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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 220931395

GI number: 220931395

Start: 600417

End: 601757

Strand: Direct

Name: yfiS [H]

Synonym: Hore_05510

Alternate gene names: 220931395

Gene position: 600417-601757 (Clockwise)

Preceding gene: 220931394

Following gene: 220931397

Centisome position: 23.29

GC content: 34.53

Gene sequence:

>1341_bases
ATGAATACTCAAACAAAAACATTATCGAAAGAAATTGAAGGTTATCAGGAAAATAAAAATATCTTTTTGTATTCAGCTGG
TAAATTAATATCTTTACTGGGGTCTGCGATTTATACCTTTGCAGTAGGTTTGTATTTATTAAAAATAACCGGATCTGGCC
TCACTTTTGCTACCAATATAGTGTTATACACCCTGCCAATGCTTTTTATAAATCCGTTTGCCGGAGTAGTTGCAGACCGA
ATTAATAAGAAAATAGTTGTGGTAGGGTCTGACTTTCTCAATGGTTTGTTTTTGGTGGTAGTGTATGTGCTGGCAGGTCG
TATTGGCTTAAGTGTGTCGTTGTTATATATAAGCACCTTTATAATGACCGTCATGGCTACCTTTTTTAATATTGCTATAG
AATCTGCTAAGCCTGATCTGGTGAGGGAAGAAAAATTAGTAAAAATAAATTCTCTAGCCCGGGTCATCGAGTCACTTTCC
TATGTAATTGGTCCTATTACAGGGGGAGTTATTTATGCCTTGTTTGATATGAAAGTATTTATACTGTTAAATGGTTTATC
CTTTTTCCTGGCTGCTTTCCTGGAGTTTTTCATTGATTACCATTTTAATAAAGTTGAAGATAATGAACTTGAAAGGGATA
AAACCAGACCAGAACCAGGTAGTGACAATAAGTTGTGGTTTAAGTTAAAAGAAGGCTACCAGTATATCCTTTCCAGACAA
CATTTACTGGCCTTGATTTATATATTTGTTGCCCTCAATTTTTTATTTAACTTTGCAATAATAGTTCCCCTCCCTTATTT
ATTAAATACTACCTGGAGTGTTGATCCGGTTATATACGGAGTTGTACAGGGAGGTTTACCTGTAGGGATGATAATCGGGG
CCTTACTGGTAAAAAGAATTATGGAAAAAGTAAGTTACAGTAAACTTTTAAAAAGAATTAGTTATCTAGCAGGTTTATGG
GTACTGATGTTTTCACTTCCTCCAGTAGTGTTTCCCTGTATCCCTGGTCAGTATTTTGTATTAATCTACTATACCACATT
GATGTTAGTGGGTGGCTTAGTCGTTTCATGGGTTGATATTCCGGCAAATGTACTATTACAAAAGATTGTTCCAGGAAAGT
TACTGGGAAGGGTTATCAGTGTAAAATTAAGTATTGTCAAGGTAATTGTTCCTATTGCTCTTCTTTTATCCGGGTATATA
GTTAATTTGTTATCACCGTTAATCCTGTTTTTAAGTGGGTCTGTTCTTTTTACTATGTTTAATTTATGGTTTTTTACTTC
TCCTTCAGGTCAGAAGTTTATTAATGTCACTAATGAGAATTTAATGGGAGAAAATGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCATCTTTTTTATTTTTACATGCTAAAAAAGCTGTAAAAAGGTATTGTGCTTGAGTATCCCCCATTCGATATACTTGGT
ATTGAAAAGGGGGTATTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACCGGAAGCTTTGCTTCCGGTTTCTTTATGGAATTATAACTAATTGCAACCTGGCTTCCTATTTTTTATGGTTTTGTAG
TTAAATATGTAGTTATTATT

Product: major facilitator superfamily protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 446; Mature: 446

Protein sequence:

>446_residues
MNTQTKTLSKEIEGYQENKNIFLYSAGKLISLLGSAIYTFAVGLYLLKITGSGLTFATNIVLYTLPMLFINPFAGVVADR
INKKIVVVGSDFLNGLFLVVVYVLAGRIGLSVSLLYISTFIMTVMATFFNIAIESAKPDLVREEKLVKINSLARVIESLS
YVIGPITGGVIYALFDMKVFILLNGLSFFLAAFLEFFIDYHFNKVEDNELERDKTRPEPGSDNKLWFKLKEGYQYILSRQ
HLLALIYIFVALNFLFNFAIIVPLPYLLNTTWSVDPVIYGVVQGGLPVGMIIGALLVKRIMEKVSYSKLLKRISYLAGLW
VLMFSLPPVVFPCIPGQYFVLIYYTTLMLVGGLVVSWVDIPANVLLQKIVPGKLLGRVISVKLSIVKVIVPIALLLSGYI
VNLLSPLILFLSGSVLFTMFNLWFFTSPSGQKFINVTNENLMGENE

Sequences:

>Translated_446_residues
MNTQTKTLSKEIEGYQENKNIFLYSAGKLISLLGSAIYTFAVGLYLLKITGSGLTFATNIVLYTLPMLFINPFAGVVADR
INKKIVVVGSDFLNGLFLVVVYVLAGRIGLSVSLLYISTFIMTVMATFFNIAIESAKPDLVREEKLVKINSLARVIESLS
YVIGPITGGVIYALFDMKVFILLNGLSFFLAAFLEFFIDYHFNKVEDNELERDKTRPEPGSDNKLWFKLKEGYQYILSRQ
HLLALIYIFVALNFLFNFAIIVPLPYLLNTTWSVDPVIYGVVQGGLPVGMIIGALLVKRIMEKVSYSKLLKRISYLAGLW
VLMFSLPPVVFPCIPGQYFVLIYYTTLMLVGGLVVSWVDIPANVLLQKIVPGKLLGRVISVKLSIVKVIVPIALLLSGYI
VNLLSPLILFLSGSVLFTMFNLWFFTSPSGQKFINVTNENLMGENE
>Mature_446_residues
MNTQTKTLSKEIEGYQENKNIFLYSAGKLISLLGSAIYTFAVGLYLLKITGSGLTFATNIVLYTLPMLFINPFAGVVADR
INKKIVVVGSDFLNGLFLVVVYVLAGRIGLSVSLLYISTFIMTVMATFFNIAIESAKPDLVREEKLVKINSLARVIESLS
YVIGPITGGVIYALFDMKVFILLNGLSFFLAAFLEFFIDYHFNKVEDNELERDKTRPEPGSDNKLWFKLKEGYQYILSRQ
HLLALIYIFVALNFLFNFAIIVPLPYLLNTTWSVDPVIYGVVQGGLPVGMIIGALLVKRIMEKVSYSKLLKRISYLAGLW
VLMFSLPPVVFPCIPGQYFVLIYYTTLMLVGGLVVSWVDIPANVLLQKIVPGKLLGRVISVKLSIVKVIVPIALLLSGYI
VNLLSPLILFLSGSVLFTMFNLWFFTSPSGQKFINVTNENLMGENE

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49799; Mature: 49799

Theoretical pI: Translated: 9.57; Mature: 9.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNTQTKTLSKEIEGYQENKNIFLYSAGKLISLLGSAIYTFAVGLYLLKITGSGLTFATNI
CCCCHHHHHHHHCCHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHH
VLYTLPMLFINPFAGVVADRINKKIVVVGSDFLNGLFLVVVYVLAGRIGLSVSLLYISTF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMTVMATFFNIAIESAKPDLVREEKLVKINSLARVIESLSYVIGPITGGVIYALFDMKVF
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILLNGLSFFLAAFLEFFIDYHFNKVEDNELERDKTRPEPGSDNKLWFKLKEGYQYILSRQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHH
HLLALIYIFVALNFLFNFAIIVPLPYLLNTTWSVDPVIYGVVQGGLPVGMIIGALLVKRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
MEKVSYSKLLKRISYLAGLWVLMFSLPPVVFPCIPGQYFVLIYYTTLMLVGGLVVSWVDI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PANVLLQKIVPGKLLGRVISVKLSIVKVIVPIALLLSGYIVNLLSPLILFLSGSVLFTMF
CHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLWFFTSPSGQKFINVTNENLMGENE
HHHHEECCCCCEEEEECCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNTQTKTLSKEIEGYQENKNIFLYSAGKLISLLGSAIYTFAVGLYLLKITGSGLTFATNI
CCCCHHHHHHHHCCHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHH
VLYTLPMLFINPFAGVVADRINKKIVVVGSDFLNGLFLVVVYVLAGRIGLSVSLLYISTF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMTVMATFFNIAIESAKPDLVREEKLVKINSLARVIESLSYVIGPITGGVIYALFDMKVF
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILLNGLSFFLAAFLEFFIDYHFNKVEDNELERDKTRPEPGSDNKLWFKLKEGYQYILSRQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHH
HLLALIYIFVALNFLFNFAIIVPLPYLLNTTWSVDPVIYGVVQGGLPVGMIIGALLVKRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
MEKVSYSKLLKRISYLAGLWVLMFSLPPVVFPCIPGQYFVLIYYTTLMLVGGLVVSWVDI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PANVLLQKIVPGKLLGRVISVKLSIVKVIVPIALLLSGYIVNLLSPLILFLSGSVLFTMF
CHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLWFFTSPSGQKFINVTNENLMGENE
HHHHEECCCCCEEEEECCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]