| Definition | Wolbachia sp. wRi, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012416 |
| Length | 1,445,873 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 225630138
Identifier: 225630138
GI number: 225630138
Start: 343873
End: 346362
Strand: Reverse
Name: 225630138
Synonym: WRi_003200
Alternate gene names: NA
Gene position: 346362-343873 (Counterclockwise)
Preceding gene: 225630139
Following gene: 225630135
Centisome position: 23.96
GC content: 32.37
Gene sequence:
>2490_bases ATGAATAAAGCTGTTGCAGATGATTATGAAGAAGTTGTTAACAATAGTGGTGGTTTAGGTAAAGCAGAATCTGTTGTTAC TTTGGAGGAGGAAGAAGAGTTTTTTGATGCTATGGAAGCTGTTTCTAATGTAGAAGAAGGGAATAATTTAGGTCTTGCTA CTTCAGAAGAGGAAGAAGAATTTTTTGATGCTGTGGAAGAACAAGAGCCGTTAGCTAATTTTAACGTTCCACTCAGTATA TTTCATTATAAAGATTATAACTCTGATTTTTTTACTTCCTGGTATAATATATCAAGCGAAATATTTAAGGAAATAAATAG AACTTGCCCAGAAAAGAAAATATTAAATTTAGCTCTGTCAGTTTTAATGCTTCCTTATATTGCTTTTACTGCACTGGGAT TAGTCGTATGCAGTAGATTTCAAGCAAACAGCAAGACACAAGACAGTGTAGGGGAAGATAAGACAAAAAAGAGTGAAACT GGCGTGCCAAAAAGATTGGCATATGGTGTTCTTGCTGCAATAGCAATTTTTGTTAATATGGCTGTACTTGTAGCCTTAGT TGTTCCTGCAACAATTGCTTTGGCTACTTTTTATCTTTTAAATAGAGATTTATCTCACTCTTTAGTTACTGCTCTTAAAA TAAGTATGGGGCGGTATTCTAATAAGCATCAAAATATTGAGGTGTCTTTTCATGAAAAGGAAGTTACTGGACCAAATATT GCGTGGGATATGGAAATAGAATTTCCACCGCAATTTAAACGATTGCTTAGAGATTTGTATGAAAATGAAAATAACAAGTG GTTTGATGTGACGCGGAATTCAGAGCATAGCATCGTACTGAAATTGTCAACTAACATCAATTTAAAAAATGGTCTTAAGC CCTTACGCAATGAAATCAAGGATGTGCTTGCAACTTCTATTCAGGAATTTGCGAAGACTATGGAAGAACTGATAAAGCTA GAAAAGAAAGAGATTACATATGATAAATTGAAGGAATTATTGAACGAATTCAAGTCGAAAGTGGTAGATAGTATAGGTCC TAATTTGACAAGTCACTTAATACAAAGTGCTTATCAAGTTGCCTTTATACAAGCAATTAAGTTTCAGCGAGATAGACGGG GAGAAGATTTTTCGCTGGAAGATGAGATAAAAAATTCTTTAGTGAGACAGGAATTAGAGAGTTTAAGAGGAATAGGTCAA ACAAGGTGTAACGATATATATAAGAAATTAAAAGAAATACATGAAAACAGTAGCTTAACAAATGACACCTTAAAAAGGGG GTTAGAAGACCTTTTTAAATTCGAATATGATGATCAAGAGATTGAGCGCAGGCTGATAAAATCAGTAATGAAAAAAGTTC AAGGTAAGTTAAGTCAATCAGATATACCGGATAAGGAGAAGCAAAGCCTAAGGAAGCAGCTTGAAGATTTAGAAAAAAAA GTAAAGGTTCCATCGGATAAGGAAGCTTCAGCTAAAATAAATGACTTTATAGAAAAGATGTATTTAGAAATAAAAAAATA TAAAGTGCAAAGGTTACTTCGAGAACAAAAAAAGGGTGTTTTACGTTTATGCAAGAAATTAAGAAAATATGGTGAATCAG GTCTAGCAGAAATAATTGAAGCTTTTCGCGTGCAAGATGAAGGACATTTAGAAAAATCTACATTAGAACAAACACTCAAA GATCAAAATAAGCGTTTACAAGCTGAACAAAATAACAGGGAAAAAGGGCATCCGGGTACAAGATCAATAGAAGTGCTCTT AAAAAGGAATGAAGAAATTCTGAAAGCATTAAAACAGTTAGAATTAGGCAAAAAAGAATTATTGATAAATGAAGAAACAA AAAATGATTATAAAGAAGAACTAACGTCTCGTGAAAAAATAAAATTTGCAGTAATAGAAGATGATTTACTGAAGGTATTC AAGCTTGAAACTTTTGATGAAAAAGAAATCAAGAAGTTATTAGAAAGAGCAGAACTGGAGTACTGTTTAGCAGAAAAACG CATCAAATATCCTGTAATTAAAACAAAAGATAATATCAAACATTTTAGTCAAAATTTATTGTCTCCTTTGATAGACAATT TGACAAAAAATATAATAAATAATATACCAGGAAATAGTGAAGGTTGTATACAGAAAGTTAAGAACTGGAGTAAAGTTATG TTTGGTGCAATAAAGATTGGAGCATCAAATGCTTATAAAGAGACTACAGAGAGAAAAGCGTTAAATGTGGCACATAATAC TTATAAAGAAGGAGAGACATTTCTTCAATGTTTTCAGTCAAATTATGAAGGTATTGGAGCCTTTTTAGGTAATTTATTTT CTGATGATGGGGTAACATTTAAAAATGATGTGTGGCCTAAAATAGAAGAGCATTTGCATGGAATGTGGGATAGATTTTTC AAGGATATTGAATTCAATATTGGAAATAAATTGGATGAAGTAAGTGTGACACAGCAACGGCAGGAAACTATGATTGTGAC TCAACGATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATCAGGATTTAAGTGTTAGTATTGAGCGTTAAATTTTTAATAAAGTTGCAAGATTGTCAGTATTTATGCTATACTTAAGG TAATTGGATAAGGTTATAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTTCTCAAAGTTCCTCCGGTATTTTCACATACTAAATTAACTATAGCACTTGATTCTTTTTGGATCTCTTTTTCAGTTAA AGTGTGGATTGGAGAGCAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 829; Mature: 829
Protein sequence:
>829_residues MNKAVADDYEEVVNNSGGLGKAESVVTLEEEEEFFDAMEAVSNVEEGNNLGLATSEEEEEFFDAVEEQEPLANFNVPLSI FHYKDYNSDFFTSWYNISSEIFKEINRTCPEKKILNLALSVLMLPYIAFTALGLVVCSRFQANSKTQDSVGEDKTKKSET GVPKRLAYGVLAAIAIFVNMAVLVALVVPATIALATFYLLNRDLSHSLVTALKISMGRYSNKHQNIEVSFHEKEVTGPNI AWDMEIEFPPQFKRLLRDLYENENNKWFDVTRNSEHSIVLKLSTNINLKNGLKPLRNEIKDVLATSIQEFAKTMEELIKL EKKEITYDKLKELLNEFKSKVVDSIGPNLTSHLIQSAYQVAFIQAIKFQRDRRGEDFSLEDEIKNSLVRQELESLRGIGQ TRCNDIYKKLKEIHENSSLTNDTLKRGLEDLFKFEYDDQEIERRLIKSVMKKVQGKLSQSDIPDKEKQSLRKQLEDLEKK VKVPSDKEASAKINDFIEKMYLEIKKYKVQRLLREQKKGVLRLCKKLRKYGESGLAEIIEAFRVQDEGHLEKSTLEQTLK DQNKRLQAEQNNREKGHPGTRSIEVLLKRNEEILKALKQLELGKKELLINEETKNDYKEELTSREKIKFAVIEDDLLKVF KLETFDEKEIKKLLERAELEYCLAEKRIKYPVIKTKDNIKHFSQNLLSPLIDNLTKNIINNIPGNSEGCIQKVKNWSKVM FGAIKIGASNAYKETTERKALNVAHNTYKEGETFLQCFQSNYEGIGAFLGNLFSDDGVTFKNDVWPKIEEHLHGMWDRFF KDIEFNIGNKLDEVSVTQQRQETMIVTQR
Sequences:
>Translated_829_residues MNKAVADDYEEVVNNSGGLGKAESVVTLEEEEEFFDAMEAVSNVEEGNNLGLATSEEEEEFFDAVEEQEPLANFNVPLSI FHYKDYNSDFFTSWYNISSEIFKEINRTCPEKKILNLALSVLMLPYIAFTALGLVVCSRFQANSKTQDSVGEDKTKKSET GVPKRLAYGVLAAIAIFVNMAVLVALVVPATIALATFYLLNRDLSHSLVTALKISMGRYSNKHQNIEVSFHEKEVTGPNI AWDMEIEFPPQFKRLLRDLYENENNKWFDVTRNSEHSIVLKLSTNINLKNGLKPLRNEIKDVLATSIQEFAKTMEELIKL EKKEITYDKLKELLNEFKSKVVDSIGPNLTSHLIQSAYQVAFIQAIKFQRDRRGEDFSLEDEIKNSLVRQELESLRGIGQ TRCNDIYKKLKEIHENSSLTNDTLKRGLEDLFKFEYDDQEIERRLIKSVMKKVQGKLSQSDIPDKEKQSLRKQLEDLEKK VKVPSDKEASAKINDFIEKMYLEIKKYKVQRLLREQKKGVLRLCKKLRKYGESGLAEIIEAFRVQDEGHLEKSTLEQTLK DQNKRLQAEQNNREKGHPGTRSIEVLLKRNEEILKALKQLELGKKELLINEETKNDYKEELTSREKIKFAVIEDDLLKVF KLETFDEKEIKKLLERAELEYCLAEKRIKYPVIKTKDNIKHFSQNLLSPLIDNLTKNIINNIPGNSEGCIQKVKNWSKVM FGAIKIGASNAYKETTERKALNVAHNTYKEGETFLQCFQSNYEGIGAFLGNLFSDDGVTFKNDVWPKIEEHLHGMWDRFF KDIEFNIGNKLDEVSVTQQRQETMIVTQR >Mature_829_residues MNKAVADDYEEVVNNSGGLGKAESVVTLEEEEEFFDAMEAVSNVEEGNNLGLATSEEEEEFFDAVEEQEPLANFNVPLSI FHYKDYNSDFFTSWYNISSEIFKEINRTCPEKKILNLALSVLMLPYIAFTALGLVVCSRFQANSKTQDSVGEDKTKKSET GVPKRLAYGVLAAIAIFVNMAVLVALVVPATIALATFYLLNRDLSHSLVTALKISMGRYSNKHQNIEVSFHEKEVTGPNI AWDMEIEFPPQFKRLLRDLYENENNKWFDVTRNSEHSIVLKLSTNINLKNGLKPLRNEIKDVLATSIQEFAKTMEELIKL EKKEITYDKLKELLNEFKSKVVDSIGPNLTSHLIQSAYQVAFIQAIKFQRDRRGEDFSLEDEIKNSLVRQELESLRGIGQ TRCNDIYKKLKEIHENSSLTNDTLKRGLEDLFKFEYDDQEIERRLIKSVMKKVQGKLSQSDIPDKEKQSLRKQLEDLEKK VKVPSDKEASAKINDFIEKMYLEIKKYKVQRLLREQKKGVLRLCKKLRKYGESGLAEIIEAFRVQDEGHLEKSTLEQTLK DQNKRLQAEQNNREKGHPGTRSIEVLLKRNEEILKALKQLELGKKELLINEETKNDYKEELTSREKIKFAVIEDDLLKVF KLETFDEKEIKKLLERAELEYCLAEKRIKYPVIKTKDNIKHFSQNLLSPLIDNLTKNIINNIPGNSEGCIQKVKNWSKVM FGAIKIGASNAYKETTERKALNVAHNTYKEGETFLQCFQSNYEGIGAFLGNLFSDDGVTFKNDVWPKIEEHLHGMWDRFF KDIEFNIGNKLDEVSVTQQRQETMIVTQR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 95611; Mature: 95611
Theoretical pI: Translated: 6.04; Mature: 6.04
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKAVADDYEEVVNNSGGLGKAESVVTLEEEEEFFDAMEAVSNVEEGNNLGLATSEEEEE CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHH FFDAVEEQEPLANFNVPLSIFHYKDYNSDFFTSWYNISSEIFKEINRTCPEKKILNLALS HHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH VLMLPYIAFTALGLVVCSRFQANSKTQDSVGEDKTKKSETGVPKRLAYGVLAAIAIFVNM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVLVALVVPATIALATFYLLNRDLSHSLVTALKISMGRYSNKHQNIEVSFHEKEVTGPNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCE AWDMEIEFPPQFKRLLRDLYENENNKWFDVTRNSEHSIVLKLSTNINLKNGLKPLRNEIK EEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEECCCCHHHCCHHHHHHHH DVLATSIQEFAKTMEELIKLEKKEITYDKLKELLNEFKSKVVDSIGPNLTSHLIQSAYQV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH AFIQAIKFQRDRRGEDFSLEDEIKNSLVRQELESLRGIGQTRCNDIYKKLKEIHENSSLT HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NDTLKRGLEDLFKFEYDDQEIERRLIKSVMKKVQGKLSQSDIPDKEKQSLRKQLEDLEKK HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VKVPSDKEASAKINDFIEKMYLEIKKYKVQRLLREQKKGVLRLCKKLRKYGESGLAEIIE CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH AFRVQDEGHLEKSTLEQTLKDQNKRLQAEQNNREKGHPGTRSIEVLLKRNEEILKALKQL HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH ELGKKELLINEETKNDYKEELTSREKIKFAVIEDDLLKVFKLETFDEKEIKKLLERAELE HCCCHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH YCLAEKRIKYPVIKTKDNIKHFSQNLLSPLIDNLTKNIINNIPGNSEGCIQKVKNWSKVM HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH FGAIKIGASNAYKETTERKALNVAHNTYKEGETFLQCFQSNYEGIGAFLGNLFSDDGVTF HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC KNDVWPKIEEHLHGMWDRFFKDIEFNIGNKLDEVSVTQQRQETMIVTQR CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCEECCCC >Mature Secondary Structure MNKAVADDYEEVVNNSGGLGKAESVVTLEEEEEFFDAMEAVSNVEEGNNLGLATSEEEEE CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHH FFDAVEEQEPLANFNVPLSIFHYKDYNSDFFTSWYNISSEIFKEINRTCPEKKILNLALS HHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH VLMLPYIAFTALGLVVCSRFQANSKTQDSVGEDKTKKSETGVPKRLAYGVLAAIAIFVNM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVLVALVVPATIALATFYLLNRDLSHSLVTALKISMGRYSNKHQNIEVSFHEKEVTGPNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCE AWDMEIEFPPQFKRLLRDLYENENNKWFDVTRNSEHSIVLKLSTNINLKNGLKPLRNEIK EEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEECCCCHHHCCHHHHHHHH DVLATSIQEFAKTMEELIKLEKKEITYDKLKELLNEFKSKVVDSIGPNLTSHLIQSAYQV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH AFIQAIKFQRDRRGEDFSLEDEIKNSLVRQELESLRGIGQTRCNDIYKKLKEIHENSSLT HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NDTLKRGLEDLFKFEYDDQEIERRLIKSVMKKVQGKLSQSDIPDKEKQSLRKQLEDLEKK HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VKVPSDKEASAKINDFIEKMYLEIKKYKVQRLLREQKKGVLRLCKKLRKYGESGLAEIIE CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH AFRVQDEGHLEKSTLEQTLKDQNKRLQAEQNNREKGHPGTRSIEVLLKRNEEILKALKQL HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH ELGKKELLINEETKNDYKEELTSREKIKFAVIEDDLLKVFKLETFDEKEIKKLLERAELE HCCCHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH YCLAEKRIKYPVIKTKDNIKHFSQNLLSPLIDNLTKNIINNIPGNSEGCIQKVKNWSKVM HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH FGAIKIGASNAYKETTERKALNVAHNTYKEGETFLQCFQSNYEGIGAFLGNLFSDDGVTF HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC KNDVWPKIEEHLHGMWDRFFKDIEFNIGNKLDEVSVTQQRQETMIVTQR CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCEECCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA