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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 218708568

GI number: 218708568

Start: 553097

End: 554674

Strand: Direct

Name: mviN [H]

Synonym: VS_0534

Alternate gene names: 218708568

Gene position: 553097-554674 (Clockwise)

Preceding gene: 218708566

Following gene: 218708569

Centisome position: 16.76

GC content: 44.49

Gene sequence:

>1578_bases
GTGTCAGAGGTTTGTGTGAGTAAACGACTATTAAAGTCAGGCCTGATTGTCAGTGCAATGACTTTTGTTTCCCGCGTATT
GGGGCTAGTACGTGATGTAGTAGTAGCAAATTTGATGGGAGCAGGAGCGAGTGCCGACGTATTTTTCTTCGCTAATAAAA
TCCCTAATTTCTTACGTCGACTTTTCGCAGAAGGTGCCTTTTCTCAAGCGTTTGTTCCTGTATTAACAGAATATCACGCT
GCTGGTGATAAAGATAAGACTCGAGATTTAATTGCCAAAGTATCGGGCACGCTCGGGGTACTAGTTTCTATCGTCACCGT
TATCGGGGTGTTGGGCTCGGGTGTCATCACTGCGATGTTTGGCGCAGGTTGGTTTATCGATTGGTTAAATGATGGCCCAG
CAGCACCAAAATTTGAGCTGGCGAGCTTTATGCTCAAGATTACCTTTCCTTATTTATGGTTTATCACCTTTGTTGCTTTA
TCTGGTGCAATCCTCAATACCATGGGCAAATTTGCGGTTTCGTCATTTACCCCTGTGTTCCTGAACGTAATGATCATAGG
TTCAGCATGGTTTATCTCTCCTAATTTAGAACAACCCGAAATTGGCTTGGCCATCGGTGTGTTTCTTGGTGGTTTAGTCC
AGTTCCTTTTCCAAATGCCTTTCTTGATTAAAGCGGGTGTGTTGGTTAAGCCGAAGTGGGGGTGGAGAGATCCCGGTGTA
GTTAAGATCCGCACGCTAATGATCCCTGCCTTGTTTGGTGTGTCAGTGAGCCAAATCAACTTGTTGTTCGATACCTTCAT
TGCCAGCTTTCTAGCAACCGGCTCTATCAGTTGGCTATATTATTCGGATCGATTATTGGAATTCCCACTCGGTTTGTTTG
GTATTGCTATTGCGACGGTTATTCTTCCTGCTTTGTCGCGTAAACACGTAGACGCTCAAGGGGAAGGGTTTGCTCATACA
ATGGACTGGGGCGTGCGCATGGTTTTATTGCTAGGCATTCCTGCAATGTTAGGTCTTATTGTTTTAGCAAAGCCGATGCT
GATGGTGCTCTTCATGCGTGGCGAGTTTTCACCACACGATGTACAGCAGGCTTCCATGTCTTTGGTGGCATACGCTTCAG
GCTTGCTTAACTTCATGTTGATTAAAGTGTTGGCTCCGGGCTATTACTCACGTCAAGATACTAAAACTCCTGTGAAGTAC
GGCATCATTGCGATGGTCACTAACATGGTGTTCAACGCGATCTTCGCTTATTTCTATGGTTATGTTGGTTTGGCAATCGC
AACTGCGTTATCTGCGTTCGTGAACATGACTCTACTTTATCGTGGTCTGCATATAGCGGGTGTTTATCGTTTAACCAAGA
CTACATTGTTGTTTAGCCTTAAATTATTAGTATCTGGAACTGTGATGGTTGGCGTGATTTTATGGCAACTAGACAATATG
CAGCTGTGGCTTGATTGGAGCTTCAACCAAAGAGCGTTGACGCTAACAGGGTTGATCGCACTTGGTGGCTTTGCTTATAT
TGTGTCGGTACTGGTTTTAGGTATCCGAGTAAAACATTTAAAAGCAGCGACAGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGATGGCGGGGATTCTAACAGCATTTTTAGACCAATGCTAATAAATATGCTTCTTAGGACAGGATAGTATTTATCCT
CGCTTGAAAGTAATCAACCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACTGATTAGTATATAATCCGTCGGTTTCACACAATAAATGATGCAAATAACAGGTTTTAGCTGATCACAATGGAACTGA
TCCGAGGTATACACAATATT

Product: virulence factor mviN homolog

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 525; Mature: 524

Protein sequence:

>525_residues
MSEVCVSKRLLKSGLIVSAMTFVSRVLGLVRDVVVANLMGAGASADVFFFANKIPNFLRRLFAEGAFSQAFVPVLTEYHA
AGDKDKTRDLIAKVSGTLGVLVSIVTVIGVLGSGVITAMFGAGWFIDWLNDGPAAPKFELASFMLKITFPYLWFITFVAL
SGAILNTMGKFAVSSFTPVFLNVMIIGSAWFISPNLEQPEIGLAIGVFLGGLVQFLFQMPFLIKAGVLVKPKWGWRDPGV
VKIRTLMIPALFGVSVSQINLLFDTFIASFLATGSISWLYYSDRLLEFPLGLFGIAIATVILPALSRKHVDAQGEGFAHT
MDWGVRMVLLLGIPAMLGLIVLAKPMLMVLFMRGEFSPHDVQQASMSLVAYASGLLNFMLIKVLAPGYYSRQDTKTPVKY
GIIAMVTNMVFNAIFAYFYGYVGLAIATALSAFVNMTLLYRGLHIAGVYRLTKTTLLFSLKLLVSGTVMVGVILWQLDNM
QLWLDWSFNQRALTLTGLIALGGFAYIVSVLVLGIRVKHLKAATD

Sequences:

>Translated_525_residues
MSEVCVSKRLLKSGLIVSAMTFVSRVLGLVRDVVVANLMGAGASADVFFFANKIPNFLRRLFAEGAFSQAFVPVLTEYHA
AGDKDKTRDLIAKVSGTLGVLVSIVTVIGVLGSGVITAMFGAGWFIDWLNDGPAAPKFELASFMLKITFPYLWFITFVAL
SGAILNTMGKFAVSSFTPVFLNVMIIGSAWFISPNLEQPEIGLAIGVFLGGLVQFLFQMPFLIKAGVLVKPKWGWRDPGV
VKIRTLMIPALFGVSVSQINLLFDTFIASFLATGSISWLYYSDRLLEFPLGLFGIAIATVILPALSRKHVDAQGEGFAHT
MDWGVRMVLLLGIPAMLGLIVLAKPMLMVLFMRGEFSPHDVQQASMSLVAYASGLLNFMLIKVLAPGYYSRQDTKTPVKY
GIIAMVTNMVFNAIFAYFYGYVGLAIATALSAFVNMTLLYRGLHIAGVYRLTKTTLLFSLKLLVSGTVMVGVILWQLDNM
QLWLDWSFNQRALTLTGLIALGGFAYIVSVLVLGIRVKHLKAATD
>Mature_524_residues
SEVCVSKRLLKSGLIVSAMTFVSRVLGLVRDVVVANLMGAGASADVFFFANKIPNFLRRLFAEGAFSQAFVPVLTEYHAA
GDKDKTRDLIAKVSGTLGVLVSIVTVIGVLGSGVITAMFGAGWFIDWLNDGPAAPKFELASFMLKITFPYLWFITFVALS
GAILNTMGKFAVSSFTPVFLNVMIIGSAWFISPNLEQPEIGLAIGVFLGGLVQFLFQMPFLIKAGVLVKPKWGWRDPGVV
KIRTLMIPALFGVSVSQINLLFDTFIASFLATGSISWLYYSDRLLEFPLGLFGIAIATVILPALSRKHVDAQGEGFAHTM
DWGVRMVLLLGIPAMLGLIVLAKPMLMVLFMRGEFSPHDVQQASMSLVAYASGLLNFMLIKVLAPGYYSRQDTKTPVKYG
IIAMVTNMVFNAIFAYFYGYVGLAIATALSAFVNMTLLYRGLHIAGVYRLTKTTLLFSLKLLVSGTVMVGVILWQLDNMQ
LWLDWSFNQRALTLTGLIALGGFAYIVSVLVLGIRVKHLKAATD

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=516, Percent_Identity=42.2480620155039, Blast_Score=388, Evalue=1e-109,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57264; Mature: 57133

Theoretical pI: Translated: 10.12; Mature: 10.12

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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EEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
SEVCVSKRLLKSGLIVSAMTFVSRVLGLVRDVVVANLMGAGASADVFFFANKIPNFLRR
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH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EEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9457888; 10952301 [H]