| Definition | Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011899 |
| Length | 2,578,146 |
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The map label for this gene is 220931953
Identifier: 220931953
GI number: 220931953
Start: 1205901
End: 1207811
Strand: Reverse
Name: 220931953
Synonym: Hore_11130
Alternate gene names: NA
Gene position: 1207811-1205901 (Counterclockwise)
Preceding gene: 220931954
Following gene: 220931952
Centisome position: 46.85
GC content: 43.01
Gene sequence:
>1911_bases ATGGAAGAAAAGAAAAAGGGACTCCATCCCAGTGCTTATGAAGTTATACCCGGGGAAGAATATCAACCATATGTTGCTGC GGAAAAAGTAATGCCAGAATTTACACTGACGTCAGTAATAGTAGGTATTTTAATGGCTGTTATTTTCGGTGCTGCAAATG CTTACTTGGGTCTTAAAGTAGGTATGACTGTCAGTGCATCTGTCCCGGCAGCTGTTATTTCCATGGCAATTATACGCGGT ATTATGAAACGAGATTCTATTTTAGAAAATAACATGGTACAAACTGTAGCTTCAGCCGGTGAATCCCTGGCAGCCGGTGT CATATTTACAATTCCAGCTTTAATAATCTGGGGTATTCAACCGAGTATTTTCAGAATGTTTATTATCGCCTTGATTGGTG GTTTAATCGGGGTTTTATTTATGATTCCACTCCGCCGCCATTTAATTGTCGGTGAACACGGTAAACTTCCATATCCTGAA GGTACTGCCTGTGCAGAAGTTCTGGTAGCTGGTGAAACAGGTGGTAGTGGTGCTAAAACAGTATTTACAGGCCTCGGTAT CGGTGCCCTTTATAAATTTATTGCCGACGGCTTTAAATTATGGCCAACCTCTATTGAAACTACTCTACCCGGTTTAAGGG GAGCAGCTATCGGTATGGATGTTCTACCGGCCTTACTGGGTGTTGGTTTTATTATTGGGCCCAGAATTGCAGCATTAATG CTGGCCGGTGGTATTATGGGATGGCTGGTCTTTATCCCTCTAATTGCAACTTTAGGTCACAACTTACCTGAACCCTTCTA CCCTGCCCCTGCTCCCATAGCTGAACTGGGTTACTGGGGTATCTGGGACTATTATATCAGGTATATAGGGGCCGGCGCTG TAGCCCTGGGTGGAATAGTTAGTCTATTAAAGGCTATTCCCACCATCTGGAGTTCATTTAAAGATGCTCTGTCAGGGTTT GCAGAAGGCATTGGTGATATTAACAAAAGGACCTTTGATGACCTTTCAATTAAATGGGTAATTGCCATATTAGTAATACT ATTCCTCTTAATTGCCTTTACACCACAAATTCCTGTAGGTGGACTCGGTGCCCTTTTTGTTCTTTTATTCGGCTTCTTCT TCGTAACCGTATCTTCAAGAATTGTAGGTATTGTTGGTAGTTCATCCAACCCTGCTTCAGGAATGACCATAGCTACTCTC TTATTTACTACAGTACTCTTTAAGGCTTTTGGCTGGACAGGAGAAACTGGTATGATTGCTGCCTTAAGTGTTGGGGCCCT GGTATGTATTGCTATTGCTGTTGCCGGTGATACCTCCCAGGACTTAAAGACCGGTTTTCTGGTTGGGGCTACCCCTAAAA AACAGCAGACTGGTGAAATAATTGGTGTACTTGCTTCTGCCCTTGTAATTGGATTTACCCTGATCTTGTTACATGAAGCC TATACCATAGGTTCTAAAGAACTGGCTGCACCACAGGCAACTTTGATGTCTTTAGTTGTTAAAGGTATTATGGAAGGTAC TCTACCCTGGGCTCTTGTCTTAACAGGTGTCTTTACAGCCTTAATTGTTGAGCTCTTTGGTATAGGGTCTCTTCCCTTTG CAGTCGGGCTATATCTTCCGATTCATCTCAGTACTCCAATTATTATTGGTGGAATTATCAGGGGGCTCCTTAAGAAATTC ACCAGTAATGATGAAGACTTGAAGGAAAAACGTGAAAAAGGAATTCTATTTGCTTCAGGGTTAATTGCTGGAGATGCCCT GCTGGGTGTTATCCTTGCTATAGTTGCCTTCTTCGGGGGTTCTCTGGCCTTATCAGATTCTCCGGTGCTTGGAAGTAGCT GGGCCCTGATCTTCTTTGGCCTTCTGGTCTTAAGCCTTATTAAGTATTCCTGGTTGGCCAAAAAAGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATATTTACAATTTTCATGGATGTTTATTTAAATAACTTTCATGATTAATTAATTTTAGTGACCGGGAAATAACAAATTA CAAAGGGAGGTATTTTTTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTTAGCTAAAAGGATAAATTATTAAAACTATGGGGGATATTATATGTATCCCCCATAGCTATTTACACCTTTTCTTAA ATAATTTAAAAAAAGGGGTA
Product: oligopeptide transporter, OPT family
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 636; Mature: 636
Protein sequence:
>636_residues MEEKKKGLHPSAYEVIPGEEYQPYVAAEKVMPEFTLTSVIVGILMAVIFGAANAYLGLKVGMTVSASVPAAVISMAIIRG IMKRDSILENNMVQTVASAGESLAAGVIFTIPALIIWGIQPSIFRMFIIALIGGLIGVLFMIPLRRHLIVGEHGKLPYPE GTACAEVLVAGETGGSGAKTVFTGLGIGALYKFIADGFKLWPTSIETTLPGLRGAAIGMDVLPALLGVGFIIGPRIAALM LAGGIMGWLVFIPLIATLGHNLPEPFYPAPAPIAELGYWGIWDYYIRYIGAGAVALGGIVSLLKAIPTIWSSFKDALSGF AEGIGDINKRTFDDLSIKWVIAILVILFLLIAFTPQIPVGGLGALFVLLFGFFFVTVSSRIVGIVGSSSNPASGMTIATL LFTTVLFKAFGWTGETGMIAALSVGALVCIAIAVAGDTSQDLKTGFLVGATPKKQQTGEIIGVLASALVIGFTLILLHEA YTIGSKELAAPQATLMSLVVKGIMEGTLPWALVLTGVFTALIVELFGIGSLPFAVGLYLPIHLSTPIIIGGIIRGLLKKF TSNDEDLKEKREKGILFASGLIAGDALLGVILAIVAFFGGSLALSDSPVLGSSWALIFFGLLVLSLIKYSWLAKKE
Sequences:
>Translated_636_residues MEEKKKGLHPSAYEVIPGEEYQPYVAAEKVMPEFTLTSVIVGILMAVIFGAANAYLGLKVGMTVSASVPAAVISMAIIRG IMKRDSILENNMVQTVASAGESLAAGVIFTIPALIIWGIQPSIFRMFIIALIGGLIGVLFMIPLRRHLIVGEHGKLPYPE GTACAEVLVAGETGGSGAKTVFTGLGIGALYKFIADGFKLWPTSIETTLPGLRGAAIGMDVLPALLGVGFIIGPRIAALM LAGGIMGWLVFIPLIATLGHNLPEPFYPAPAPIAELGYWGIWDYYIRYIGAGAVALGGIVSLLKAIPTIWSSFKDALSGF AEGIGDINKRTFDDLSIKWVIAILVILFLLIAFTPQIPVGGLGALFVLLFGFFFVTVSSRIVGIVGSSSNPASGMTIATL LFTTVLFKAFGWTGETGMIAALSVGALVCIAIAVAGDTSQDLKTGFLVGATPKKQQTGEIIGVLASALVIGFTLILLHEA YTIGSKELAAPQATLMSLVVKGIMEGTLPWALVLTGVFTALIVELFGIGSLPFAVGLYLPIHLSTPIIIGGIIRGLLKKF TSNDEDLKEKREKGILFASGLIAGDALLGVILAIVAFFGGSLALSDSPVLGSSWALIFFGLLVLSLIKYSWLAKKE >Mature_636_residues MEEKKKGLHPSAYEVIPGEEYQPYVAAEKVMPEFTLTSVIVGILMAVIFGAANAYLGLKVGMTVSASVPAAVISMAIIRG IMKRDSILENNMVQTVASAGESLAAGVIFTIPALIIWGIQPSIFRMFIIALIGGLIGVLFMIPLRRHLIVGEHGKLPYPE GTACAEVLVAGETGGSGAKTVFTGLGIGALYKFIADGFKLWPTSIETTLPGLRGAAIGMDVLPALLGVGFIIGPRIAALM LAGGIMGWLVFIPLIATLGHNLPEPFYPAPAPIAELGYWGIWDYYIRYIGAGAVALGGIVSLLKAIPTIWSSFKDALSGF AEGIGDINKRTFDDLSIKWVIAILVILFLLIAFTPQIPVGGLGALFVLLFGFFFVTVSSRIVGIVGSSSNPASGMTIATL LFTTVLFKAFGWTGETGMIAALSVGALVCIAIAVAGDTSQDLKTGFLVGATPKKQQTGEIIGVLASALVIGFTLILLHEA YTIGSKELAAPQATLMSLVVKGIMEGTLPWALVLTGVFTALIVELFGIGSLPFAVGLYLPIHLSTPIIIGGIIRGLLKKF TSNDEDLKEKREKGILFASGLIAGDALLGVILAIVAFFGGSLALSDSPVLGSSWALIFFGLLVLSLIKYSWLAKKE
Specific function: Unknown
COG id: COG1297
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the oligopeptide OPT transporter family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004814 - InterPro: IPR004813 [H]
Pfam domain/function: PF03169 OPT [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 66787; Mature: 66787
Theoretical pI: Translated: 7.15; Mature: 7.15
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEEKKKGLHPSAYEVIPGEEYQPYVAAEKVMPEFTLTSVIVGILMAVIFGAANAYLGLKV CCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE GMTVSASVPAAVISMAIIRGIMKRDSILENNMVQTVASAGESLAAGVIFTIPALIIWGIQ CCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PSIFRMFIIALIGGLIGVLFMIPLRRHLIVGEHGKLPYPEGTACAEVLVAGETGGSGAKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHEECCCCCCCHHH VFTGLGIGALYKFIADGFKLWPTSIETTLPGLRGAAIGMDVLPALLGVGFIIGPRIAALM HHHHCCHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAGGIMGWLVFIPLIATLGHNLPEPFYPAPAPIAELGYWGIWDYYIRYIGAGAVALGGIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLLKAIPTIWSSFKDALSGFAEGIGDINKRTFDDLSIKWVIAILVILFLLIAFTPQIPVG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC GLGALFVLLFGFFFVTVSSRIVGIVGSSSNPASGMTIATLLFTTVLFKAFGWTGETGMIA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH ALSVGALVCIAIAVAGDTSQDLKTGFLVGATPKKQQTGEIIGVLASALVIGFTLILLHEA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTIGSKELAAPQATLMSLVVKGIMEGTLPWALVLTGVFTALIVELFGIGSLPFAVGLYLP HHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH IHLSTPIIIGGIIRGLLKKFTSNDEDLKEKREKGILFASGLIAGDALLGVILAIVAFFGG HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SLALSDSPVLGSSWALIFFGLLVLSLIKYSWLAKKE CEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MEEKKKGLHPSAYEVIPGEEYQPYVAAEKVMPEFTLTSVIVGILMAVIFGAANAYLGLKV CCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE GMTVSASVPAAVISMAIIRGIMKRDSILENNMVQTVASAGESLAAGVIFTIPALIIWGIQ CCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PSIFRMFIIALIGGLIGVLFMIPLRRHLIVGEHGKLPYPEGTACAEVLVAGETGGSGAKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHEECCCCCCCHHH VFTGLGIGALYKFIADGFKLWPTSIETTLPGLRGAAIGMDVLPALLGVGFIIGPRIAALM HHHHCCHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAGGIMGWLVFIPLIATLGHNLPEPFYPAPAPIAELGYWGIWDYYIRYIGAGAVALGGIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLLKAIPTIWSSFKDALSGFAEGIGDINKRTFDDLSIKWVIAILVILFLLIAFTPQIPVG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC GLGALFVLLFGFFFVTVSSRIVGIVGSSSNPASGMTIATLLFTTVLFKAFGWTGETGMIA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH ALSVGALVCIAIAVAGDTSQDLKTGFLVGATPKKQQTGEIIGVLASALVIGFTLILLHEA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTIGSKELAAPQATLMSLVVKGIMEGTLPWALVLTGVFTALIVELFGIGSLPFAVGLYLP HHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH IHLSTPIIIGGIIRGLLKKFTSNDEDLKEKREKGILFASGLIAGDALLGVILAIVAFFGG HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SLALSDSPVLGSSWALIFFGLLVLSLIKYSWLAKKE CEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]