| Definition | Wolbachia sp. wRi, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012416 |
| Length | 1,445,873 |
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The map label for this gene is 225630777
Identifier: 225630777
GI number: 225630777
Start: 1169228
End: 1171048
Strand: Direct
Name: 225630777
Synonym: WRi_010770
Alternate gene names: NA
Gene position: 1169228-1171048 (Clockwise)
Preceding gene: 225630776
Following gene: 225630784
Centisome position: 80.87
GC content: 32.02
Gene sequence:
>1821_bases ATGATAGGTATTTCTCAAATACAATTTCCTTCAAAGGATTCTAGTAAGCTAAAATTTGTTAGCTACTTTGGAGCTTTTGT CTCGTTAAGCATTATCACTAATCCTGTTAATGTTCTTTTTTCTCTTGGTACTATGTTCTTCAGGTCTGAAATTAAAACTC TTTATATCTACAAAGAAATAAAAACGGCAAAACAGCAAAAAATGAGCAAAAGGGAATATTGGGAAATATTTTTTAAAAAC AATACAATCAAGGTAGCAGCCTTCCTCTTGTTTTCTGCTTTCATAACATATCTAACTTTCACTACCACTTTCTTGCTTAT TTCGTTACTGGGAACTATACCACTTACAATGCTATTAATTTTATTGCAGAGTGAACTAAGGCCAAAAGATTTTAACCCAT TTACGCTGCTTAAAGCTTCTATAAATTTCTTTTTGGAAGGTATAAAAGAGAATTTACGTGGTATGGTTAATAGTTTTGAT GTTAAGCTTGAACATTTACTGCCCCATCAATTAAATGATGATATCATTAAAAATATTGATAAATTAAAAGATAAGTATGG TGAAGAAGTATCCGAAGACGTTATTAATGATAGAGAATTTAAGCAATTTATTGAATATATAAATGATTTATATGAACTTA ATTATCGTCAATTTAGTGATGAAGATAAAGGAAGAGTAATTGCATTTTTAAATGACTTTTGCAAAGATGATCAAAAGCAT AGCTCCCGCTTTACAGGTGGACGGATTTTACTTTTAGTTCTGAAAGCCTGCAATGATGGAGACAGAGAAGCTGTAAAAAA TAAAAAAGACGCGTTAATTACAAATTTGCTTGATAGCCAAACTTTCTCTAGACAAGAGCGTATTCCTAACACCTGCTTTA CCGGTATTGTTTATAGGATGTTAAGTACATTAGAAGGTATTCATCCTGATCCAGAAATTAGATTTACTCCTCCAAGGCAA ATATTACTTCCAGAAGCACAAAATGAAGCACGTAAGTTCATGTTAGACAGGTTAAAAAACAAGAAAAACAATAAAGAAAT TTTTAAGGCTTGGTATGACGTTCAAAATGGTTATGAAGATGATGAAAGTCAAAAAATAGTTGATGATTTTATTTCAGAAG TAAGTATTCCTTTAATGAGAAAATTATTGAGTATTACTTCTCAATATAGTGAACAAATTGTGCTGACGTTAATGAAAAAT ATTAGCTCTATAAAGTTAAATAAATTACAATGTTGTGAGCTGGTTCAGCACATGAGAAATAAACTGCAGGAGCATGGTTT AGGTGACCAAGAAAGTTTACTCGAAAACATCGGAAAAAAAGTATTCTTAGAGCTATTAAATCGAGATCTACTCGAGACAG ATTTTTCTCTCAAGGATTCATCTTTGGATGGAGCTAAAAGAATAGCTAACAAAATAATAATAGGAGAAGTTGAGAAATTT AGGTCAGAAGCTGCTGAAAAGGCTAGGGAAGTTAACTCTATAGAAGTTCAAGTGGATGTTACATTGCGGGGTCTGTCAAC CTTGCCGCGAGAAAAGAAGTGTTGCATTGCATATAGCAGACTAAGTGGCCAGTATGAAGGTGATGAGAGAGAGATAATGG AGAACATCTTACTAAAAAAATTAGAGATAACGAAAAAAGAAATGAATAAGATGCTAGAAGAGAATGATATACGTAAACTA AAATTAGCACTTGATGATGCATGTAAGAAAAGTGGAAAAAACATGGAAGAAATGATAAAAGAAGTAGAAGAAGTAGTCTC AAGTCGTTTCTCGCATGAAGTATCTGTTAGTAATATAGCAACAGAGTCAGCACACTTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GAGATCGAATACGATGAGTGTGCGGATAATAAGATACTTAAACATTGACGTTTTAAATTATTATGCTATTACTAGAGTGT AATGATGTTGAAGGTAAGCT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATTTATTTTCCTTACCTTGCAGAAGATTCACAATATTTCTGTGGTGTTTTAGGAAGACCAGTGCTCCTATAATTAGTA ATGTTAAGAACAAATTCCTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 606; Mature: 606
Protein sequence:
>606_residues MIGISQIQFPSKDSSKLKFVSYFGAFVSLSIITNPVNVLFSLGTMFFRSEIKTLYIYKEIKTAKQQKMSKREYWEIFFKN NTIKVAAFLLFSAFITYLTFTTTFLLISLLGTIPLTMLLILLQSELRPKDFNPFTLLKASINFFLEGIKENLRGMVNSFD VKLEHLLPHQLNDDIIKNIDKLKDKYGEEVSEDVINDREFKQFIEYINDLYELNYRQFSDEDKGRVIAFLNDFCKDDQKH SSRFTGGRILLLVLKACNDGDREAVKNKKDALITNLLDSQTFSRQERIPNTCFTGIVYRMLSTLEGIHPDPEIRFTPPRQ ILLPEAQNEARKFMLDRLKNKKNNKEIFKAWYDVQNGYEDDESQKIVDDFISEVSIPLMRKLLSITSQYSEQIVLTLMKN ISSIKLNKLQCCELVQHMRNKLQEHGLGDQESLLENIGKKVFLELLNRDLLETDFSLKDSSLDGAKRIANKIIIGEVEKF RSEAAEKAREVNSIEVQVDVTLRGLSTLPREKKCCIAYSRLSGQYEGDEREIMENILLKKLEITKKEMNKMLEENDIRKL KLALDDACKKSGKNMEEMIKEVEEVVSSRFSHEVSVSNIATESAHL
Sequences:
>Translated_606_residues MIGISQIQFPSKDSSKLKFVSYFGAFVSLSIITNPVNVLFSLGTMFFRSEIKTLYIYKEIKTAKQQKMSKREYWEIFFKN NTIKVAAFLLFSAFITYLTFTTTFLLISLLGTIPLTMLLILLQSELRPKDFNPFTLLKASINFFLEGIKENLRGMVNSFD VKLEHLLPHQLNDDIIKNIDKLKDKYGEEVSEDVINDREFKQFIEYINDLYELNYRQFSDEDKGRVIAFLNDFCKDDQKH SSRFTGGRILLLVLKACNDGDREAVKNKKDALITNLLDSQTFSRQERIPNTCFTGIVYRMLSTLEGIHPDPEIRFTPPRQ ILLPEAQNEARKFMLDRLKNKKNNKEIFKAWYDVQNGYEDDESQKIVDDFISEVSIPLMRKLLSITSQYSEQIVLTLMKN ISSIKLNKLQCCELVQHMRNKLQEHGLGDQESLLENIGKKVFLELLNRDLLETDFSLKDSSLDGAKRIANKIIIGEVEKF RSEAAEKAREVNSIEVQVDVTLRGLSTLPREKKCCIAYSRLSGQYEGDEREIMENILLKKLEITKKEMNKMLEENDIRKL KLALDDACKKSGKNMEEMIKEVEEVVSSRFSHEVSVSNIATESAHL >Mature_606_residues MIGISQIQFPSKDSSKLKFVSYFGAFVSLSIITNPVNVLFSLGTMFFRSEIKTLYIYKEIKTAKQQKMSKREYWEIFFKN NTIKVAAFLLFSAFITYLTFTTTFLLISLLGTIPLTMLLILLQSELRPKDFNPFTLLKASINFFLEGIKENLRGMVNSFD VKLEHLLPHQLNDDIIKNIDKLKDKYGEEVSEDVINDREFKQFIEYINDLYELNYRQFSDEDKGRVIAFLNDFCKDDQKH SSRFTGGRILLLVLKACNDGDREAVKNKKDALITNLLDSQTFSRQERIPNTCFTGIVYRMLSTLEGIHPDPEIRFTPPRQ ILLPEAQNEARKFMLDRLKNKKNNKEIFKAWYDVQNGYEDDESQKIVDDFISEVSIPLMRKLLSITSQYSEQIVLTLMKN ISSIKLNKLQCCELVQHMRNKLQEHGLGDQESLLENIGKKVFLELLNRDLLETDFSLKDSSLDGAKRIANKIIIGEVEKF RSEAAEKAREVNSIEVQVDVTLRGLSTLPREKKCCIAYSRLSGQYEGDEREIMENILLKKLEITKKEMNKMLEENDIRKL KLALDDACKKSGKNMEEMIKEVEEVVSSRFSHEVSVSNIATESAHL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70090; Mature: 70090
Theoretical pI: Translated: 6.94; Mature: 6.94
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIGISQIQFPSKDSSKLKFVSYFGAFVSLSIITNPVNVLFSLGTMFFRSEIKTLYIYKEI CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTAKQQKMSKREYWEIFFKNNTIKVAAFLLFSAFITYLTFTTTFLLISLLGTIPLTMLLI HHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLQSELRPKDFNPFTLLKASINFFLEGIKENLRGMVNSFDVKLEHLLPHQLNDDIIKNID HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH KLKDKYGEEVSEDVINDREFKQFIEYINDLYELNYRQFSDEDKGRVIAFLNDFCKDDQKH HHHHHHCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHCCCHHH SSRFTGGRILLLVLKACNDGDREAVKNKKDALITNLLDSQTFSRQERIPNTCFTGIVYRM HCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LSTLEGIHPDPEIRFTPPRQILLPEAQNEARKFMLDRLKNKKNNKEIFKAWYDVQNGYED HHHHCCCCCCCCEEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC DESQKIVDDFISEVSIPLMRKLLSITSQYSEQIVLTLMKNISSIKLNKLQCCELVQHMRN CHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH KLQEHGLGDQESLLENIGKKVFLELLNRDLLETDFSLKDSSLDGAKRIANKIIIGEVEKF HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH RSEAAEKAREVNSIEVQVDVTLRGLSTLPREKKCCIAYSRLSGQYEGDEREIMENILLKK HHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH LEITKKEMNKMLEENDIRKLKLALDDACKKSGKNMEEMIKEVEEVVSSRFSHEVSVSNIA HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH TESAHL HHCCCC >Mature Secondary Structure MIGISQIQFPSKDSSKLKFVSYFGAFVSLSIITNPVNVLFSLGTMFFRSEIKTLYIYKEI CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTAKQQKMSKREYWEIFFKNNTIKVAAFLLFSAFITYLTFTTTFLLISLLGTIPLTMLLI HHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLQSELRPKDFNPFTLLKASINFFLEGIKENLRGMVNSFDVKLEHLLPHQLNDDIIKNID HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH KLKDKYGEEVSEDVINDREFKQFIEYINDLYELNYRQFSDEDKGRVIAFLNDFCKDDQKH HHHHHHCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHCCCHHH SSRFTGGRILLLVLKACNDGDREAVKNKKDALITNLLDSQTFSRQERIPNTCFTGIVYRM HCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LSTLEGIHPDPEIRFTPPRQILLPEAQNEARKFMLDRLKNKKNNKEIFKAWYDVQNGYED HHHHCCCCCCCCEEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC DESQKIVDDFISEVSIPLMRKLLSITSQYSEQIVLTLMKNISSIKLNKLQCCELVQHMRN CHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH KLQEHGLGDQESLLENIGKKVFLELLNRDLLETDFSLKDSSLDGAKRIANKIIIGEVEKF HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH RSEAAEKAREVNSIEVQVDVTLRGLSTLPREKKCCIAYSRLSGQYEGDEREIMENILLKK HHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH LEITKKEMNKMLEENDIRKLKLALDDACKKSGKNMEEMIKEVEEVVSSRFSHEVSVSNIA HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH TESAHL HHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA