| Definition | Bacillus cereus B4264, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011725 |
| Length | 5,419,036 |
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The map label for this gene is ydgH [H]
Identifier: 218231239
GI number: 218231239
Start: 2822571
End: 2825687
Strand: Reverse
Name: ydgH [H]
Synonym: BCB4264_A2953
Alternate gene names: 218231239
Gene position: 2825687-2822571 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218236018
Following gene: 218233396
Centisome position: 52.14
GC content: 34.2
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GAAGAGACTGTAGGGAATGATTTCTCTACAGTTTTTTCGGTATATAATATTTCAGATGAAAATGAATCCGATATATTACA GAATGAGCAGTGAAAGGTTA
Product: membrane protein, MmpL family
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1038; Mature: 1037
Protein sequence:
>1038_residues MSKLKSWRSLSFLLWIVITITMVVTMPNMDKLVKEKGKITIPNTKQSSIADKMMKEMDKEGVEKYEIIAVFNSGNKAALT DEQKKEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKDLEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHEKVQTKEVKTYL TGSDLIAGDFLKSSQEGVKKTEVISIIFILVVLILVFRSPVVPIVSLLTVGISYLVSMGIIAQLVDQFNFPFSNFTQVFV VVVLFGVGTDYNILLYTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLL LVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVVRPFVALIIVFVISIPFILKYSNTLNYNDLFEVENKYE SKMGINVIEDHFPPGFSSPSTLVIQSDKKLDEGTSLQIVDELTDKISKVKGVSEVYAPTRPTGEKIKELYLNKQAGELNT GLGDADGGIKEINDGLTDAKNKMGSNDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALHQLSNGINDGAQGAQQIESGLASVN ENINVLSNATSQLHAGYAQLEKGLNSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFVQTKPELANDPNIQQTIGIAKEAQK KLSVLSNELNQLATQHKTAMSSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVNKLQKGAADLKNGLNEGSSGSKQIANKSVELQSGLT KINDGQGQLLTGLKDLQEKMGQLQSGLSKSTEGLGKVSNGLHDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYM SQDRKIAKMTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTVKGTELHDAKTAIGGTTARNVDLKEVTGQDFLRTATIMLIGIAI VLIVITRSLLNTIFIIGSLLLAYFASLGISEQISAHVLHVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNEIEGDSVTK IVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLTLIQVASVVGVALLLLALIVMPILLPALIGLTSKMKSYKEKIINTK
Sequences:
>Translated_1038_residues MSKLKSWRSLSFLLWIVITITMVVTMPNMDKLVKEKGKITIPNTKQSSIADKMMKEMDKEGVEKYEIIAVFNSGNKAALT DEQKKEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKDLEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHEKVQTKEVKTYL TGSDLIAGDFLKSSQEGVKKTEVISIIFILVVLILVFRSPVVPIVSLLTVGISYLVSMGIIAQLVDQFNFPFSNFTQVFV VVVLFGVGTDYNILLYTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLL LVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVVRPFVALIIVFVISIPFILKYSNTLNYNDLFEVENKYE SKMGINVIEDHFPPGFSSPSTLVIQSDKKLDEGTSLQIVDELTDKISKVKGVSEVYAPTRPTGEKIKELYLNKQAGELNT GLGDADGGIKEINDGLTDAKNKMGSNDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALHQLSNGINDGAQGAQQIESGLASVN ENINVLSNATSQLHAGYAQLEKGLNSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFVQTKPELANDPNIQQTIGIAKEAQK KLSVLSNELNQLATQHKTAMSSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVNKLQKGAADLKNGLNEGSSGSKQIANKSVELQSGLT KINDGQGQLLTGLKDLQEKMGQLQSGLSKSTEGLGKVSNGLHDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYM SQDRKIAKMTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTVKGTELHDAKTAIGGTTARNVDLKEVTGQDFLRTATIMLIGIAI VLIVITRSLLNTIFIIGSLLLAYFASLGISEQISAHVLHVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNEIEGDSVTK IVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLTLIQVASVVGVALLLLALIVMPILLPALIGLTSKMKSYKEKIINTK >Mature_1037_residues SKLKSWRSLSFLLWIVITITMVVTMPNMDKLVKEKGKITIPNTKQSSIADKMMKEMDKEGVEKYEIIAVFNSGNKAALTD EQKKEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKDLEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHEKVQTKEVKTYLT GSDLIAGDFLKSSQEGVKKTEVISIIFILVVLILVFRSPVVPIVSLLTVGISYLVSMGIIAQLVDQFNFPFSNFTQVFVV VVLFGVGTDYNILLYTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLL VLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVVRPFVALIIVFVISIPFILKYSNTLNYNDLFEVENKYES KMGINVIEDHFPPGFSSPSTLVIQSDKKLDEGTSLQIVDELTDKISKVKGVSEVYAPTRPTGEKIKELYLNKQAGELNTG LGDADGGIKEINDGLTDAKNKMGSNDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALHQLSNGINDGAQGAQQIESGLASVNE NINVLSNATSQLHAGYAQLEKGLNSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFVQTKPELANDPNIQQTIGIAKEAQKK LSVLSNELNQLATQHKTAMSSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVNKLQKGAADLKNGLNEGSSGSKQIANKSVELQSGLTK INDGQGQLLTGLKDLQEKMGQLQSGLSKSTEGLGKVSNGLHDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMS QDRKIAKMTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTVKGTELHDAKTAIGGTTARNVDLKEVTGQDFLRTATIMLIGIAIV LIVITRSLLNTIFIIGSLLLAYFASLGISEQISAHVLHVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNEIEGDSVTKI VTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLTLIQVASVVGVALLLLALIVMPILLPALIGLTSKMKSYKEKIINTK
Specific function: Unknown
COG id: COG2409
COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mmpL family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004869 - InterPro: IPR000731 [H]
Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 113163; Mature: 113031
Theoretical pI: Translated: 8.37; Mature: 8.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSKLKSWRSLSFLLWIVITITMVVTMPNMDKLVKEKGKITIPNTKQSSIADKMMKEMDKE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH GVEKYEIIAVFNSGNKAALTDEQKKEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKDLEKQLV CCCEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHH SKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHEKVQTKEVKTYLTGSDLIAGDFLKSSQEGVKK CCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH TEVISIIFILVVLILVFRSPVVPIVSLLTVGISYLVSMGIIAQLVDQFNFPFSNFTQVFV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH VVVLFGVGTDYNILLYTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLAL HHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKN HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHCCCCCCCHHHHHHHCC SVVRPFVALIIVFVISIPFILKYSNTLNYNDLFEVENKYESKMGINVIEDHFPPGFSSPS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCC TLVIQSDKKLDEGTSLQIVDELTDKISKVKGVSEVYAPTRPTGEKIKELYLNKQAGELNT EEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCC GLGDADGGIKEINDGLTDAKNKMGSNDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALHQLSN CCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC GINDGAQGAQQIESGLASVNENINVLSNATSQLHAGYAQLEKGLNSYDQYFGSISQAIDG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKKGYEQIEMLMTNFVQTKPELANDPNIQQTIGIAKEAQKKLSVLSNELNQLATQHKTAM HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVNKLQKGAADLKNGLNEGSSGSKQIANKSVELQSGLT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHCCC KINDGQGQLLTGLKDLQEKMGQLQSGLSKSTEGLGKVSNGLHDAQKYLGELNESKSSEKF CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE YIPKEVLEGEDFQKALNTYMSQDRKIAKMTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTVKGT ECCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC ELHDAKTAIGGTTARNVDLKEVTGQDFLRTATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLL CHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAYFASLGISEQISAHVLHVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNEIEGDSVTK HHHHHHCCCHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHH IVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLTLIQVASVVGVALLLLALIVMPILLPAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGLTSKMKSYKEKIINTK HHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure SKLKSWRSLSFLLWIVITITMVVTMPNMDKLVKEKGKITIPNTKQSSIADKMMKEMDKE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH GVEKYEIIAVFNSGNKAALTDEQKKEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKDLEKQLV CCCEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHH SKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHEKVQTKEVKTYLTGSDLIAGDFLKSSQEGVKK CCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH TEVISIIFILVVLILVFRSPVVPIVSLLTVGISYLVSMGIIAQLVDQFNFPFSNFTQVFV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH VVVLFGVGTDYNILLYTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLAL HHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKN HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHCCCCCCCHHHHHHHCC SVVRPFVALIIVFVISIPFILKYSNTLNYNDLFEVENKYESKMGINVIEDHFPPGFSSPS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCC TLVIQSDKKLDEGTSLQIVDELTDKISKVKGVSEVYAPTRPTGEKIKELYLNKQAGELNT EEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCC GLGDADGGIKEINDGLTDAKNKMGSNDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALHQLSN CCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC GINDGAQGAQQIESGLASVNENINVLSNATSQLHAGYAQLEKGLNSYDQYFGSISQAIDG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKKGYEQIEMLMTNFVQTKPELANDPNIQQTIGIAKEAQKKLSVLSNELNQLATQHKTAM HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVNKLQKGAADLKNGLNEGSSGSKQIANKSVELQSGLT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHCCC KINDGQGQLLTGLKDLQEKMGQLQSGLSKSTEGLGKVSNGLHDAQKYLGELNESKSSEKF CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE YIPKEVLEGEDFQKALNTYMSQDRKIAKMTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTVKGT ECCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC ELHDAKTAIGGTTARNVDLKEVTGQDFLRTATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLL CHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAYFASLGISEQISAHVLHVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNEIEGDSVTK HHHHHHCCCHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHH IVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLTLIQVASVVGVALLLLALIVMPILLPAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGLTSKMKSYKEKIINTK HHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]