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The map label for this gene is nhaC2 [H]

Identifier: 218233318

GI number: 218233318

Start: 1686977

End: 1688380

Strand: Direct

Name: nhaC2 [H]

Synonym: BCB4264_A1780

Alternate gene names: 218233318

Gene position: 1686977-1688380 (Clockwise)

Preceding gene: 218233837

Following gene: 218231217

Centisome position: 31.13

GC content: 36.4

Gene sequence:

>1404_bases
ATGAAAAGTGTAAGATTACCATCGATGCTAGAAATCATAGTTCTTTTATTACTATTTCTTGCTGTTGTCTTTTCCTTCCA
AACGATTTTTGATCTCCCAATTCAATTAGCGCTATTTATTTCATGGTTTTTAGTAATTGCGCTTGGATTAAGATTAGGAT
TTCGTTATCAAGAATTGCAAGATGCAATTACGAAAGGGATTTCTAACGGATTAGAAGCGATACTGATTTTAGTTGCAGTA
GGTGCTTTAATTGGAACATGGATTGCTGGTGGGGTAGTACCAACATTAATCTATTATGGATTAGAATTTATTCACCCTAG
CATATTCCTATTAGCAACATTAATTATTTGTTCTATAACTTCTATCGCAACAGGAACGTCTTGGGGAACAGTGGGAACAG
CAGGTATTGCTATGATGGCGATTGGTGAAGGACTTGGTTTACCACTTCCGCTTGTTGCTGGTGCAGTTCTTTCAGGAGCT
TATTTCGGCGACAAATTATCACCACTTTCTGATAGCACAGTTCTTGCAGCTTCTATGGCGAAAGTAGATGTTATTGCTCA
CGTTCGAGCTATGCTCGTATTAGATGTTCCGGCTTATATTATTACTAGTATTATGTTTACTGTAGCTGGTTGGATGTATG
GCGGCGATAATGTAGATTTGAATCGAGTAGAATTTTTAAAAGAAGCTTTATTAAAGCAATTTGATATTAAAATATGGATG
CTTGTTCCGGCGGTTATTGTTATCGTTCTATTAGCGATGAAGAAACCGTCTATGCCAACAATTGCAATGGGAGCTTTAAT
TGGTGCAATTTGGGCAACTCTTTTCCAAGGGATGAACTTTGGAGAGGCGATTGGAACAGCTTATAACGGATTCTCAATTC
AATCTGGTGTTGAGTTTGTTGACAAGTTATTAAACCGTGGTGGAATTAACGGCATGCTTGGCTCAGTAGCCGTTATTATT
TTCGGTTTAGGATTTGGTGGATTACTTGAAAAACTAGGTGTTTTAAAAGTAATCGTATCAAAATTTGAGAAGAAATTAAA
TTCTGCAGGTAATGTAACATTGTCTACATTAATCGTGGCATTCTTAGCTAATATATTTGGTTGTGCGATGTATGTATCAC
TAATTTTAACACCAAAAATTATGGAAGATAGCTATGATAAATTAAAAATAGACCGTCGTGTATTAGCGCGTAACTCAGAA
GTAGGTGGAACGTTAACTTCAGGTATGGTTCCATGGTCTGATAATGGTATTTTTATGGCTGGTATTTTAGGTGTAGCAAC
GTTCTCATACGTTCCGTTTATGTGGTTAAGCTTCGTATCGTTAATTTTAGCAGTTATTTACGGATATACAGGCAAATTCA
TCTGGTATGTAGATGATGCAGATAAAGGAAAGCAAGCATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGAAATAATATGAAAATTTTGTTTTGTCTTCGCTAATTGTATATTACATACATGTAAGACGACATACGTCATGTTATCG
ACTTGTAAGGAGAGAAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAAAAATCACCTTCTACAATATGTAGAAGGTGATTTTTTTATTTTTTAATAGCATTTGCTGAAGTTATTTCATTCTCA
TATTTAGCAATTTTTTGTTG

Product: Na+/H+ antiporter NhaC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 467; Mature: 467

Protein sequence:

>467_residues
MKSVRLPSMLEIIVLLLLFLAVVFSFQTIFDLPIQLALFISWFLVIALGLRLGFRYQELQDAITKGISNGLEAILILVAV
GALIGTWIAGGVVPTLIYYGLEFIHPSIFLLATLIICSITSIATGTSWGTVGTAGIAMMAIGEGLGLPLPLVAGAVLSGA
YFGDKLSPLSDSTVLAASMAKVDVIAHVRAMLVLDVPAYIITSIMFTVAGWMYGGDNVDLNRVEFLKEALLKQFDIKIWM
LVPAVIVIVLLAMKKPSMPTIAMGALIGAIWATLFQGMNFGEAIGTAYNGFSIQSGVEFVDKLLNRGGINGMLGSVAVII
FGLGFGGLLEKLGVLKVIVSKFEKKLNSAGNVTLSTLIVAFLANIFGCAMYVSLILTPKIMEDSYDKLKIDRRVLARNSE
VGGTLTSGMVPWSDNGIFMAGILGVATFSYVPFMWLSFVSLILAVIYGYTGKFIWYVDDADKGKQAS

Sequences:

>Translated_467_residues
MKSVRLPSMLEIIVLLLLFLAVVFSFQTIFDLPIQLALFISWFLVIALGLRLGFRYQELQDAITKGISNGLEAILILVAV
GALIGTWIAGGVVPTLIYYGLEFIHPSIFLLATLIICSITSIATGTSWGTVGTAGIAMMAIGEGLGLPLPLVAGAVLSGA
YFGDKLSPLSDSTVLAASMAKVDVIAHVRAMLVLDVPAYIITSIMFTVAGWMYGGDNVDLNRVEFLKEALLKQFDIKIWM
LVPAVIVIVLLAMKKPSMPTIAMGALIGAIWATLFQGMNFGEAIGTAYNGFSIQSGVEFVDKLLNRGGINGMLGSVAVII
FGLGFGGLLEKLGVLKVIVSKFEKKLNSAGNVTLSTLIVAFLANIFGCAMYVSLILTPKIMEDSYDKLKIDRRVLARNSE
VGGTLTSGMVPWSDNGIFMAGILGVATFSYVPFMWLSFVSLILAVIYGYTGKFIWYVDDADKGKQAS
>Mature_467_residues
MKSVRLPSMLEIIVLLLLFLAVVFSFQTIFDLPIQLALFISWFLVIALGLRLGFRYQELQDAITKGISNGLEAILILVAV
GALIGTWIAGGVVPTLIYYGLEFIHPSIFLLATLIICSITSIATGTSWGTVGTAGIAMMAIGEGLGLPLPLVAGAVLSGA
YFGDKLSPLSDSTVLAASMAKVDVIAHVRAMLVLDVPAYIITSIMFTVAGWMYGGDNVDLNRVEFLKEALLKQFDIKIWM
LVPAVIVIVLLAMKKPSMPTIAMGALIGAIWATLFQGMNFGEAIGTAYNGFSIQSGVEFVDKLLNRGGINGMLGSVAVII
FGLGFGGLLEKLGVLKVIVSKFEKKLNSAGNVTLSTLIVAFLANIFGCAMYVSLILTPKIMEDSYDKLKIDRRVLARNSE
VGGTLTSGMVPWSDNGIFMAGILGVATFSYVPFMWLSFVSLILAVIYGYTGKFIWYVDDADKGKQAS

Specific function: Couples proton uptake and Na(+) efflux to the substrate- product malate/lactate antiport, in an electroneutral malate- 2H(+)/Na(+)-lactate exchange. Plays a role in supporting growth to high density on malate at reduced protonmotive force [H]

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the nhaC Na(+)/H(+) antiporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004770
- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50063; Mature: 50063

Theoretical pI: Translated: 7.39; Mature: 7.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377; 10903309 [H]