| Definition | Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011899 |
| Length | 2,578,146 |
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The map label for this gene is yhaN [H]
Identifier: 220931482
GI number: 220931482
Start: 687497
End: 690403
Strand: Direct
Name: yhaN [H]
Synonym: Hore_06380
Alternate gene names: 220931482
Gene position: 687497-690403 (Clockwise)
Preceding gene: 220931481
Following gene: 220931484
Centisome position: 26.67
GC content: 35.4
Gene sequence:
>2907_bases GTGAGGATTAAGAGTCTTTATATAAAGGATTTTGGTATCTTCCGGGAGCAGAAGCTGGAAAAGATAGCTCCAGGTATGGT TGTGATTGGTGGCCCCAATAGAGCTGGAAAAACTACTTTTCTTAATATAATTAGGTATCTCTGGTTTGGTTTTCCATCTA AAAAAACTCTACCGCCTGCCCTGAGGAAGTATGAAGTGGAGGCAGATATTGCCCTTGACAACGAAGATGAATATAACATC TATGTAGAAGGACAGGCTCCTCCGAAAATTACAGCTATTAGGGCAAACTCAGACCAGATAAAAAGTTTTGAAGAACTGGT CGGGGTAGATGAGTTTACATACCATCGTTTGTTTACCATACCCCTGAATGAGCTAAATAAAATCCCCTCAGGGGTTGAAG ATGAAGAAAGGATTCAGTCCCTTCTGCTGGGGGCAGGACTTAAAGAAATTTTATTAATTCCCAGGATTAAAGATGAACTA TATAAAAAGGCCTATAATATAGGGAGAAAACACGGCAACCCAAGATATGGCCAGTTTAAACCCTATTTTGATAGAATTAA AGAAGGTATAAAAAATAGACAAAAGGCCCTGTCACAGGTCCGGGAGTATGAAAAAATTAAGGATAAATTATCTAAGGTTA ACTTTGAAATTAATGAACTGGAAAATTCAACAATTCCTGACCTGGAACATAGATTGACACTTCTGGATGTACTTCACAAC AATTATCAGGATTTCCAGCAACTTAATAAATTAAAAATCAGTTTAAACCGACCAGAGATAAAGGACCTTTTATTAAATTT TCCTGTTGAACTTGTGGAAAGGGTAAAGGGGCTTAAAGATAAGTATTTAAATTTGAAGGAAAATTATAATAATCTAAAAA CAGAATTTAAAATTGAGACCGGGGTTCAGGATGTTAAAAACAATATTGAAAAATTACTGGACCATGATGACAGGATTAAA ACCATGTTCCAAAAATTATCGGGTCTCAGGGAAAAAGTTAAACAATATAAAAAACAAAAAGAGAATTTAACGCGGAACAG GAATGAATTATTTATTGAAATGGAACAAATAAATTCAGCCTGGCAAAGCTTTAAAGATCTTAAGGAAATTAAAACTGATG CAATTGAACAAAAGGATCTTGAAGATTGTCTTATCAACTATACAGAATTGAGTAATACCAGGAATAATTATTTAAAAGAG ATAAATGAACTGGAAGATGAAAAGGCCAGACTGGAGGAACAATTAAAGAGTATATCAGAAAAACATGTGGTTATTAATCT TGGGAAATATTTTATTCTGGCCCTTATTATTACTATATCAGGGGCTGGTCTTTCTATTATAAATCCTGTTATGGGGATAA TTATTGGGACAGGTGGTGTCTCTGTACTTGCATTGTACTGGTGGTATAAAGGATTTTTAACCCGGGTAAGTTATGAAAGA AAGGAAGATTTAAACCAACGTCTGAAAGACATCAATGGGAAGCTAAATTATAAAAACAGTGAATTTAATAAAATTCAGGA CAGGCTTTCTTCTGTAATTAATAAATTTCATGGGTATAGCCAAAAGCTGGGCCTTAAAGAAGAATCCCCTCCTGAACTTG TAAGGTTGTATTTTGATAAGGTTCAGGGATTAAAGAAAAAAATTAAAGGGTGGCAACAGAGGATTGAAGATAATGAAAAA TATGCCCGGGAACTTGATGAACGGTTATTTGAAATTATTAAGTTGCTAACTTCTTTTCCAGACATATCAGGAGGAGAAAT AGTCAATTATTTTCTTAATTTAAAAAACTATGATTACAGAATAACATACAGTGATAAGTTGTTTTCAGCGGTAGAAGAAT TATATGAATATCTCCAGTTAGCCCGGAGGATTAAGGAGCAAGAAGAAAAACTTGCCGGGGTTACCCGGGAAATAGTTGAC CTAATAAAGCCCAATAATCAGGAGAAATTAATGGAAGAAATAACTATTTTTTTTAAACGGGCTGAGGATTATGAAAAATA TGCAGAAATGAGGTCAGAGGCAAGGCTTCTGGAGGTTAAAATAACCGGAAATTTGAATACCCGGAGGGTTAGAAACTCTC TGGAATACGCTGCAGTAAATAATATACTGGTAAATATAGATCGAAATTACATTAAATCAAATGATGGCTCCGGATTAATA AATATACTGGATAAGTTATACCGGGATTATACTTCGCAAAAAGATATAGAAAAGGATTTTAGACAGACAGAAACTCGTCT TGAAAAGGTGTCCGGAAAACTTGAGAATCTCAAAGAAGAAAGGAAACTTCTACAGGATAAATTAAAAGAACTGTCTACTG TTGAAAAGTTACATAATGCCCAGGCTCAGATTGATGAAGGCAGGAACCGGTTGCAATATCTGGCTGAAAAGTATGCTCTC TATAAGACAGCAACCTATCTTCTTGACCAGGTGCAAAACAGGTTTATTGAAAGGGCCCGGGAGACCCTGTTGAGTGATGC CAGTAATCTATTTAATCAGATAACAGGTGGCGAATATAAAAAAATATTACCACCGGATAATCTACTCAAAATTGATTTCC AGGCTGTATTAAGTAATGGTAATACCCAGAAAACAGTTAATGTTTTAAGCCGGGGAACAAGGGAACAGCTCTATCTGGCT ATCAGGGTCAGTAGGTTAAGGCAAATAAAGCCACCCCTGCCTGTTATAATTGACGATTCCCTTGTAAATTTTGATAGCAG GCATTTAGAAAAAACTATAGAAATATTATCTGACCTCGCCGAAACCCATCAGGTATTTATTTTGACCTGCCATCATCGTT TAGTTGATTACATTGAGAGAAAGAATCATAAAACCCAGTTCTGGAAATTGGAGAAAGGTGTTTTTAACCCTTCAAGTGGA GCAGAACTAAAAACAGTGTTAAAGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AATGAAACAAAGATACAATTGGATAAAGAAACCATGAAAACAATTATTGATCAGGCCCGACATCTGGTAATAGAAAAAAT TTTAGAGAGGGGGGGCTGGG
Downstream 100 bases:
>100_bases CTTCCGGTTTAATTCCGGAAGTTTTTTTTAAAAAATTTATCAGGTTGATTTTTATATAAATTTCAGGAAAAAATATTAAG ACAATATAAGTTAAATGAGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 968; Mature: 968
Protein sequence:
>968_residues MRIKSLYIKDFGIFREQKLEKIAPGMVVIGGPNRAGKTTFLNIIRYLWFGFPSKKTLPPALRKYEVEADIALDNEDEYNI YVEGQAPPKITAIRANSDQIKSFEELVGVDEFTYHRLFTIPLNELNKIPSGVEDEERIQSLLLGAGLKEILLIPRIKDEL YKKAYNIGRKHGNPRYGQFKPYFDRIKEGIKNRQKALSQVREYEKIKDKLSKVNFEINELENSTIPDLEHRLTLLDVLHN NYQDFQQLNKLKISLNRPEIKDLLLNFPVELVERVKGLKDKYLNLKENYNNLKTEFKIETGVQDVKNNIEKLLDHDDRIK TMFQKLSGLREKVKQYKKQKENLTRNRNELFIEMEQINSAWQSFKDLKEIKTDAIEQKDLEDCLINYTELSNTRNNYLKE INELEDEKARLEEQLKSISEKHVVINLGKYFILALIITISGAGLSIINPVMGIIIGTGGVSVLALYWWYKGFLTRVSYER KEDLNQRLKDINGKLNYKNSEFNKIQDRLSSVINKFHGYSQKLGLKEESPPELVRLYFDKVQGLKKKIKGWQQRIEDNEK YARELDERLFEIIKLLTSFPDISGGEIVNYFLNLKNYDYRITYSDKLFSAVEELYEYLQLARRIKEQEEKLAGVTREIVD LIKPNNQEKLMEEITIFFKRAEDYEKYAEMRSEARLLEVKITGNLNTRRVRNSLEYAAVNNILVNIDRNYIKSNDGSGLI NILDKLYRDYTSQKDIEKDFRQTETRLEKVSGKLENLKEERKLLQDKLKELSTVEKLHNAQAQIDEGRNRLQYLAEKYAL YKTATYLLDQVQNRFIERARETLLSDASNLFNQITGGEYKKILPPDNLLKIDFQAVLSNGNTQKTVNVLSRGTREQLYLA IRVSRLRQIKPPLPVIIDDSLVNFDSRHLEKTIEILSDLAETHQVFILTCHHRLVDYIERKNHKTQFWKLEKGVFNPSSG AELKTVLK
Sequences:
>Translated_968_residues MRIKSLYIKDFGIFREQKLEKIAPGMVVIGGPNRAGKTTFLNIIRYLWFGFPSKKTLPPALRKYEVEADIALDNEDEYNI YVEGQAPPKITAIRANSDQIKSFEELVGVDEFTYHRLFTIPLNELNKIPSGVEDEERIQSLLLGAGLKEILLIPRIKDEL YKKAYNIGRKHGNPRYGQFKPYFDRIKEGIKNRQKALSQVREYEKIKDKLSKVNFEINELENSTIPDLEHRLTLLDVLHN NYQDFQQLNKLKISLNRPEIKDLLLNFPVELVERVKGLKDKYLNLKENYNNLKTEFKIETGVQDVKNNIEKLLDHDDRIK TMFQKLSGLREKVKQYKKQKENLTRNRNELFIEMEQINSAWQSFKDLKEIKTDAIEQKDLEDCLINYTELSNTRNNYLKE INELEDEKARLEEQLKSISEKHVVINLGKYFILALIITISGAGLSIINPVMGIIIGTGGVSVLALYWWYKGFLTRVSYER KEDLNQRLKDINGKLNYKNSEFNKIQDRLSSVINKFHGYSQKLGLKEESPPELVRLYFDKVQGLKKKIKGWQQRIEDNEK YARELDERLFEIIKLLTSFPDISGGEIVNYFLNLKNYDYRITYSDKLFSAVEELYEYLQLARRIKEQEEKLAGVTREIVD LIKPNNQEKLMEEITIFFKRAEDYEKYAEMRSEARLLEVKITGNLNTRRVRNSLEYAAVNNILVNIDRNYIKSNDGSGLI NILDKLYRDYTSQKDIEKDFRQTETRLEKVSGKLENLKEERKLLQDKLKELSTVEKLHNAQAQIDEGRNRLQYLAEKYAL YKTATYLLDQVQNRFIERARETLLSDASNLFNQITGGEYKKILPPDNLLKIDFQAVLSNGNTQKTVNVLSRGTREQLYLA IRVSRLRQIKPPLPVIIDDSLVNFDSRHLEKTIEILSDLAETHQVFILTCHHRLVDYIERKNHKTQFWKLEKGVFNPSSG AELKTVLK >Mature_968_residues MRIKSLYIKDFGIFREQKLEKIAPGMVVIGGPNRAGKTTFLNIIRYLWFGFPSKKTLPPALRKYEVEADIALDNEDEYNI YVEGQAPPKITAIRANSDQIKSFEELVGVDEFTYHRLFTIPLNELNKIPSGVEDEERIQSLLLGAGLKEILLIPRIKDEL YKKAYNIGRKHGNPRYGQFKPYFDRIKEGIKNRQKALSQVREYEKIKDKLSKVNFEINELENSTIPDLEHRLTLLDVLHN NYQDFQQLNKLKISLNRPEIKDLLLNFPVELVERVKGLKDKYLNLKENYNNLKTEFKIETGVQDVKNNIEKLLDHDDRIK TMFQKLSGLREKVKQYKKQKENLTRNRNELFIEMEQINSAWQSFKDLKEIKTDAIEQKDLEDCLINYTELSNTRNNYLKE INELEDEKARLEEQLKSISEKHVVINLGKYFILALIITISGAGLSIINPVMGIIIGTGGVSVLALYWWYKGFLTRVSYER KEDLNQRLKDINGKLNYKNSEFNKIQDRLSSVINKFHGYSQKLGLKEESPPELVRLYFDKVQGLKKKIKGWQQRIEDNEK YARELDERLFEIIKLLTSFPDISGGEIVNYFLNLKNYDYRITYSDKLFSAVEELYEYLQLARRIKEQEEKLAGVTREIVD LIKPNNQEKLMEEITIFFKRAEDYEKYAEMRSEARLLEVKITGNLNTRRVRNSLEYAAVNNILVNIDRNYIKSNDGSGLI NILDKLYRDYTSQKDIEKDFRQTETRLEKVSGKLENLKEERKLLQDKLKELSTVEKLHNAQAQIDEGRNRLQYLAEKYAL YKTATYLLDQVQNRFIERARETLLSDASNLFNQITGGEYKKILPPDNLLKIDFQAVLSNGNTQKTVNVLSRGTREQLYLA IRVSRLRQIKPPLPVIIDDSLVNFDSRHLEKTIEILSDLAETHQVFILTCHHRLVDYIERKNHKTQFWKLEKGVFNPSSG AELKTVLK
Specific function: Unknown
COG id: COG4717
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Single-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 113363; Mature: 113363
Theoretical pI: Translated: 9.41; Mature: 9.41
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 0.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 0.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRIKSLYIKDFGIFREQKLEKIAPGMVVIGGPNRAGKTTFLNIIRYLWFGFPSKKTLPPA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH LRKYEVEADIALDNEDEYNIYVEGQAPPKITAIRANSDQIKSFEELVGVDEFTYHRLFTI HHHHCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEE PLNELNKIPSGVEDEERIQSLLLGAGLKEILLIPRIKDELYKKAYNIGRKHGNPRYGQFK EHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC PYFDRIKEGIKNRQKALSQVREYEKIKDKLSKVNFEINELENSTIPDLEHRLTLLDVLHN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHC NYQDFQQLNKLKISLNRPEIKDLLLNFPVELVERVKGLKDKYLNLKENYNNLKTEFKIET CHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCHHHHHCCHHHHHCCCCEEEEECC GVQDVKNNIEKLLDHDDRIKTMFQKLSGLREKVKQYKKQKENLTRNRNELFIEMEQINSA CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEHHHHHHH WQSFKDLKEIKTDAIEQKDLEDCLINYTELSNTRNNYLKEINELEDEKARLEEQLKSISE HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KHVVINLGKYFILALIITISGAGLSIINPVMGIIIGTGGVSVLALYWWYKGFLTRVSYER CCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEDLNQRLKDINGKLNYKNSEFNKIQDRLSSVINKFHGYSQKLGLKEESPPELVRLYFDK HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH VQGLKKKIKGWQQRIEDNEKYARELDERLFEIIKLLTSFPDISGGEIVNYFLNLKNYDYR HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEE ITYSDKLFSAVEELYEYLQLARRIKEQEEKLAGVTREIVDLIKPNNQEKLMEEITIFFKR EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH AEDYEKYAEMRSEARLLEVKITGNLNTRRVRNSLEYAAVNNILVNIDRNYIKSNDGSGLI HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHCCCCCCHHH NILDKLYRDYTSQKDIEKDFRQTETRLEKVSGKLENLKEERKLLQDKLKELSTVEKLHNA HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QAQIDEGRNRLQYLAEKYALYKTATYLLDQVQNRFIERARETLLSDASNLFNQITGGEYK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC KILPPDNLLKIDFQAVLSNGNTQKTVNVLSRGTREQLYLAIRVSRLRQIKPPLPVIIDDS CCCCCCCEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCH LVNFDSRHLEKTIEILSDLAETHQVFILTCHHRLVDYIERKNHKTQFWKLEKGVFNPSSG HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC AELKTVLK CCHHHHCC >Mature Secondary Structure MRIKSLYIKDFGIFREQKLEKIAPGMVVIGGPNRAGKTTFLNIIRYLWFGFPSKKTLPPA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH LRKYEVEADIALDNEDEYNIYVEGQAPPKITAIRANSDQIKSFEELVGVDEFTYHRLFTI HHHHCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEE PLNELNKIPSGVEDEERIQSLLLGAGLKEILLIPRIKDELYKKAYNIGRKHGNPRYGQFK EHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC PYFDRIKEGIKNRQKALSQVREYEKIKDKLSKVNFEINELENSTIPDLEHRLTLLDVLHN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHC NYQDFQQLNKLKISLNRPEIKDLLLNFPVELVERVKGLKDKYLNLKENYNNLKTEFKIET CHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCHHHHHCCHHHHHCCCCEEEEECC GVQDVKNNIEKLLDHDDRIKTMFQKLSGLREKVKQYKKQKENLTRNRNELFIEMEQINSA CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEHHHHHHH WQSFKDLKEIKTDAIEQKDLEDCLINYTELSNTRNNYLKEINELEDEKARLEEQLKSISE HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KHVVINLGKYFILALIITISGAGLSIINPVMGIIIGTGGVSVLALYWWYKGFLTRVSYER CCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEDLNQRLKDINGKLNYKNSEFNKIQDRLSSVINKFHGYSQKLGLKEESPPELVRLYFDK HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH VQGLKKKIKGWQQRIEDNEKYARELDERLFEIIKLLTSFPDISGGEIVNYFLNLKNYDYR HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEE ITYSDKLFSAVEELYEYLQLARRIKEQEEKLAGVTREIVDLIKPNNQEKLMEEITIFFKR EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH AEDYEKYAEMRSEARLLEVKITGNLNTRRVRNSLEYAAVNNILVNIDRNYIKSNDGSGLI HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHCCCCCCHHH NILDKLYRDYTSQKDIEKDFRQTETRLEKVSGKLENLKEERKLLQDKLKELSTVEKLHNA HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QAQIDEGRNRLQYLAEKYALYKTATYLLDQVQNRFIERARETLLSDASNLFNQITGGEYK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC KILPPDNLLKIDFQAVLSNGNTQKTVNVLSRGTREQLYLAIRVSRLRQIKPPLPVIIDDS CCCCCCCEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCH LVNFDSRHLEKTIEILSDLAETHQVFILTCHHRLVDYIERKNHKTQFWKLEKGVFNPSSG HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC AELKTVLK CCHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377 [H]