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The map label for this gene is 209694581

Identifier: 209694581

GI number: 209694581

Start: 1116746

End: 1119259

Strand: Direct

Name: 209694581

Synonym: VSAL_I1020

Alternate gene names: NA

Gene position: 1116746-1119259 (Clockwise)

Preceding gene: 209694580

Following gene: 209694582

Centisome position: 33.58

GC content: 42.0

Gene sequence:

>2514_bases
ATGGCAAAGCTTACATTTACCCCTCAAGAACAACGTGCAGCCACTAAAGCTTGTTTAAGCTTTGGTGGTTTGTGCGTATT
CCCTCAAAAGCCAAAAGCGATTCAAGCGCCTTATTCTCAAGTAAGCTTTGAAACACCAGAGCCTGAGAACATGACAGTTA
TCGAGCGCAATTTATATTCGGTCGATAAAGTTGATCATGAATGGCGCAAGCAATTCTTTGCTGATTTACCTTCTTACTTA
AGCAAGTACTTTGCTGATCGCTATATTGCCATTTTCAAGAAAAAAGGCCGAGCAGAGGCAAATACTTATCTACGTGAAAG
AATGGGTGGAGAGCTGCAACGCCGTGTAAGTTTAGTGTTGTACCGTTACCGCCAATTGCCAACCTACAATAAAATCAAAT
TGATGAGCGAAGATGAAGACGCTGACCAATGTGATTTTGATGCTACGCCAAAAGAAGGCCAACTACAGTTTGATCTAGAA
AAGGTCGAAATCAAAAAGCCAAAGTCTCGCCTACTTGCCGAAATGGAATTAGACGAGTTAAAAGACATGGCGTTTAAAAT
ATCTCAAATCATGAATCGCCGCTTTAATCTGCTAAATAAAAAATACGCAGGCGAAACAGACCAAGAAATAAATGAAGGTT
TACTTAATATTTATGACGAGCTGGCAGAGTTAACGTTATCTTTTGGCTTTGCTGCGCCTTGCACAAAGAAAAATCCAAAA
ACCAGAATAGCCCAAGATGTTTACGGCGATATTTTCCGTATGTTGGATGAGAAGTTTTGGTTAACGAGCCTTAAAAAAGC
AAGAAAGATAATGCGTGAGCACTTGGCCATTGCTATGGGGCAGGTGTCTAAACGCGCCTCTGCATATTGCTCTTATGATT
GCGTTCGTGAGCATAAAGAACAGCAAAGAAAGAATTGGGAATACATTCAAAACCAAATCTTGGTTGATGATGAAACCCAA
GAAGAATGCAGCATGGAAGACATGGTGTTAAAAAGCGTGTCTAACCCTGCTATTCGTCGTCATGAATTAATGACTCGCAC
GCGTGGCTGTGAAAACATCGCCGAAGAAATGGAGCTATGCGGTTTATTCTTAACATTAACCGCACCAGGTAAATATCATA
ATAGTTACCAACGTGGCGGTTTTATTGAACACTGGAATGGCTCAAGCCCTCGTGATGCACAAGTGTATTTAAACGGAGTT
TGGTCACGTATTCGCGCTAAGTTAGGCCGTGAAGAGTTTCGTTGGTTTGGTATTCGTGTTGCAGAGCCGCATCACGATGG
CACACCACACTGGCATTTACTTCTATGGTGCAAGCCAGAAGAAAAAGAAGCCATTACTAAAATATTTATTGATTACGCAA
CAAAAGAAGACAAGCACGAGCTAATGAAAAAAGGCGTGTTTGATTATTCTGCACGTTGTGACATTAAAGCTATCGACTCA
GAGCAAGGTTCAGCAACGGGCTATATTGCCAAGTATATTTCTAAAAACATTGACGGCTATAAAATGGATGATGAAGTTTC
AGACGAAACGGATAAACCAATTAAAGATATGGCTAAAAATGTAACAGCGTGGAAAAGTCGCTGGTGTATTCGTCAATTTC
AATTTATTGGCGGCGCACCGGTTACCACTTACCGCGAACTTCGTCGTTTAGCAAATCTTGATAAAGCGTCATACATGGAT
TTCTTACACAGTCAAAAACGTGAAGAGTTATTGACTGTGTACCGTGACATGACCGCTAACGATATGGGTCCGCATCTACC
AAGTATCATGCTAACCAAATCAGTCATTATGAAGCGTTTGGGTGATGCGTATAAACCAACCATTAAGCACGAGAACAACA
GCGTGGTCGCTACGATGCAATCAGCCGACGAAGGTAATTGGCAAGGTTACATCATGGGCCAAGGCGGTCCATTTGTTAAA
CGCGCTCAGTTAATGGTTCGTAACGCTTATGAAGAACTGCCGTTTTCGTCTCGCTACTCTGAAACCATTCGTAAGATAGA
AGGTATTTTTGCGGCGGGTGAGTTTATTAAAACTCGCGTAAGAAAGTGGACAATTCAAAACAAACCTAAAGTTGTAACTG
AACTTGAAGCGGGGGCTCTTGCTCTTGATGGCAGCGCAGCTGCTCCTTGGAGTTCTGTCAATAACTGTACGCGCGATCTC
AAAGAGAGCCGCAAAGGACAGGTTAGCGATAAGCTATCTACTTTGTTAACGCCTTTGGGTAAAAAACCAGAATCCCTTGA
TGAACATGCACTTAATGCCTTTATGAAGGGCAGCACTTTAAACCTTCATGATGGTAGAAAAGTAAAATTACGCTCAGGTT
ATGTGGATATGGACGGCAACGTTCGTCAACCAGAGCTAATTGAAATAACAAAAGAGCCAGAAAACTTAAGTTGGCTTGAT
TTTGAAGGTTGGCCAGACGCCCCAACCGACACCAATTCAAACGAATATCAACAACCAGACCTTTCAATCTTCCCAGACTG
TGATTTTGGTGACGATGAATGGCCGTTAGTGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTATTCAGATTCAATTAATGCCATTAGCTGAGAGGCTATTGCTCCATAAAATGTTCAAGATTAATACTGCTGGCCTCGAT
ATTTCGGATATCCCGTTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAAATATGACTATGGAAGGGCTTTCGTATTTAAATTCGGGTATTGATTCGTGTTTTTTACTTCGTCTAGATTTAAATAA
ATACACTTCAATAAAAAAAG

Product: phage replication protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 837; Mature: 836

Protein sequence:

>837_residues
MAKLTFTPQEQRAATKACLSFGGLCVFPQKPKAIQAPYSQVSFETPEPENMTVIERNLYSVDKVDHEWRKQFFADLPSYL
SKYFADRYIAIFKKKGRAEANTYLRERMGGELQRRVSLVLYRYRQLPTYNKIKLMSEDEDADQCDFDATPKEGQLQFDLE
KVEIKKPKSRLLAEMELDELKDMAFKISQIMNRRFNLLNKKYAGETDQEINEGLLNIYDELAELTLSFGFAAPCTKKNPK
TRIAQDVYGDIFRMLDEKFWLTSLKKARKIMREHLAIAMGQVSKRASAYCSYDCVREHKEQQRKNWEYIQNQILVDDETQ
EECSMEDMVLKSVSNPAIRRHELMTRTRGCENIAEEMELCGLFLTLTAPGKYHNSYQRGGFIEHWNGSSPRDAQVYLNGV
WSRIRAKLGREEFRWFGIRVAEPHHDGTPHWHLLLWCKPEEKEAITKIFIDYATKEDKHELMKKGVFDYSARCDIKAIDS
EQGSATGYIAKYISKNIDGYKMDDEVSDETDKPIKDMAKNVTAWKSRWCIRQFQFIGGAPVTTYRELRRLANLDKASYMD
FLHSQKREELLTVYRDMTANDMGPHLPSIMLTKSVIMKRLGDAYKPTIKHENNSVVATMQSADEGNWQGYIMGQGGPFVK
RAQLMVRNAYEELPFSSRYSETIRKIEGIFAAGEFIKTRVRKWTIQNKPKVVTELEAGALALDGSAAAPWSSVNNCTRDL
KESRKGQVSDKLSTLLTPLGKKPESLDEHALNAFMKGSTLNLHDGRKVKLRSGYVDMDGNVRQPELIEITKEPENLSWLD
FEGWPDAPTDTNSNEYQQPDLSIFPDCDFGDDEWPLV

Sequences:

>Translated_837_residues
MAKLTFTPQEQRAATKACLSFGGLCVFPQKPKAIQAPYSQVSFETPEPENMTVIERNLYSVDKVDHEWRKQFFADLPSYL
SKYFADRYIAIFKKKGRAEANTYLRERMGGELQRRVSLVLYRYRQLPTYNKIKLMSEDEDADQCDFDATPKEGQLQFDLE
KVEIKKPKSRLLAEMELDELKDMAFKISQIMNRRFNLLNKKYAGETDQEINEGLLNIYDELAELTLSFGFAAPCTKKNPK
TRIAQDVYGDIFRMLDEKFWLTSLKKARKIMREHLAIAMGQVSKRASAYCSYDCVREHKEQQRKNWEYIQNQILVDDETQ
EECSMEDMVLKSVSNPAIRRHELMTRTRGCENIAEEMELCGLFLTLTAPGKYHNSYQRGGFIEHWNGSSPRDAQVYLNGV
WSRIRAKLGREEFRWFGIRVAEPHHDGTPHWHLLLWCKPEEKEAITKIFIDYATKEDKHELMKKGVFDYSARCDIKAIDS
EQGSATGYIAKYISKNIDGYKMDDEVSDETDKPIKDMAKNVTAWKSRWCIRQFQFIGGAPVTTYRELRRLANLDKASYMD
FLHSQKREELLTVYRDMTANDMGPHLPSIMLTKSVIMKRLGDAYKPTIKHENNSVVATMQSADEGNWQGYIMGQGGPFVK
RAQLMVRNAYEELPFSSRYSETIRKIEGIFAAGEFIKTRVRKWTIQNKPKVVTELEAGALALDGSAAAPWSSVNNCTRDL
KESRKGQVSDKLSTLLTPLGKKPESLDEHALNAFMKGSTLNLHDGRKVKLRSGYVDMDGNVRQPELIEITKEPENLSWLD
FEGWPDAPTDTNSNEYQQPDLSIFPDCDFGDDEWPLV
>Mature_836_residues
AKLTFTPQEQRAATKACLSFGGLCVFPQKPKAIQAPYSQVSFETPEPENMTVIERNLYSVDKVDHEWRKQFFADLPSYLS
KYFADRYIAIFKKKGRAEANTYLRERMGGELQRRVSLVLYRYRQLPTYNKIKLMSEDEDADQCDFDATPKEGQLQFDLEK
VEIKKPKSRLLAEMELDELKDMAFKISQIMNRRFNLLNKKYAGETDQEINEGLLNIYDELAELTLSFGFAAPCTKKNPKT
RIAQDVYGDIFRMLDEKFWLTSLKKARKIMREHLAIAMGQVSKRASAYCSYDCVREHKEQQRKNWEYIQNQILVDDETQE
ECSMEDMVLKSVSNPAIRRHELMTRTRGCENIAEEMELCGLFLTLTAPGKYHNSYQRGGFIEHWNGSSPRDAQVYLNGVW
SRIRAKLGREEFRWFGIRVAEPHHDGTPHWHLLLWCKPEEKEAITKIFIDYATKEDKHELMKKGVFDYSARCDIKAIDSE
QGSATGYIAKYISKNIDGYKMDDEVSDETDKPIKDMAKNVTAWKSRWCIRQFQFIGGAPVTTYRELRRLANLDKASYMDF
LHSQKREELLTVYRDMTANDMGPHLPSIMLTKSVIMKRLGDAYKPTIKHENNSVVATMQSADEGNWQGYIMGQGGPFVKR
AQLMVRNAYEELPFSSRYSETIRKIEGIFAAGEFIKTRVRKWTIQNKPKVVTELEAGALALDGSAAAPWSSVNNCTRDLK
ESRKGQVSDKLSTLLTPLGKKPESLDEHALNAFMKGSTLNLHDGRKVKLRSGYVDMDGNVRQPELIEITKEPENLSWLDF
EGWPDAPTDTNSNEYQQPDLSIFPDCDFGDDEWPLV

Specific function: Possible endonuclease which induces a single-strand cut and initiates DNA replication (Potential) [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the phage GPA family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020220
- InterPro:   IPR008766
- ProDom:   PD092055 [H]

Pfam domain/function: PF05840 Phage_GPA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96493; Mature: 96362

Theoretical pI: Translated: 7.06; Mature: 7.06

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAKLTFTPQEQRAATKACLSFGGLCVFPQKPKAIQAPYSQVSFETPEPENMTVIERNLYS
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCHHCCCHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHH
VDKVDHEWRKQFFADLPSYLSKYFADRYIAIFKKKGRAEANTYLRERMGGELQRRVSLVL
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
YRYRQLPTYNKIKLMSEDEDADQCDFDATPKEGQLQFDLEKVEIKKPKSRLLAEMELDEL
HHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
KDMAFKISQIMNRRFNLLNKKYAGETDQEINEGLLNIYDELAELTLSFGFAAPCTKKNPK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
TRIAQDVYGDIFRMLDEKFWLTSLKKARKIMREHLAIAMGQVSKRASAYCSYDCVREHKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QQRKNWEYIQNQILVDDETQEECSMEDMVLKSVSNPAIRRHELMTRTRGCENIAEEMELC
HHHHHHHHHHCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
GLFLTLTAPGKYHNSYQRGGFIEHWNGSSPRDAQVYLNGVWSRIRAKLGREEFRWFGIRV
CEEEEEECCCCCCCCHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHEEEEEE
AEPHHDGTPHWHLLLWCKPEEKEAITKIFIDYATKEDKHELMKKGVFDYSARCDIKAIDS
ECCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECC
EQGSATGYIAKYISKNIDGYKMDDEVSDETDKPIKDMAKNVTAWKSRWCIRQFQFIGGAP
CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
VTTYRELRRLANLDKASYMDFLHSQKREELLTVYRDMTANDMGPHLPSIMLTKSVIMKRL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
GDAYKPTIKHENNSVVATMQSADEGNWQGYIMGQGGPFVKRAQLMVRNAYEELPFSSRYS
CCHHCCCEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
ETIRKIEGIFAAGEFIKTRVRKWTIQNKPKVVTELEAGALALDGSAAAPWSSVNNCTRDL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHH
KESRKGQVSDKLSTLLTPLGKKPESLDEHALNAFMKGSTLNLHDGRKVKLRSGYVDMDGN
HHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCEEEEECCEEECCCC
VRQPELIEITKEPENLSWLDFEGWPDAPTDTNSNEYQQPDLSIFPDCDFGDDEWPLV
CCCCCEEEEECCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AKLTFTPQEQRAATKACLSFGGLCVFPQKPKAIQAPYSQVSFETPEPENMTVIERNLYS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCHHCCCHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHH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ETIRKIEGIFAAGEFIKTRVRKWTIQNKPKVVTELEAGALALDGSAAAPWSSVNNCTRDL
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VRQPELIEITKEPENLSWLDFEGWPDAPTDTNSNEYQQPDLSIFPDCDFGDDEWPLV
CCCCCEEEEECCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11677608; 12644504 [H]