Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ppc

Identifier: 209696160

GI number: 209696160

Start: 2983188

End: 2985818

Strand: Reverse

Name: ppc

Synonym: VSAL_I2754

Alternate gene names: 209696160

Gene position: 2985818-2983188 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209696161

Following gene: 209696152

Centisome position: 89.79

GC content: 43.25

Gene sequence:

>2631_bases
ATGAATGAAAAGTACGCGGCTTTAAAAAGCAATGTAAGCATGTTGGGTCATCTACTTGGAAACACAATTAGAGACGCTCA
TGGTGAAGAGCTATTAGCAAAAGTTGAAACCATTCGTAAGCTGTCTAAAACAGCGCGCGCAGGAAGCGACAATGACCGTA
ATGCATTAATTGAAGAGATTAAAAGTCTCCCTAATGATCAACTGACCCCAGTTGCTCGTGCATTCAGTCAGTTCCTAAAT
TTAACCAATATGGCAGAACAGTATCATACGATTTCTCGTCACTGCGAAGAACACGTATGCGAACCTGATGCGATCAGCTC
ACTGTTTTCTAAATTAAGCCAAAACAACATCAGCAAATTAGATACGGTACAAGCGGTGCGTGAACTCAACATTGAGCTAG
TGCTAACTGCGCATCCAACAGAAATTGCGCGCCGTACCATGATCAATAAATTGGTAAAGATCAATGAATGTTTATCAAAA
CTTGAACTGAGTGATATCTCATTTTCTGAACGAGAAAAAACAGAACGTCGCCTTGAGCAACTGATTGCTCAAGCTTGGCA
TTCTGATGTTATTCGTCAAGAACGTCCAACGCCATTAGATGAAGCAAAATGGGGGTTTGCCGTTGTTGAAAATTCATTAT
GGCAAGGTATTCCTGATTTCTTACGTGAATTTGATCAACGTCTTGAAAATCATTTAGGTGAAGGCTTACCGATTGATGCT
CGTCCTGTCCATATGTCTTCTTGGATGGGGGGAGATCGCGATGGTAATCCATTTGTAACTCACACGATAACACGTGAAGT
TATGCTGCTTTCTCGCTGGAAAGCGGCCGATCTTTACTTAAAAGACGTAAATGAGTTAATCAGTGAATTGTCGATGGTGA
AGTGTACCGATGAAGTTCGTAAGCTTGCTGGTGATCAACACGAACCTTATCGAGCTATCTTAAAACAACTTCGTACTCTA
TTAAACGATACGCTTGAAAATCTTGATGCACAAATGAAAGGTGAGTTAACCAATAACAAACCGATCCTTCGTAATGCTGA
ACAATTATGGTTACCTTTGCACGCTTGTTACCAGTCACTACACGCTTGCGGTATGGGTATCATTGCTGAAGGTTCTTTAT
TAGATACGCTACGCCGTGTCAAAGCCTTTGGAGCCCATCTTGTTCGCCTAGACATACGTCAAGAAAGTACTCGCCATTCA
AATGTACTCTCTGAACTAACGCGTTACTTAGGCATTGGTGATTACGATCAATGGAGCGAACAAGATAAGATTTCTTTCTT
AGTGAATGAATTAAGCTCTAAACGCCCTCTTCTTCCTCGCGATTGGACTCCAACAGCAGAAGTTCAAGAAGTTATTGATA
CATGTAAAATTGTCGCTGAGCAATCAAAAGAAGCTCTCGGTTCTTATGTAATTTCAATGGCTCGCACCGCATCAGACGTA
TTGGCTGTTCATCTTCTGCTTCAAGAAGCAGGTTGCCCATTCCGTATGGATGTGTGCCCATTGTTTGAAACATTAGACGA
TTTAAACCGCTCTAAAGAAGTCATGGAACAATTGTTCTCTATTGATTGGTACCGCGGATTTATTCAAAATCATCAGATGG
TCATGATCGGCTATTCAGATTCAGCAAAAGATGCCGGTGTGATGTCTGCTGGCTGGGCGCAATACAGTGCGATGGAAGCC
TTAGTTGATGTCTGTGAGAAAGAAAGCATTGAACTAACCTTATTCCACGGCCGTGGCGGTACAATTGGTCGTGGGGGTGC
ACCAGCCCATGCCGCACTTCTATCTCAACCACCAAAAAGCTTAAAAGGTGGCCTACGTGTTACTGAGCAAGGTGAGATGA
TCCGGTTTAAGCTTGGTCTACCTGAAGTGGCAGTAAACAGCTTTAATTTATACGCAAGTGCGATTCTTGAAGCGAATCTT
CTTCCACCACCAGAGCCTAAGCAAGAATGGCGCGATTTAATGGAAGTACTTTCTGAAGTATCGTGCGAAGCGTACCGTAA
TATTGTTCGTGGCGAAAAAGACTTCGTGCCTTACTTCCGAGCAGCAACCCCTGAGTTAGAGTTAGGCAAATTACCGTTAG
GATCTCGCCCTGCAAAGCGTAATCCAAATGGCGGTGTTGAAAGTCTACGAGCTATTCCTTGGATCTTCTCATGGAGCCAA
AACCGTCTGGTACTTCCTGCATGGTTAGGCGCGGGTGAAGCGATTCAATACTCGATTGATAAAGGTCACCAAGAGCTATT
AGAAGAAATGTGTCGTGAATGGCCATTCTTCTCTACCCGTCTTGGTATGCTTGAGATGGTCTACACTAAGTGTAATCCAC
AAATGTCAGAGTACTACGACCAACGCTTAACGGATAAATCCTTATGGCCTCTAGGCGTACGTCTACGTAATCAATTACAA
GCAGACATTAAAGCGGTCTTGAATGTAGAAAACAGTGACCACTTAATGGAAAGTGACCCGTGGGGATCGGAGTCGATACG
TCTGCGTAATATCTACGTTGATCCACTAAATATGCTGCAAGCTGAATTACTGTATCGAACACGTCAGCAAGAAGAGACCT
CTCCTGAGCTTGAAGAAGCGCTGATGGTCACTATTGCAGGCATAGCTGCAGGTATGCGAAATACAGGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCGTTTATTCTTCAAAGTTTGACGAAGAGCCGTAAATTCGGATAGATTGAATGCAGAAAAAATTTAGGATGTAATAAAA
TTACAGTATAGGAAGTATGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCCTGATTAGCATGACATAACGCACTCTACATTAAGGTCACTTCGGTGGCCTTTTTTTATAATCTTATTTTTAACAATT
ACGATGAATTAACGTTAAAA

Product: phosphoenolpyruvate carboxylase

Products: NA

Alternate protein names: PEPC; PEPCase

Number of amino acids: Translated: 876; Mature: 876

Protein sequence:

>876_residues
MNEKYAALKSNVSMLGHLLGNTIRDAHGEELLAKVETIRKLSKTARAGSDNDRNALIEEIKSLPNDQLTPVARAFSQFLN
LTNMAEQYHTISRHCEEHVCEPDAISSLFSKLSQNNISKLDTVQAVRELNIELVLTAHPTEIARRTMINKLVKINECLSK
LELSDISFSEREKTERRLEQLIAQAWHSDVIRQERPTPLDEAKWGFAVVENSLWQGIPDFLREFDQRLENHLGEGLPIDA
RPVHMSSWMGGDRDGNPFVTHTITREVMLLSRWKAADLYLKDVNELISELSMVKCTDEVRKLAGDQHEPYRAILKQLRTL
LNDTLENLDAQMKGELTNNKPILRNAEQLWLPLHACYQSLHACGMGIIAEGSLLDTLRRVKAFGAHLVRLDIRQESTRHS
NVLSELTRYLGIGDYDQWSEQDKISFLVNELSSKRPLLPRDWTPTAEVQEVIDTCKIVAEQSKEALGSYVISMARTASDV
LAVHLLLQEAGCPFRMDVCPLFETLDDLNRSKEVMEQLFSIDWYRGFIQNHQMVMIGYSDSAKDAGVMSAGWAQYSAMEA
LVDVCEKESIELTLFHGRGGTIGRGGAPAHAALLSQPPKSLKGGLRVTEQGEMIRFKLGLPEVAVNSFNLYASAILEANL
LPPPEPKQEWRDLMEVLSEVSCEAYRNIVRGEKDFVPYFRAATPELELGKLPLGSRPAKRNPNGGVESLRAIPWIFSWSQ
NRLVLPAWLGAGEAIQYSIDKGHQELLEEMCREWPFFSTRLGMLEMVYTKCNPQMSEYYDQRLTDKSLWPLGVRLRNQLQ
ADIKAVLNVENSDHLMESDPWGSESIRLRNIYVDPLNMLQAELLYRTRQQEETSPELEEALMVTIAGIAAGMRNTG

Sequences:

>Translated_876_residues
MNEKYAALKSNVSMLGHLLGNTIRDAHGEELLAKVETIRKLSKTARAGSDNDRNALIEEIKSLPNDQLTPVARAFSQFLN
LTNMAEQYHTISRHCEEHVCEPDAISSLFSKLSQNNISKLDTVQAVRELNIELVLTAHPTEIARRTMINKLVKINECLSK
LELSDISFSEREKTERRLEQLIAQAWHSDVIRQERPTPLDEAKWGFAVVENSLWQGIPDFLREFDQRLENHLGEGLPIDA
RPVHMSSWMGGDRDGNPFVTHTITREVMLLSRWKAADLYLKDVNELISELSMVKCTDEVRKLAGDQHEPYRAILKQLRTL
LNDTLENLDAQMKGELTNNKPILRNAEQLWLPLHACYQSLHACGMGIIAEGSLLDTLRRVKAFGAHLVRLDIRQESTRHS
NVLSELTRYLGIGDYDQWSEQDKISFLVNELSSKRPLLPRDWTPTAEVQEVIDTCKIVAEQSKEALGSYVISMARTASDV
LAVHLLLQEAGCPFRMDVCPLFETLDDLNRSKEVMEQLFSIDWYRGFIQNHQMVMIGYSDSAKDAGVMSAGWAQYSAMEA
LVDVCEKESIELTLFHGRGGTIGRGGAPAHAALLSQPPKSLKGGLRVTEQGEMIRFKLGLPEVAVNSFNLYASAILEANL
LPPPEPKQEWRDLMEVLSEVSCEAYRNIVRGEKDFVPYFRAATPELELGKLPLGSRPAKRNPNGGVESLRAIPWIFSWSQ
NRLVLPAWLGAGEAIQYSIDKGHQELLEEMCREWPFFSTRLGMLEMVYTKCNPQMSEYYDQRLTDKSLWPLGVRLRNQLQ
ADIKAVLNVENSDHLMESDPWGSESIRLRNIYVDPLNMLQAELLYRTRQQEETSPELEEALMVTIAGIAAGMRNTG
>Mature_876_residues
MNEKYAALKSNVSMLGHLLGNTIRDAHGEELLAKVETIRKLSKTARAGSDNDRNALIEEIKSLPNDQLTPVARAFSQFLN
LTNMAEQYHTISRHCEEHVCEPDAISSLFSKLSQNNISKLDTVQAVRELNIELVLTAHPTEIARRTMINKLVKINECLSK
LELSDISFSEREKTERRLEQLIAQAWHSDVIRQERPTPLDEAKWGFAVVENSLWQGIPDFLREFDQRLENHLGEGLPIDA
RPVHMSSWMGGDRDGNPFVTHTITREVMLLSRWKAADLYLKDVNELISELSMVKCTDEVRKLAGDQHEPYRAILKQLRTL
LNDTLENLDAQMKGELTNNKPILRNAEQLWLPLHACYQSLHACGMGIIAEGSLLDTLRRVKAFGAHLVRLDIRQESTRHS
NVLSELTRYLGIGDYDQWSEQDKISFLVNELSSKRPLLPRDWTPTAEVQEVIDTCKIVAEQSKEALGSYVISMARTASDV
LAVHLLLQEAGCPFRMDVCPLFETLDDLNRSKEVMEQLFSIDWYRGFIQNHQMVMIGYSDSAKDAGVMSAGWAQYSAMEA
LVDVCEKESIELTLFHGRGGTIGRGGAPAHAALLSQPPKSLKGGLRVTEQGEMIRFKLGLPEVAVNSFNLYASAILEANL
LPPPEPKQEWRDLMEVLSEVSCEAYRNIVRGEKDFVPYFRAATPELELGKLPLGSRPAKRNPNGGVESLRAIPWIFSWSQ
NRLVLPAWLGAGEAIQYSIDKGHQELLEEMCREWPFFSTRLGMLEMVYTKCNPQMSEYYDQRLTDKSLWPLGVRLRNQLQ
ADIKAVLNVENSDHLMESDPWGSESIRLRNIYVDPLNMLQAELLYRTRQQEETSPELEEALMVTIAGIAAGMRNTG

Specific function: Forms oxaloacetate, a four-carbon dicarboxylic acid source for the tricarboxylic acid cycle

COG id: COG2352

COG function: function code C; Phosphoenolpyruvate carboxylase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the PEPCase type 1 family

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790393, Length=884, Percent_Identity=65.3846153846154, Blast_Score=1165, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: 3,500 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]

Swissprot (AC and ID): CAPP_ALISL (B6EMN4)

Other databases:

- EMBL:   FM178379
- RefSeq:   YP_002264090.1
- GeneID:   6987908
- GenomeReviews:   FM178379_GR
- KEGG:   vsa:VSAL_I2754
- HOGENOM:   HBG351035
- OMA:   AIPWVFG
- ProtClustDB:   PRK00009
- HAMAP:   MF_00595
- InterPro:   IPR021135
- InterPro:   IPR018129
- InterPro:   IPR022805
- InterPro:   IPR015813
- PRINTS:   PR00150

Pfam domain/function: PF00311 PEPcase; SSF51621 Pyrv/PenolPyrv_Kinase_cat

EC number: =4.1.1.31

Molecular weight: Translated: 99130; Mature: 99130

Theoretical pI: Translated: 5.31; Mature: 5.31

Prosite motif: PS00781 PEPCASE_1; PS00393 PEPCASE_2

Important sites: ACT_SITE 138-138 ACT_SITE 543-543

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNEKYAALKSNVSMLGHLLGNTIRDAHGEELLAKVETIRKLSKTARAGSDNDRNALIEEI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
KSLPNDQLTPVARAFSQFLNLTNMAEQYHTISRHCEEHVCEPDAISSLFSKLSQNNISKL
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
DTVQAVRELNIELVLTAHPTEIARRTMINKLVKINECLSKLELSDISFSEREKTERRLEQ
HHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LIAQAWHSDVIRQERPTPLDEAKWGFAVVENSLWQGIPDFLREFDQRLENHLGEGLPIDA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
RPVHMSSWMGGDRDGNPFVTHTITREVMLLSRWKAADLYLKDVNELISELSMVKCTDEVR
CCCCHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLAGDQHEPYRAILKQLRTLLNDTLENLDAQMKGELTNNKPILRNAEQLWLPLHACYQSL
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
HACGMGIIAEGSLLDTLRRVKAFGAHLVRLDIRQESTRHSNVLSELTRYLGIGDYDQWSE
HHCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCC
QDKISFLVNELSSKRPLLPRDWTPTAEVQEVIDTCKIVAEQSKEALGSYVISMARTASDV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVHLLLQEAGCPFRMDVCPLFETLDDLNRSKEVMEQLFSIDWYRGFIQNHQMVMIGYSD
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCC
SAKDAGVMSAGWAQYSAMEALVDVCEKESIELTLFHGRGGTIGRGGAPAHAALLSQPPKS
CCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHH
LKGGLRVTEQGEMIRFKLGLPEVAVNSFNLYASAILEANLLPPPEPKQEWRDLMEVLSEV
HHCCCEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SCEAYRNIVRGEKDFVPYFRAATPELELGKLPLGSRPAKRNPNGGVESLRAIPWIFSWSQ
HHHHHHHHHCCCHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHEECCC
NRLVLPAWLGAGEAIQYSIDKGHQELLEEMCREWPFFSTRLGMLEMVYTKCNPQMSEYYD
CCEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
QRLTDKSLWPLGVRLRNQLQADIKAVLNVENSDHLMESDPWGSESIRLRNIYVDPLNMLQ
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHH
AELLYRTRQQEETSPELEEALMVTIAGIAAGMRNTG
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNEKYAALKSNVSMLGHLLGNTIRDAHGEELLAKVETIRKLSKTARAGSDNDRNALIEEI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
KSLPNDQLTPVARAFSQFLNLTNMAEQYHTISRHCEEHVCEPDAISSLFSKLSQNNISKL
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
DTVQAVRELNIELVLTAHPTEIARRTMINKLVKINECLSKLELSDISFSEREKTERRLEQ
HHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LIAQAWHSDVIRQERPTPLDEAKWGFAVVENSLWQGIPDFLREFDQRLENHLGEGLPIDA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
RPVHMSSWMGGDRDGNPFVTHTITREVMLLSRWKAADLYLKDVNELISELSMVKCTDEVR
CCCCHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLAGDQHEPYRAILKQLRTLLNDTLENLDAQMKGELTNNKPILRNAEQLWLPLHACYQSL
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
HACGMGIIAEGSLLDTLRRVKAFGAHLVRLDIRQESTRHSNVLSELTRYLGIGDYDQWSE
HHCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCC
QDKISFLVNELSSKRPLLPRDWTPTAEVQEVIDTCKIVAEQSKEALGSYVISMARTASDV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVHLLLQEAGCPFRMDVCPLFETLDDLNRSKEVMEQLFSIDWYRGFIQNHQMVMIGYSD
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCC
SAKDAGVMSAGWAQYSAMEALVDVCEKESIELTLFHGRGGTIGRGGAPAHAALLSQPPKS
CCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHH
LKGGLRVTEQGEMIRFKLGLPEVAVNSFNLYASAILEANLLPPPEPKQEWRDLMEVLSEV
HHCCCEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SCEAYRNIVRGEKDFVPYFRAATPELELGKLPLGSRPAKRNPNGGVESLRAIPWIFSWSQ
HHHHHHHHHCCCHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHEECCC
NRLVLPAWLGAGEAIQYSIDKGHQELLEEMCREWPFFSTRLGMLEMVYTKCNPQMSEYYD
CCEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
QRLTDKSLWPLGVRLRNQLQADIKAVLNVENSDHLMESDPWGSESIRLRNIYVDPLNMLQ
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHH
AELLYRTRQQEETSPELEEALMVTIAGIAAGMRNTG
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA