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The map label for this gene is 213158932

Identifier: 213158932

GI number: 213158932

Start: 3737891

End: 3739519

Strand: Reverse

Name: 213158932

Synonym: AB57_3633

Alternate gene names: NA

Gene position: 3739519-3737891 (Counterclockwise)

Preceding gene: 213158933

Following gene: 213158925

Centisome position: 92.32

GC content: 35.79

Gene sequence:

>1629_bases
ATGCAAGTATTCTTTCTGTTCCTCGCAGCAATTTTGTTGGGTTTTGCGTGGTTATCACCATTCCACTATAACCCTTGGGT
AATGTTTTCTAGTGAAATGAGTACTTTTGCGGCAGGTTTAAGTGTCTTAGCTGTTACTTTTTACCAAAATATTAAAATTC
CGCGTGCACAATTATTGCTATTGCCATTTACTTTAATTCCAGTGGTGCAGTGGGCTTTTGGTCTAGTTTTTGATTTTAGT
ACAGCTTTGTTAAGTTCACTTTACTTATTAGGCTTCTGGTTTATGGTCTTGGCTGGCTATAACCTATCTTTAGATCAAAA
AAAGAGAGATCAAATTTTTTCAGGTTTTAGCTTATTAATAATTATTACATCGCTATTCACCAGTCTTATAGCAATTTTCC
AGTGGTTAAATATTGAGTCACATTTAATTTATACACTTCATCTAATTGGTAATCGTCCTTACGGAAATTTTGGTCAACCC
AACAACATGGCAACATTCTTAATTATTGGGTTGTTAGGATGTTTGTATTTATATGAAAAGCATAAAGTAACACTATGGTT
ATTATTGCCTTCCGCCCTGATTATTCTATTTACTATTGCATTGAGCCAGTCTCGAACGTCATGGATCGTTTTTCCATTTT
TACTCATCTATTGGATGGTTAAACAATTTGGAAAACAAAAAAGGTTTAGATTTGTTCAAGGTTTATTATGGTGCTTAGCT
TTTTTTCTAATTGCTGGCCTAATCTTACCTTATATAACTCAATTTATTGAATTCTCTACAAATACAGAAATTACTGAAAC
AAGTTCGTTTGTCGCGCGTGCGGGGTCGGGGCATGAGCGTATAGGGATGTGGATACAAATATTACATGCTATAGCTCAGC
AGCCATGGTTAGGATATGGATGGAGTCAAACCAGCGTTGCTGTAGTTGATAGTATCCAATATGGGACAGTGCATGTATGG
TTTAATAGTGCTCATAATGTGCTACTGGATATCATCATCTGGAACGGTATTCCAATAGGTATAGTCATTATTGCTTACTT
TGCATGTTGGTTCGTTTGGCTAAATCAGCAGGCTAAAGAAACTATCTCAATTATTGCAATTATGATGGTGTGTACCGTAC
TCATTCATGCCATGTTAGAGTTTCCTCAACGCTACGCTTACTTCTTACTTACTTGTGGTTTCTTATTAGGCATAATTCAG
GCACAGACACCTGTACTCAAAGGCATTGTACTCAACAAGCAGGTTCTTCGATTAATTTGGGGAATAAGTGTAATACTTCT
GGTAGCAATTTGGCGTGACTATAATGTCTATGTCACAAATAGTAATTTGCTGTTTAAGAATAAACAGCCAAATGCTGAGA
TTTTAGGAAGTAATCAGATTTTTATTTTAACGCAGTTTGAGCAGCGTCTAAAATGGATTGAGATGAAGCCTGAAACTACT
TTATCTGATGCTGATTTAGCAGTATGGGGTAATTTTGTGAAGAATAAAGCGACGCCTTATAACTTGCGTAAATATGCCCA
GCTACTTGCCTATAATGGAAAAGTAGAACAGGCCGAGCAGCAAATATTTATTTTGCAGCATCTTTATCGACAGCAAATAA
CTTTGGCAGAGTTGTTAAAAAATAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTAAAAATTGAAGAAATTTAATTGTGTATAGAACTCAATTCTTCTCACTTGCTTCCATGTATAATTCTTCCCAAGTTT
TTGACCTATAAACTGTCACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAATCCCCTTGAGTACAAGGGGATTTTTTTTATGAGGAATTACATTTGGCTTTGGATATAATTTTCGATACCAACAC
TGCCAATAAGATCAATTTGA

Product: O-antigen polymerase family

Products: NA

Alternate protein names: Lipid A Core; O-Antigen Polymerase Family Protein; O-Antigen Ligase

Number of amino acids: Translated: 542; Mature: 542

Protein sequence:

>542_residues
MQVFFLFLAAILLGFAWLSPFHYNPWVMFSSEMSTFAAGLSVLAVTFYQNIKIPRAQLLLLPFTLIPVVQWAFGLVFDFS
TALLSSLYLLGFWFMVLAGYNLSLDQKKRDQIFSGFSLLIIITSLFTSLIAIFQWLNIESHLIYTLHLIGNRPYGNFGQP
NNMATFLIIGLLGCLYLYEKHKVTLWLLLPSALIILFTIALSQSRTSWIVFPFLLIYWMVKQFGKQKRFRFVQGLLWCLA
FFLIAGLILPYITQFIEFSTNTEITETSSFVARAGSGHERIGMWIQILHAIAQQPWLGYGWSQTSVAVVDSIQYGTVHVW
FNSAHNVLLDIIIWNGIPIGIVIIAYFACWFVWLNQQAKETISIIAIMMVCTVLIHAMLEFPQRYAYFLLTCGFLLGIIQ
AQTPVLKGIVLNKQVLRLIWGISVILLVAIWRDYNVYVTNSNLLFKNKQPNAEILGSNQIFILTQFEQRLKWIEMKPETT
LSDADLAVWGNFVKNKATPYNLRKYAQLLAYNGKVEQAEQQIFILQHLYRQQITLAELLKNK

Sequences:

>Translated_542_residues
MQVFFLFLAAILLGFAWLSPFHYNPWVMFSSEMSTFAAGLSVLAVTFYQNIKIPRAQLLLLPFTLIPVVQWAFGLVFDFS
TALLSSLYLLGFWFMVLAGYNLSLDQKKRDQIFSGFSLLIIITSLFTSLIAIFQWLNIESHLIYTLHLIGNRPYGNFGQP
NNMATFLIIGLLGCLYLYEKHKVTLWLLLPSALIILFTIALSQSRTSWIVFPFLLIYWMVKQFGKQKRFRFVQGLLWCLA
FFLIAGLILPYITQFIEFSTNTEITETSSFVARAGSGHERIGMWIQILHAIAQQPWLGYGWSQTSVAVVDSIQYGTVHVW
FNSAHNVLLDIIIWNGIPIGIVIIAYFACWFVWLNQQAKETISIIAIMMVCTVLIHAMLEFPQRYAYFLLTCGFLLGIIQ
AQTPVLKGIVLNKQVLRLIWGISVILLVAIWRDYNVYVTNSNLLFKNKQPNAEILGSNQIFILTQFEQRLKWIEMKPETT
LSDADLAVWGNFVKNKATPYNLRKYAQLLAYNGKVEQAEQQIFILQHLYRQQITLAELLKNK
>Mature_542_residues
MQVFFLFLAAILLGFAWLSPFHYNPWVMFSSEMSTFAAGLSVLAVTFYQNIKIPRAQLLLLPFTLIPVVQWAFGLVFDFS
TALLSSLYLLGFWFMVLAGYNLSLDQKKRDQIFSGFSLLIIITSLFTSLIAIFQWLNIESHLIYTLHLIGNRPYGNFGQP
NNMATFLIIGLLGCLYLYEKHKVTLWLLLPSALIILFTIALSQSRTSWIVFPFLLIYWMVKQFGKQKRFRFVQGLLWCLA
FFLIAGLILPYITQFIEFSTNTEITETSSFVARAGSGHERIGMWIQILHAIAQQPWLGYGWSQTSVAVVDSIQYGTVHVW
FNSAHNVLLDIIIWNGIPIGIVIIAYFACWFVWLNQQAKETISIIAIMMVCTVLIHAMLEFPQRYAYFLLTCGFLLGIIQ
AQTPVLKGIVLNKQVLRLIWGISVILLVAIWRDYNVYVTNSNLLFKNKQPNAEILGSNQIFILTQFEQRLKWIEMKPETT
LSDADLAVWGNFVKNKATPYNLRKYAQLLAYNGKVEQAEQQIFILQHLYRQQITLAELLKNK

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62308; Mature: 62308

Theoretical pI: Translated: 9.53; Mature: 9.53

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQVFFLFLAAILLGFAWLSPFHYNPWVMFSSEMSTFAAGLSVLAVTFYQNIKIPRAQLLL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
LPFTLIPVVQWAFGLVFDFSTALLSSLYLLGFWFMVLAGYNLSLDQKKRDQIFSGFSLLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHH
IITSLFTSLIAIFQWLNIESHLIYTLHLIGNRPYGNFGQPNNMATFLIIGLLGCLYLYEK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
HKVTLWLLLPSALIILFTIALSQSRTSWIVFPFLLIYWMVKQFGKQKRFRFVQGLLWCLA
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFLIAGLILPYITQFIEFSTNTEITETSSFVARAGSGHERIGMWIQILHAIAQQPWLGYG
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
WSQTSVAVVDSIQYGTVHVWFNSAHNVLLDIIIWNGIPIGIVIIAYFACWFVWLNQQAKE
CCCCCCCEEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TISIIAIMMVCTVLIHAMLEFPQRYAYFLLTCGFLLGIIQAQTPVLKGIVLNKQVLRLIW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GISVILLVAIWRDYNVYVTNSNLLFKNKQPNAEILGSNQIFILTQFEQRLKWIEMKPETT
HHHHHHHHHHHCCCEEEEECCEEEEECCCCCCEEECCCCEEEEEEHHHHHHHEECCCCCC
LSDADLAVWGNFVKNKATPYNLRKYAQLLAYNGKVEQAEQQIFILQHLYRQQITLAELLK
CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NK
CC
>Mature Secondary Structure
MQVFFLFLAAILLGFAWLSPFHYNPWVMFSSEMSTFAAGLSVLAVTFYQNIKIPRAQLLL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
LPFTLIPVVQWAFGLVFDFSTALLSSLYLLGFWFMVLAGYNLSLDQKKRDQIFSGFSLLI
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IITSLFTSLIAIFQWLNIESHLIYTLHLIGNRPYGNFGQPNNMATFLIIGLLGCLYLYEK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
HKVTLWLLLPSALIILFTIALSQSRTSWIVFPFLLIYWMVKQFGKQKRFRFVQGLLWCLA
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CCCCCCCEEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TISIIAIMMVCTVLIHAMLEFPQRYAYFLLTCGFLLGIIQAQTPVLKGIVLNKQVLRLIW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GISVILLVAIWRDYNVYVTNSNLLFKNKQPNAEILGSNQIFILTQFEQRLKWIEMKPETT
HHHHHHHHHHHCCCEEEEECCEEEEECCCCCCEEECCCCEEEEEEHHHHHHHEECCCCCC
LSDADLAVWGNFVKNKATPYNLRKYAQLLAYNGKVEQAEQQIFILQHLYRQQITLAELLK
CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NK
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA