AIKQSDYNVLAKALNWETLTVNKNESYILMKDLDDQVIGTLHNKEQKNTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLI
LSDENVEALSTVSKQMSVYNFKVTDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFL
GVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFFA
EITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68363; Mature: 68232

Theoretical pI: Translated: 9.70; Mature: 9.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
RKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYAISSIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH
VIPSLIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LSTLAFTMITFLYGFGKFTKFDAIRENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKLNEEHFTY
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
TKFKTDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWETLTVNKNESYILMKDLDDQVIG
EEHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHH
TLHNKEQKNTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVEALSTVSKQMSVY
HHCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHE
NFKVTDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTF
EEEECCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMA
HHHHHHHCCCHHEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
RKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYAISSIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH
VIPSLIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LSTLAFTMITFLYGFGKFTKFDAIRENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKLNEEHFTY
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
TKFKTDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWETLTVNKNESYILMKDLDDQVIG
EEHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHH
TLHNKEQKNTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVEALSTVSKQMSVY
HHCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHE
NFKVTDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTF
EEEECCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMA
HHHHHHHCCCHHEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]