Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 189184253

Identifier: 189184253

GI number: 189184253

Start: 1369897

End: 1372737

Strand: Direct

Name: 189184253

Synonym: OTT_1346

Alternate gene names: NA

Gene position: 1369897-1372737 (Clockwise)

Preceding gene: 189184252

Following gene: 189184261

Centisome position: 68.19

GC content: 27.24

Gene sequence:

>2841_bases
ATGAGTATATACTATGTTAAGCCAAATGATGATTTCCTATTTTTACTAGCTAATTTTTTATTAAAAAATTACACATCATC
ACTTGATAAGGTTAAGGTTATATTACCTTATAGTCAACAATGTCAGGAACTCAAAAAAATAATAATGCTTACAGCTCGAA
AAGAAGCTATGTTATTACCAGATGTATTAACATTAAAACAATTTATTACTTCTTTTATTGCTGCTAGTAACTACTCGTTA
TCTATTTGTTGCCAGTTAAGTTCTTATGAACAAGAAGCTGCACTTTCTAAAATTATTCAACAACATAATCAACAACCGAT
TCGTTTAGGTGATGCTCTTAAGTTAAGTGGGAAATTATTACAGCTTTTTCAACAATTAGAAAGTCAACAAATCAATCTAA
CTCAATTAAAAGATTTTGTTGATCAAATTGATAGTTCAGAATACTGGCAAAATACATATAAGTTCTTAAGCTTTGCATAT
ATTGAGTGGAGTAAATTATATAGTAACAGCAGTTGTGATAGTAAAAGCGATATTTTTTCACAGCTACAAGATTTATTAAA
ATCTAACCTCAGTTCAAATATAGTTATCTTAGCAGGGTTATTACCAACTAGTAAGCTAGAGCTAGTAATTTTTAAGGGAG
TACTTTCTTGTAAGCTTGGCCATGTGATTTTACCGCCAATTTATTTAGAAGAATTATGCTATAGTGTAAAAAATTCTAGT
GATACTTTATATGATTTTCAGTATTTTGTTAAATCATGCAATATTTCACTAGATGATATAACATATCTAGCTAAAGCAAT
AGCATTACCAACAAAAAATAAACCTATACAATTATCAGAGTTTTTAGGTTTACCAAAGTTAAACTTAGTATCTGATGCTG
ATGCTACTAAGTTTAACAGTAATATTCCTATTGATATTGAATATGTTAAGGTTAACAGTCAATATGATGAAGCAAAGTTG
GTTGCAGCTATGATTCATAACTATTTAATCAAAGCTAATACTCAACATAATAAAATTTTAGTTGTTACTACTACTCCAAG
CTTTACTACTTTGCTAACTATGCACTTAAGCAAGTATCAGATAAACTATGCTAATCTTACAAATGTTGATATTAAGCAAT
TATTAGAAATAAATTTTATACTAGTATTAGCAGATTTAGTATCTAGCAATTTTAGCATTAGTAAATTTATTAATTTAATT
AAAACTTCATTACTTACTAGTAGTAGCAGTAATAAATTTGAAAACCTAATTTTAAAAAATAAATTTCAACAATCAGAACT
TAAACAGATTTTACTTGATTTAACCATTAGTAAAGATGATAGCGAATTGCAAAAATGGGCTACTTTTATTCTTAGCGCTT
TAGATGATTTATGGATATATTATAATAGCAATACTATTTTGTGTGATCAACTGATTATAGGTTTATTGCAAGCAGCTGAA
AATTTGACAGAAGGAAAAATTTGGCAATTTCAATTTAGTAAAAGAATATCTGATGTTCTAAAAGAAGTTATTCATATTGC
TAAGCAGTTTGGGAATATTGATATTAGAGATTTTAGCAATGTTCTTACAGAATTGGTTACTATGATTAAATTTAATTATG
AACATGATTATAATGCTAATGTTGTTATTACAGGCGCAGATAGCGCTATATTATTAAGTGCAGATTATATTATTATACCA
GAATTTAATAATGATCATTGGCCTGGTAACTCAATTCAAAATCCATGGCTTAACCAAGCTATATATAGTAAGTTAGGATT
AATTGAACGTAATGCTCATTATGATAGAAAACAATATATATTATATACTATATTACAGAAAGCTCATGTTAGTTTGATCA
ATTCTCAATTTACTGCATCAAGTAAGACTACAGATTCTCAATTTATCTTAAAATTACAACTTCTTGCTTTTAAAAATCCT
TTAATTCGCATTAGAGTAAATGACTTAAAGCTTCAATATAATCAAAATTATACTTCTAATGTTGTAGATAATAAATCTAC
AACATTCCAAATATTGCCTGGCATTTTACTGTCTAGTGCTGATATAGTCAAAACGATATCTGCAACAGATATTGAAATGC
TAATTAGAAATCCTTATGGATTTTACGCTAAAAATATATTAAGACTAAAACCAGTAATACTAAATGATGATCAATTAACA
CAAGCAAAATTTGGCGACTTTATTCATAAGGTAATTCATAGGTATACTATTTGCTACAAAGATATGGAGGAAAGTAAATT
AATAAACTATTTTATTGATATAGGTAAACAATTAATAGATTGTTACAACTGTAGTTCATTTGCTAAAATGATATGGCTAA
CTAAGCTGCATCAATTAGCTGAGGAATTTGTGAGATTTGATATGGAGAGGAAAAATGAAGGATTTAAGATTTTTTCAGAA
CAGTCAGGACAAATTTCACTAAATATTAATAATAATGCGCTAAATATTATAGCTATAGCAGATAGAATAGAATATTCACA
AAATGGTGAATGCTACATTATCGATTTTAAAACTGGTACAGTTCCTAATAAAAAAGAAGTACAGCAGGGAATAGCAACTC
AATTAATTATTGAAAGTATTATACTATATCGAGGTGGGTTTAAAAACTTACCTGCAATGATGCCTAATAAAATAATTTAT
ATTAAAATTACTTCTACTAAGCCATTACTTGAGTTTACAGAAATAACAGTAGATCAAGAAATGTTAGATAAACATGAGTT
AGGCTTAGTAGAGTTACTGCAATATTACATTAAAGACGGAGGAGTATTTTTTCCTTCTCCTGTTGATAAGTTAGCTCCAA
AATATAATAATTATAAGCATTTAGCACGTTATTTAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAATCTACCTACTATTAAGCTTTATTGCAACGAATGCATATATGAAGTTTTATTTAAGAATTAATTATTGAAAACAATC
TGTTACTTAATATTTAGCAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGTAATTACAAATATTAAACTTATAGCAACATAAGAAGTTAATATATAGCATAAATCAAAAAGATAGCTGTTGTGTATT
TTCAAATTTTCCAGATCAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 946; Mature: 945

Protein sequence:

>946_residues
MSIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTARKEAMLLPDVLTLKQFITSFIAASNYSL
SICCQLSSYEQEAALSKIIQQHNQQPIRLGDALKLSGKLLQLFQQLESQQINLTQLKDFVDQIDSSEYWQNTYKFLSFAY
IEWSKLYSNSSCDSKSDIFSQLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELVIFKGVLSCKLGHVILPPIYLEELCYSVKNSS
DTLYDFQYFVKSCNISLDDITYLAKAIALPTKNKPIQLSEFLGLPKLNLVSDADATKFNSNIPIDIEYVKVNSQYDEAKL
VAAMIHNYLIKANTQHNKILVVTTTPSFTTLLTMHLSKYQINYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLI
KTSLLTSSSSNKFENLILKNKFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDDLWIYYNSNTILCDQLIIGLLQAAE
NLTEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVVITGADSAILLSADYIIIP
EFNNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILYTILQKAHVSLINSQFTASSKTTDSQFILKLQLLAFKNP
LIRIRVNDLKLQYNQNYTSNVVDNKSTTFQILPGILLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLT
QAKFGDFIHKVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMIWLTKLHQLAEEFVRFDMERKNEGFKIFSE
QSGQISLNINNNALNIIAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNKKEVQQGIATQLIIESIILYRGGFKNLPAMMPNKIIY
IKITSTKPLLEFTEITVDQEMLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI

Sequences:

>Translated_946_residues
MSIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTARKEAMLLPDVLTLKQFITSFIAASNYSL
SICCQLSSYEQEAALSKIIQQHNQQPIRLGDALKLSGKLLQLFQQLESQQINLTQLKDFVDQIDSSEYWQNTYKFLSFAY
IEWSKLYSNSSCDSKSDIFSQLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELVIFKGVLSCKLGHVILPPIYLEELCYSVKNSS
DTLYDFQYFVKSCNISLDDITYLAKAIALPTKNKPIQLSEFLGLPKLNLVSDADATKFNSNIPIDIEYVKVNSQYDEAKL
VAAMIHNYLIKANTQHNKILVVTTTPSFTTLLTMHLSKYQINYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLI
KTSLLTSSSSNKFENLILKNKFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDDLWIYYNSNTILCDQLIIGLLQAAE
NLTEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVVITGADSAILLSADYIIIP
EFNNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILYTILQKAHVSLINSQFTASSKTTDSQFILKLQLLAFKNP
LIRIRVNDLKLQYNQNYTSNVVDNKSTTFQILPGILLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLT
QAKFGDFIHKVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMIWLTKLHQLAEEFVRFDMERKNEGFKIFSE
QSGQISLNINNNALNIIAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNKKEVQQGIATQLIIESIILYRGGFKNLPAMMPNKIIY
IKITSTKPLLEFTEITVDQEMLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI
>Mature_945_residues
SIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTARKEAMLLPDVLTLKQFITSFIAASNYSLS
ICCQLSSYEQEAALSKIIQQHNQQPIRLGDALKLSGKLLQLFQQLESQQINLTQLKDFVDQIDSSEYWQNTYKFLSFAYI
EWSKLYSNSSCDSKSDIFSQLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELVIFKGVLSCKLGHVILPPIYLEELCYSVKNSSD
TLYDFQYFVKSCNISLDDITYLAKAIALPTKNKPIQLSEFLGLPKLNLVSDADATKFNSNIPIDIEYVKVNSQYDEAKLV
AAMIHNYLIKANTQHNKILVVTTTPSFTTLLTMHLSKYQINYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIK
TSLLTSSSSNKFENLILKNKFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDDLWIYYNSNTILCDQLIIGLLQAAEN
LTEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVVITGADSAILLSADYIIIPE
FNNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILYTILQKAHVSLINSQFTASSKTTDSQFILKLQLLAFKNPL
IRIRVNDLKLQYNQNYTSNVVDNKSTTFQILPGILLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQ
AKFGDFIHKVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMIWLTKLHQLAEEFVRFDMERKNEGFKIFSEQ
SGQISLNINNNALNIIAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNKKEVQQGIATQLIIESIILYRGGFKNLPAMMPNKIIYI
KITSTKPLLEFTEITVDQEMLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI

Specific function: Unknown

COG id: COG2887

COG function: function code L; RecB family exonuclease

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011335
- InterPro:   IPR022436 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 108400; Mature: 108269

Theoretical pI: Translated: 7.34; Mature: 7.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTARKEAMLLP
CEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCH
DVLTLKQFITSFIAASNYSLSICCQLSSYEQEAALSKIIQQHNQQPIRLGDALKLSGKLL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHH
QLFQQLESQQINLTQLKDFVDQIDSSEYWQNTYKFLSFAYIEWSKLYSNSSCDSKSDIFS
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
QLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELVIFKGVLSCKLGHVILPPIYLEELCYSVKNSS
HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHCCCC
DTLYDFQYFVKSCNISLDDITYLAKAIALPTKNKPIQLSEFLGLPKLNLVSDADATKFNS
CCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCCC
NIPIDIEYVKVNSQYDEAKLVAAMIHNYLIKANTQHNKILVVTTTPSFTTLLTMHLSKYQ
CCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHEE
INYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKTSLLTSSSSNKFENLILKN
EEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
KFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDDLWIYYNSNTILCDQLIIGLLQAAE
HCCHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHC
NLTEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNAN
CCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
VVITGADSAILLSADYIIIPEFNNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYI
EEEECCCCEEEEEECEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
LYTILQKAHVSLINSQFTASSKTTDSQFILKLQLLAFKNPLIRIRVNDLKLQYNQNYTSN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCC
VVDNKSTTFQILPGILLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLT
CCCCCCCCCEEHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHEECCEEECCCCHH
QAKFGDFIHKVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMIWLTKLHQLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
EEFVRFDMERKNEGFKIFSEQSGQISLNINNNALNIIAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGT
HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCC
VPNKKEVQQGIATQLIIESIILYRGGFKNLPAMMPNKIIYIKITSTKPLLEFTEITVDQE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHH
MLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI
HHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTARKEAMLLP
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCH
DVLTLKQFITSFIAASNYSLSICCQLSSYEQEAALSKIIQQHNQQPIRLGDALKLSGKLL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHH
QLFQQLESQQINLTQLKDFVDQIDSSEYWQNTYKFLSFAYIEWSKLYSNSSCDSKSDIFS
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
QLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELVIFKGVLSCKLGHVILPPIYLEELCYSVKNSS
HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHCCCC
DTLYDFQYFVKSCNISLDDITYLAKAIALPTKNKPIQLSEFLGLPKLNLVSDADATKFNS
CCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCCC
NIPIDIEYVKVNSQYDEAKLVAAMIHNYLIKANTQHNKILVVTTTPSFTTLLTMHLSKYQ
CCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHEE
INYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKTSLLTSSSSNKFENLILKN
EEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
KFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDDLWIYYNSNTILCDQLIIGLLQAAE
HCCHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHC
NLTEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNAN
CCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
VVITGADSAILLSADYIIIPEFNNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYI
EEEECCCCEEEEEECEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
LYTILQKAHVSLINSQFTASSKTTDSQFILKLQLLAFKNPLIRIRVNDLKLQYNQNYTSN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCC
VVDNKSTTFQILPGILLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLT
CCCCCCCCCEEHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHEECCEEECCCCHH
QAKFGDFIHKVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMIWLTKLHQLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
EEFVRFDMERKNEGFKIFSEQSGQISLNINNNALNIIAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGT
HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCC
VPNKKEVQQGIATQLIIESIILYRGGFKNLPAMMPNKIIYIKITSTKPLLEFTEITVDQE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHH
MLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI
HHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA