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The map label for this gene is yaaJ [C]

Identifier: 226949931

GI number: 226949931

Start: 2888453

End: 2889820

Strand: Reverse

Name: yaaJ [C]

Synonym: CLM_2883

Alternate gene names: 226949931

Gene position: 2889820-2888453 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226949932

Following gene: 226949930

Centisome position: 69.55

GC content: 32.46

Gene sequence:

>1368_bases
ATGGAATTTTTACTAAATGTTTTTGAAAATATCAATAATGTGCTATGGTCCTATATATTAATGTTTTTTTTATGTGGTGC
AGGAATATTTTTCACTTTTAAACTAGGATTTGTACAAGTTAAGAAATTTAAGGCAATGTTCAAACAAGTATTTACTAAAA
GTGATAATGATGACGGGATTAGTTCATTCCAAGCATTGGCTACCGCAGTAGCAGCACAGGTAGGAACAGGAATTTTAGCT
GGAGCTGCAACGGCTATAGCATCTGGTGGACCAGGAGCTATATTTTGGATGTGGATTAGTTCCTTTTTTGGTATGGGTAC
TATATTTGCAGAGGCTGTTTTAGCTCAGAAATATAAAACTCATGCCGAAGATGGTGAAGTTTTAGGAGGTCCAGCTTATT
ATATAAGAGATGGATTAGGTAATAAAAAATTAGCTAAATTTTTTGCTTTTGCTATGATGGTATCTGCCTGTTTAACAGGA
GATATGGTTCAATCAAATTCCATATCTATAGCCATAAATAAGGCTTATAATATTCCAACTTTAATTACAGGGATAGTGTT
AGTGGTTCTTACAGCTATGATAGTTATAGGTGGAATACAACGTATAGCATCAGTTACAGAAAAATTAATACCTATAATGG
GCGCATTATTTATATTAGGTAGTTTTATAATTATATTTAAAAATTACTATAATATAATACCAGCTCTTAAGATGATATTT
GTAGGAGCTTTTAATCCAAGAGCTGCTACAGGTGGTCTTATAGGTGCATCTGTAAGAGAAGCTATGAGATACGGTGTATC
TAGAGGTTTATTTTCAAATGAAGCTGGTATGGGATCTACACCTCATGCTCATGCAATTGCAAATGTTAAGCATCCAGTAC
AACAAGGATTAGTTGCTATGTTCGGAGTTTTTATAGATATATTCGTAATATTAAACTGTACAGCTTTCGTTATACTTACA
AGTGGAGCTTTAGATGGTAAAACTACAGGTATAGAATTAACACAACAGGCTTTTGTAAATGGTTTCGGAGGATTTGGTAA
TTCTTTTGTAGCTATTAGTTTATTCTTCTTTGCATTTTCAACTATGATAGGATGGTTTTTCTTTGGTGCTCTAAATGTTA
AATTTATATTTGGAAAAAAAGGAATGAAACCGTATACTGCTATATACCTAATTTCTTTAATATTGGGTACTGTTTTAGAT
GTACCACTAGTATGGCAATTAGCGGATACCTTTAATGGATTAATGGTTATACCAAACTTAATAGCTTTGATAGCTTTGGC
TAAATTGGTTCAAAAAGAACTTAAAGACTATAATGAAAATTTCTTATTGAAACAAGCGGTGGCAGATAGGAAAGCTAGTA
AGCTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAATATTAATTTTACTTAATATTTGAAAAATGATAACATTTACAATGAGGATTTGATCCAAATACATTTTAAGATATA
CATAAAGAGGGGAGAAGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAAATAAAGACTTTATTAATTAATATGATATAGTAAAAAATCAATATTCCTATTTAATAATACTCCATAATGTAATATT
ATATATATAAGAGTTTAATA

Product: sodium:alanine symporter family protein

Products: Na (I) [Cytoplasm]; L-alanine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 455; Mature: 455

Protein sequence:

>455_residues
MEFLLNVFENINNVLWSYILMFFLCGAGIFFTFKLGFVQVKKFKAMFKQVFTKSDNDDGISSFQALATAVAAQVGTGILA
GAATAIASGGPGAIFWMWISSFFGMGTIFAEAVLAQKYKTHAEDGEVLGGPAYYIRDGLGNKKLAKFFAFAMMVSACLTG
DMVQSNSISIAINKAYNIPTLITGIVLVVLTAMIVIGGIQRIASVTEKLIPIMGALFILGSFIIIFKNYYNIIPALKMIF
VGAFNPRAATGGLIGASVREAMRYGVSRGLFSNEAGMGSTPHAHAIANVKHPVQQGLVAMFGVFIDIFVILNCTAFVILT
SGALDGKTTGIELTQQAFVNGFGGFGNSFVAISLFFFAFSTMIGWFFFGALNVKFIFGKKGMKPYTAIYLISLILGTVLD
VPLVWQLADTFNGLMVIPNLIALIALAKLVQKELKDYNENFLLKQAVADRKASKL

Sequences:

>Translated_455_residues
MEFLLNVFENINNVLWSYILMFFLCGAGIFFTFKLGFVQVKKFKAMFKQVFTKSDNDDGISSFQALATAVAAQVGTGILA
GAATAIASGGPGAIFWMWISSFFGMGTIFAEAVLAQKYKTHAEDGEVLGGPAYYIRDGLGNKKLAKFFAFAMMVSACLTG
DMVQSNSISIAINKAYNIPTLITGIVLVVLTAMIVIGGIQRIASVTEKLIPIMGALFILGSFIIIFKNYYNIIPALKMIF
VGAFNPRAATGGLIGASVREAMRYGVSRGLFSNEAGMGSTPHAHAIANVKHPVQQGLVAMFGVFIDIFVILNCTAFVILT
SGALDGKTTGIELTQQAFVNGFGGFGNSFVAISLFFFAFSTMIGWFFFGALNVKFIFGKKGMKPYTAIYLISLILGTVLD
VPLVWQLADTFNGLMVIPNLIALIALAKLVQKELKDYNENFLLKQAVADRKASKL
>Mature_455_residues
MEFLLNVFENINNVLWSYILMFFLCGAGIFFTFKLGFVQVKKFKAMFKQVFTKSDNDDGISSFQALATAVAAQVGTGILA
GAATAIASGGPGAIFWMWISSFFGMGTIFAEAVLAQKYKTHAEDGEVLGGPAYYIRDGLGNKKLAKFFAFAMMVSACLTG
DMVQSNSISIAINKAYNIPTLITGIVLVVLTAMIVIGGIQRIASVTEKLIPIMGALFILGSFIIIFKNYYNIIPALKMIF
VGAFNPRAATGGLIGASVREAMRYGVSRGLFSNEAGMGSTPHAHAIANVKHPVQQGLVAMFGVFIDIFVILNCTAFVILT
SGALDGKTTGIELTQQAFVNGFGGFGNSFVAISLFFFAFSTMIGWFFFGALNVKFIFGKKGMKPYTAIYLISLILGTVLD
VPLVWQLADTFNGLMVIPNLIALIALAKLVQKELKDYNENFLLKQAVADRKASKL

Specific function: Unknown

COG id: COG1115

COG function: function code E; Na+/alanine symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:alanine (SAF) symporter family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786188, Length=441, Percent_Identity=37.18820861678, Blast_Score=274, Evalue=1e-74,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001463 [H]

Pfam domain/function: PF01235 Na_Ala_symp [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49127; Mature: 49127

Theoretical pI: Translated: 9.89; Mature: 9.89

Prosite motif: PS00873 NA_ALANINE_SYMP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEFLLNVFENINNVLWSYILMFFLCGAGIFFTFKLGFVQVKKFKAMFKQVFTKSDNDDGI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
SSFQALATAVAAQVGTGILAGAATAIASGGPGAIFWMWISSFFGMGTIFAEAVLAQKYKT
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
HAEDGEVLGGPAYYIRDGLGNKKLAKFFAFAMMVSACLTGDMVQSNSISIAINKAYNIPT
CCCCCCEECCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHH
LITGIVLVVLTAMIVIGGIQRIASVTEKLIPIMGALFILGSFIIIFKNYYNIIPALKMIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGAFNPRAATGGLIGASVREAMRYGVSRGLFSNEAGMGSTPHAHAIANVKHPVQQGLVAM
HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGVFIDIFVILNCTAFVILTSGALDGKTTGIELTQQAFVNGFGGFGNSFVAISLFFFAFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TMIGWFFFGALNVKFIFGKKGMKPYTAIYLISLILGTVLDVPLVWQLADTFNGLMVIPNL
HHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
IALIALAKLVQKELKDYNENFLLKQAVADRKASKL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEFLLNVFENINNVLWSYILMFFLCGAGIFFTFKLGFVQVKKFKAMFKQVFTKSDNDDGI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
SSFQALATAVAAQVGTGILAGAATAIASGGPGAIFWMWISSFFGMGTIFAEAVLAQKYKT
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
HAEDGEVLGGPAYYIRDGLGNKKLAKFFAFAMMVSACLTGDMVQSNSISIAINKAYNIPT
CCCCCCEECCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHH
LITGIVLVVLTAMIVIGGIQRIASVTEKLIPIMGALFILGSFIIIFKNYYNIIPALKMIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGAFNPRAATGGLIGASVREAMRYGVSRGLFSNEAGMGSTPHAHAIANVKHPVQQGLVAM
HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGVFIDIFVILNCTAFVILTSGALDGKTTGIELTQQAFVNGFGGFGNSFVAISLFFFAFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TMIGWFFFGALNVKFIFGKKGMKPYTAIYLISLILGTVLDVPLVWQLADTFNGLMVIPNL
HHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
IALIALAKLVQKELKDYNENFLLKQAVADRKASKL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; L-alanine [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + L-alanine [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + L-alanine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]