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The map label for this gene is yhgE [H]

Identifier: 226224911

GI number: 226224911

Start: 2398347

End: 2401130

Strand: Reverse

Name: yhgE [H]

Synonym: Lm4b_02330

Alternate gene names: 226224911

Gene position: 2401130-2398347 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226224912

Following gene: 226224910

Centisome position: 82.44

GC content: 39.91

Gene sequence:

>2784_bases
ATGGATATGGTAAAAAATGAGTGGAAGAAATTATTTAAAAACAAAATACTACTTTTATCATTTGTAGTTATTCTGTTTAT
TCCACTTTTATATGCAAGCTTTTTCTTAAAATCCGTCTGGGATCCGTACGGCAAAACAGGGGATTTACCAGTAGCGGTAG
TTAACAATGATAAACCGGTTGATTATAACGGCCAAACAATGGATGTTGGTGATCAGTTAGTCACAAAACTGAAAAGCAAC
AAAGAACTTGATTGGAATTTTCTTTCCAAAGAAGATGCGGAACAAGGCTTAAAAGATGGCAAATATTATATGATTGTCAC
GATTCCAAAAGATTTCTCTAAAAATGCAGCATCCGTTTTAGATAAAGATCCGAAAAAAATGGAATTATCCTATAAAACAA
ACGGCTCGCTGAACTATTTAGGTCAAGTCGTGAGTGAACAAGGAGCCAAACAACTGAAAAGCGAGGTTTCCGCTGAAGTA
ACAAAATCATACGCGGAAGCAATTTTTGATAAAATTAAAGAGTCTGGTGAAGGGTTCGCCCAAGCTGCAGATGGCTCTGG
AAAAATTAAAGATGGCCTTGTGAAATCACAAGAAGGTAATAAAACGATTTCTACTAATTTAAAAACGCTCGCAGATAGCT
CTTTAACGTTCAAAGATGGCGCTAATACGTTAGAAGTTGGCTTGAAAACTTACACAGATGGTGTAAACACTGCGGCCGCT
GGTGGGGATAAATTAAATGATGGTGTTTCGACACTTGCAGCTGGAGTAGGACCACTAAAAGACGGTGTAGCAGCGCTTGA
CGGCGGGGCAACGAAATTAGCTAGCGGAGTTTCTACCTATACATCTGGTGTAGATACACTAGCAGGCGGAATTAACCAAG
CTTACACTGGTTCTACTGCACTTTCAGATGGATTAAATAAGATGAATGGCAGTGTACCAACTTTAGCATCGGGCATAACA
CAACTAAACAACGGTCAAAAAAGCTTAGCAACTGGCTTAGATTCACTAGTCGATGGAAGTAACAAACTTTCAGCAGGACT
TAAAGAATTAGACGGTAATTTAACTGATAAACAAGGCAAAATTGCCCAATTGAAACAAGGCATGAACGATTTACAACAAG
GAATTGATCAATTAAATAAAAGTGTCAACGGGGAAGATGCAGCACTTGCAAAACAACTCGCTGCACTACAAAAAAGTTTA
AGCGACCTACAAAATGGCTTAACATTTATTAAATCTAATGCGAACTTCGATGCTGAAGCAATTAAATCAAAAATTAATGC
GACAGCTGGCGTGAGTGCAGAAGATAAACAAAAAATTATTGATGCTATTCAAGCCGATTTAGATAAAGAAACACAAAAAT
CCGCTACACAAGTAGCAACAGTAGAACAACTACAAAGCGGCTTATCAGGTCTTGATTTAGCGGCAATTCAAACACAAGTA
ACAGAATTGCAAACTGGCGTAGCGAAAATTTCCGCTGGTTATCAAGCAGTTCACGGTGGAACAAACGAAGCCTTTAACAG
TATTCACCAAGCAATTAATGGCTCAGGTAGTCAAACTCTACTTGGCGGCGCGAACCAACTAACTGCTGGACTCAAATCAG
CACAAGCTGGAAATGCCAAATTAGTTGCTGGAACAAATCAACTTAACAGCCAAGTGCCAACCCTAACTTCTGGCGTAGGA
CAACTCGCTGCGGGTAGTGCAAATATGGAAAACGGATTAAGTCAGTTAAATGATGGTGGTAATCAACTTGCAAGTAATTC
CGGCGCATTACGTTCAGGCGCAACAGAGTTACAAGGCGGAACAAACCAATTAGCTGCAAAAGTACCAACACTTGCAGGTG
GAGTTAATCAACTACAAGCAGGTTCAAGCCAATTAGCAGGCGGTCTAAACCAACTATCAGCTAACTCACCAAAACTAGTT
TCAGGCGTAGGACAACTAGCAGACGGCTCTTCCAAAATTGCCGATGGTTCTTCCAAATTAGCGAATGGTTCCTTCCAATT
AGGAGATGGACTTACTAAATTAACAGACGGCAGCACAGAATTAACAGACAAACTAGCAGACGGAGCACAACAAGTCAAAG
ATACAAAAGCAACAGACAAAACATTTAACATGATTGCTGCTCCAACAAAACTCGCACATAATGAATATACGCACGTAAGT
AACTACGGACATGCATTAGCACCATATGTGTTATCACTAGCTCTATATGTTGGTGCACTTGTATTTAACTTCATCATGCC
AATCAGACGTGTTTCGATGGAAGGACAACCAGCTTATAAATGGTGGTTAAGTAAACTATCACTTGGTTTTGTCGCAGCTG
TTGCGATGGCGCTTCTTGAAGGTGGTATCATGATAGCACTAGGACTAAGACCAGATAGCATTGTTGAATTCTTCGGAACA
GCGATTATTACGGCACTTGCTTACATGTTCCTTATCATGCTCCTTGCCATGACATTTGATAATCCAGGTCGTTTTATCGC
GATGGTATTACTCATTGTTCAATTAGCGGGATCAGGCGGAACATTCCCAATGCCACTTACTGGATGGTTCTTCAATTTAA
TCCATCCGTTCTTACCAATGACTTACTCGATTTATGCGTTTAGAGAGTCACTGGCAGCAGGTATGGGACCAAATGTATAC
AGTATGTCGATGCTCGTTCTTACAATCATCATGATCGCATGTGTTGGCTTACTATATCTATCTATGAGCCACTTGAAAAA
ACGCCATGATGCACATGAGTCAGCTCTTGATGATAATCAAAAATTAATGGCTTTAGAAAACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCTGTTTTAGTAGAGCAAGTTATTGGGAAAGAACGAACCACTATCATAGATTGGAACGAAGCGTAATAAATCTTTAAAA
GAAAGAAGTGCGGTAATAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAAATAAAACCCCTATAAAGTAGCAATTACTTTATAGGGGTTTTTTGTATAAAAAAGGTAAAGTGACAATTTCCTATGC
TTAGGAAATAAGATTAATTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORFB [H]

Number of amino acids: Translated: 927; Mature: 927

Protein sequence:

>927_residues
MDMVKNEWKKLFKNKILLLSFVVILFIPLLYASFFLKSVWDPYGKTGDLPVAVVNNDKPVDYNGQTMDVGDQLVTKLKSN
KELDWNFLSKEDAEQGLKDGKYYMIVTIPKDFSKNAASVLDKDPKKMELSYKTNGSLNYLGQVVSEQGAKQLKSEVSAEV
TKSYAEAIFDKIKESGEGFAQAADGSGKIKDGLVKSQEGNKTISTNLKTLADSSLTFKDGANTLEVGLKTYTDGVNTAAA
GGDKLNDGVSTLAAGVGPLKDGVAALDGGATKLASGVSTYTSGVDTLAGGINQAYTGSTALSDGLNKMNGSVPTLASGIT
QLNNGQKSLATGLDSLVDGSNKLSAGLKELDGNLTDKQGKIAQLKQGMNDLQQGIDQLNKSVNGEDAALAKQLAALQKSL
SDLQNGLTFIKSNANFDAEAIKSKINATAGVSAEDKQKIIDAIQADLDKETQKSATQVATVEQLQSGLSGLDLAAIQTQV
TELQTGVAKISAGYQAVHGGTNEAFNSIHQAINGSGSQTLLGGANQLTAGLKSAQAGNAKLVAGTNQLNSQVPTLTSGVG
QLAAGSANMENGLSQLNDGGNQLASNSGALRSGATELQGGTNQLAAKVPTLAGGVNQLQAGSSQLAGGLNQLSANSPKLV
SGVGQLADGSSKIADGSSKLANGSFQLGDGLTKLTDGSTELTDKLADGAQQVKDTKATDKTFNMIAAPTKLAHNEYTHVS
NYGHALAPYVLSLALYVGALVFNFIMPIRRVSMEGQPAYKWWLSKLSLGFVAAVAMALLEGGIMIALGLRPDSIVEFFGT
AIITALAYMFLIMLLAMTFDNPGRFIAMVLLIVQLAGSGGTFPMPLTGWFFNLIHPFLPMTYSIYAFRESLAAGMGPNVY
SMSMLVLTIIMIACVGLLYLSMSHLKKRHDAHESALDDNQKLMALEN

Sequences:

>Translated_927_residues
MDMVKNEWKKLFKNKILLLSFVVILFIPLLYASFFLKSVWDPYGKTGDLPVAVVNNDKPVDYNGQTMDVGDQLVTKLKSN
KELDWNFLSKEDAEQGLKDGKYYMIVTIPKDFSKNAASVLDKDPKKMELSYKTNGSLNYLGQVVSEQGAKQLKSEVSAEV
TKSYAEAIFDKIKESGEGFAQAADGSGKIKDGLVKSQEGNKTISTNLKTLADSSLTFKDGANTLEVGLKTYTDGVNTAAA
GGDKLNDGVSTLAAGVGPLKDGVAALDGGATKLASGVSTYTSGVDTLAGGINQAYTGSTALSDGLNKMNGSVPTLASGIT
QLNNGQKSLATGLDSLVDGSNKLSAGLKELDGNLTDKQGKIAQLKQGMNDLQQGIDQLNKSVNGEDAALAKQLAALQKSL
SDLQNGLTFIKSNANFDAEAIKSKINATAGVSAEDKQKIIDAIQADLDKETQKSATQVATVEQLQSGLSGLDLAAIQTQV
TELQTGVAKISAGYQAVHGGTNEAFNSIHQAINGSGSQTLLGGANQLTAGLKSAQAGNAKLVAGTNQLNSQVPTLTSGVG
QLAAGSANMENGLSQLNDGGNQLASNSGALRSGATELQGGTNQLAAKVPTLAGGVNQLQAGSSQLAGGLNQLSANSPKLV
SGVGQLADGSSKIADGSSKLANGSFQLGDGLTKLTDGSTELTDKLADGAQQVKDTKATDKTFNMIAAPTKLAHNEYTHVS
NYGHALAPYVLSLALYVGALVFNFIMPIRRVSMEGQPAYKWWLSKLSLGFVAAVAMALLEGGIMIALGLRPDSIVEFFGT
AIITALAYMFLIMLLAMTFDNPGRFIAMVLLIVQLAGSGGTFPMPLTGWFFNLIHPFLPMTYSIYAFRESLAAGMGPNVY
SMSMLVLTIIMIACVGLLYLSMSHLKKRHDAHESALDDNQKLMALEN
>Mature_927_residues
MDMVKNEWKKLFKNKILLLSFVVILFIPLLYASFFLKSVWDPYGKTGDLPVAVVNNDKPVDYNGQTMDVGDQLVTKLKSN
KELDWNFLSKEDAEQGLKDGKYYMIVTIPKDFSKNAASVLDKDPKKMELSYKTNGSLNYLGQVVSEQGAKQLKSEVSAEV
TKSYAEAIFDKIKESGEGFAQAADGSGKIKDGLVKSQEGNKTISTNLKTLADSSLTFKDGANTLEVGLKTYTDGVNTAAA
GGDKLNDGVSTLAAGVGPLKDGVAALDGGATKLASGVSTYTSGVDTLAGGINQAYTGSTALSDGLNKMNGSVPTLASGIT
QLNNGQKSLATGLDSLVDGSNKLSAGLKELDGNLTDKQGKIAQLKQGMNDLQQGIDQLNKSVNGEDAALAKQLAALQKSL
SDLQNGLTFIKSNANFDAEAIKSKINATAGVSAEDKQKIIDAIQADLDKETQKSATQVATVEQLQSGLSGLDLAAIQTQV
TELQTGVAKISAGYQAVHGGTNEAFNSIHQAINGSGSQTLLGGANQLTAGLKSAQAGNAKLVAGTNQLNSQVPTLTSGVG
QLAAGSANMENGLSQLNDGGNQLASNSGALRSGATELQGGTNQLAAKVPTLAGGVNQLQAGSSQLAGGLNQLSANSPKLV
SGVGQLADGSSKIADGSSKLANGSFQLGDGLTKLTDGSTELTDKLADGAQQVKDTKATDKTFNMIAAPTKLAHNEYTHVS
NYGHALAPYVLSLALYVGALVFNFIMPIRRVSMEGQPAYKWWLSKLSLGFVAAVAMALLEGGIMIALGLRPDSIVEFFGT
AIITALAYMFLIMLLAMTFDNPGRFIAMVLLIVQLAGSGGTFPMPLTGWFFNLIHPFLPMTYSIYAFRESLAAGMGPNVY
SMSMLVLTIIMIACVGLLYLSMSHLKKRHDAHESALDDNQKLMALEN

Specific function: Unknown

COG id: COG1511

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013525
- InterPro:   IPR022703
- InterPro:   IPR017501
- InterPro:   IPR017500 [H]

Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 97237; Mature: 97237

Theoretical pI: Translated: 6.11; Mature: 6.11

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDMVKNEWKKLFKNKILLLSFVVILFIPLLYASFFLKSVWDPYGKTGDLPVAVVNNDKPV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCC
DYNGQTMDVGDQLVTKLKSNKELDWNFLSKEDAEQGLKDGKYYMIVTIPKDFSKNAASVL
CCCCCEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHH
DKDPKKMELSYKTNGSLNYLGQVVSEQGAKQLKSEVSAEVTKSYAEAIFDKIKESGEGFA
CCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
QAADGSGKIKDGLVKSQEGNKTISTNLKTLADSSLTFKDGANTLEVGLKTYTDGVNTAAA
CCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHCC
GGDKLNDGVSTLAAGVGPLKDGVAALDGGATKLASGVSTYTSGVDTLAGGINQAYTGSTA
CCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCHH
LSDGLNKMNGSVPTLASGITQLNNGQKSLATGLDSLVDGSNKLSAGLKELDGNLTDKQGK
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
IAQLKQGMNDLQQGIDQLNKSVNGEDAALAKQLAALQKSLSDLQNGLTFIKSNANFDAEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHEEECCCCCCHHH
IKSKINATAGVSAEDKQKIIDAIQADLDKETQKSATQVATVEQLQSGLSGLDLAAIQTQV
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
TELQTGVAKISAGYQAVHGGTNEAFNSIHQAINGSGSQTLLGGANQLTAGLKSAQAGNAK
HHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHCCCCCEE
LVAGTNQLNSQVPTLTSGVGQLAAGSANMENGLSQLNDGGNQLASNSGALRSGATELQGG
EEECCHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHCCCHHHCCC
TNQLAAKVPTLAGGVNQLQAGSSQLAGGLNQLSANSPKLVSGVGQLADGSSKIADGSSKL
HHHHHHHCCHHHCCHHHHHCCHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH
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CCCCEECCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHH
NYGHALAPYVLSLALYVGALVFNFIMPIRRVSMEGQPAYKWWLSKLSLGFVAAVAMALLE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GGIMIALGLRPDSIVEFFGTAIITALAYMFLIMLLAMTFDNPGRFIAMVLLIVQLAGSGG
CCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TFPMPLTGWFFNLIHPFLPMTYSIYAFRESLAAGMGPNVYSMSMLVLTIIMIACVGLLYL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SMSHLKKRHDAHESALDDNQKLMALEN
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECC
>Mature Secondary Structure
MDMVKNEWKKLFKNKILLLSFVVILFIPLLYASFFLKSVWDPYGKTGDLPVAVVNNDKPV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCC
DYNGQTMDVGDQLVTKLKSNKELDWNFLSKEDAEQGLKDGKYYMIVTIPKDFSKNAASVL
CCCCCEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHH
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CCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
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EEECCHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHCCCHHHCCC
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HHHHHHHCCHHHCCHHHHHCCHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH
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CCCCEECCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHH
NYGHALAPYVLSLALYVGALVFNFIMPIRRVSMEGQPAYKWWLSKLSLGFVAAVAMALLE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GGIMIALGLRPDSIVEFFGTAIITALAYMFLIMLLAMTFDNPGRFIAMVLLIVQLAGSGG
CCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TFPMPLTGWFFNLIHPFLPMTYSIYAFRESLAAGMGPNVYSMSMLVLTIIMIACVGLLYL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SMSHLKKRHDAHESALDDNQKLMALEN
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]