| Definition | Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011999 |
| Length | 2,102,324 |
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The map label for this gene is yqjV [H]
Identifier: 222151283
GI number: 222151283
Start: 1143678
End: 1144898
Strand: Direct
Name: yqjV [H]
Synonym: MCCL_1036
Alternate gene names: 222151283
Gene position: 1143678-1144898 (Clockwise)
Preceding gene: 222151281
Following gene: 222151284
Centisome position: 54.4
GC content: 35.95
Gene sequence:
>1221_bases ATGAAAATGAAAGTTCGTGATTTACCGATTAATATCCAGCTCAGATTGTGGGGTTCATTTGTCAATCGCTGTACTTATAG TGCGACACTACCATTTATTGCACTATATTTAACTGATCAGCTGAATGCAAGAATCGCTGGATTGTTTTTAGCATCAATCG TCTTTGTCCAGTTTATCAGTAATATTTGGGGAGGTTACTTAGTCGACCAATTTCCAAGAAAGAAGATGCTGATATTTGGT TCATTCACAGAAGCATTATCGCTATTATTTATGTGGCTAACCGTTGTCAACTCATGGATTTATCTATTTATGACGACATT TATACTCTTTACCATATTCAGTGCATTTCGCAGACCTTCTATGAGTGCGCTTGTACAGGATTCAGCAACAGATGAAAATA AGAAATTATTATATCGTATGGATTACTGGCTAATAAATTTATCACTGGCAATCGGAGCACTCCTGGGCGGGCTATTCTAT AGCGAACATAAAAGCTGGCTATTCTTTGCTTCAGCGATGGTGGCACTGATATTAAGTTTCTTATATATGAAATATATTGA AGAAACAAACAGCTTTATCCGTAAAAAAGAACATAATAATGTCTTTGTAGACCTGTTCATTGCCTATCAGACTGTCATTA AAGATAAACGATTCGTATTGATGGTAATCGGTACCATGCTCATTGCAACCGTGGAGCTCATGACAAGTACTTACGTTGCT GTAAGGCTTCATAAAAGCTTTGAAACGGTTTACTTATTCAACTTTGAAATTACCGGTGTTCGAATGTTTACAATCATTAA CCTCGTTAATACAATTACCGTTGTTTCATTCTCTTTACTAATTGGTAAATGGTTAGATAAATTTAAAGTAAGTAGAATCC TAGGATTTGGGCTATTGATGTACGCAATAGGATATGCTGTGCTCACTTCAGCAAATATGTGGTGGCTGATTATCATAGCT GTGCTTGCTGCAACATTTGGTGAAATGATTTTTGCGCCGATTAAAAGTGCTGAAATGCTGACGCTAATACCAAAAGAAAA ACGAGGTACCTATAATACATTCAGTTCATTCACGTTTAGTGGCGCACAGCTATTATCTAATGGGTCTTTAATCCTCGGAA CATATTTAAATCCATATGCGATGAGTGTAGTTGTGTTTGTGATTGTTACAATAGGGGCAATGCTCATGATGAATAGCTTG TTTAAAATGAAAAAGAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAATTGCTCCATAGCTCCTCCTAAAAGTGGACTAAAATAAAATATTGTCCATTTTTTAATCATTAAGTCTACTTTATCA TATGTATAAAGTTAGGGGGA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTACATAGATATAAAAACTTTCAGTAGATTGATAATTCCTTAGAAAATTTAATAAACTTTCAGTTAACTGAAAGTTTT TGTATTTTTCTTATCAACCA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 406; Mature: 406
Protein sequence:
>406_residues MKMKVRDLPINIQLRLWGSFVNRCTYSATLPFIALYLTDQLNARIAGLFLASIVFVQFISNIWGGYLVDQFPRKKMLIFG SFTEALSLLFMWLTVVNSWIYLFMTTFILFTIFSAFRRPSMSALVQDSATDENKKLLYRMDYWLINLSLAIGALLGGLFY SEHKSWLFFASAMVALILSFLYMKYIEETNSFIRKKEHNNVFVDLFIAYQTVIKDKRFVLMVIGTMLIATVELMTSTYVA VRLHKSFETVYLFNFEITGVRMFTIINLVNTITVVSFSLLIGKWLDKFKVSRILGFGLLMYAIGYAVLTSANMWWLIIIA VLAATFGEMIFAPIKSAEMLTLIPKEKRGTYNTFSSFTFSGAQLLSNGSLILGTYLNPYAMSVVVFVIVTIGAMLMMNSL FKMKKN
Sequences:
>Translated_406_residues MKMKVRDLPINIQLRLWGSFVNRCTYSATLPFIALYLTDQLNARIAGLFLASIVFVQFISNIWGGYLVDQFPRKKMLIFG SFTEALSLLFMWLTVVNSWIYLFMTTFILFTIFSAFRRPSMSALVQDSATDENKKLLYRMDYWLINLSLAIGALLGGLFY SEHKSWLFFASAMVALILSFLYMKYIEETNSFIRKKEHNNVFVDLFIAYQTVIKDKRFVLMVIGTMLIATVELMTSTYVA VRLHKSFETVYLFNFEITGVRMFTIINLVNTITVVSFSLLIGKWLDKFKVSRILGFGLLMYAIGYAVLTSANMWWLIIIA VLAATFGEMIFAPIKSAEMLTLIPKEKRGTYNTFSSFTFSGAQLLSNGSLILGTYLNPYAMSVVVFVIVTIGAMLMMNSL FKMKKN >Mature_406_residues MKMKVRDLPINIQLRLWGSFVNRCTYSATLPFIALYLTDQLNARIAGLFLASIVFVQFISNIWGGYLVDQFPRKKMLIFG SFTEALSLLFMWLTVVNSWIYLFMTTFILFTIFSAFRRPSMSALVQDSATDENKKLLYRMDYWLINLSLAIGALLGGLFY SEHKSWLFFASAMVALILSFLYMKYIEETNSFIRKKEHNNVFVDLFIAYQTVIKDKRFVLMVIGTMLIATVELMTSTYVA VRLHKSFETVYLFNFEITGVRMFTIINLVNTITVVSFSLLIGKWLDKFKVSRILGFGLLMYAIGYAVLTSANMWWLIIIA VLAATFGEMIFAPIKSAEMLTLIPKEKRGTYNTFSSFTFSGAQLLSNGSLILGTYLNPYAMSVVVFVIVTIGAMLMMNSL FKMKKN
Specific function: Unknown
COG id: COG0477
COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR020846 - InterPro: IPR011701 - InterPro: IPR016196 - InterPro: IPR005829 - InterPro: IPR001958 [H]
Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46437; Mature: 46437
Theoretical pI: Translated: 10.15; Mature: 10.15
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 5.4 %Met (Translated Protein) 5.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 5.4 %Met (Mature Protein) 5.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKMKVRDLPINIQLRLWGSFVNRCTYSATLPFIALYLTDQLNARIAGLFLASIVFVQFIS CCCEEEECCEEEEEEEHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIWGGYLVDQFPRKKMLIFGSFTEALSLLFMWLTVVNSWIYLFMTTFILFTIFSAFRRPS HHHCCHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC MSALVQDSATDENKKLLYRMDYWLINLSLAIGALLGGLFYSEHKSWLFFASAMVALILSF HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LYMKYIEETNSFIRKKEHNNVFVDLFIAYQTVIKDKRFVLMVIGTMLIATVELMTSTYVA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VRLHKSFETVYLFNFEITGVRMFTIINLVNTITVVSFSLLIGKWLDKFKVSRILGFGLLM EEEECCCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YAIGYAVLTSANMWWLIIIAVLAATFGEMIFAPIKSAEMLTLIPKEKRGTYNTFSSFTFS HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHCCCC GAQLLSNGSLILGTYLNPYAMSVVVFVIVTIGAMLMMNSLFKMKKN CHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKMKVRDLPINIQLRLWGSFVNRCTYSATLPFIALYLTDQLNARIAGLFLASIVFVQFIS CCCEEEECCEEEEEEEHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIWGGYLVDQFPRKKMLIFGSFTEALSLLFMWLTVVNSWIYLFMTTFILFTIFSAFRRPS HHHCCHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC MSALVQDSATDENKKLLYRMDYWLINLSLAIGALLGGLFYSEHKSWLFFASAMVALILSF HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LYMKYIEETNSFIRKKEHNNVFVDLFIAYQTVIKDKRFVLMVIGTMLIATVELMTSTYVA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VRLHKSFETVYLFNFEITGVRMFTIINLVNTITVVSFSLLIGKWLDKFKVSRILGFGLLM EEEECCCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YAIGYAVLTSANMWWLIIIAVLAATFGEMIFAPIKSAEMLTLIPKEKRGTYNTFSSFTFS HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHCCCC GAQLLSNGSLILGTYLNPYAMSVVVFVIVTIGAMLMMNSLFKMKKN CHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8969508; 9384377 [H]