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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 188587137

GI number: 188587137

Start: 2729502

End: 2731049

Strand: Reverse

Name: mviN [H]

Synonym: Nther_2534

Alternate gene names: 188587137

Gene position: 2731049-2729502 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188587138

Following gene: 188587136

Centisome position: 86.27

GC content: 30.49

Gene sequence:

>1548_bases
ATGGATGGTAATCGAACAGTAATCAAATCATTGTCCATGATAAGTATAATTGCTATGATCTCAAAATTTTTTGGACTCGG
AAGGGAAGTGGCTATTGCATCTACGTTTGGGGCAAGTGCAGATGCCGATATTTTTTTAATAGCACTTATGATTCCAATGA
GTTTATTTGGTATTGCTTTTTCTGTTTTTGCTCGAACAATCGTTCCTGTCAAAGCTAAACTATATACTAATTATGGTAAC
AGAGAAGTTCGAGATTTTTTTGTTAGTATTTTTACTGTAGTATTTGGCTTTGCTTTCTTGATTACATTATTTGTTTATTT
TGGAGCGCCGTGGTTAACAAAAATATTAGTTCCTGGCTTTGAAGAACAATATTTTAATCAGACGGTAAAAGCTATTAAAA
TAGTATCCCCTGGAATAATATTTTTTGCGATTTCAGCTTTGTTATCTGGGATGCTTCATTCTTATAATAGTTTCTTTTAT
CCAGCCATTAAAAGTATCCCTTTTAATCTTGTAATAATAATTGGTTTGATATTTATAGGGGATAGGCATGGTTTAGAAGC
TTCAGTTATGATAATTGTACTAGCATTGTGTTTTCAGTTTTTAGTTCAACTTCCGGGAGTTAAATCAATACTTGATATAA
ATAATATTAACTTTAGTTTGCACTCAGGAGTTAAAGAAGCTTTTTTGTTAGCATTTCCACTGATATTGTCTGTGATGAGT
GTTGAGCTGAAGATTGTGATCGATCGTGTGTTTGCATCAACTTTGGCGGAGGGCAGTATTTCTGCTTTGAATTATGCAAA
AAGATTAAGATTGCTACCTATTGGAATAATTGCTACTCCGATTGCTACAGTTTTTTTCCCAAGGTTAAGTGAAAGTATAG
CAAATAAAAATATGAAAAGTTTTTCAAATTACTTTACCCAAGCTTTTAATTTAGCCATATTTTTGTTAACGCCAATCATG
GTTGGTTTAATCATATTAAGGTTTGAAATTGTAGAAGTTTTATTTAAAAGGGGAGCATTTGACACTCAAGCTGTCGCTTT
AACTTCGTCTGCGTTACTATTTTATGCACCTAGTATTGTTAGTTTGGGACTGAAAAACTTATTTGAAAGAACTTTTACTA
GTGTGAATTTGACAATGAAATTGTCTAAAATATCATTTGTTGCTATAACATTAAATGTTTTTTTGAATTATGTTTTAATA
AGTTTTATGGAACATAATGGGATAGCTTTAGCGACCACTATATCAAACTTTATTGCTGTGTTTTTATTATTTAAAACTTT
ACAAAATAATGTCTCTAACATTACCTCAAACTGTAAGAATATATTTAAAATAGTAATAATGTCTAGTATTATGGGTGTTT
TTGTGTATGTTTTAAATAGTATCAAGGAACCTCTTTGGGGACAGTGGACAGTTTTAGATTGGTTTATATTACTACTTTTA
ATTACAATTGGTGGAGCTATCTATACATTGCTGGGATATATTTTTAAATGCAAAGAAATAGAATACTTTTTCCGAATTGT
AAAAGATAAACTTTTTTCTGGAGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTTACTAGTTAACGTAGTTAGTTTGATTCAAAAAAAGTTTCGATTTATTGAGATGTTTCTAAAGCAAGTATGGTAAA
AAAGTAGAAAGGAAATTAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAATGAGTAAGTTAATAGGCTTATACTATATGGACAAGTATGAAAATTTAAAGTCTAAATTACGACATTTAAAAAAAGA
TATAAATGTTCCCAATGCTA

Product: integral membrane protein MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 515; Mature: 515

Protein sequence:

>515_residues
MDGNRTVIKSLSMISIIAMISKFFGLGREVAIASTFGASADADIFLIALMIPMSLFGIAFSVFARTIVPVKAKLYTNYGN
REVRDFFVSIFTVVFGFAFLITLFVYFGAPWLTKILVPGFEEQYFNQTVKAIKIVSPGIIFFAISALLSGMLHSYNSFFY
PAIKSIPFNLVIIIGLIFIGDRHGLEASVMIIVLALCFQFLVQLPGVKSILDINNINFSLHSGVKEAFLLAFPLILSVMS
VELKIVIDRVFASTLAEGSISALNYAKRLRLLPIGIIATPIATVFFPRLSESIANKNMKSFSNYFTQAFNLAIFLLTPIM
VGLIILRFEIVEVLFKRGAFDTQAVALTSSALLFYAPSIVSLGLKNLFERTFTSVNLTMKLSKISFVAITLNVFLNYVLI
SFMEHNGIALATTISNFIAVFLLFKTLQNNVSNITSNCKNIFKIVIMSSIMGVFVYVLNSIKEPLWGQWTVLDWFILLLL
ITIGGAIYTLLGYIFKCKEIEYFFRIVKDKLFSGG

Sequences:

>Translated_515_residues
MDGNRTVIKSLSMISIIAMISKFFGLGREVAIASTFGASADADIFLIALMIPMSLFGIAFSVFARTIVPVKAKLYTNYGN
REVRDFFVSIFTVVFGFAFLITLFVYFGAPWLTKILVPGFEEQYFNQTVKAIKIVSPGIIFFAISALLSGMLHSYNSFFY
PAIKSIPFNLVIIIGLIFIGDRHGLEASVMIIVLALCFQFLVQLPGVKSILDINNINFSLHSGVKEAFLLAFPLILSVMS
VELKIVIDRVFASTLAEGSISALNYAKRLRLLPIGIIATPIATVFFPRLSESIANKNMKSFSNYFTQAFNLAIFLLTPIM
VGLIILRFEIVEVLFKRGAFDTQAVALTSSALLFYAPSIVSLGLKNLFERTFTSVNLTMKLSKISFVAITLNVFLNYVLI
SFMEHNGIALATTISNFIAVFLLFKTLQNNVSNITSNCKNIFKIVIMSSIMGVFVYVLNSIKEPLWGQWTVLDWFILLLL
ITIGGAIYTLLGYIFKCKEIEYFFRIVKDKLFSGG
>Mature_515_residues
MDGNRTVIKSLSMISIIAMISKFFGLGREVAIASTFGASADADIFLIALMIPMSLFGIAFSVFARTIVPVKAKLYTNYGN
REVRDFFVSIFTVVFGFAFLITLFVYFGAPWLTKILVPGFEEQYFNQTVKAIKIVSPGIIFFAISALLSGMLHSYNSFFY
PAIKSIPFNLVIIIGLIFIGDRHGLEASVMIIVLALCFQFLVQLPGVKSILDINNINFSLHSGVKEAFLLAFPLILSVMS
VELKIVIDRVFASTLAEGSISALNYAKRLRLLPIGIIATPIATVFFPRLSESIANKNMKSFSNYFTQAFNLAIFLLTPIM
VGLIILRFEIVEVLFKRGAFDTQAVALTSSALLFYAPSIVSLGLKNLFERTFTSVNLTMKLSKISFVAITLNVFLNYVLI
SFMEHNGIALATTISNFIAVFLLFKTLQNNVSNITSNCKNIFKIVIMSSIMGVFVYVLNSIKEPLWGQWTVLDWFILLLL
ITIGGAIYTLLGYIFKCKEIEYFFRIVKDKLFSGG

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=432, Percent_Identity=27.5462962962963, Blast_Score=147, Evalue=2e-36,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57336; Mature: 57336

Theoretical pI: Translated: 10.02; Mature: 10.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDGNRTVIKSLSMISIIAMISKFFGLGREVAIASTFGASADADIFLIALMIPMSLFGIAF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVFARTIVPVKAKLYTNYGNREVRDFFVSIFTVVFGFAFLITLFVYFGAPWLTKILVPGF
HHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCC
EEQYFNQTVKAIKIVSPGIIFFAISALLSGMLHSYNSFFYPAIKSIPFNLVIIIGLIFIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHC
DRHGLEASVMIIVLALCFQFLVQLPGVKSILDINNINFSLHSGVKEAFLLAFPLILSVMS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VELKIVIDRVFASTLAEGSISALNYAKRLRLLPIGIIATPIATVFFPRLSESIANKNMKS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
FSNYFTQAFNLAIFLLTPIMVGLIILRFEIVEVLFKRGAFDTQAVALTSSALLFYAPSIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLGLKNLFERTFTSVNLTMKLSKISFVAITLNVFLNYVLISFMEHNGIALATTISNFIAV
HHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHH
FLLFKTLQNNVSNITSNCKNIFKIVIMSSIMGVFVYVLNSIKEPLWGQWTVLDWFILLLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
ITIGGAIYTLLGYIFKCKEIEYFFRIVKDKLFSGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MDGNRTVIKSLSMISIIAMISKFFGLGREVAIASTFGASADADIFLIALMIPMSLFGIAF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVFARTIVPVKAKLYTNYGNREVRDFFVSIFTVVFGFAFLITLFVYFGAPWLTKILVPGF
HHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCC
EEQYFNQTVKAIKIVSPGIIFFAISALLSGMLHSYNSFFYPAIKSIPFNLVIIIGLIFIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHC
DRHGLEASVMIIVLALCFQFLVQLPGVKSILDINNINFSLHSGVKEAFLLAFPLILSVMS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VELKIVIDRVFASTLAEGSISALNYAKRLRLLPIGIIATPIATVFFPRLSESIANKNMKS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
FSNYFTQAFNLAIFLLTPIMVGLIILRFEIVEVLFKRGAFDTQAVALTSSALLFYAPSIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLGLKNLFERTFTSVNLTMKLSKISFVAITLNVFLNYVLISFMEHNGIALATTISNFIAV
HHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHH
FLLFKTLQNNVSNITSNCKNIFKIVIMSSIMGVFVYVLNSIKEPLWGQWTVLDWFILLLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
ITIGGAIYTLLGYIFKCKEIEYFFRIVKDKLFSGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8200538; 11677609 [H]