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The map label for this gene is rfbX [H]

Identifier: 194738297

GI number: 194738297

Start: 2190167

End: 2191447

Strand: Reverse

Name: rfbX [H]

Synonym: SeSA_A2321

Alternate gene names: 194738297

Gene position: 2191447-2190167 (Counterclockwise)

Preceding gene: 194734104

Following gene: 194737653

Centisome position: 46.54

GC content: 30.29

Gene sequence:

>1281_bases
TTGTTAAAAATTCCGAGTCATTTAATTGTTGCAGGTTCATCATGGTTATCCAAAATAATAATTGCTGGGGTGCAGTTAGC
AAGTATTTCATATCTTATTTCTATACTAGGTGAAGAGAAATATGCAATCTTTAGTTTGTTAACTGGTTTATTAGTATGGT
GTAGCGCTGTTGATTTTGGCATAGGTACAGGACTGCAAAATTATATATCAGAATGCAGAGCCAAAAACAAAAGTTATGAT
GCATATATTAAATCAGCATTACATCTAAGCTTTATAGCTATTGTTTTTTTTATTGCTTTATTTTATATTTTTTCTGGAGT
AATTTCCTCTAAATATCTTTCTTCTTTTCATGAGATATTACAGGATAAAACCAGAATGCTCTTTTTTACCTCATGTCTAG
TTTTCAGTTCTATTGGAATCGGAGCCATTGCTTATAAAATACTTTTTGCCGAATTGGTCGGGTGGAAAGCTAATCTATTA
AACGCATTATCTTATATGATAGGTATGCTTGGCTTGCTATATATATACTATAGGGGGATTTCAGTTGACATAAAATTATC
ACTAATAGTCCTGTATCTTCCAGTGGGTATGATTTCATTGTGCTATATTGTATATAGATACATAAAGCTTTATCACGTTA
AAACAACAAAATCTTATTATATAGCGATTTTACGTAGATCTTCAGGGTTTTTTCTTTTTACTTTATTATCGATAGTGGTA
CTTCAAACAGATTATATGGTCATTTCTCAAAGGCTAACTCCTGCTGATATTGTCCAATATACAGTAACGATGAAAATTTT
TGGTTTAGTCTTTTTTATTTATACTGCTATTTTGCAAGCATTATGGCCTATATGTGCTGAATTGAGAGTCAAACAGCAAT
GGAAAAAACTTAACAAAATGATAGGTGTCAATATTTTGCTTGGCTCACTATATGTTGTTGGATGTACAATATTTATTTAT
TTATTTAAAGAACAGATATTTTCAGTAATAGCCAAAGATATTAATTATCAAGTTTCTATGTTATCTTTTATGTTAATTGG
CATATATTTCTGTATTCGTGTTTGGTGTGATACTTATGCAATGTTATTGCAAAGTATGAATTATTTAAAAATACTTTGGA
TATTAGTACCACTACAAGCAATAATTGGTGGAATAGCACAATGGTATTTTTCTAGTAAGCTTGGAATCAGCGGAGTGCTA
CTTGGCTTGATTATATCTTTTGCTTTAACTGTTTTTTGGGGGCTTCCACTAACTTACTTAATTAAGGCAAATAAGGAATA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTATGAGATTTTCATGATCTTTTAATAAATAAATCGTTAACAAATTAGTCGCGTTATGTTGTAAAAACTAAGTCGTTTA
ATTGCATAGTGAAAGTTCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCATATGCTTGTATCATTTTGTATTCCAACTTATAATAGAAAAGAATACCTTGAAGAGTTGTTAAATAGTATAAATAATC
AGGAAAAATTTAATTTAGAT

Product: putative O-antigen transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 426; Mature: 426

Protein sequence:

>426_residues
MLKIPSHLIVAGSSWLSKIIIAGVQLASISYLISILGEEKYAIFSLLTGLLVWCSAVDFGIGTGLQNYISECRAKNKSYD
AYIKSALHLSFIAIVFFIALFYIFSGVISSKYLSSFHEILQDKTRMLFFTSCLVFSSIGIGAIAYKILFAELVGWKANLL
NALSYMIGMLGLLYIYYRGISVDIKLSLIVLYLPVGMISLCYIVYRYIKLYHVKTTKSYYIAILRRSSGFFLFTLLSIVV
LQTDYMVISQRLTPADIVQYTVTMKIFGLVFFIYTAILQALWPICAELRVKQQWKKLNKMIGVNILLGSLYVVGCTIFIY
LFKEQIFSVIAKDINYQVSMLSFMLIGIYFCIRVWCDTYAMLLQSMNYLKILWILVPLQAIIGGIAQWYFSSKLGISGVL
LGLIISFALTVFWGLPLTYLIKANKE

Sequences:

>Translated_426_residues
MLKIPSHLIVAGSSWLSKIIIAGVQLASISYLISILGEEKYAIFSLLTGLLVWCSAVDFGIGTGLQNYISECRAKNKSYD
AYIKSALHLSFIAIVFFIALFYIFSGVISSKYLSSFHEILQDKTRMLFFTSCLVFSSIGIGAIAYKILFAELVGWKANLL
NALSYMIGMLGLLYIYYRGISVDIKLSLIVLYLPVGMISLCYIVYRYIKLYHVKTTKSYYIAILRRSSGFFLFTLLSIVV
LQTDYMVISQRLTPADIVQYTVTMKIFGLVFFIYTAILQALWPICAELRVKQQWKKLNKMIGVNILLGSLYVVGCTIFIY
LFKEQIFSVIAKDINYQVSMLSFMLIGIYFCIRVWCDTYAMLLQSMNYLKILWILVPLQAIIGGIAQWYFSSKLGISGVL
LGLIISFALTVFWGLPLTYLIKANKE
>Mature_426_residues
MLKIPSHLIVAGSSWLSKIIIAGVQLASISYLISILGEEKYAIFSLLTGLLVWCSAVDFGIGTGLQNYISECRAKNKSYD
AYIKSALHLSFIAIVFFIALFYIFSGVISSKYLSSFHEILQDKTRMLFFTSCLVFSSIGIGAIAYKILFAELVGWKANLL
NALSYMIGMLGLLYIYYRGISVDIKLSLIVLYLPVGMISLCYIVYRYIKLYHVKTTKSYYIAILRRSSGFFLFTLLSIVV
LQTDYMVISQRLTPADIVQYTVTMKIFGLVFFIYTAILQALWPICAELRVKQQWKKLNKMIGVNILLGSLYVVGCTIFIY
LFKEQIFSVIAKDINYQVSMLSFMLIGIYFCIRVWCDTYAMLLQSMNYLKILWILVPLQAIIGGIAQWYFSSKLGISGVL
LGLIISFALTVFWGLPLTYLIKANKE

Specific function: May be involved in the translocation process of the nascent O-polysaccharide molecules and/or its ligation to lipid A core units [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48301; Mature: 48301

Theoretical pI: Translated: 9.66; Mature: 9.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKIPSHLIVAGSSWLSKIIIAGVQLASISYLISILGEEKYAIFSLLTGLLVWCSAVDFG
CCCCCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGTGLQNYISECRAKNKSYDAYIKSALHLSFIAIVFFIALFYIFSGVISSKYLSSFHEIL
HCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QDKTRMLFFTSCLVFSSIGIGAIAYKILFAELVGWKANLLNALSYMIGMLGLLYIYYRGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SVDIKLSLIVLYLPVGMISLCYIVYRYIKLYHVKTTKSYYIAILRRSSGFFLFTLLSIVV
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHH
LQTDYMVISQRLTPADIVQYTVTMKIFGLVFFIYTAILQALWPICAELRVKQQWKKLNKM
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGVNILLGSLYVVGCTIFIYLFKEQIFSVIAKDINYQVSMLSFMLIGIYFCIRVWCDTYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLLQSMNYLKILWILVPLQAIIGGIAQWYFSSKLGISGVLLGLIISFALTVFWGLPLTYL
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
IKANKE
EECCCC
>Mature Secondary Structure
MLKIPSHLIVAGSSWLSKIIIAGVQLASISYLISILGEEKYAIFSLLTGLLVWCSAVDFG
CCCCCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGTGLQNYISECRAKNKSYDAYIKSALHLSFIAIVFFIALFYIFSGVISSKYLSSFHEIL
HCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QDKTRMLFFTSCLVFSSIGIGAIAYKILFAELVGWKANLLNALSYMIGMLGLLYIYYRGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SVDIKLSLIVLYLPVGMISLCYIVYRYIKLYHVKTTKSYYIAILRRSSGFFLFTLLSIVV
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHH
LQTDYMVISQRLTPADIVQYTVTMKIFGLVFFIYTAILQALWPICAELRVKQQWKKLNKM
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGVNILLGSLYVVGCTIFIYLFKEQIFSVIAKDINYQVSMLSFMLIGIYFCIRVWCDTYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLLQSMNYLKILWILVPLQAIIGGIAQWYFSSKLGISGVLLGLIISFALTVFWGLPLTYL
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
IKANKE
EECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1710759; 11677609 [H]