| Definition | Wolbachia sp. wRi, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012416 |
| Length | 1,445,873 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 225630626
Identifier: 225630626
GI number: 225630626
Start: 974051
End: 975517
Strand: Direct
Name: 225630626
Synonym: WRi_008980
Alternate gene names: NA
Gene position: 974051-975517 (Clockwise)
Preceding gene: 225630624
Following gene: 225630627
Centisome position: 67.37
GC content: 33.67
Gene sequence:
>1467_bases ATGAATCCGAGATTAAAAGCATTTTTGGTTGTTTGTAGTATTATTGCATTTTTGATTGCACTTTTGTTTCTCGTGTATTA TTTAAATCTTCTTGTTAACTATATCCTTGACCCGATTCTAGTTCGTCCCTTTGAAAGATTATACAAAAACTTAATTGTTG ATGGTCTTTATGCCTATTTATCTACAAGCACTTCTAGCCCTGCACTAGCATTTTTGGCTACAGGTTTTATTGTTATTGCT GCGTTTATTTGCCTGAATAAAATGCTTCTTCCCTTGCAAGAGAAGATCATAAACAACTATACCTCCTTTAAAAACAACAA TATTGATAGCAATAGCATGTTGTTTGAGGTTTATAAAGATCCAACAATAAAATTAAAGGACAAAATCTTATTCTTCAGTA TACACTTGATATATTACCTACAGCTTCCATTTTTGTACATTGCATCAAAGGTATCAGCTCTACGTGAGTTTCTTATATTT AATTTTGGTTTATTATTGTTAAATTATGCACTGCTAATTCCAGTAGCACTTCTTGAGTTAATAAAATATCCATCAGTAAA ACTCTTTTCACCTTTGGGTTTGAATGTAAAGCAGCTAAGCTTTTTGTTTAATGTAAGTGATGTGGGCACTGGTAGTCAAA GTGTTCATACTAGAAGTTTTGAAGAAAGCACCATTAAATGTGCTAAAGAATTAAAGGAAAAATATGGGGCACCATCAAAT GAGTTAGATGAAGAGTTTAAAAGTTATATAAGCGGTTTAACAAGTCAGCAAAAACGAATGATAGAACCTTATCTAAGATT GGATGGTTATGAAACTGGGGAGTGGGTAAATTGGGTAGATTCAAAAACCGGATTGACATTGACACAGGCTATAAATTTAG TTTTAATTGCGGCAAGAAAGCAAAATTCAGACGTAGAACTATTGAAATCTATATTACTGGTTCGCTTTGATGAAAGTAAC CGCCAATGTGGTCCTGGAATGCTTCTCCGCATTATTTATGCATTAAATGGCCTTGAAGCAGAAAACAACTTTGCAGCTCA ACTAGAGCCTTGGCAAATAGGAGAGTTGGCTAGGTATACTACTAAAAGATTTTTTGAGAGATATGTGGATAAGCATTACT ATAAGATAAAAGTTTTGAAAGAAAATTTTGATGATTTGTATTCACCAAGTTCTGAAGTGGATTTGAGCAACGTGAGTGAT GAAGTAAAGGACGGCATTTCTTATACAAGAGATGCTATAAAAGAATTTGTGTTTAAGGAATTATATGTAAAGTTTTATAA CGACTATGGGGAGCATATTCAGAGAGGGCAGATAAAACAAAGGTTAAGGGAGTTAATAACGGATGAAGTCGTAGACGCGG CAATATATTCTAAAATAGATGAAATAGAAATCCCTGCAGAACCACCTACTTATCTTGAAAGAGTAAAAGCATTTTTTGGA GGTCATGCAAGGTCTTCTGCTGCTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAACTCAGAAATTTCAATTGATCTTTTAACATAAAAACTTGCATTTTTTTCAATTTATTCCTAAAATAGATTATATTAA CAGATTATTAAGAGGGGGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGGTTTAGTTCGTGCTATATAGCTAAACTGACTTAGATTTACTGACAATTTTAAAACAACAAATTCGTCATTCCGCTACT AGTTAGCGGAATCTATACCG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488
Protein sequence:
>488_residues MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYLSTSTSSPALAFLATGFIVIA AFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKDPTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALREFLIF NFGLLLLNYALLIPVALLELIKYPSVKLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTRSFEESTIKCAKELKEKYGAPSN ELDEEFKSYISGLTSQQKRMIEPYLRLDGYETGEWVNWVDSKTGLTLTQAINLVLIAARKQNSDVELLKSILLVRFDESN RQCGPGMLLRIIYALNGLEAENNFAAQLEPWQIGELARYTTKRFFERYVDKHYYKIKVLKENFDDLYSPSSEVDLSNVSD EVKDGISYTRDAIKEFVFKELYVKFYNDYGEHIQRGQIKQRLRELITDEVVDAAIYSKIDEIEIPAEPPTYLERVKAFFG GHARSSAA
Sequences:
>Translated_488_residues MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYLSTSTSSPALAFLATGFIVIA AFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKDPTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALREFLIF NFGLLLLNYALLIPVALLELIKYPSVKLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTRSFEESTIKCAKELKEKYGAPSN ELDEEFKSYISGLTSQQKRMIEPYLRLDGYETGEWVNWVDSKTGLTLTQAINLVLIAARKQNSDVELLKSILLVRFDESN RQCGPGMLLRIIYALNGLEAENNFAAQLEPWQIGELARYTTKRFFERYVDKHYYKIKVLKENFDDLYSPSSEVDLSNVSD EVKDGISYTRDAIKEFVFKELYVKFYNDYGEHIQRGQIKQRLRELITDEVVDAAIYSKIDEIEIPAEPPTYLERVKAFFG GHARSSAA >Mature_488_residues MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYLSTSTSSPALAFLATGFIVIA AFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKDPTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALREFLIF NFGLLLLNYALLIPVALLELIKYPSVKLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTRSFEESTIKCAKELKEKYGAPSN ELDEEFKSYISGLTSQQKRMIEPYLRLDGYETGEWVNWVDSKTGLTLTQAINLVLIAARKQNSDVELLKSILLVRFDESN RQCGPGMLLRIIYALNGLEAENNFAAQLEPWQIGELARYTTKRFFERYVDKHYYKIKVLKENFDDLYSPSSEVDLSNVSD EVKDGISYTRDAIKEFVFKELYVKFYNDYGEHIQRGQIKQRLRELITDEVVDAAIYSKIDEIEIPAEPPTYLERVKAFFG GHARSSAA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 55999; Mature: 55999
Theoretical pI: Translated: 6.69; Mature: 6.69
Prosite motif: PS00443 GATASE_TYPE_II
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH STSTSSPALAFLATGFIVIAAFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKD HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECC PTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALREFLIFNFGLLLLNYALLIPVALLEL CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKYPSVKLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTRSFEESTIKCAKELKEKYGAPSN HCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH ELDEEFKSYISGLTSQQKRMIEPYLRLDGYETGEWVNWVDSKTGLTLTQAINLVLIAARK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHEEEECC QNSDVELLKSILLVRFDESNRQCGPGMLLRIIYALNGLEAENNFAAQLEPWQIGELARYT CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH TKRFFERYVDKHYYKIKVLKENFDDLYSPSSEVDLSNVSDEVKDGISYTRDAIKEFVFKE HHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYVKFYNDYGEHIQRGQIKQRLRELITDEVVDAAIYSKIDEIEIPAEPPTYLERVKAFFG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHC GHARSSAA CCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH STSTSSPALAFLATGFIVIAAFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKD HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECC PTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALREFLIFNFGLLLLNYALLIPVALLEL CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKYPSVKLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTRSFEESTIKCAKELKEKYGAPSN HCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH ELDEEFKSYISGLTSQQKRMIEPYLRLDGYETGEWVNWVDSKTGLTLTQAINLVLIAARK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHEEEECC QNSDVELLKSILLVRFDESNRQCGPGMLLRIIYALNGLEAENNFAAQLEPWQIGELARYT CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH TKRFFERYVDKHYYKIKVLKENFDDLYSPSSEVDLSNVSDEVKDGISYTRDAIKEFVFKE HHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYVKFYNDYGEHIQRGQIKQRLRELITDEVVDAAIYSKIDEIEIPAEPPTYLERVKAFFG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHC GHARSSAA CCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA