Definition Borrelia duttonii Ly, complete genome.
Accession NC_011229
Length 931,674

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The map label for this gene is recN

Identifier: 203284231

GI number: 203284231

Start: 332210

End: 333796

Strand: Reverse

Name: recN

Synonym: BDU_313

Alternate gene names: NA

Gene position: 333796-332210 (Counterclockwise)

Preceding gene: 203284232

Following gene: 203284230

Centisome position: 35.83

GC content: 23.06

Gene sequence:

>1587_bases
ATGTGTCATATATTGATTGAACTTTTTATAAAAAATTTGATTTTAATTAAAAAGTTTTATATGAGGCTAAATGTGGGATT
ATTTGCATTTGAGGATGAATCTGATAATATCAGGGGTATATTGTTGTTGTCTTTATTTTATTATTTATTTGGTTACAAAA
TTAAACATGATGTAATTTCTAATGAAGGATGTAGAGATGTTTTAGTTGCTAAATTTCAAGCAAGTGATGAGTTTAGACGT
TGTTTATTTTTTAGGGGAATTTTGGTCAAAGATTTAAAAACAATAATATTTGATTTTGTAAATGTCATTGTGGGTCATTA
TTATGTCAATGACAAGCCAATTTCTATTTTCGTATTAAATTCGATTTTTAATATGGAATTTAAAATTTGTTTTCAAAATT
GGGAATATTTATTTTTAAAAAATATTTTAGATTGTCTTAATATTTTGAATGATTATGTTAATTTAAATATTAAATTAGAA
ACATATAAATTAGAGTTTAAATCGTATATTAGGTGTTTAAATAGTTATTATGGTTTTATTTTAAAACAAAAATTGTATGG
TGATAATATAGAGAAATATGAAAAAACAATTAAAAATGAACTTAAAAGTTACAAATCTATATATAATTCAATCTTAAATT
TAAGAAATGTTTTAAACTTGGATGATAATGTTTGTTGTTTAAGAGAGATAATAAAGGTGATTTGTGATGCTGAGTATTTT
TTAAAAGTAAATATTTGTTATTTTGAATTTGAAAATTGTTTTAAAAATTTTTACTATGAACTTGAGGATATTGGTCACGA
TTATAGTGGAGTTTGTCTTGGAAAAGCTTGTGATGAAAATGAGCTTGAATTAGTAGATAGACGTTTATATTTTTTTCCTT
GTCTTAATAAAAAATATGGACCAAATTTTAAAAATGTTATAGTGTTAGTAAATAAGTATAGTGAGATTATTAATTTGTTG
CTTAATATTGCAACATTTAAATTAGCTAATGAGCAAAAATTAAATGTTTTGTTTGAAAATTTGCAAAAATTATCATTTGG
TATTTCAAATATTATAAAAACAGTTGCTTTAAAATTTGCATCGGGAGTAATTGAGATTTTTCATAAATTTAATATGAGGG
ATGTAAAATTCTTTGTATCAGTATTTGAAGGTAAAATGAATTTGGCAGCTGTAGGTGATTTAAAGTTTTTTATTTCTAAT
TATATTGCTTTAAAAGTGCAATCAATAATGTATAGAGTTGCATCTGTAGGGGAGATTTTAAAAACAATATTGACTATTCA
GAGTGTTCAAAGCATTGATGATAATCATATAATAGTTAATGGTATTGATTATGCTATAGAGAGTAAGTTTAATGTAACTT
TGGGTAAATATTTGAAAAGTTTATCGCAAAATATGCATATATTTATTGTCACTTATCTTACTAATATTGCAAACTTTTTA
TATTTTAGTAAAGAAAAGTGTATTAAAAGAGAATTTGTGCTTAAGGAGGTGTCTTTGTTGTTTGCCTATGAGAGTGTTTT
AGGAATTGTTAGAATGCTTTATGGTAATATTAGTAATATTAATTTTGGGTATGTAGTAGTCTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAATAAAAGTTTACGTTTTGCATCCTTTTGTACGGATACTTTTGTTAGAAGACTGAAAAATAAGTTATTATAGACTATG
GTTTTATAATAATTTATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGTAATAATTGATTGCAAGTGTAGGTATTTATGGATTTAGTGCATAATGAAAATTATCAAAAAATTTTGTTTATTGATA
GTCTTATTTTGCAAACTTTA

Product: DNA repair ATPase

Products: NA

Alternate protein names: ATPase Involved In DNA Repair; DNA Repair ATPase

Number of amino acids: Translated: 528; Mature: 528

Protein sequence:

>528_residues
MCHILIELFIKNLILIKKFYMRLNVGLFAFEDESDNIRGILLLSLFYYLFGYKIKHDVISNEGCRDVLVAKFQASDEFRR
CLFFRGILVKDLKTIIFDFVNVIVGHYYVNDKPISIFVLNSIFNMEFKICFQNWEYLFLKNILDCLNILNDYVNLNIKLE
TYKLEFKSYIRCLNSYYGFILKQKLYGDNIEKYEKTIKNELKSYKSIYNSILNLRNVLNLDDNVCCLREIIKVICDAEYF
LKVNICYFEFENCFKNFYYELEDIGHDYSGVCLGKACDENELELVDRRLYFFPCLNKKYGPNFKNVIVLVNKYSEIINLL
LNIATFKLANEQKLNVLFENLQKLSFGISNIIKTVALKFASGVIEIFHKFNMRDVKFFVSVFEGKMNLAAVGDLKFFISN
YIALKVQSIMYRVASVGEILKTILTIQSVQSIDDNHIIVNGIDYAIESKFNVTLGKYLKSLSQNMHIFIVTYLTNIANFL
YFSKEKCIKREFVLKEVSLLFAYESVLGIVRMLYGNISNINFGYVVVF

Sequences:

>Translated_528_residues
MCHILIELFIKNLILIKKFYMRLNVGLFAFEDESDNIRGILLLSLFYYLFGYKIKHDVISNEGCRDVLVAKFQASDEFRR
CLFFRGILVKDLKTIIFDFVNVIVGHYYVNDKPISIFVLNSIFNMEFKICFQNWEYLFLKNILDCLNILNDYVNLNIKLE
TYKLEFKSYIRCLNSYYGFILKQKLYGDNIEKYEKTIKNELKSYKSIYNSILNLRNVLNLDDNVCCLREIIKVICDAEYF
LKVNICYFEFENCFKNFYYELEDIGHDYSGVCLGKACDENELELVDRRLYFFPCLNKKYGPNFKNVIVLVNKYSEIINLL
LNIATFKLANEQKLNVLFENLQKLSFGISNIIKTVALKFASGVIEIFHKFNMRDVKFFVSVFEGKMNLAAVGDLKFFISN
YIALKVQSIMYRVASVGEILKTILTIQSVQSIDDNHIIVNGIDYAIESKFNVTLGKYLKSLSQNMHIFIVTYLTNIANFL
YFSKEKCIKREFVLKEVSLLFAYESVLGIVRMLYGNISNINFGYVVVF
>Mature_528_residues
MCHILIELFIKNLILIKKFYMRLNVGLFAFEDESDNIRGILLLSLFYYLFGYKIKHDVISNEGCRDVLVAKFQASDEFRR
CLFFRGILVKDLKTIIFDFVNVIVGHYYVNDKPISIFVLNSIFNMEFKICFQNWEYLFLKNILDCLNILNDYVNLNIKLE
TYKLEFKSYIRCLNSYYGFILKQKLYGDNIEKYEKTIKNELKSYKSIYNSILNLRNVLNLDDNVCCLREIIKVICDAEYF
LKVNICYFEFENCFKNFYYELEDIGHDYSGVCLGKACDENELELVDRRLYFFPCLNKKYGPNFKNVIVLVNKYSEIINLL
LNIATFKLANEQKLNVLFENLQKLSFGISNIIKTVALKFASGVIEIFHKFNMRDVKFFVSVFEGKMNLAAVGDLKFFISN
YIALKVQSIMYRVASVGEILKTILTIQSVQSIDDNHIIVNGIDYAIESKFNVTLGKYLKSLSQNMHIFIVTYLTNIANFL
YFSKEKCIKREFVLKEVSLLFAYESVLGIVRMLYGNISNINFGYVVVF

Specific function: Unknown

COG id: COG0497

COG function: function code L; ATPase involved in DNA repair

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61896; Mature: 61896

Theoretical pI: Translated: 8.33; Mature: 8.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.8 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
2.8 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MCHILIELFIKNLILIKKFYMRLNVGLFAFEDESDNIRGILLLSLFYYLFGYKIKHDVIS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHC
NEGCRDVLVAKFQASDEFRRCLFFRGILVKDLKTIIFDFVNVIVGHYYVNDKPISIFVLN
CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEE
SIFNMEFKICFQNWEYLFLKNILDCLNILNDYVNLNIKLETYKLEFKSYIRCLNSYYGFI
HHHCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKQKLYGDNIEKYEKTIKNELKSYKSIYNSILNLRNVLNLDDNVCCLREIIKVICDAEYF
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEE
LKVNICYFEFENCFKNFYYELEDIGHDYSGVCLGKACDENELELVDRRLYFFPCLNKKYG
EEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCC
PNFKNVIVLVNKYSEIINLLLNIATFKLANEQKLNVLFENLQKLSFGISNIIKTVALKFA
CCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGVIEIFHKFNMRDVKFFVSVFEGKMNLAAVGDLKFFISNYIALKVQSIMYRVASVGEIL
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTILTIQSVQSIDDNHIIVNGIDYAIESKFNVTLGKYLKSLSQNMHIFIVTYLTNIANFL
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHH
YFSKEKCIKREFVLKEVSLLFAYESVLGIVRMLYGNISNINFGYVVVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MCHILIELFIKNLILIKKFYMRLNVGLFAFEDESDNIRGILLLSLFYYLFGYKIKHDVIS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHC
NEGCRDVLVAKFQASDEFRRCLFFRGILVKDLKTIIFDFVNVIVGHYYVNDKPISIFVLN
CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEE
SIFNMEFKICFQNWEYLFLKNILDCLNILNDYVNLNIKLETYKLEFKSYIRCLNSYYGFI
HHHCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKQKLYGDNIEKYEKTIKNELKSYKSIYNSILNLRNVLNLDDNVCCLREIIKVICDAEYF
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEE
LKVNICYFEFENCFKNFYYELEDIGHDYSGVCLGKACDENELELVDRRLYFFPCLNKKYG
EEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCC
PNFKNVIVLVNKYSEIINLLLNIATFKLANEQKLNVLFENLQKLSFGISNIIKTVALKFA
CCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGVIEIFHKFNMRDVKFFVSVFEGKMNLAAVGDLKFFISNYIALKVQSIMYRVASVGEIL
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTILTIQSVQSIDDNHIIVNGIDYAIESKFNVTLGKYLKSLSQNMHIFIVTYLTNIANFL
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHH
YFSKEKCIKREFVLKEVSLLFAYESVLGIVRMLYGNISNINFGYVVVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA