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The map label for this gene is yjiO [C]

Identifier: 218709316

GI number: 218709316

Start: 1428642

End: 1431266

Strand: Reverse

Name: yjiO [C]

Synonym: VS_1325

Alternate gene names: 218709316

Gene position: 1431266-1428642 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218709317

Following gene: 218709315

Centisome position: 43.38

GC content: 40.57

Gene sequence:

>2625_bases
ATGAACAGCAAGACCAGCCAAACCTCCACCAATCCGACATCATTTAGCCTGTCACTTAGGGTCAAATTGATGTTTGCCAT
CATGGCGGTTTTGCTGTTTTCCATCACGTTAAATGCAACACTGAACTATTTCAATTTCGAGAAAAGGCTAACGGAAACCT
CCGATTCTACCTATCGAATCGTTTTAGAAGAAACACATAATGATATCAATCAAGCAATCAGTTTAGGTCTGCCTCTTTCA
GCTATATCGAACATACAAGGTATCCTAGATCGTAGGCTAAAGTTTGTTGATGGCATTACTGCATTAATGGTGGTGTCTAC
CTCTGGTGAACAACTATTTGGCACAGGTGTACACAACCAAGCAAACGATCGTCAGCTATCACTTGATATAACCAATTCTT
TCGGTTTAGTTGAAGGCCAAATAAAGCTCTACTACTCTACGTCACTATTAGACCAACAAAAAGCGTCCTTGCTAAAGGAT
CAATTCTTGTATTCAGTCATATGGATAGTGCTGTCTTGCGCATTTGCCTTTATAGCATTGAAATATCTGTTAGAAGGGAT
TGTAGACCGTGTTAAAGGTGCAACTGCGATAATCGAAACTTCTGATGGAGCTAGCGATTTACTTCCTACGTTAGCTCAAG
CACATAAGGCACTGCAATCTCCCTATTCAATGTCCAAGTTCGAGAAATTGAAAACAAAACACTTTCCCGTGTTTATCATT
TCTCTTGCTATCCTGTTAACGATTATTGCTAATTTAGGTGTTTCTTATCAATCTCTGGACAAGTTTTCGCAGATTTATGA
AGTTAAACTCGAGCAGAAATCAACCCTGATTGGTGACTCACTAAATCAGATGATTAAAGGGTTACTCAATAAAGGCGTTC
CTGACAACAGACTGCATGGCTTAGAAGACGAATTTGCTTTCTTCGTTGATAACCACAGTGAGATTCTATCTATTACTTTT
AACGGGGAGTCTGGTAGCTCTTATCACTATCCAGAGGAAAATGTAAAACACGCGTCTATACGCGTATCAACGTTTAATAG
TGACAACCTCGATAATAGCAACGACCACAACAATATAGACAACCACAATAACAGTAATAGCCAAAGTCACACAATGCAGC
TGAAGGTGACTACCGACAACAACTTGATCATGAATATGCTGAAAGAAAGCGTCATGGATATGATCACCGTTTTGGTCGCA
TCTTGCCTTGTCGTCGCCGAAATAATTCTATTCATGTGTAACTTCATGATTATTTCACCTTGGAACCAATTAAAGAAAGT
ATTCATGCTTGTGAACCGAGATATCGTCAATCACTTGGCAAAAACTTCTTCTCGCGACGAGTTTGGCAAATTGCTTCATC
TAGCTAACCAAGCAATTATTAAGCTAAAGCCTGCTCAGCCTTCACAAGATATTGATAAACAAGACTTTCGATTCATTCGC
TTACCACTATTTTTATTGGTCCTCTCGGAAGCGTCTTCACTAGCCTTTTTTCCTAGGTTCGTGTCTTCACTGGACAACAT
AACGGGTTGGATTCCTGACAACCTAGTGACTAGTCTACCAATTTCACTGTTCATGTTGTGTTGGGCGATCTCACTACCAT
TTGCGGGATACTGGTCAGACAAAGTAGGCAGAAGACATTCGTTGATGACAGGAGGGCTGATCACGAGCATAGGGTTAATC
GCTACTGCTTTCGTTCAATCCCTCGAATTCTTATTAGTAGCGCGTGCATTCACGGCGGTTGGTTATGGTATCGTTTTTAT
TTCCGCACAGGGTTATGTGTCAGATACCACCAACGATTCTAATCGTACTAAAGGAATGGCGACTTTCTTGTCATCATTTT
TCTCTGGCTCTCTATGTGGAGCCGCGATTGGTGGGATCCTTGCGGAGAAGCTTGGATACTCAGAGACGTTTATGCTCGCT
GGATTGATCGCAACGCTCAGTGTCTTACTTGTCTATGTGTTTTTTGAGAAATCAAGCACAACTAACTCAAGTAAACCTCT
CAATTTAAAAGATTTCAAACAACTGTTAAGTAACAAATATTTTGCATTAATCACGATATTCAGTGCGATACCAGCGAAGA
TCGTACTTACTGGTTTCCTTTACTATATTTGCCCGGTTTATCTACAATTCTTGGGCGAAAGTAGCTCTGTTTCTGGCCGA
GTAATTATGGCTTACGGTCTTGCAATCATCGTCATTTCACCGTTGAGCGCAATTCTAGTCGACAAACTCAAAAACAAAAT
GGCTTTCATTTTTATCGGTGGGCTACTTTCTTCTCTTGCATTACTCAACTTCTACTTCTTCCAAGGTACATTGGGAGTGT
TACTGATCGTCATCATTATCGGCATTGCGCATGGCATTTGTGTTTCGCCTCAAATACCACTGGTCATCGAACTACTCTCC
GGCCAAGGAATTGAAAAAGGGAAAATTATCGGTATCTTCAGGCTCACCGAGCGCATCGGTAATATTGCAGGGCCTATGCT
AGCAGGCGTATGTTTGAGCATTTTTGGTTACGATAATACCATCCTTATATTTGGGGTTTCATTACTCGTGAGTTCATTTA
GTCTAATTCTGTTCTTTTCATTATTTCTAGAATCCGATAAACAGAAATTAGGGGTTCAATCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCGGGCGATTAAGCCGCAGCGAACCCATTACTCAAGTAACAGTTAGTGCAACGAACAACAGTGCTGACTTCGATTTATC
TATTAAGTAGGCCTTAACCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTTTTAGTTTTCGTTATCACCTTTATTTTAATGACTCCCTTCACCTTTGCCAAAAGTGATGAAAAACACGTTGTCCTT
TTATTGTGGCGTGGAGTAAC

Product: hypothetical protein

Products: Proton [Cytoplasm]; drug [Periplasm] [C]

Alternate protein names: Facilitator Superfamily Permease; Facilitator Superfamily Protein; Arabinose Efflux Permease; Facilitator Superfamily Transporter; Methyl-Accepting Chemotaxis Protein; Permease Of Facilitator Superfamily

Number of amino acids: Translated: 874; Mature: 874

Protein sequence:

>874_residues
MNSKTSQTSTNPTSFSLSLRVKLMFAIMAVLLFSITLNATLNYFNFEKRLTETSDSTYRIVLEETHNDINQAISLGLPLS
AISNIQGILDRRLKFVDGITALMVVSTSGEQLFGTGVHNQANDRQLSLDITNSFGLVEGQIKLYYSTSLLDQQKASLLKD
QFLYSVIWIVLSCAFAFIALKYLLEGIVDRVKGATAIIETSDGASDLLPTLAQAHKALQSPYSMSKFEKLKTKHFPVFII
SLAILLTIIANLGVSYQSLDKFSQIYEVKLEQKSTLIGDSLNQMIKGLLNKGVPDNRLHGLEDEFAFFVDNHSEILSITF
NGESGSSYHYPEENVKHASIRVSTFNSDNLDNSNDHNNIDNHNNSNSQSHTMQLKVTTDNNLIMNMLKESVMDMITVLVA
SCLVVAEIILFMCNFMIISPWNQLKKVFMLVNRDIVNHLAKTSSRDEFGKLLHLANQAIIKLKPAQPSQDIDKQDFRFIR
LPLFLLVLSEASSLAFFPRFVSSLDNITGWIPDNLVTSLPISLFMLCWAISLPFAGYWSDKVGRRHSLMTGGLITSIGLI
ATAFVQSLEFLLVARAFTAVGYGIVFISAQGYVSDTTNDSNRTKGMATFLSSFFSGSLCGAAIGGILAEKLGYSETFMLA
GLIATLSVLLVYVFFEKSSTTNSSKPLNLKDFKQLLSNKYFALITIFSAIPAKIVLTGFLYYICPVYLQFLGESSSVSGR
VIMAYGLAIIVISPLSAILVDKLKNKMAFIFIGGLLSSLALLNFYFFQGTLGVLLIVIIIGIAHGICVSPQIPLVIELLS
GQGIEKGKIIGIFRLTERIGNIAGPMLAGVCLSIFGYDNTILIFGVSLLVSSFSLILFFSLFLESDKQKLGVQS

Sequences:

>Translated_874_residues
MNSKTSQTSTNPTSFSLSLRVKLMFAIMAVLLFSITLNATLNYFNFEKRLTETSDSTYRIVLEETHNDINQAISLGLPLS
AISNIQGILDRRLKFVDGITALMVVSTSGEQLFGTGVHNQANDRQLSLDITNSFGLVEGQIKLYYSTSLLDQQKASLLKD
QFLYSVIWIVLSCAFAFIALKYLLEGIVDRVKGATAIIETSDGASDLLPTLAQAHKALQSPYSMSKFEKLKTKHFPVFII
SLAILLTIIANLGVSYQSLDKFSQIYEVKLEQKSTLIGDSLNQMIKGLLNKGVPDNRLHGLEDEFAFFVDNHSEILSITF
NGESGSSYHYPEENVKHASIRVSTFNSDNLDNSNDHNNIDNHNNSNSQSHTMQLKVTTDNNLIMNMLKESVMDMITVLVA
SCLVVAEIILFMCNFMIISPWNQLKKVFMLVNRDIVNHLAKTSSRDEFGKLLHLANQAIIKLKPAQPSQDIDKQDFRFIR
LPLFLLVLSEASSLAFFPRFVSSLDNITGWIPDNLVTSLPISLFMLCWAISLPFAGYWSDKVGRRHSLMTGGLITSIGLI
ATAFVQSLEFLLVARAFTAVGYGIVFISAQGYVSDTTNDSNRTKGMATFLSSFFSGSLCGAAIGGILAEKLGYSETFMLA
GLIATLSVLLVYVFFEKSSTTNSSKPLNLKDFKQLLSNKYFALITIFSAIPAKIVLTGFLYYICPVYLQFLGESSSVSGR
VIMAYGLAIIVISPLSAILVDKLKNKMAFIFIGGLLSSLALLNFYFFQGTLGVLLIVIIIGIAHGICVSPQIPLVIELLS
GQGIEKGKIIGIFRLTERIGNIAGPMLAGVCLSIFGYDNTILIFGVSLLVSSFSLILFFSLFLESDKQKLGVQS
>Mature_874_residues
MNSKTSQTSTNPTSFSLSLRVKLMFAIMAVLLFSITLNATLNYFNFEKRLTETSDSTYRIVLEETHNDINQAISLGLPLS
AISNIQGILDRRLKFVDGITALMVVSTSGEQLFGTGVHNQANDRQLSLDITNSFGLVEGQIKLYYSTSLLDQQKASLLKD
QFLYSVIWIVLSCAFAFIALKYLLEGIVDRVKGATAIIETSDGASDLLPTLAQAHKALQSPYSMSKFEKLKTKHFPVFII
SLAILLTIIANLGVSYQSLDKFSQIYEVKLEQKSTLIGDSLNQMIKGLLNKGVPDNRLHGLEDEFAFFVDNHSEILSITF
NGESGSSYHYPEENVKHASIRVSTFNSDNLDNSNDHNNIDNHNNSNSQSHTMQLKVTTDNNLIMNMLKESVMDMITVLVA
SCLVVAEIILFMCNFMIISPWNQLKKVFMLVNRDIVNHLAKTSSRDEFGKLLHLANQAIIKLKPAQPSQDIDKQDFRFIR
LPLFLLVLSEASSLAFFPRFVSSLDNITGWIPDNLVTSLPISLFMLCWAISLPFAGYWSDKVGRRHSLMTGGLITSIGLI
ATAFVQSLEFLLVARAFTAVGYGIVFISAQGYVSDTTNDSNRTKGMATFLSSFFSGSLCGAAIGGILAEKLGYSETFMLA
GLIATLSVLLVYVFFEKSSTTNSSKPLNLKDFKQLLSNKYFALITIFSAIPAKIVLTGFLYYICPVYLQFLGESSSVSGR
VIMAYGLAIIVISPLSAILVDKLKNKMAFIFIGGLLSSLALLNFYFFQGTLGVLLIVIIIGIAHGICVSPQIPLVIELLS
GQGIEKGKIIGIFRLTERIGNIAGPMLAGVCLSIFGYDNTILIFGVSLLVSSFSLILFFSLFLESDKQKLGVQS

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein. Inner Membrane [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96239; Mature: 96239

Theoretical pI: Translated: 7.61; Mature: 7.61

Prosite motif: PS50850 MFS ; PS00216 SUGAR_TRANSPORT_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNSKTSQTSTNPTSFSLSLRVKLMFAIMAVLLFSITLNATLNYFNFEKRLTETSDSTYRI
CCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHCCCCCEEEE
VLEETHNDINQAISLGLPLSAISNIQGILDRRLKFVDGITALMVVSTSGEQLFGTGVHNQ
EEEHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEEECCCCCCC
ANDRQLSLDITNSFGLVEGQIKLYYSTSLLDQQKASLLKDQFLYSVIWIVLSCAFAFIAL
CCCCEEEEEEECCCCEEECEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYLLEGIVDRVKGATAIIETSDGASDLLPTLAQAHKALQSPYSMSKFEKLKTKHFPVFII
HHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHH
SLAILLTIIANLGVSYQSLDKFSQIYEVKLEQKSTLIGDSLNQMIKGLLNKGVPDNRLHG
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
LEDEFAFFVDNHSEILSITFNGESGSSYHYPEENVKHASIRVSTFNSDNLDNSNDHNNID
CCCCCEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCC
NHNNSNSQSHTMQLKVTTDNNLIMNMLKESVMDMITVLVASCLVVAEIILFMCNFMIISP
CCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECC
WNQLKKVFMLVNRDIVNHLAKTSSRDEFGKLLHLANQAIIKLKPAQPSQDIDKQDFRFIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHH
LPLFLLVLSEASSLAFFPRFVSSLDNITGWIPDNLVTSLPISLFMLCWAISLPFAGYWSD
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
KVGRRHSLMTGGLITSIGLIATAFVQSLEFLLVARAFTAVGYGIVFISAQGYVSDTTNDS
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCCCCC
NRTKGMATFLSSFFSGSLCGAAIGGILAEKLGYSETFMLAGLIATLSVLLVYVFFEKSST
CHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TNSSKPLNLKDFKQLLSNKYFALITIFSAIPAKIVLTGFLYYICPVYLQFLGESSSVSGR
CCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
VIMAYGLAIIVISPLSAILVDKLKNKMAFIFIGGLLSSLALLNFYFFQGTLGVLLIVIII
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIAHGICVSPQIPLVIELLSGQGIEKGKIIGIFRLTERIGNIAGPMLAGVCLSIFGYDNT
HHHCCCCCCCCCCHHHEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
ILIFGVSLLVSSFSLILFFSLFLESDKQKLGVQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNSKTSQTSTNPTSFSLSLRVKLMFAIMAVLLFSITLNATLNYFNFEKRLTETSDSTYRI
CCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHCCCCCEEEE
VLEETHNDINQAISLGLPLSAISNIQGILDRRLKFVDGITALMVVSTSGEQLFGTGVHNQ
EEEHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEEECCCCCCC
ANDRQLSLDITNSFGLVEGQIKLYYSTSLLDQQKASLLKDQFLYSVIWIVLSCAFAFIAL
CCCCEEEEEEECCCCEEECEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYLLEGIVDRVKGATAIIETSDGASDLLPTLAQAHKALQSPYSMSKFEKLKTKHFPVFII
HHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHH
SLAILLTIIANLGVSYQSLDKFSQIYEVKLEQKSTLIGDSLNQMIKGLLNKGVPDNRLHG
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
LEDEFAFFVDNHSEILSITFNGESGSSYHYPEENVKHASIRVSTFNSDNLDNSNDHNNID
CCCCCEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCC
NHNNSNSQSHTMQLKVTTDNNLIMNMLKESVMDMITVLVASCLVVAEIILFMCNFMIISP
CCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECC
WNQLKKVFMLVNRDIVNHLAKTSSRDEFGKLLHLANQAIIKLKPAQPSQDIDKQDFRFIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHH
LPLFLLVLSEASSLAFFPRFVSSLDNITGWIPDNLVTSLPISLFMLCWAISLPFAGYWSD
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
KVGRRHSLMTGGLITSIGLIATAFVQSLEFLLVARAFTAVGYGIVFISAQGYVSDTTNDS
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCCCCC
NRTKGMATFLSSFFSGSLCGAAIGGILAEKLGYSETFMLAGLIATLSVLLVYVFFEKSST
CHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TNSSKPLNLKDFKQLLSNKYFALITIFSAIPAKIVLTGFLYYICPVYLQFLGESSSVSGR
CCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
VIMAYGLAIIVISPLSAILVDKLKNKMAFIFIGGLLSSLALLNFYFFQGTLGVLLIVIII
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIAHGICVSPQIPLVIELLSGQGIEKGKIIGIFRLTERIGNIAGPMLAGVCLSIFGYDNT
HHHCCCCCCCCCCHHHEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
ILIFGVSLLVSSFSLILFFSLFLESDKQKLGVQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; drug [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + drug [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + drug [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA