| Definition | Vibrio cholerae M66-2 chromosome I, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012578 |
| Length | 2,892,523 |
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The map label for this gene is lplT [H]
Identifier: 227082093
GI number: 227082093
Start: 2052886
End: 2054766
Strand: Direct
Name: lplT [H]
Synonym: VCM66_1890
Alternate gene names: 227082093
Gene position: 2052886-2054766 (Clockwise)
Preceding gene: 227082091
Following gene: 227082094
Centisome position: 70.97
GC content: 49.6
Gene sequence:
>1881_bases ATGAACAAGATGGCAAACCCAACTACGGCTCTCTTAACTGAGCGCCGCTTTTTACCCTATTTCATCACTCAGTTTCTTGG TGCCTTTAACGACAACATTTTTAAAAATGTCTTGTTACTCTTTGTTGCGTTTGCAGGCCCTCAAGCGTTACCTATCTCAA GCAATTTATTCATCAATCTCGCTGCTGGGCTGTTTATTCTGCCTTTTTTCCTCTTCTCTGCGACCGCGGGAGTCTTAGCG GATAAGCTAGAAAAGTCTCGGTATATTCGTTGGGTTAAATTGCTTGAAATCGCCATCATGCTGTGTGGTGCGATAGGTTT TATCACTCAAAGCTACGGAATCTCACTGTTTTTATTGTTCTTGATGGGTACACAATCGGCCTTTTTTGGCCCAGTGAAAT ACGCATTGCTACCACAACAACTGAAATCGGAAGAGCTCGTCCCCGGTAATGCCTTAGTAGAAACCGGTACTTTTCTGGCG ATCTTATTAGGCACCTTAGGGGCTGGACTGATTGCTTCCGCTGATAACGCGCACTACTTCGCCGCGGCTGCGGTAGTGAT TTTCGCCGTGCTTGGTTATCTCTCTAGCCGCGCTATCCCACTCGCACCTGCGAGTGCTCCTCATCTCGAATTTCGTTGGC AGCCAATTACGCAAACCAAGCAGACGCTCCGCATAGCCAAACGTGATCGCGCCATTTTCCAGTCCATTATGGCGATCAGT TGGTTCTGGTTTCTCGGCGCGGGGTACCTTACTCAGTTTCCTAACTTCACTAAACTGCACCTCAACGGTAATGAAGCCGC GGTCTCTTTCTTACTGGCGCTATTTTCCGTCGGCATTGCCGTCGGCTCACTGGCGTGTGACAAGCTTTCCGGACACCGGA TTGAGGTCGGCATTGTGCCCTTGGGCAGTGTGGGGATCAGCTTCTTCGGGTATCTGATGGCGACCAGCATTCCCGCCGAT CTCCCCATTTTCAGTACTTTTGCGGATTTTGTTACTTACTCCGCGCTATGGCCACTATTTGCTTATTTATTATTGATTGG CGTGTTTGGTGGCGTATTCATCGTTCCGCTTTACGCCATGTTGCAGCAACGCGCTAAAGTCACTGAACGTGCGCAAGTGA TCGCGGCTCTCAATATCTACAATTCGCTGTTTATGGTCGGCAGTGCCGCACTTGGCATTGTGTGCCTCAGTGTATTGGAG ATGAGTATTCCGCAGTTATTTGCACTACTGGCTGTGCTTAACGTCTTGGTGGCTTTGTATATTTTCCTACAAGTGCCGAT TTTTGCCGTTCGCTTTCTGGTGTGGATCCTCACTCATACGCTGTACCGAGTGCGCCATAAAAACTTGCACCATATTCCAG AGCAAGGTGGCGCACTGCTGGTGTGTAACCATGTCAGTTATATGGATGCCCTATTGCTCAGTGCGGTTTGTCCGCGCTTA ATTCACTTTGTGATGGAAGAAGAGTACGCCAACCTGCCACTGCTGAAACGTTTCTTGAAACGCGCTGGGGTGATCCCGAT TTCTGCCAACAACCGAGCCTCTCTTCGCCGCGCATTTGCGGATATTGAACACTCACTCAACGAAGGGAATTTGGTGTGCA TTTTCCCAGAAGGTCGACTTACCGCCGATGGTGAAATGAATCCGTTTATGCGTGGCTTAGATTTAATCCTACACCGCAGC CCTGTTCCTGTGGTTCCTCTGGCACTCAAAGGGTTATGGGGCAGTTATTTCAGCCGTTACAAAGGCCGAGCTTGCCAAGG TGTGCCACGCCGTTTTCGCTCACAGTTAGAGATTGAAGCGGGAATGCCAGTTGCCCCGGAGCAAGCCAACTCGGCGGTGA TGCACGAAAAAGTGGCACAATTGCGTGGCGATTGGCGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATCTTGAGTGTCGATGATAAATTTTTTGCCAATGAACCGATTGATGGTAATGCTTTGATTAATAATCTGCTGAATCACT ATCTGGCTAACTGGTAATGG
Downstream 100 bases:
>100_bases TCCCACACCTTCTTCCTCTATTATTCATGATGTTTTGAAGTTGCAGTCAATCGCGCTGCAACTTCTCCTCATAACCCCAT TATTTATCCTCCCAATTAAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 626; Mature: 626
Protein sequence:
>626_residues MNKMANPTTALLTERRFLPYFITQFLGAFNDNIFKNVLLLFVAFAGPQALPISSNLFINLAAGLFILPFFLFSATAGVLA DKLEKSRYIRWVKLLEIAIMLCGAIGFITQSYGISLFLLFLMGTQSAFFGPVKYALLPQQLKSEELVPGNALVETGTFLA ILLGTLGAGLIASADNAHYFAAAAVVIFAVLGYLSSRAIPLAPASAPHLEFRWQPITQTKQTLRIAKRDRAIFQSIMAIS WFWFLGAGYLTQFPNFTKLHLNGNEAAVSFLLALFSVGIAVGSLACDKLSGHRIEVGIVPLGSVGISFFGYLMATSIPAD LPIFSTFADFVTYSALWPLFAYLLLIGVFGGVFIVPLYAMLQQRAKVTERAQVIAALNIYNSLFMVGSAALGIVCLSVLE MSIPQLFALLAVLNVLVALYIFLQVPIFAVRFLVWILTHTLYRVRHKNLHHIPEQGGALLVCNHVSYMDALLLSAVCPRL IHFVMEEEYANLPLLKRFLKRAGVIPISANNRASLRRAFADIEHSLNEGNLVCIFPEGRLTADGEMNPFMRGLDLILHRS PVPVVPLALKGLWGSYFSRYKGRACQGVPRRFRSQLEIEAGMPVAPEQANSAVMHEKVAQLRGDWR
Sequences:
>Translated_626_residues MNKMANPTTALLTERRFLPYFITQFLGAFNDNIFKNVLLLFVAFAGPQALPISSNLFINLAAGLFILPFFLFSATAGVLA DKLEKSRYIRWVKLLEIAIMLCGAIGFITQSYGISLFLLFLMGTQSAFFGPVKYALLPQQLKSEELVPGNALVETGTFLA ILLGTLGAGLIASADNAHYFAAAAVVIFAVLGYLSSRAIPLAPASAPHLEFRWQPITQTKQTLRIAKRDRAIFQSIMAIS WFWFLGAGYLTQFPNFTKLHLNGNEAAVSFLLALFSVGIAVGSLACDKLSGHRIEVGIVPLGSVGISFFGYLMATSIPAD LPIFSTFADFVTYSALWPLFAYLLLIGVFGGVFIVPLYAMLQQRAKVTERAQVIAALNIYNSLFMVGSAALGIVCLSVLE MSIPQLFALLAVLNVLVALYIFLQVPIFAVRFLVWILTHTLYRVRHKNLHHIPEQGGALLVCNHVSYMDALLLSAVCPRL IHFVMEEEYANLPLLKRFLKRAGVIPISANNRASLRRAFADIEHSLNEGNLVCIFPEGRLTADGEMNPFMRGLDLILHRS PVPVVPLALKGLWGSYFSRYKGRACQGVPRRFRSQLEIEAGMPVAPEQANSAVMHEKVAQLRGDWR >Mature_626_residues MNKMANPTTALLTERRFLPYFITQFLGAFNDNIFKNVLLLFVAFAGPQALPISSNLFINLAAGLFILPFFLFSATAGVLA DKLEKSRYIRWVKLLEIAIMLCGAIGFITQSYGISLFLLFLMGTQSAFFGPVKYALLPQQLKSEELVPGNALVETGTFLA ILLGTLGAGLIASADNAHYFAAAAVVIFAVLGYLSSRAIPLAPASAPHLEFRWQPITQTKQTLRIAKRDRAIFQSIMAIS WFWFLGAGYLTQFPNFTKLHLNGNEAAVSFLLALFSVGIAVGSLACDKLSGHRIEVGIVPLGSVGISFFGYLMATSIPAD LPIFSTFADFVTYSALWPLFAYLLLIGVFGGVFIVPLYAMLQQRAKVTERAQVIAALNIYNSLFMVGSAALGIVCLSVLE MSIPQLFALLAVLNVLVALYIFLQVPIFAVRFLVWILTHTLYRVRHKNLHHIPEQGGALLVCNHVSYMDALLLSAVCPRL IHFVMEEEYANLPLLKRFLKRAGVIPISANNRASLRRAFADIEHSLNEGNLVCIFPEGRLTADGEMNPFMRGLDLILHRS PVPVVPLALKGLWGSYFSRYKGRACQGVPRRFRSQLEIEAGMPVAPEQANSAVMHEKVAQLRGDWR
Specific function: Catalyzes the facilitated diffusion of 2-acyl-glycero-3- phosphoethanolamine (2-acyl-GPE) into the cell [H]
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. LplT (TC 2.A.1.42) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789200, Length=409, Percent_Identity=29.3398533007335, Blast_Score=89, Evalue=9e-19,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011701 - InterPro: IPR016196 [H]
Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69001; Mature: 69001
Theoretical pI: Translated: 9.70; Mature: 9.70
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKMANPTTALLTERRFLPYFITQFLGAFNDNIFKNVLLLFVAFAGPQALPISSNLFINL CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHH AAGLFILPFFLFSATAGVLADKLEKSRYIRWVKLLEIAIMLCGAIGFITQSYGISLFLLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMGTQSAFFGPVKYALLPQQLKSEELVPGNALVETGTFLAILLGTLGAGLIASADNAHYF HHHCCHHHHCHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHH AAAAVVIFAVLGYLSSRAIPLAPASAPHLEFRWQPITQTKQTLRIAKRDRAIFQSIMAIS HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WFWFLGAGYLTQFPNFTKLHLNGNEAAVSFLLALFSVGIAVGSLACDKLSGHRIEVGIVP HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEE LGSVGISFFGYLMATSIPADLPIFSTFADFVTYSALWPLFAYLLLIGVFGGVFIVPLYAM CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQQRAKVTERAQVIAALNIYNSLFMVGSAALGIVCLSVLEMSIPQLFALLAVLNVLVALY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFLQVPIFAVRFLVWILTHTLYRVRHKNLHHIPEQGGALLVCNHVSYMDALLLSAVCPRL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH IHFVMEEEYANLPLLKRFLKRAGVIPISANNRASLRRAFADIEHSLNEGNLVCIFPEGRL HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCC TADGEMNPFMRGLDLILHRSPVPVVPLALKGLWGSYFSRYKGRACQGVPRRFRSQLEIEA CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHEECCC GMPVAPEQANSAVMHEKVAQLRGDWR CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MNKMANPTTALLTERRFLPYFITQFLGAFNDNIFKNVLLLFVAFAGPQALPISSNLFINL CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHH AAGLFILPFFLFSATAGVLADKLEKSRYIRWVKLLEIAIMLCGAIGFITQSYGISLFLLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMGTQSAFFGPVKYALLPQQLKSEELVPGNALVETGTFLAILLGTLGAGLIASADNAHYF HHHCCHHHHCHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHH AAAAVVIFAVLGYLSSRAIPLAPASAPHLEFRWQPITQTKQTLRIAKRDRAIFQSIMAIS HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WFWFLGAGYLTQFPNFTKLHLNGNEAAVSFLLALFSVGIAVGSLACDKLSGHRIEVGIVP HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEE LGSVGISFFGYLMATSIPADLPIFSTFADFVTYSALWPLFAYLLLIGVFGGVFIVPLYAM CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQQRAKVTERAQVIAALNIYNSLFMVGSAALGIVCLSVLEMSIPQLFALLAVLNVLVALY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFLQVPIFAVRFLVWILTHTLYRVRHKNLHHIPEQGGALLVCNHVSYMDALLLSAVCPRL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH IHFVMEEEYANLPLLKRFLKRAGVIPISANNRASLRRAFADIEHSLNEGNLVCIFPEGRL HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCC TADGEMNPFMRGLDLILHRSPVPVVPLALKGLWGSYFSRYKGRACQGVPRRFRSQLEIEA CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHEECCC GMPVAPEQANSAVMHEKVAQLRGDWR CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA