Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is rpfG [H]

Identifier: 220932429

GI number: 220932429

Start: 1706269

End: 1708425

Strand: Reverse

Name: rpfG [H]

Synonym: Hore_15930

Alternate gene names: 220932429

Gene position: 1708425-1706269 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220932430

Following gene: 220932428

Centisome position: 66.27

GC content: 35.7

Gene sequence:

>2157_bases
ATGGTAAAAAGTAAGAGTATTAAAAAAGTCGTTAAAAGTAATAGAGTTGTTTTAAAGTTTCTGGTAGTACTTATTATATT
TACATATGGGCTTTATATTTATAATATTTATGCCACTACCCGGAAATCAGTAAGGAGTCTTTATGAATTAAATTACAATA
TGCTAAATAATTATATAAATAAATCTATTCGACAGACAAAGGAAGTTTCTGCTTTACCCCTTCATCTTATTCCTAATTTT
GTTAAATTTAATGAAAATGTTCATTCAGTCCATATCATTGACCAACAGGGGGTCATTACCTATTCCTATCCATATAAAAG
CCTGGTTGATGTTTCCTATAATAACCTTCCCATTATAGTAAGAGCCCTGGAGACAGGGGAGTTACAGACTCAGATTCTTT
CTTATAGCCTCGGGCAATACGGAACTGCCCTGGGGATTGTTTATCCGGTCGATAATAAATTATATATGGTTAATTATTCC
TTTAACCCGGTTTTTCATGAGATTTCCAATTCATCACTGTTTGTTACCACAGACAGTAGAGGAAATATAATTATAACTAA
TTCCTCCGGGGGGCTTTTTCCAACCAATTTATCCAGAAAAGATGGTATAATACCTTTAGAAAAACTTGTAGTTATTAACA
GGGAGATGAAATCAATTTCCAGCAGGTTATATTTTGTATATTATATAGATGAATATATTAATAGGGCCTTTGATTTAGGC
CTGTTATCCCTGTTTTTACTTTCTATAATTGTCTTTGTGTTCCGTTTTTCGCGGAATAATTACCGGGTGATTATGGAAGA
TATCCAGTTACTTGAAAATAAATCGAGAGATTTAATAAATGCTATAGAAGGCCATCGTAGTAAACTGGTAAAGATAGATA
AAGAATTTAATGCTATGAATTTACTCGGTCAGACCCTGGAGAAAGCAAAGACTAATTTCAGGGAAACAAAATATGCCTTT
ACCTCATACAAAAAGATGGTTAATGAGATGTTGCGGTTACTGGAAGAAGTTACTATGCAGAATGAAGAAATTTCAGCAAT
GAATCAGGAAATATCAGTTTCCTATGAGGCCATTAACACATACCAGAATAAGATACTGGCGATTATCGATCTCTTGAGCA
AAATAGACCCTGAAGCTCCTTTGAAAGGGTTTTTGCAGGATATTGTTCAGCTTGCGGTGGAATTAATACCTGCTGCCGAT
GCCGGTAGTGCCGGTATAAAAGAGGGAAAATATTTTAAGTTTCTGGCCCAGTATGGGTATGATGATTTACTGACAGAAGT
TGATTTTCCCGAAGAAATCCTCATGTGCAGTGAAAATCCGGTTATCTTTAAAAATGTTAATAATAGTTACCTGGAAAAAA
ATCCAGAAGAATATAAAAGGGTATTTGCTGAGGTAGGCTCCAGTAGAATAAAATCAACCCTGGTGGTTGGTTTAAAAACT
CAGGACATTATCGGTAATATTTTTATCGATACTTTTCAGGCAGAAAAAGAATTTACCAGTGAAGATAAAAGGGTGCTTGA
GGCTATATCCAAGGTTTCATCTATATTAATATACCTTAAATTATCCTTAACTGAACTTGATGAGACATATCTAGGTGTTA
TTAAGGCCCTGGCCGATGCCGTTGAATTGAAAGATAAATATACTAAAGGTCACTCTGAAAGGGTTGCCAGATATAGTTTG
AAACTGGGGGAATACCTCAATTTATCACCAGAACGGCTAAGGGTTTTAAAAGAAGCAGCTCTTTTACATGACATAGGGAA
AATAGGTGTCCCTGATTTGATATTAAATAAACCGGGTAAATTAAATGACAGGGAATATGTCCAGGTCAGAAAGCATTCTG
TTTATGGAAGCAGGATTCTGGAAAATGTCAATAACTTTGAGCGGGTGGCCAGTATAGTCAGGCACCACCATGAAAGATGG
GATGGTCATGGTTACCCCGATGGGCTTAAAGGTAAAGAAATCCCTCTGGAATCAAGGATTATAGCATTATTTGATGCCTT
TGATACTATATTGACCAGTCGATCTTACAAAGATGCTTTACCCTTTGAGTATGCTATTAAGGAAGTCAGGGAGAATGCTG
GAACTCAGTTTGACCCGGAACTGACCGGAAAATTTTTAGATGTTGTAACTGAAGAGTGGGTACTTAGTTCATCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTGAAGATGGGCTAGTTTATAGAAAAATTTCAATACTTACAGTAAATAATAGCAGATTCGTAACTGACCGGGTAATTAA
TACAGAGAGAGGTCGTCGGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAGGTGTTGTTTTAAATGGTTGATTCCTTAAAATTTTGCAAAAAAATGCTGCCAAAGGTTTCAAGAAGTTTTGCCCTTA
CCATACCATTACTTGATGAT

Product: metal dependent phosphohydrolase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 718; Mature: 718

Protein sequence:

>718_residues
MVKSKSIKKVVKSNRVVLKFLVVLIIFTYGLYIYNIYATTRKSVRSLYELNYNMLNNYINKSIRQTKEVSALPLHLIPNF
VKFNENVHSVHIIDQQGVITYSYPYKSLVDVSYNNLPIIVRALETGELQTQILSYSLGQYGTALGIVYPVDNKLYMVNYS
FNPVFHEISNSSLFVTTDSRGNIIITNSSGGLFPTNLSRKDGIIPLEKLVVINREMKSISSRLYFVYYIDEYINRAFDLG
LLSLFLLSIIVFVFRFSRNNYRVIMEDIQLLENKSRDLINAIEGHRSKLVKIDKEFNAMNLLGQTLEKAKTNFRETKYAF
TSYKKMVNEMLRLLEEVTMQNEEISAMNQEISVSYEAINTYQNKILAIIDLLSKIDPEAPLKGFLQDIVQLAVELIPAAD
AGSAGIKEGKYFKFLAQYGYDDLLTEVDFPEEILMCSENPVIFKNVNNSYLEKNPEEYKRVFAEVGSSRIKSTLVVGLKT
QDIIGNIFIDTFQAEKEFTSEDKRVLEAISKVSSILIYLKLSLTELDETYLGVIKALADAVELKDKYTKGHSERVARYSL
KLGEYLNLSPERLRVLKEAALLHDIGKIGVPDLILNKPGKLNDREYVQVRKHSVYGSRILENVNNFERVASIVRHHHERW
DGHGYPDGLKGKEIPLESRIIALFDAFDTILTSRSYKDALPFEYAIKEVRENAGTQFDPELTGKFLDVVTEEWVLSSS

Sequences:

>Translated_718_residues
MVKSKSIKKVVKSNRVVLKFLVVLIIFTYGLYIYNIYATTRKSVRSLYELNYNMLNNYINKSIRQTKEVSALPLHLIPNF
VKFNENVHSVHIIDQQGVITYSYPYKSLVDVSYNNLPIIVRALETGELQTQILSYSLGQYGTALGIVYPVDNKLYMVNYS
FNPVFHEISNSSLFVTTDSRGNIIITNSSGGLFPTNLSRKDGIIPLEKLVVINREMKSISSRLYFVYYIDEYINRAFDLG
LLSLFLLSIIVFVFRFSRNNYRVIMEDIQLLENKSRDLINAIEGHRSKLVKIDKEFNAMNLLGQTLEKAKTNFRETKYAF
TSYKKMVNEMLRLLEEVTMQNEEISAMNQEISVSYEAINTYQNKILAIIDLLSKIDPEAPLKGFLQDIVQLAVELIPAAD
AGSAGIKEGKYFKFLAQYGYDDLLTEVDFPEEILMCSENPVIFKNVNNSYLEKNPEEYKRVFAEVGSSRIKSTLVVGLKT
QDIIGNIFIDTFQAEKEFTSEDKRVLEAISKVSSILIYLKLSLTELDETYLGVIKALADAVELKDKYTKGHSERVARYSL
KLGEYLNLSPERLRVLKEAALLHDIGKIGVPDLILNKPGKLNDREYVQVRKHSVYGSRILENVNNFERVASIVRHHHERW
DGHGYPDGLKGKEIPLESRIIALFDAFDTILTSRSYKDALPFEYAIKEVRENAGTQFDPELTGKFLDVVTEEWVLSSS
>Mature_718_residues
MVKSKSIKKVVKSNRVVLKFLVVLIIFTYGLYIYNIYATTRKSVRSLYELNYNMLNNYINKSIRQTKEVSALPLHLIPNF
VKFNENVHSVHIIDQQGVITYSYPYKSLVDVSYNNLPIIVRALETGELQTQILSYSLGQYGTALGIVYPVDNKLYMVNYS
FNPVFHEISNSSLFVTTDSRGNIIITNSSGGLFPTNLSRKDGIIPLEKLVVINREMKSISSRLYFVYYIDEYINRAFDLG
LLSLFLLSIIVFVFRFSRNNYRVIMEDIQLLENKSRDLINAIEGHRSKLVKIDKEFNAMNLLGQTLEKAKTNFRETKYAF
TSYKKMVNEMLRLLEEVTMQNEEISAMNQEISVSYEAINTYQNKILAIIDLLSKIDPEAPLKGFLQDIVQLAVELIPAAD
AGSAGIKEGKYFKFLAQYGYDDLLTEVDFPEEILMCSENPVIFKNVNNSYLEKNPEEYKRVFAEVGSSRIKSTLVVGLKT
QDIIGNIFIDTFQAEKEFTSEDKRVLEAISKVSSILIYLKLSLTELDETYLGVIKALADAVELKDKYTKGHSERVARYSL
KLGEYLNLSPERLRVLKEAALLHDIGKIGVPDLILNKPGKLNDREYVQVRKHSVYGSRILENVNNFERVASIVRHHHERW
DGHGYPDGLKGKEIPLESRIIALFDAFDTILTSRSYKDALPFEYAIKEVRENAGTQFDPELTGKFLDVVTEEWVLSSS

Specific function: Positively regulates the synthesis of extracellular enzymes and extracellular polysaccharides. The cell-cell signaling system encoded by rpf genes is required for full virulence and is implicated in regulation of the formation and dispersal of biofilms [H

COG id: COG2206

COG function: function code T; HD-GYP domain

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 response regulatory domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011006
- InterPro:   IPR003607
- InterPro:   IPR001789 [H]

Pfam domain/function: PF00072 Response_reg [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82145; Mature: 82145

Theoretical pI: Translated: 7.18; Mature: 7.18

Prosite motif: PS00214 FABP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVKSKSIKKVVKSNRVVLKFLVVLIIFTYGLYIYNIYATTRKSVRSLYELNYNMLNNYIN
CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSIRQTKEVSALPLHLIPNFVKFNENVHSVHIIDQQGVITYSYPYKSLVDVSYNNLPIIV
HHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCHHHHHCCCCCCEEEE
RALETGELQTQILSYSLGQYGTALGIVYPVDNKLYMVNYSFNPVFHEISNSSLFVTTDSR
EEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEEEEEECCCHHHHHCCCCEEEEEECCC
GNIIITNSSGGLFPTNLSRKDGIIPLEKLVVINREMKSISSRLYFVYYIDEYINRAFDLG
CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHH
LLSLFLLSIIVFVFRFSRNNYRVIMEDIQLLENKSRDLINAIEGHRSKLVKIDKEFNAMN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHH
LLGQTLEKAKTNFRETKYAFTSYKKMVNEMLRLLEEVTMQNEEISAMNQEISVSYEAINT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHHHEEHHHHHHH
YQNKILAIIDLLSKIDPEAPLKGFLQDIVQLAVELIPAADAGSAGIKEGKYFKFLAQYGY
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCH
DDLLTEVDFPEEILMCSENPVIFKNVNNSYLEKNPEEYKRVFAEVGSSRIKSTLVVGLKT
HHHHHCCCCCHHHHEECCCCEEEECCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCH
QDIIGNIFIDTFQAEKEFTSEDKRVLEAISKVSSILIYLKLSLTELDETYLGVIKALADA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VELKDKYTKGHSERVARYSLKLGEYLNLSPERLRVLKEAALLHDIGKIGVPDLILNKPGK
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCC
LNDREYVQVRKHSVYGSRILENVNNFERVASIVRHHHERWDGHGYPDGLKGKEIPLESRI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
IALFDAFDTILTSRSYKDALPFEYAIKEVRENAGTQFDPELTGKFLDVVTEEWVLSSS
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MVKSKSIKKVVKSNRVVLKFLVVLIIFTYGLYIYNIYATTRKSVRSLYELNYNMLNNYIN
CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSIRQTKEVSALPLHLIPNFVKFNENVHSVHIIDQQGVITYSYPYKSLVDVSYNNLPIIV
HHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCHHHHHCCCCCCEEEE
RALETGELQTQILSYSLGQYGTALGIVYPVDNKLYMVNYSFNPVFHEISNSSLFVTTDSR
EEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEEEEEECCCHHHHHCCCCEEEEEECCC
GNIIITNSSGGLFPTNLSRKDGIIPLEKLVVINREMKSISSRLYFVYYIDEYINRAFDLG
CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHH
LLSLFLLSIIVFVFRFSRNNYRVIMEDIQLLENKSRDLINAIEGHRSKLVKIDKEFNAMN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHH
LLGQTLEKAKTNFRETKYAFTSYKKMVNEMLRLLEEVTMQNEEISAMNQEISVSYEAINT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHHHEEHHHHHHH
YQNKILAIIDLLSKIDPEAPLKGFLQDIVQLAVELIPAADAGSAGIKEGKYFKFLAQYGY
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCH
DDLLTEVDFPEEILMCSENPVIFKNVNNSYLEKNPEEYKRVFAEVGSSRIKSTLVVGLKT
HHHHHCCCCCHHHHEECCCCEEEECCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCH
QDIIGNIFIDTFQAEKEFTSEDKRVLEAISKVSSILIYLKLSLTELDETYLGVIKALADA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VELKDKYTKGHSERVARYSLKLGEYLNLSPERLRVLKEAALLHDIGKIGVPDLILNKPGK
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCC
LNDREYVQVRKHSVYGSRILENVNNFERVASIVRHHHERWDGHGYPDGLKGKEIPLESRI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
IALFDAFDTILTSRSYKDALPFEYAIKEVRENAGTQFDPELTGKFLDVVTEEWVLSSS
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11123673 [H]