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The map label for this gene is yqjA [H]

Identifier: 195978030

GI number: 195978030

Start: 946349

End: 947311

Strand: Direct

Name: yqjA [H]

Synonym: Sez_0903

Alternate gene names: 195978030

Gene position: 946349-947311 (Clockwise)

Preceding gene: 195978029

Following gene: 195978031

Centisome position: 46.75

GC content: 41.85

Gene sequence:

>963_bases
GTGAGCTTAATTGAACGAACAATAAAAATGCTATTAGCAACGATGGCTGCAATCTTTCTTGCCTCTCAGCTACAGCTGTC
TTATGCCATATCAGCGGGAATTATTGCCCTGTTAGGTGTGCTAGACACTAGAAAATCTAGCTTAATTGTTGCTAGAAATC
GTCTGCTGTCTTTTTTCTTAGCCTTTGCTGTGGCGGTTAGTCTATTTGCCTTATTTGACTTTGGTCTGCTTTCCCTTGGC
TTGTATCTAGCGCTAACCATTCCTTTGCTTTATCAGCTGAAAATAGAGGCAGGTCTTGTTCCTATCACTGTCTTGGTGAC
TCACCTGATGTCTGAGCAGCGTATTGATTTGTCAATTCTTTTAAATGAGCTGTTGCTGTTTTTGATTGGGACGGGTCTTG
CCCTTCTTGTTAACGGCTATATGGGGTCTCAGGAGCATCGCCTACGCTTGTACCACCAAAAGATAGAAGATGGCTTAAAG
GCTATCTTGTACCGTTTTGAATCCTTTTTGTTAGAAGGTCAGGGACAAAACGAGGGACAGATGATTAAGGAATTGGAGCT
TAGCTTAGATGAGGCGTTGCAGCTGGTTTATCGTGAAAGGCACAATACCCTTTTTTATCATACCAATTACCAGGTGCATT
ATTTTGAGATGAGACGTCATCAAAATAGATTGTTGGCGCAAATGGCCTTAAATGTCAATCAGCTAACATCTCAAAGCAGA
GAAAGTATCCTACTCTCCCATCTTTTTCATGAGACAGCCCGTCAGCTGAGTGAGAAGAATTCTGCCTTGACCTTGATTGA
CGATATTGAGCAATTACTTGAGGTCTTTAGGCAAAGAGAGCTGCCTCAGACCAGAGAGGAATTTGAAAGACGGGCGATTT
TGTTTCAGCTATTGCAGGATTTGGAGCGCTTTATTCTACTGAAGGTAGAATTTTATCGTGATTATAAGGAAGAGCAGGTA
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCGAGGTCTGCATGACTATCAACGGAAAGTAAATAGAGCTGAGCAGGAGTGGCAGTTTATTCAAAATGAAATTCAAAAAG
GCTTGGGCTAGAGGTAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGCTGCTTGCTGCTACGATTAAGAGTCTGGAAAAAATCATTTTTCAGGCTTTTTTGCTATAATGGCAGTGAGATAATTG
CAAGAATGGAGAAATCATGA

Product: integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 320; Mature: 319

Protein sequence:

>320_residues
MSLIERTIKMLLATMAAIFLASQLQLSYAISAGIIALLGVLDTRKSSLIVARNRLLSFFLAFAVAVSLFALFDFGLLSLG
LYLALTIPLLYQLKIEAGLVPITVLVTHLMSEQRIDLSILLNELLLFLIGTGLALLVNGYMGSQEHRLRLYHQKIEDGLK
AILYRFESFLLEGQGQNEGQMIKELELSLDEALQLVYRERHNTLFYHTNYQVHYFEMRRHQNRLLAQMALNVNQLTSQSR
ESILLSHLFHETARQLSEKNSALTLIDDIEQLLEVFRQRELPQTREEFERRAILFQLLQDLERFILLKVEFYRDYKEEQV

Sequences:

>Translated_320_residues
MSLIERTIKMLLATMAAIFLASQLQLSYAISAGIIALLGVLDTRKSSLIVARNRLLSFFLAFAVAVSLFALFDFGLLSLG
LYLALTIPLLYQLKIEAGLVPITVLVTHLMSEQRIDLSILLNELLLFLIGTGLALLVNGYMGSQEHRLRLYHQKIEDGLK
AILYRFESFLLEGQGQNEGQMIKELELSLDEALQLVYRERHNTLFYHTNYQVHYFEMRRHQNRLLAQMALNVNQLTSQSR
ESILLSHLFHETARQLSEKNSALTLIDDIEQLLEVFRQRELPQTREEFERRAILFQLLQDLERFILLKVEFYRDYKEEQV
>Mature_319_residues
SLIERTIKMLLATMAAIFLASQLQLSYAISAGIIALLGVLDTRKSSLIVARNRLLSFFLAFAVAVSLFALFDFGLLSLGL
YLALTIPLLYQLKIEAGLVPITVLVTHLMSEQRIDLSILLNELLLFLIGTGLALLVNGYMGSQEHRLRLYHQKIEDGLKA
ILYRFESFLLEGQGQNEGQMIKELELSLDEALQLVYRERHNTLFYHTNYQVHYFEMRRHQNRLLAQMALNVNQLTSQSRE
SILLSHLFHETARQLSEKNSALTLIDDIEQLLEVFRQRELPQTREEFERRAILFQLLQDLERFILLKVEFYRDYKEEQV

Specific function: Unknown

COG id: COG4129

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010343
- InterPro:   IPR021062 [H]

Pfam domain/function: PF06081 DUF939; PF11728 DUF939_C [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 37093; Mature: 36962

Theoretical pI: Translated: 6.43; Mature: 6.43

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSLIERTIKMLLATMAAIFLASQLQLSYAISAGIIALLGVLDTRKSSLIVARNRLLSFFL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AFAVAVSLFALFDFGLLSLGLYLALTIPLLYQLKIEAGLVPITVLVTHLMSEQRIDLSIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
LNELLLFLIGTGLALLVNGYMGSQEHRLRLYHQKIEDGLKAILYRFESFLLEGQGQNEGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
MIKELELSLDEALQLVYRERHNTLFYHTNYQVHYFEMRRHQNRLLAQMALNVNQLTSQSR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ESILLSHLFHETARQLSEKNSALTLIDDIEQLLEVFRQRELPQTREEFERRAILFQLLQD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LERFILLKVEFYRDYKEEQV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SLIERTIKMLLATMAAIFLASQLQLSYAISAGIIALLGVLDTRKSSLIVARNRLLSFFL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AFAVAVSLFALFDFGLLSLGLYLALTIPLLYQLKIEAGLVPITVLVTHLMSEQRIDLSIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
LNELLLFLIGTGLALLVNGYMGSQEHRLRLYHQKIEDGLKAILYRFESFLLEGQGQNEGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
MIKELELSLDEALQLVYRERHNTLFYHTNYQVHYFEMRRHQNRLLAQMALNVNQLTSQSR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ESILLSHLFHETARQLSEKNSALTLIDDIEQLLEVFRQRELPQTREEFERRAILFQLLQD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LERFILLKVEFYRDYKEEQV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 7.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377 [H]