Definition Vibrio splendidus LGP32 chromosome 1, complete genome.
Accession NC_011753
Length 3,299,303

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The map label for this gene is sbcC [H]

Identifier: 218709615

GI number: 218709615

Start: 1740232

End: 1743954

Strand: Reverse

Name: sbcC [H]

Synonym: VS_1625

Alternate gene names: 218709615

Gene position: 1743954-1740232 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218709616

Following gene: 218709614

Centisome position: 52.86

GC content: 45.85

Gene sequence:

>3723_bases
ATGAAGATTTTAAGCCTAGAATTTGAAAACCTGAACTCTTTGAAAGGGCGTTGGAAGCTCGATTTTACCCAATCACCGTT
TGCAGAAAATGGTCTGTTCGCGATTACTGGCCCAACAGGGGCAGGTAAAACCACCATTCTTGATGCGATTTGTTTGGCAT
TGTTCCACCGCACACCGCGTTTAAAGAGCATCGCTAAAGGCAACAACGAATTAATGACGCGTGGCACGGGTGAGTGTTTC
GCTGAGCTTGAATTTGAAGTGCAGGGCAAAACGTATCGCTCTAACTTCCACCAAAAGCGAGCTCGCGGAAAGCACGATGG
CGCATTACAAACGCCAACGTGTGAATTTGCGGATGCGGACACCGATAAAGTCTTAGAGACTATGTTGACCAAGAAGACAA
AGTTGGTGGAGCAGGTAACGGGTCTCGATTTCTCACGCTTCACTAAATCGATCATGTTGTCTCAAGGTGAGTTTGCGGCG
TTCTTAAATGCTAATGCTAACGACCGTGCCGAGCTACTTGAAGAGCTGACGGGCACAGAAGTCTATAGCCTGATCTCTGA
GCGCATCTACGATCATTTCAAGTCGAGTGAAGAGTCGCTTAATCACCTTAAAGCCAAAGCAGAAGGTGTGAGCTTACTGT
CTGAAGAGCAAATCCAAGAGCTAACCGCAGAACGAGAAACGTTAGAAGCGGAACAGAAGCGTTTAGCGGAGCAATTAAAA
GAGTGGCAAGCGCATCTAAGCTGGTGGAAAGACGTAACTAAAGCTGAGCAAACTATCGCGACCAGTGAGCACGATCTTAA
AACAGCTCAAGATGAACTAGACCGTAATCAACCTTCATTAGAGCGCTTGGCAAACAGTGAGCCGGCTGAAAAGCTGCGCC
CAATGCACAAAGGTTTAAAGCGTTGCGAACAAGAGGTGAACACTACTCAAGCTCACTTAGATAACAGCTCTAAGTTACTG
GCCGTTCGTGATGCAGAAAAGCAAGACGCGCAAACTAAATTGACTCAAAGCAGTGCAATTGTCGAACAAGTAAAAACCGA
GCAACAAGATCAAGAGAAGATCATCGATCTTGTCCGTCCGCTAGATAACCAAATTGCCGTACTCAAAGATAAGCAAACTG
CGGCCGTTAATGCAGCAAATACGCTAAACGAGCAACACACGCAACAGCGTAATCAACAGATTGTTTTAGTCCAAAAAATT
GATGCACTGAAGCAACAAGATCAACTCAGCACTGAGTACTTAAATACACATCAAACTGACCAACATCTGGAAAAATACTT
AGGTCAGTGGCAAGCAAAGGTAGAGCAAGTTCGTACTCTAGAGCGTCAGCATGCAGAACAGTTAAACTCAGCGAAGCAAA
CTTTGTCTGCGGTTGATGCACAGCAAACGATCATCAAATCTGCGCAAGAAGCTAAAGCAACGCAAGACAAAACTTTAAGT
GAATTGGTTGTGCTAGAGAGTAGTGCAAAGCAACAGTGGGTAGCATTGCAAGGCAACATCAGCGAACAAGTATTGAATGC
GCAAAAAGATCTGTTGGAGTACTGGAATCGCAATACGCACTCATTACTTGAGATCAACCGTGGTTTCCTAAATGCCCAGC
AACAGCTGCACGCAAAAACTCAGGCACATCAAACTAACACTCAGTTGGTCGATAAGCTTTCGAAAGAACGTGAAGTGTTG
GTGGAGCGATATAAAGAGAAAGAGACTTCGCTTGAGCGATTAACGCGTTTGATTGATCAAGAAGGCGAGTTGGCGAAATA
CCGTGCAGCTCTAGAATCAGGCTCTGAGTGCCCGCTATGTGGTTCAACAGACCATTCGATTGAACAGTCACAAGACACTG
CAAATTTGGTTGCTCAAAAAGAAACGGAAAACCTAGAGTTAACGGCCATCAAAAAAGAAGGCCAAGAGCATCGTCAGCAG
TTAGATTCTCTGGCCCCTATGATTGCGGCGCTTAACGATGACATTCAGCGAGCGCAAGCGGATATTCAACAAGCTCAACT
GAATTGGCAAGGCGTTGTCGGCAAGCTTCAACATAGCTTATCTGATTTCGTTGGCACTGCTCCTGAACTGGCGTTGCTAA
CGATTAACGATTTAGGCAATGAAGCTATAGTCGCGACCTTTGCTCAGCAGTGTGAAGTTCAACTAAGTCAGTTCTCGCAG
CAACTCAAAGCGTTGGCTGATGCGAAAGCACACTATGCCGAAGCTGAGAAACAACGCTTGTCTGCAAGTGTTATGGCTGA
CAAGGCGCAGTCTAATCTCGAGTTGGCCGAGCAACGCTTAGCGGATCTGAATAAGCAAAATCACAGCACGAACGAACAAG
TGGCTCAGATAGCTCAAACAAAAGAACAGCAATGGAACGCTCTGAAAGAGAGCATTGTTCAAACGGCTATCGAAGCGCCT
GAACTTGAACATATTGATGATTGGTTTACTGCGAAATCGCAGGCATCAAGCACATGGCAGCAAACCAAACAGCAACAGGC
CGATATTGAGAAGCAACTGATCACTCAAAATGCCGAATTGAAAACCTTAGATGACAAGCTAAGCAGTGTTGAGAAAGAGC
TCGCGACACTCACGCAACAGAGTGAGTCTCTAGTGTTAGAGTTGACTCGTATTAGTGCTGAAAGAACAGAGTTGTTTGGT
GACAAAGACATTCAAGCCACCAGCAATGCGATGAAGCAAAAAGTCACCGAAGCGGTAAATGCATTTGATGCCGCGCAGTT
GGTGCTTAACCGCTCCGAGCTGGAACATCGAACTGAGCAAACCAAACACATTAGCTTCTCTGAAGAGTTGACTAGCAAGC
AGTCAAGTTACACACAAGCGTCGAATGCTTGGTTAGAAGCACTGAAAACGAGCCCATTCGAAGATGAGGTAAATTTTGAA
GCGGCGTTGTTGGATGAGGAGGTTAGAACTCAACTTCAAAGCCTGAAGAAGTCTTTAGATGAAGCGATTGTCAGTGCACA
AGCAAGGTTGAATACCGCCAAAGCGACGCAAGTGGAGCTACAAAACCACGTAAATGCGAAAGCATGGCAAGAGCAAGAGC
AAGACCAACAGCAAGTTGAAGAAGCAACTACTGAATGCCAAAACGCACAACAAAGCCATGCGACAAAGATCGGCGCGATT
TCGGCCAATCTTGAAACGGATAGCCAGAACCGCAGTAATCAGCAAGATCTGTTCAAGCAGATCGACGAACAGCAGGTCGA
GTTTGATGATATCTCACGTCTGAACTCACTTATCGGTTCTAAGAACGGCGATAAATTTCGTAAGTTTGCCCAAGGTTTAA
CTCTGGAAAACTTGGTGTATTTGGCGAACAAGCAGCTACAGCGTTTACATGGTCGTTATGAGCTAAAACGTAAAGCCGAT
GATGGCTTAGAACTTCAAGTGCTCGACACATGGCAGGGCGATGTGATGCGTGATACCAAGACGTTATCCGGTGGCGAAAG
CTTCTTGGTGAGCTTGGCGTTGGCATTAGCGCTTTCTGATCTTGTGAGCTACAAAACCAGTATTGATTCTCTGTTCTTGG
ATGAAGGTTTCGGCACGCTGGATAGCGACACATTGGACATTGCCCTAAACGCGCTCGATAACCTAAATGCGTCAGGCAAG
ATGATTGGCGTCATCAGTCACGTTGAAGCATTGAAAGAGCGAGTGCCTGTTCAGCTTAAAGTAACAAAACACTCTGGCTT
AGGTGTCAGTGAGATGGAGAAGCAGTATAAGGTTGTTGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGCACGTTTAGAGCGAATGACGGTGAAGTTTAAACAAGTGATGGTTGAAGTGTCTGAAAGCGCTCAAACACCAAAC
AAAGTAGAAGAGTAACCAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTCTAGCTATATTCCATCAGTGTAGAAATCGAAACAGAGCTAGATGAAGCAGATCCCCGACTCAGTCGTTCCTCCTTCT
CGAGGATGACGGAGTCGGAA

Product: nuclease subunit C

Products: 5'-phosphomonoesters [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1240; Mature: 1240

Protein sequence:

>1240_residues
MKILSLEFENLNSLKGRWKLDFTQSPFAENGLFAITGPTGAGKTTILDAICLALFHRTPRLKSIAKGNNELMTRGTGECF
AELEFEVQGKTYRSNFHQKRARGKHDGALQTPTCEFADADTDKVLETMLTKKTKLVEQVTGLDFSRFTKSIMLSQGEFAA
FLNANANDRAELLEELTGTEVYSLISERIYDHFKSSEESLNHLKAKAEGVSLLSEEQIQELTAERETLEAEQKRLAEQLK
EWQAHLSWWKDVTKAEQTIATSEHDLKTAQDELDRNQPSLERLANSEPAEKLRPMHKGLKRCEQEVNTTQAHLDNSSKLL
AVRDAEKQDAQTKLTQSSAIVEQVKTEQQDQEKIIDLVRPLDNQIAVLKDKQTAAVNAANTLNEQHTQQRNQQIVLVQKI
DALKQQDQLSTEYLNTHQTDQHLEKYLGQWQAKVEQVRTLERQHAEQLNSAKQTLSAVDAQQTIIKSAQEAKATQDKTLS
ELVVLESSAKQQWVALQGNISEQVLNAQKDLLEYWNRNTHSLLEINRGFLNAQQQLHAKTQAHQTNTQLVDKLSKEREVL
VERYKEKETSLERLTRLIDQEGELAKYRAALESGSECPLCGSTDHSIEQSQDTANLVAQKETENLELTAIKKEGQEHRQQ
LDSLAPMIAALNDDIQRAQADIQQAQLNWQGVVGKLQHSLSDFVGTAPELALLTINDLGNEAIVATFAQQCEVQLSQFSQ
QLKALADAKAHYAEAEKQRLSASVMADKAQSNLELAEQRLADLNKQNHSTNEQVAQIAQTKEQQWNALKESIVQTAIEAP
ELEHIDDWFTAKSQASSTWQQTKQQQADIEKQLITQNAELKTLDDKLSSVEKELATLTQQSESLVLELTRISAERTELFG
DKDIQATSNAMKQKVTEAVNAFDAAQLVLNRSELEHRTEQTKHISFSEELTSKQSSYTQASNAWLEALKTSPFEDEVNFE
AALLDEEVRTQLQSLKKSLDEAIVSAQARLNTAKATQVELQNHVNAKAWQEQEQDQQQVEEATTECQNAQQSHATKIGAI
SANLETDSQNRSNQQDLFKQIDEQQVEFDDISRLNSLIGSKNGDKFRKFAQGLTLENLVYLANKQLQRLHGRYELKRKAD
DGLELQVLDTWQGDVMRDTKTLSGGESFLVSLALALALSDLVSYKTSIDSLFLDEGFGTLDSDTLDIALNALDNLNASGK
MIGVISHVEALKERVPVQLKVTKHSGLGVSEMEKQYKVVA

Sequences:

>Translated_1240_residues
MKILSLEFENLNSLKGRWKLDFTQSPFAENGLFAITGPTGAGKTTILDAICLALFHRTPRLKSIAKGNNELMTRGTGECF
AELEFEVQGKTYRSNFHQKRARGKHDGALQTPTCEFADADTDKVLETMLTKKTKLVEQVTGLDFSRFTKSIMLSQGEFAA
FLNANANDRAELLEELTGTEVYSLISERIYDHFKSSEESLNHLKAKAEGVSLLSEEQIQELTAERETLEAEQKRLAEQLK
EWQAHLSWWKDVTKAEQTIATSEHDLKTAQDELDRNQPSLERLANSEPAEKLRPMHKGLKRCEQEVNTTQAHLDNSSKLL
AVRDAEKQDAQTKLTQSSAIVEQVKTEQQDQEKIIDLVRPLDNQIAVLKDKQTAAVNAANTLNEQHTQQRNQQIVLVQKI
DALKQQDQLSTEYLNTHQTDQHLEKYLGQWQAKVEQVRTLERQHAEQLNSAKQTLSAVDAQQTIIKSAQEAKATQDKTLS
ELVVLESSAKQQWVALQGNISEQVLNAQKDLLEYWNRNTHSLLEINRGFLNAQQQLHAKTQAHQTNTQLVDKLSKEREVL
VERYKEKETSLERLTRLIDQEGELAKYRAALESGSECPLCGSTDHSIEQSQDTANLVAQKETENLELTAIKKEGQEHRQQ
LDSLAPMIAALNDDIQRAQADIQQAQLNWQGVVGKLQHSLSDFVGTAPELALLTINDLGNEAIVATFAQQCEVQLSQFSQ
QLKALADAKAHYAEAEKQRLSASVMADKAQSNLELAEQRLADLNKQNHSTNEQVAQIAQTKEQQWNALKESIVQTAIEAP
ELEHIDDWFTAKSQASSTWQQTKQQQADIEKQLITQNAELKTLDDKLSSVEKELATLTQQSESLVLELTRISAERTELFG
DKDIQATSNAMKQKVTEAVNAFDAAQLVLNRSELEHRTEQTKHISFSEELTSKQSSYTQASNAWLEALKTSPFEDEVNFE
AALLDEEVRTQLQSLKKSLDEAIVSAQARLNTAKATQVELQNHVNAKAWQEQEQDQQQVEEATTECQNAQQSHATKIGAI
SANLETDSQNRSNQQDLFKQIDEQQVEFDDISRLNSLIGSKNGDKFRKFAQGLTLENLVYLANKQLQRLHGRYELKRKAD
DGLELQVLDTWQGDVMRDTKTLSGGESFLVSLALALALSDLVSYKTSIDSLFLDEGFGTLDSDTLDIALNALDNLNASGK
MIGVISHVEALKERVPVQLKVTKHSGLGVSEMEKQYKVVA
>Mature_1240_residues
MKILSLEFENLNSLKGRWKLDFTQSPFAENGLFAITGPTGAGKTTILDAICLALFHRTPRLKSIAKGNNELMTRGTGECF
AELEFEVQGKTYRSNFHQKRARGKHDGALQTPTCEFADADTDKVLETMLTKKTKLVEQVTGLDFSRFTKSIMLSQGEFAA
FLNANANDRAELLEELTGTEVYSLISERIYDHFKSSEESLNHLKAKAEGVSLLSEEQIQELTAERETLEAEQKRLAEQLK
EWQAHLSWWKDVTKAEQTIATSEHDLKTAQDELDRNQPSLERLANSEPAEKLRPMHKGLKRCEQEVNTTQAHLDNSSKLL
AVRDAEKQDAQTKLTQSSAIVEQVKTEQQDQEKIIDLVRPLDNQIAVLKDKQTAAVNAANTLNEQHTQQRNQQIVLVQKI
DALKQQDQLSTEYLNTHQTDQHLEKYLGQWQAKVEQVRTLERQHAEQLNSAKQTLSAVDAQQTIIKSAQEAKATQDKTLS
ELVVLESSAKQQWVALQGNISEQVLNAQKDLLEYWNRNTHSLLEINRGFLNAQQQLHAKTQAHQTNTQLVDKLSKEREVL
VERYKEKETSLERLTRLIDQEGELAKYRAALESGSECPLCGSTDHSIEQSQDTANLVAQKETENLELTAIKKEGQEHRQQ
LDSLAPMIAALNDDIQRAQADIQQAQLNWQGVVGKLQHSLSDFVGTAPELALLTINDLGNEAIVATFAQQCEVQLSQFSQ
QLKALADAKAHYAEAEKQRLSASVMADKAQSNLELAEQRLADLNKQNHSTNEQVAQIAQTKEQQWNALKESIVQTAIEAP
ELEHIDDWFTAKSQASSTWQQTKQQQADIEKQLITQNAELKTLDDKLSSVEKELATLTQQSESLVLELTRISAERTELFG
DKDIQATSNAMKQKVTEAVNAFDAAQLVLNRSELEHRTEQTKHISFSEELTSKQSSYTQASNAWLEALKTSPFEDEVNFE
AALLDEEVRTQLQSLKKSLDEAIVSAQARLNTAKATQVELQNHVNAKAWQEQEQDQQQVEEATTECQNAQQSHATKIGAI
SANLETDSQNRSNQQDLFKQIDEQQVEFDDISRLNSLIGSKNGDKFRKFAQGLTLENLVYLANKQLQRLHGRYELKRKAD
DGLELQVLDTWQGDVMRDTKTLSGGESFLVSLALALALSDLVSYKTSIDSLFLDEGFGTLDSDTLDIALNALDNLNASGK
MIGVISHVEALKERVPVQLKVTKHSGLGVSEMEKQYKVVA

Specific function: SbcCD cleaves DNA hairpin structures. These structures can inhibit DNA replication and are intermediates in certain DNA recombination reactions. The complex acts as a 3'->5' double strand exonuclease that can open hairpins. It also has a 5' single-strand

COG id: COG0419

COG function: function code L; ATPase involved in DNA repair

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the SMC family. SbcC subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786597, Length=294, Percent_Identity=51.7006802721088, Blast_Score=312, Evalue=9e-86,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004592 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 139245; Mature: 139245

Theoretical pI: Translated: 4.86; Mature: 4.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKILSLEFENLNSLKGRWKLDFTQSPFAENGLFAITGPTGAGKTTILDAICLALFHRTPR
CCEEEEEHHCHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
LKSIAKGNNELMTRGTGECFAELEFEVQGKTYRSNFHQKRARGKHDGALQTPTCEFADAD
HHHHHCCCCHHECCCCCHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
TDKVLETMLTKKTKLVEQVTGLDFSRFTKSIMLSQGEFAAFLNANANDRAELLEELTGTE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
VYSLISERIYDHFKSSEESLNHLKAKAEGVSLLSEEQIQELTAERETLEAEQKRLAEQLK
HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EWQAHLSWWKDVTKAEQTIATSEHDLKTAQDELDRNQPSLERLANSEPAEKLRPMHKGLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
RCEQEVNTTQAHLDNSSKLLAVRDAEKQDAQTKLTQSSAIVEQVKTEQQDQEKIIDLVRP
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LDNQIAVLKDKQTAAVNAANTLNEQHTQQRNQQIVLVQKIDALKQQDQLSTEYLNTHQTD
CCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
QHLEKYLGQWQAKVEQVRTLERQHAEQLNSAKQTLSAVDAQQTIIKSAQEAKATQDKTLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELVVLESSAKQQWVALQGNISEQVLNAQKDLLEYWNRNTHSLLEINRGFLNAQQQLHAKT
HHHHHHCCCHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QAHQTNTQLVDKLSKEREVLVERYKEKETSLERLTRLIDQEGELAKYRAALESGSECPLC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
GSTDHSIEQSQDTANLVAQKETENLELTAIKKEGQEHRQQLDSLAPMIAALNDDIQRAQA
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DIQQAQLNWQGVVGKLQHSLSDFVGTAPELALLTINDLGNEAIVATFAQQCEVQLSQFSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLKALADAKAHYAEAEKQRLSASVMADKAQSNLELAEQRLADLNKQNHSTNEQVAQIAQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
KEQQWNALKESIVQTAIEAPELEHIDDWFTAKSQASSTWQQTKQQQADIEKQLITQNAEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
KTLDDKLSSVEKELATLTQQSESLVLELTRISAERTELFGDKDIQATSNAMKQKVTEAVN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFDAAQLVLNRSELEHRTEQTKHISFSEELTSKQSSYTQASNAWLEALKTSPFEDEVNFE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
AALLDEEVRTQLQSLKKSLDEAIVSAQARLNTAKATQVELQNHVNAKAWQEQEQDQQQVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
EATTECQNAQQSHATKIGAISANLETDSQNRSNQQDLFKQIDEQQVEFDDISRLNSLIGS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC
KNGDKFRKFAQGLTLENLVYLANKQLQRLHGRYELKRKADDGLELQVLDTWQGDVMRDTK
CCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHH
TLSGGESFLVSLALALALSDLVSYKTSIDSLFLDEGFGTLDSDTLDIALNALDNLNASGK
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC
MIGVISHVEALKERVPVQLKVTKHSGLGVSEMEKQYKVVA
HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKILSLEFENLNSLKGRWKLDFTQSPFAENGLFAITGPTGAGKTTILDAICLALFHRTPR
CCEEEEEHHCHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
LKSIAKGNNELMTRGTGECFAELEFEVQGKTYRSNFHQKRARGKHDGALQTPTCEFADAD
HHHHHCCCCHHECCCCCHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
TDKVLETMLTKKTKLVEQVTGLDFSRFTKSIMLSQGEFAAFLNANANDRAELLEELTGTE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
VYSLISERIYDHFKSSEESLNHLKAKAEGVSLLSEEQIQELTAERETLEAEQKRLAEQLK
HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EWQAHLSWWKDVTKAEQTIATSEHDLKTAQDELDRNQPSLERLANSEPAEKLRPMHKGLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
RCEQEVNTTQAHLDNSSKLLAVRDAEKQDAQTKLTQSSAIVEQVKTEQQDQEKIIDLVRP
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LDNQIAVLKDKQTAAVNAANTLNEQHTQQRNQQIVLVQKIDALKQQDQLSTEYLNTHQTD
CCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
QHLEKYLGQWQAKVEQVRTLERQHAEQLNSAKQTLSAVDAQQTIIKSAQEAKATQDKTLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELVVLESSAKQQWVALQGNISEQVLNAQKDLLEYWNRNTHSLLEINRGFLNAQQQLHAKT
HHHHHHCCCHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QAHQTNTQLVDKLSKEREVLVERYKEKETSLERLTRLIDQEGELAKYRAALESGSECPLC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
GSTDHSIEQSQDTANLVAQKETENLELTAIKKEGQEHRQQLDSLAPMIAALNDDIQRAQA
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DIQQAQLNWQGVVGKLQHSLSDFVGTAPELALLTINDLGNEAIVATFAQQCEVQLSQFSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLKALADAKAHYAEAEKQRLSASVMADKAQSNLELAEQRLADLNKQNHSTNEQVAQIAQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
KEQQWNALKESIVQTAIEAPELEHIDDWFTAKSQASSTWQQTKQQQADIEKQLITQNAEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
KTLDDKLSSVEKELATLTQQSESLVLELTRISAERTELFGDKDIQATSNAMKQKVTEAVN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFDAAQLVLNRSELEHRTEQTKHISFSEELTSKQSSYTQASNAWLEALKTSPFEDEVNFE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
AALLDEEVRTQLQSLKKSLDEAIVSAQARLNTAKATQVELQNHVNAKAWQEQEQDQQQVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
EATTECQNAQQSHATKIGAISANLETDSQNRSNQQDLFKQIDEQQVEFDDISRLNSLIGS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC
KNGDKFRKFAQGLTLENLVYLANKQLQRLHGRYELKRKADDGLELQVLDTWQGDVMRDTK
CCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHH
TLSGGESFLVSLALALALSDLVSYKTSIDSLFLDEGFGTLDSDTLDIALNALDNLNASGK
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC
MIGVISHVEALKERVPVQLKVTKHSGLGVSEMEKQYKVVA
HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: ribo- or deoxyribonucleic acids [C]

Specific reaction: ribo- or deoxyribonucleic acids = 5'-phosphomonoesters [C]

General reaction: Hydrolase; Acting on ester bonds [C]

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 2530497; 9278503; 1744033; 1490631; 10886369; 9653124; 9927737 [H]