Definition Vibrio cholerae M66-2 chromosome I, complete genome.
Accession NC_012578
Length 2,892,523

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The map label for this gene is lplT [H]

Identifier: 227082093

GI number: 227082093

Start: 2052886

End: 2054766

Strand: Direct

Name: lplT [H]

Synonym: VCM66_1890

Alternate gene names: 227082093

Gene position: 2052886-2054766 (Clockwise)

Preceding gene: 227082091

Following gene: 227082094

Centisome position: 70.97

GC content: 49.6

Gene sequence:

>1881_bases
ATGAACAAGATGGCAAACCCAACTACGGCTCTCTTAACTGAGCGCCGCTTTTTACCCTATTTCATCACTCAGTTTCTTGG
TGCCTTTAACGACAACATTTTTAAAAATGTCTTGTTACTCTTTGTTGCGTTTGCAGGCCCTCAAGCGTTACCTATCTCAA
GCAATTTATTCATCAATCTCGCTGCTGGGCTGTTTATTCTGCCTTTTTTCCTCTTCTCTGCGACCGCGGGAGTCTTAGCG
GATAAGCTAGAAAAGTCTCGGTATATTCGTTGGGTTAAATTGCTTGAAATCGCCATCATGCTGTGTGGTGCGATAGGTTT
TATCACTCAAAGCTACGGAATCTCACTGTTTTTATTGTTCTTGATGGGTACACAATCGGCCTTTTTTGGCCCAGTGAAAT
ACGCATTGCTACCACAACAACTGAAATCGGAAGAGCTCGTCCCCGGTAATGCCTTAGTAGAAACCGGTACTTTTCTGGCG
ATCTTATTAGGCACCTTAGGGGCTGGACTGATTGCTTCCGCTGATAACGCGCACTACTTCGCCGCGGCTGCGGTAGTGAT
TTTCGCCGTGCTTGGTTATCTCTCTAGCCGCGCTATCCCACTCGCACCTGCGAGTGCTCCTCATCTCGAATTTCGTTGGC
AGCCAATTACGCAAACCAAGCAGACGCTCCGCATAGCCAAACGTGATCGCGCCATTTTCCAGTCCATTATGGCGATCAGT
TGGTTCTGGTTTCTCGGCGCGGGGTACCTTACTCAGTTTCCTAACTTCACTAAACTGCACCTCAACGGTAATGAAGCCGC
GGTCTCTTTCTTACTGGCGCTATTTTCCGTCGGCATTGCCGTCGGCTCACTGGCGTGTGACAAGCTTTCCGGACACCGGA
TTGAGGTCGGCATTGTGCCCTTGGGCAGTGTGGGGATCAGCTTCTTCGGGTATCTGATGGCGACCAGCATTCCCGCCGAT
CTCCCCATTTTCAGTACTTTTGCGGATTTTGTTACTTACTCCGCGCTATGGCCACTATTTGCTTATTTATTATTGATTGG
CGTGTTTGGTGGCGTATTCATCGTTCCGCTTTACGCCATGTTGCAGCAACGCGCTAAAGTCACTGAACGTGCGCAAGTGA
TCGCGGCTCTCAATATCTACAATTCGCTGTTTATGGTCGGCAGTGCCGCACTTGGCATTGTGTGCCTCAGTGTATTGGAG
ATGAGTATTCCGCAGTTATTTGCACTACTGGCTGTGCTTAACGTCTTGGTGGCTTTGTATATTTTCCTACAAGTGCCGAT
TTTTGCCGTTCGCTTTCTGGTGTGGATCCTCACTCATACGCTGTACCGAGTGCGCCATAAAAACTTGCACCATATTCCAG
AGCAAGGTGGCGCACTGCTGGTGTGTAACCATGTCAGTTATATGGATGCCCTATTGCTCAGTGCGGTTTGTCCGCGCTTA
ATTCACTTTGTGATGGAAGAAGAGTACGCCAACCTGCCACTGCTGAAACGTTTCTTGAAACGCGCTGGGGTGATCCCGAT
TTCTGCCAACAACCGAGCCTCTCTTCGCCGCGCATTTGCGGATATTGAACACTCACTCAACGAAGGGAATTTGGTGTGCA
TTTTCCCAGAAGGTCGACTTACCGCCGATGGTGAAATGAATCCGTTTATGCGTGGCTTAGATTTAATCCTACACCGCAGC
CCTGTTCCTGTGGTTCCTCTGGCACTCAAAGGGTTATGGGGCAGTTATTTCAGCCGTTACAAAGGCCGAGCTTGCCAAGG
TGTGCCACGCCGTTTTCGCTCACAGTTAGAGATTGAAGCGGGAATGCCAGTTGCCCCGGAGCAAGCCAACTCGGCGGTGA
TGCACGAAAAAGTGGCACAATTGCGTGGCGATTGGCGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATCTTGAGTGTCGATGATAAATTTTTTGCCAATGAACCGATTGATGGTAATGCTTTGATTAATAATCTGCTGAATCACT
ATCTGGCTAACTGGTAATGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCCCACACCTTCTTCCTCTATTATTCATGATGTTTTGAAGTTGCAGTCAATCGCGCTGCAACTTCTCCTCATAACCCCAT
TATTTATCCTCCCAATTAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 626; Mature: 626

Protein sequence:

>626_residues
MNKMANPTTALLTERRFLPYFITQFLGAFNDNIFKNVLLLFVAFAGPQALPISSNLFINLAAGLFILPFFLFSATAGVLA
DKLEKSRYIRWVKLLEIAIMLCGAIGFITQSYGISLFLLFLMGTQSAFFGPVKYALLPQQLKSEELVPGNALVETGTFLA
ILLGTLGAGLIASADNAHYFAAAAVVIFAVLGYLSSRAIPLAPASAPHLEFRWQPITQTKQTLRIAKRDRAIFQSIMAIS
WFWFLGAGYLTQFPNFTKLHLNGNEAAVSFLLALFSVGIAVGSLACDKLSGHRIEVGIVPLGSVGISFFGYLMATSIPAD
LPIFSTFADFVTYSALWPLFAYLLLIGVFGGVFIVPLYAMLQQRAKVTERAQVIAALNIYNSLFMVGSAALGIVCLSVLE
MSIPQLFALLAVLNVLVALYIFLQVPIFAVRFLVWILTHTLYRVRHKNLHHIPEQGGALLVCNHVSYMDALLLSAVCPRL
IHFVMEEEYANLPLLKRFLKRAGVIPISANNRASLRRAFADIEHSLNEGNLVCIFPEGRLTADGEMNPFMRGLDLILHRS
PVPVVPLALKGLWGSYFSRYKGRACQGVPRRFRSQLEIEAGMPVAPEQANSAVMHEKVAQLRGDWR

Sequences:

>Translated_626_residues
MNKMANPTTALLTERRFLPYFITQFLGAFNDNIFKNVLLLFVAFAGPQALPISSNLFINLAAGLFILPFFLFSATAGVLA
DKLEKSRYIRWVKLLEIAIMLCGAIGFITQSYGISLFLLFLMGTQSAFFGPVKYALLPQQLKSEELVPGNALVETGTFLA
ILLGTLGAGLIASADNAHYFAAAAVVIFAVLGYLSSRAIPLAPASAPHLEFRWQPITQTKQTLRIAKRDRAIFQSIMAIS
WFWFLGAGYLTQFPNFTKLHLNGNEAAVSFLLALFSVGIAVGSLACDKLSGHRIEVGIVPLGSVGISFFGYLMATSIPAD
LPIFSTFADFVTYSALWPLFAYLLLIGVFGGVFIVPLYAMLQQRAKVTERAQVIAALNIYNSLFMVGSAALGIVCLSVLE
MSIPQLFALLAVLNVLVALYIFLQVPIFAVRFLVWILTHTLYRVRHKNLHHIPEQGGALLVCNHVSYMDALLLSAVCPRL
IHFVMEEEYANLPLLKRFLKRAGVIPISANNRASLRRAFADIEHSLNEGNLVCIFPEGRLTADGEMNPFMRGLDLILHRS
PVPVVPLALKGLWGSYFSRYKGRACQGVPRRFRSQLEIEAGMPVAPEQANSAVMHEKVAQLRGDWR
>Mature_626_residues
MNKMANPTTALLTERRFLPYFITQFLGAFNDNIFKNVLLLFVAFAGPQALPISSNLFINLAAGLFILPFFLFSATAGVLA
DKLEKSRYIRWVKLLEIAIMLCGAIGFITQSYGISLFLLFLMGTQSAFFGPVKYALLPQQLKSEELVPGNALVETGTFLA
ILLGTLGAGLIASADNAHYFAAAAVVIFAVLGYLSSRAIPLAPASAPHLEFRWQPITQTKQTLRIAKRDRAIFQSIMAIS
WFWFLGAGYLTQFPNFTKLHLNGNEAAVSFLLALFSVGIAVGSLACDKLSGHRIEVGIVPLGSVGISFFGYLMATSIPAD
LPIFSTFADFVTYSALWPLFAYLLLIGVFGGVFIVPLYAMLQQRAKVTERAQVIAALNIYNSLFMVGSAALGIVCLSVLE
MSIPQLFALLAVLNVLVALYIFLQVPIFAVRFLVWILTHTLYRVRHKNLHHIPEQGGALLVCNHVSYMDALLLSAVCPRL
IHFVMEEEYANLPLLKRFLKRAGVIPISANNRASLRRAFADIEHSLNEGNLVCIFPEGRLTADGEMNPFMRGLDLILHRS
PVPVVPLALKGLWGSYFSRYKGRACQGVPRRFRSQLEIEAGMPVAPEQANSAVMHEKVAQLRGDWR

Specific function: Catalyzes the facilitated diffusion of 2-acyl-glycero-3- phosphoethanolamine (2-acyl-GPE) into the cell [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. LplT (TC 2.A.1.42) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789200, Length=409, Percent_Identity=29.3398533007335, Blast_Score=89, Evalue=9e-19,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69001; Mature: 69001

Theoretical pI: Translated: 9.70; Mature: 9.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKMANPTTALLTERRFLPYFITQFLGAFNDNIFKNVLLLFVAFAGPQALPISSNLFINL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHH
AAGLFILPFFLFSATAGVLADKLEKSRYIRWVKLLEIAIMLCGAIGFITQSYGISLFLLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMGTQSAFFGPVKYALLPQQLKSEELVPGNALVETGTFLAILLGTLGAGLIASADNAHYF
HHHCCHHHHCHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHH
AAAAVVIFAVLGYLSSRAIPLAPASAPHLEFRWQPITQTKQTLRIAKRDRAIFQSIMAIS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WFWFLGAGYLTQFPNFTKLHLNGNEAAVSFLLALFSVGIAVGSLACDKLSGHRIEVGIVP
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEE
LGSVGISFFGYLMATSIPADLPIFSTFADFVTYSALWPLFAYLLLIGVFGGVFIVPLYAM
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQQRAKVTERAQVIAALNIYNSLFMVGSAALGIVCLSVLEMSIPQLFALLAVLNVLVALY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFLQVPIFAVRFLVWILTHTLYRVRHKNLHHIPEQGGALLVCNHVSYMDALLLSAVCPRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
IHFVMEEEYANLPLLKRFLKRAGVIPISANNRASLRRAFADIEHSLNEGNLVCIFPEGRL
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCC
TADGEMNPFMRGLDLILHRSPVPVVPLALKGLWGSYFSRYKGRACQGVPRRFRSQLEIEA
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHEECCC
GMPVAPEQANSAVMHEKVAQLRGDWR
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNKMANPTTALLTERRFLPYFITQFLGAFNDNIFKNVLLLFVAFAGPQALPISSNLFINL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHH
AAGLFILPFFLFSATAGVLADKLEKSRYIRWVKLLEIAIMLCGAIGFITQSYGISLFLLF
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LMGTQSAFFGPVKYALLPQQLKSEELVPGNALVETGTFLAILLGTLGAGLIASADNAHYF
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AAAAVVIFAVLGYLSSRAIPLAPASAPHLEFRWQPITQTKQTLRIAKRDRAIFQSIMAIS
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LQQRAKVTERAQVIAALNIYNSLFMVGSAALGIVCLSVLEMSIPQLFALLAVLNVLVALY
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IHFVMEEEYANLPLLKRFLKRAGVIPISANNRASLRRAFADIEHSLNEGNLVCIFPEGRL
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCC
TADGEMNPFMRGLDLILHRSPVPVVPLALKGLWGSYFSRYKGRACQGVPRRFRSQLEIEA
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHEECCC
GMPVAPEQANSAVMHEKVAQLRGDWR
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA