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The map label for this gene is perM [C]

Identifier: 189183980

GI number: 189183980

Start: 1101241

End: 1102293

Strand: Reverse

Name: perM [C]

Synonym: OTT_1073

Alternate gene names: 189183980

Gene position: 1102293-1101241 (Counterclockwise)

Preceding gene: 189183986

Following gene: 189183948

Centisome position: 54.87

GC content: 25.64

Gene sequence:

>1053_bases
ATGATAGTAAAAACAAATAACTACATACTGTATTTTCTAATTACAGCAATAATATTATCGTTATGTTATTTTTTAATTAA
TATAGCTACTCCATTTTTAGCCGCTGCAGTTTTAGCTTATATACTAAACCCAATAGTAGAAATATTACAAATAAAACTTA
AATTATCCAGAAACTTAATAGTATCCATAGTATTTGTAGTATTTTTAACTATTCTAATTGTAGCAGCACTATTATTAATG
CCAATTATCTATAAACAAGCAGCACTATTAATTGCTAATATTCCAGTATATAAAGCAACCATACAAAACTTTATAGAATC
TAATAACAGTACTAACAATCTTGAGAATAGCATTAATCATAATATTAAACATATACTTACTGAAATAATAAATAGCTGGA
TTCTGATAATAACTCATATTTTAAATCACGCTTGGCAATATACCATTACCACCATACATAGCGTTGTTACAGCAGCATTT
ACTGGTATATTACTATTTTATTTTCTCAGAGACTGGAAGCTAATTATCAATAGCTGCAAGTCTATACTCCCTCAGCAAAG
CATTTTATATATTAATAAAATAGTTAATAGCATGAATACTTCATTATTAGCATATGCTCAGGGACAACTAAATATTTGTC
TAATATTATCAATTTTTTATAGCATCTCACTATTATTAATTAATTTAGATTTTTCTTTAACTATAGGATTATTTTCTGGT
ACTATAATTATAATACCTTTAATTGGAACAATAATCTCAACAAGCATAGCATTAATAACATGTTTTTCTCAATTTGGTTT
ATCATTCAAGTTACTTTATGTAATTATGATTTATATCATCAGTCATATTTTAGAAACTCACTTTCTTACTCCTAAACTTA
TAGGCAGCAAAGTTGGCTTACACCCTATATGGATATATTTTGCAGTATTAACCTGTAGCTATTATTTAGGATTTACAGGA
ATATTTTTGGCTATTCCGCTGGCTATTATAATCAAAATTGTATGTCAAACAATAATAGATACTTATAAGTTAAATAACTT
CAATTATAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTAATTAAAAATGCATTTCATTCATGGTAAAATTTTTCTTAAACTATATTCCTCATTTTACAATTCAATATTACTTAAT
TAACTGAAGATCATTGTTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGCCATATTAGCCCAATGCTGCAGATATATTAAGATTTAATAATACCTGTTTTAAAGCTACTGTTAAATTATGTATCA
TTTCATCAGTATGAAATGGA

Product: permease protein PerM

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 350; Mature: 350

Protein sequence:

>350_residues
MIVKTNNYILYFLITAIILSLCYFLINIATPFLAAAVLAYILNPIVEILQIKLKLSRNLIVSIVFVVFLTILIVAALLLM
PIIYKQAALLIANIPVYKATIQNFIESNNSTNNLENSINHNIKHILTEIINSWILIITHILNHAWQYTITTIHSVVTAAF
TGILLFYFLRDWKLIINSCKSILPQQSILYINKIVNSMNTSLLAYAQGQLNICLILSIFYSISLLLINLDFSLTIGLFSG
TIIIIPLIGTIISTSIALITCFSQFGLSFKLLYVIMIYIISHILETHFLTPKLIGSKVGLHPIWIYFAVLTCSYYLGFTG
IFLAIPLAIIIKIVCQTIIDTYKLNNFNYK

Sequences:

>Translated_350_residues
MIVKTNNYILYFLITAIILSLCYFLINIATPFLAAAVLAYILNPIVEILQIKLKLSRNLIVSIVFVVFLTILIVAALLLM
PIIYKQAALLIANIPVYKATIQNFIESNNSTNNLENSINHNIKHILTEIINSWILIITHILNHAWQYTITTIHSVVTAAF
TGILLFYFLRDWKLIINSCKSILPQQSILYINKIVNSMNTSLLAYAQGQLNICLILSIFYSISLLLINLDFSLTIGLFSG
TIIIIPLIGTIISTSIALITCFSQFGLSFKLLYVIMIYIISHILETHFLTPKLIGSKVGLHPIWIYFAVLTCSYYLGFTG
IFLAIPLAIIIKIVCQTIIDTYKLNNFNYK
>Mature_350_residues
MIVKTNNYILYFLITAIILSLCYFLINIATPFLAAAVLAYILNPIVEILQIKLKLSRNLIVSIVFVVFLTILIVAALLLM
PIIYKQAALLIANIPVYKATIQNFIESNNSTNNLENSINHNIKHILTEIINSWILIITHILNHAWQYTITTIHSVVTAAF
TGILLFYFLRDWKLIINSCKSILPQQSILYINKIVNSMNTSLLAYAQGQLNICLILSIFYSISLLLINLDFSLTIGLFSG
TIIIIPLIGTIISTSIALITCFSQFGLSFKLLYVIMIYIISHILETHFLTPKLIGSKVGLHPIWIYFAVLTCSYYLGFTG
IFLAIPLAIIIKIVCQTIIDTYKLNNFNYK

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=326, Percent_Identity=26.6871165644172, Blast_Score=112, Evalue=5e-26,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 39504; Mature: 39504

Theoretical pI: Translated: 9.31; Mature: 9.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIVKTNNYILYFLITAIILSLCYFLINIATPFLAAAVLAYILNPIVEILQIKLKLSRNLI
CEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSIVFVVFLTILIVAALLLMPIIYKQAALLIANIPVYKATIQNFIESNNSTNNLENSINH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
NIKHILTEIINSWILIITHILNHAWQYTITTIHSVVTAAFTGILLFYFLRDWKLIINSCK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILPQQSILYINKIVNSMNTSLLAYAQGQLNICLILSIFYSISLLLINLDFSLTIGLFSG
HHCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
TIIIIPLIGTIISTSIALITCFSQFGLSFKLLYVIMIYIISHILETHFLTPKLIGSKVGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCC
HPIWIYFAVLTCSYYLGFTGIFLAIPLAIIIKIVCQTIIDTYKLNNFNYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIVKTNNYILYFLITAIILSLCYFLINIATPFLAAAVLAYILNPIVEILQIKLKLSRNLI
CEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSIVFVVFLTILIVAALLLMPIIYKQAALLIANIPVYKATIQNFIESNNSTNNLENSINH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
NIKHILTEIINSWILIITHILNHAWQYTITTIHSVVTAAFTGILLFYFLRDWKLIINSCK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILPQQSILYINKIVNSMNTSLLAYAQGQLNICLILSIFYSISLLLINLDFSLTIGLFSG
HHCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
TIIIIPLIGTIISTSIALITCFSQFGLSFKLLYVIMIYIISHILETHFLTPKLIGSKVGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCC
HPIWIYFAVLTCSYYLGFTGIFLAIPLAIIIKIVCQTIIDTYKLNNFNYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 7.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9823893 [H]