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The map label for this gene is 226949461

Identifier: 226949461

GI number: 226949461

Start: 2470799

End: 2472499

Strand: Reverse

Name: 226949461

Synonym: CLM_2394

Alternate gene names: NA

Gene position: 2472499-2470799 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226949462

Following gene: 226949460

Centisome position: 59.5

GC content: 31.8

Gene sequence:

>1701_bases
GTGAGTGAAAATTCAAAATCTAAGGTAGGATTCTTAACTGCTTTTCAGGTAGCAGCAGTGTGGTTTGGAGCTCATGTAGG
AGGGGGATTTGCAACAGGTAATCAAACAATGAATTTTTTTGTTAAATATGGTTGGCATTCTATATGGTTACCTGCAGTTA
TAATTATAATTATAGGATTAACATATAGAGAGTCATTAGTATTAGCAAAAAATTATGGGACTTATGATTATAAAAGTTGG
TCAAAAAAAATGTATGAACCCTATGATAAATTCTTTTCTGTTATTTTTGAAATAGGATATTTAATGATAGTATTATTAGG
TACAGGAGGATCTATAGCAGGTTCCGCTTCTCTAATGGAGACTTATGGAGTTAATTATTTAGTAGGAGTATTAATTACAG
GTGGCATTTTTTATATATTAACTATATATGGATCAGAATTAATAAGAAAGGCTTCAACTATTATAACTGTTCTAATATTA
ATATTTTTAACAATCATAGTAATTGTAGGCATAGTTAATAATTCAGGGAATTTAGCACATCTTGTTTCTACAAAATATTC
CCCTTCATCCTTTGGTACAGTTTTGTATAGTGGACTTCGATATGCTGGTTATCAGGCCTTTGTTGTTGCTATTGTACTAA
GTGCAAGTGACACTTTAAAATCTGATAAAGCTATTAATAAGTCAATTTTTTTAGGTATTATTTTAAACGGTGTAATGATC
ACACTATCCTGTATAATGCTATTGGCATGGATGCCAGGAGCCCAAAAGGAAACTATACCAATTTTATATATATGTAAACG
TTTAAACAGTGGATTTTTATTATTTTCTTACTCAGTAGTACTATTTCTGGCCTTTGTATCCACAGGTATAGGATGTGTAT
TTGGAGCAGTGGCTAGGTTTGAGCATGTTTTTAAGAAACCGGAGAATATTAAAAAAAGAAGGGGATTGATTTCTCTTGTT
TGTATGATATTATCTATGGCAATTTCCCTATTTGGATTAACTAAAATTGTTGTTATAGGCTATGGATATGTAGGGATAAT
CGGCATATTTGCTGTAGTTATTCCTTGTATAGTTGTAGGAAGAATAAAAAACAACAGATTTAAAAAAGAGAAGGAAAGTA
TATTATTAGAAGAGCAAAATGATATATCAAATGAATATCAAAACAGTGCATCAGTAGAAGATAAAAGTGACATGTTAAAA
GAAAAAGATAGTGCGTTAAAAGAAGAGCAAGATAATATATCCAAAAAAGATAAAGACATTGCATCAAAAGAAGACAAAGA
TGATGTGTTAAAGGAAGAAGACAGTGAGTTAATAGAAGACCAAGATGATATATCGGAGGAAGATGAGGAAAACGTGCCAG
TAGAAGGTCCAGATAATACATTAAAGGAAAATAAGGAAAGTATATCAGTAGAAGATCAAGTTGATGTGCTAAAGGGAGAA
CAGGACAGTGTACCAGAAGATGCAGATGATACATTGGAGGAAGATAAGGAAAGTGTGTCAATAGAAGATCAGGATGATAT
ATTAAAGGAAGAACAGGACAGTGTATCAGAAGGTGAAGATGATACGTTAAAGGAAGATAAGGAAAATGTGGCAGTAGAAG
GTCAGGATGATATGCAAAAAGAAGATAAAGAGAGTATATCAATAGAAGAGGAAAAAAGTACAGATGACGATGCATCAAAG
GAAGATGAGGACAATATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTGTTAGTTATAAAAAAATTAATATTTAATAGGATTGTCTTAATAGGGGGACATAATATAAAAATTATACCCAATTAA
TATATATAGGGGAGGATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGATGGTATATCAACTGTAGAGTCTGAATAACAATTATTATACTAAAATATTTTAAAAAGGGGGATACACATATGT
ATACAATGGGATTGGATATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 566; Mature: 565

Protein sequence:

>566_residues
MSENSKSKVGFLTAFQVAAVWFGAHVGGGFATGNQTMNFFVKYGWHSIWLPAVIIIIIGLTYRESLVLAKNYGTYDYKSW
SKKMYEPYDKFFSVIFEIGYLMIVLLGTGGSIAGSASLMETYGVNYLVGVLITGGIFYILTIYGSELIRKASTIITVLIL
IFLTIIVIVGIVNNSGNLAHLVSTKYSPSSFGTVLYSGLRYAGYQAFVVAIVLSASDTLKSDKAINKSIFLGIILNGVMI
TLSCIMLLAWMPGAQKETIPILYICKRLNSGFLLFSYSVVLFLAFVSTGIGCVFGAVARFEHVFKKPENIKKRRGLISLV
CMILSMAISLFGLTKIVVIGYGYVGIIGIFAVVIPCIVVGRIKNNRFKKEKESILLEEQNDISNEYQNSASVEDKSDMLK
EKDSALKEEQDNISKKDKDIASKEDKDDVLKEEDSELIEDQDDISEEDEENVPVEGPDNTLKENKESISVEDQVDVLKGE
QDSVPEDADDTLEEDKESVSIEDQDDILKEEQDSVSEGEDDTLKEDKENVAVEGQDDMQKEDKESISIEEEKSTDDDASK
EDEDNI

Sequences:

>Translated_566_residues
MSENSKSKVGFLTAFQVAAVWFGAHVGGGFATGNQTMNFFVKYGWHSIWLPAVIIIIIGLTYRESLVLAKNYGTYDYKSW
SKKMYEPYDKFFSVIFEIGYLMIVLLGTGGSIAGSASLMETYGVNYLVGVLITGGIFYILTIYGSELIRKASTIITVLIL
IFLTIIVIVGIVNNSGNLAHLVSTKYSPSSFGTVLYSGLRYAGYQAFVVAIVLSASDTLKSDKAINKSIFLGIILNGVMI
TLSCIMLLAWMPGAQKETIPILYICKRLNSGFLLFSYSVVLFLAFVSTGIGCVFGAVARFEHVFKKPENIKKRRGLISLV
CMILSMAISLFGLTKIVVIGYGYVGIIGIFAVVIPCIVVGRIKNNRFKKEKESILLEEQNDISNEYQNSASVEDKSDMLK
EKDSALKEEQDNISKKDKDIASKEDKDDVLKEEDSELIEDQDDISEEDEENVPVEGPDNTLKENKESISVEDQVDVLKGE
QDSVPEDADDTLEEDKESVSIEDQDDILKEEQDSVSEGEDDTLKEDKENVAVEGQDDMQKEDKESISIEEEKSTDDDASK
EDEDNI
>Mature_565_residues
SENSKSKVGFLTAFQVAAVWFGAHVGGGFATGNQTMNFFVKYGWHSIWLPAVIIIIIGLTYRESLVLAKNYGTYDYKSWS
KKMYEPYDKFFSVIFEIGYLMIVLLGTGGSIAGSASLMETYGVNYLVGVLITGGIFYILTIYGSELIRKASTIITVLILI
FLTIIVIVGIVNNSGNLAHLVSTKYSPSSFGTVLYSGLRYAGYQAFVVAIVLSASDTLKSDKAINKSIFLGIILNGVMIT
LSCIMLLAWMPGAQKETIPILYICKRLNSGFLLFSYSVVLFLAFVSTGIGCVFGAVARFEHVFKKPENIKKRRGLISLVC
MILSMAISLFGLTKIVVIGYGYVGIIGIFAVVIPCIVVGRIKNNRFKKEKESILLEEQNDISNEYQNSASVEDKSDMLKE
KDSALKEEQDNISKKDKDIASKEDKDDVLKEEDSELIEDQDDISEEDEENVPVEGPDNTLKENKESISVEDQVDVLKGEQ
DSVPEDADDTLEEDKESVSIEDQDDILKEEQDSVSEGEDDTLKEDKENVAVEGQDDMQKEDKESISIEEEKSTDDDASKE
DEDNI

Specific function: Unknown

COG id: COG3949

COG function: function code S; Uncharacterized membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Drosophila melanogaster, GI17986031, Length=181, Percent_Identity=24.8618784530387, Blast_Score=65, Evalue=8e-11,
Organism=Drosophila melanogaster, GI221330583, Length=181, Percent_Identity=24.8618784530387, Blast_Score=65, Evalue=9e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62706; Mature: 62575

Theoretical pI: Translated: 4.24; Mature: 4.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SENSKSKVGFLTAFQVAAVWFGAHVGGGFATGNQTMNFFVKYGWHSIWLPAVIIIIIGL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH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HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA