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The map label for this gene is 220933117

Identifier: 220933117

GI number: 220933117

Start: 2495144

End: 2496643

Strand: Reverse

Name: 220933117

Synonym: Hore_22850

Alternate gene names: NA

Gene position: 2496643-2495144 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220933118

Following gene: 220933116

Centisome position: 96.84

GC content: 28.73

Gene sequence:

>1500_bases
ATGGAAGAAGAACTGTTAGATGTAACTAAAAAATCAGGGGTAGTTTTCATTGGTCGCATAATAGGGGTTTTATTCGGGCT
TGTATTTAATTTCATAGTCGCCCGATATATGGGTGCTGAAGCCTATGGAAGGTTTATGTATGTCTATACTTTTATTAGTT
TTTTCCCAATTATAACCAGGTTTGGGCTGGACCAGGGCCTGGTCTCATTTTTGCCACCATTGGTTGATGATAATAAAGTG
GAAGAACGTAATGGATTAATAACCTCATCAATATTATTTACCTTAATAACTGGTTTTGTTTTATCTACTATAATCATAAC
TAATAGTAAATTTATTGCCACAAATATATTAAATAGTCCGGAGTTAGTGGATTTAATTAGATATTCTACGCCTTTATTAA
TTTTACTAGCTTTTACGCAGTTATCCCGGGGCATATTCAGGGGAATAGGAATAATAAAATATTTTGTTCAGGGTCAAAAT
ATACTAACTCCCATAGTAAAAATAGCCTGTATAATAACATTTTCATTTCTAGGATTTAAAATTTATGGTATATTAATTTC
TTTCTATATATCTTTAGGTTTAACCAGTCTATATTTATTTTATAAAATTTTAAAAATGGGATTTTTAAGTAGTATTAAAT
CTATTAATCATGGTCTATTAAAAGATGTATTCCGGTTTTCTTTTCCATTGTTGTTGACAGGTTTATTAGGATTCTTAATA
AATAGAATTGATACATTTATGATTGGATATTTTCTCTCTGATGACAAAGTTGGCATTTACAACATAGCTCTAAGAATAGG
TACAATGAGCAGTTTTATCCTAATAGCTTTTAATACCATGTTTGCACCAATGATTTCTTCTTTACACCATAAAGGGGAAA
TGGATAAACTTGCAGCTATGTATAAAATAATTACAAAATGGATTTTAGCAATTAATTTAGTTGCTTTTTCTATTATTTTA
CTCTTTAACAGGGATATAATGCATCTGTTTGGAAAAGAGTTTATAGCTGGATCAACAGCTTTAGTATTAATATCAATAGG
TCAGGTTGTTAATGCTGGCGTGGGTTCTGCAGGATATATTAATGTTATGACAGGGCATCCTCATTATGAATTGTATACCA
ACATATTAGTTGTGGGTATGAATGTAACATTAAACTATGCTTTAATACCCAACTATGGAATAAATGGAGCAGCGGTTGCA
TCATTAATATCAGTATCACTAACCAATATAATAAAACTTTTATTAGTATATAAAGATCATAAAATTCATCCATATAATTT
TGATTATTTTAAAGTAGTTGGCTCTGTGACAATTAGTTTTATGTTGGTTTATTATTTAAATAATATTATACAAATTTTTT
GGCTTATTAAATTGTTATTATTAACATTCTTATTCTTTGTTATGACTGCAATAATATATTACTTCATAGGTGGTTTATCT
ACTGAAGACTTGCTTGTTTTAAAGAAATTAGTGGGAAAACTGTATTATAGAAAAAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGAGGTTAAGGAGATAAGGGAGATATTGCATAGGAATGGTATGGAAGAGTGTCTTTAATACATTATAATTTTATAAATA
AGAAAGGCATGGTATAATGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAAGTTTTAAGACATGGAAATTATCAAAATGGAAATGATGTAGGAGGTAAATTAATGAATAAAAACCCTATTTTTATA
TTAGGTGCACATAAATCTGG

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: Polysaccharide Efflux Transporter; Polysaccharide Biosynthesis Related Protein; Polysaccharide Biosynthesis-Like Protein; Polysaccharide Biosynthesis Associated Protein; Heteropolysaccharide Repeat-Containing Protein; Capsular Polysaccharide Biosynthesis Protein; Multi Antimicrobial Extrusion Protein MatE; Lipopolysaccharide O-Side Chain Biosynthesis Protein; O-Antigen And Teichoic Acid Export Protein; Transporter Protein; Methyltransferase FkbM Family; Lipopolysaccharide Biosynthesis Protein; Virulence Factor MVIN Family Protein; Polysaccharide Biosynthesis Family Protein; PST Family Polysaccharide Export Protein; MatE Family; O-Antigen Flippase; Polysaccharide Biosynthesis Transporter

Number of amino acids: Translated: 499; Mature: 499

Protein sequence:

>499_residues
MEEELLDVTKKSGVVFIGRIIGVLFGLVFNFIVARYMGAEAYGRFMYVYTFISFFPIITRFGLDQGLVSFLPPLVDDNKV
EERNGLITSSILFTLITGFVLSTIIITNSKFIATNILNSPELVDLIRYSTPLLILLAFTQLSRGIFRGIGIIKYFVQGQN
ILTPIVKIACIITFSFLGFKIYGILISFYISLGLTSLYLFYKILKMGFLSSIKSINHGLLKDVFRFSFPLLLTGLLGFLI
NRIDTFMIGYFLSDDKVGIYNIALRIGTMSSFILIAFNTMFAPMISSLHHKGEMDKLAAMYKIITKWILAINLVAFSIIL
LFNRDIMHLFGKEFIAGSTALVLISIGQVVNAGVGSAGYINVMTGHPHYELYTNILVVGMNVTLNYALIPNYGINGAAVA
SLISVSLTNIIKLLLVYKDHKIHPYNFDYFKVVGSVTISFMLVYYLNNIIQIFWLIKLLLLTFLFFVMTAIIYYFIGGLS
TEDLLVLKKLVGKLYYRKK

Sequences:

>Translated_499_residues
MEEELLDVTKKSGVVFIGRIIGVLFGLVFNFIVARYMGAEAYGRFMYVYTFISFFPIITRFGLDQGLVSFLPPLVDDNKV
EERNGLITSSILFTLITGFVLSTIIITNSKFIATNILNSPELVDLIRYSTPLLILLAFTQLSRGIFRGIGIIKYFVQGQN
ILTPIVKIACIITFSFLGFKIYGILISFYISLGLTSLYLFYKILKMGFLSSIKSINHGLLKDVFRFSFPLLLTGLLGFLI
NRIDTFMIGYFLSDDKVGIYNIALRIGTMSSFILIAFNTMFAPMISSLHHKGEMDKLAAMYKIITKWILAINLVAFSIIL
LFNRDIMHLFGKEFIAGSTALVLISIGQVVNAGVGSAGYINVMTGHPHYELYTNILVVGMNVTLNYALIPNYGINGAAVA
SLISVSLTNIIKLLLVYKDHKIHPYNFDYFKVVGSVTISFMLVYYLNNIIQIFWLIKLLLLTFLFFVMTAIIYYFIGGLS
TEDLLVLKKLVGKLYYRKK
>Mature_499_residues
MEEELLDVTKKSGVVFIGRIIGVLFGLVFNFIVARYMGAEAYGRFMYVYTFISFFPIITRFGLDQGLVSFLPPLVDDNKV
EERNGLITSSILFTLITGFVLSTIIITNSKFIATNILNSPELVDLIRYSTPLLILLAFTQLSRGIFRGIGIIKYFVQGQN
ILTPIVKIACIITFSFLGFKIYGILISFYISLGLTSLYLFYKILKMGFLSSIKSINHGLLKDVFRFSFPLLLTGLLGFLI
NRIDTFMIGYFLSDDKVGIYNIALRIGTMSSFILIAFNTMFAPMISSLHHKGEMDKLAAMYKIITKWILAINLVAFSIIL
LFNRDIMHLFGKEFIAGSTALVLISIGQVVNAGVGSAGYINVMTGHPHYELYTNILVVGMNVTLNYALIPNYGINGAAVA
SLISVSLTNIIKLLLVYKDHKIHPYNFDYFKVVGSVTISFMLVYYLNNIIQIFWLIKLLLLTFLFFVMTAIIYYFIGGLS
TEDLLVLKKLVGKLYYRKK

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56197; Mature: 56197

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEEELLDVTKKSGVVFIGRIIGVLFGLVFNFIVARYMGAEAYGRFMYVYTFISFFPIITR
CCCHHHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGLDQGLVSFLPPLVDDNKVEERNGLITSSILFTLITGFVLSTIIITNSKFIATNILNSP
HCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHCCCCC
ELVDLIRYSTPLLILLAFTQLSRGIFRGIGIIKYFVQGQNILTPIVKIACIITFSFLGFK
HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYGILISFYISLGLTSLYLFYKILKMGFLSSIKSINHGLLKDVFRFSFPLLLTGLLGFLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRIDTFMIGYFLSDDKVGIYNIALRIGTMSSFILIAFNTMFAPMISSLHHKGEMDKLAAM
HHHHHHHHHHEECCCCCCCEEHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
YKIITKWILAINLVAFSIILLFNRDIMHLFGKEFIAGSTALVLISIGQVVNAGVGSAGYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
NVMTGHPHYELYTNILVVGMNVTLNYALIPNYGINGAAVASLISVSLTNIIKLLLVYKDH
EEEECCCCHHHHHHHHEEEECEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KIHPYNFDYFKVVGSVTISFMLVYYLNNIIQIFWLIKLLLLTFLFFVMTAIIYYFIGGLS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
TEDLLVLKKLVGKLYYRKK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEEELLDVTKKSGVVFIGRIIGVLFGLVFNFIVARYMGAEAYGRFMYVYTFISFFPIITR
CCCHHHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGLDQGLVSFLPPLVDDNKVEERNGLITSSILFTLITGFVLSTIIITNSKFIATNILNSP
HCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHCCCCC
ELVDLIRYSTPLLILLAFTQLSRGIFRGIGIIKYFVQGQNILTPIVKIACIITFSFLGFK
HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYGILISFYISLGLTSLYLFYKILKMGFLSSIKSINHGLLKDVFRFSFPLLLTGLLGFLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRIDTFMIGYFLSDDKVGIYNIALRIGTMSSFILIAFNTMFAPMISSLHHKGEMDKLAAM
HHHHHHHHHHEECCCCCCCEEHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
YKIITKWILAINLVAFSIILLFNRDIMHLFGKEFIAGSTALVLISIGQVVNAGVGSAGYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
NVMTGHPHYELYTNILVVGMNVTLNYALIPNYGINGAAVASLISVSLTNIIKLLLVYKDH
EEEECCCCHHHHHHHHEEEECEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KIHPYNFDYFKVVGSVTISFMLVYYLNNIIQIFWLIKLLLLTFLFFVMTAIIYYFIGGLS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
TEDLLVLKKLVGKLYYRKK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA