| Definition | Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010718 |
| Length | 3,165,557 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 188585536
Identifier: 188585536
GI number: 188585536
Start: 960565
End: 963402
Strand: Direct
Name: 188585536
Synonym: Nther_0908
Alternate gene names: NA
Gene position: 960565-963402 (Clockwise)
Preceding gene: 188585533
Following gene: 188585537
Centisome position: 30.34
GC content: 38.69
Gene sequence:
>2838_bases TTGAGGAATAAGTTTATTATTTTAATGTTTGTTGTGATTTTTTTATTATTTTCAATGGGGTCTATAGCTAATTTCATTAC AGAATGGCAATGGTTCTCCAGCTTGGGTTATTTGGATTTATTTGTGATGCCTTTTGTAATTCAAGTGGTGATTTCCATAG CTGCCTTTATTGTTGGAACTGTATTTGTTTATTTTAATTTGAATACATTATCTAACTATTTATTGACCCCCAAAGAACAG GTGAAGCTGTATGAAAGCAAGTACGCAGAACTAATTGACAAATTTCAATCATTCGGAAAATGGGCTAAAATTGGAATATC TGCCTTTTTAGGACTGATCTGGGCAGGTTTATTTCAAGGTTTGTGGCTGAGAATCGTTTATTTTATACACGGTGAAGCCA CAGGGGAACTTGAACCTGTTTATAATTTAGATTTAGCTTTTTACTTATTTAGATTGCCTATGTATCAACAGATTGTAACA GCACTTATAAGTTTAGTTTTATTCACTTTAATTGCTGTTGTCGTAATTTACCTTGCAAGGGGCTTTCTATCATGGAATAC TATCAAAGATGATGGTGGTTTTCCCGCTGGTCGTTTGGCGTTAAGACATATCAATATATTGTTAGGGATTTTCTTATTAG TTTTAGCACTTAATGCCATACTGGGAAGGTATGAGTTGTTGTTTTCTGCCCGGGGAGCTGTCTTTGGTGCTGGATATACG GATATCCATGTTACGCGACTGGTATACACAGGCCTTGGTGTGATTGGAACTTTAGGATTTGTTATTAGCTTAGCGAATCT AAAATTAGCCAAGTATAAACTGGTATTCTTCTCTTTAGGAGCCTTTTTCCTTGTCTCTATATTGGGAGGGGTTGCCGGAC AGATAGTGCAATCGACTATAGTATCTCCTAATGAATTGACTAGAGAAAGGCCTTTTATAGAAAATCACCTGGAAATGACG CGTACGGCTTATGGACTAGCAGATATTCAGGAAGAAACCTGGGATGTGGATGTGGAAGGCGAGTTGGAAGATGACGCAGT AGAAGAAGGAGAAGATATAGAAGAAGAACTCGAGGAAATCGAATCAGAACTTCCGCCACCTGAACTTGATGAAGTAACTT ATAATAACATGCGATTATTGGACTATCGTCCAGTACAGGATGTATACAGGGAAGCACAAGAGTACAGAAGATATTATCAT TTTAATGATGTAAATCTAGCCAGGTATCGGATAGATGATGAATATCATCAGGTGATGGTATCACCTCGGGAAATGGATGT AGACAGAATACCATCTGAAGCTCAAACACCGGTTAATCGCCATTTAAAATATACCCATGGGTATGGCTTGGTGATGAGCC CAGTAGGACAATTTACCGATGGCGGTATGCCTGAATACTATTTGAAAGATATGCCGATTGAGGATGATTTAGGATTGGGG ATAGAAAGACCAGAATTATACTTTGGTGAACTGACTAACGATTTCGTATTAGTAAACACTGATGTAGAAGAGTTTCACTA CCCTGGGCAAGAAGAAGTGGACTTGACCTATCAAGGAGAAACTGGTATTGATATGAGTTTACTTAATAGAATTCTGTTTG CTATTCGTGAACGCAGCAGTTTCCTATTGTTTTCCCAGGAGTATTCTTCAGATAGTCAAATATTGATAAATCGAAATATC CACGACAGAGTGGAAAGACTGGCACCCTTTTTAGAATATGATAATGACCCTTATATAGCAGCAGCTAATGGTGAATTATA CTGGATTATGGATGCTTATGTTACTAGCGATAATTTTCCGTATAGTAGACCTTTCCAGGGAGATGACAATTATATTAAAA ATCCGGTAAAAGTAGTTATAGATGCTTACACAGGTGAAACTTCATTTTACTTAGTAGAAGATGATGAGCCCTTGACCCAG GCTATCTCCAATGCTTTTCCAGATCTGTTCTCTGACCCTCAGGAATTGTCAGATGAATTGAGGGCCCAGTTTAGGTATCC TCATAATTTCTTTACTATCCAGGCTAATATGTTGAAAAACTATCACATGACAAATCCAGTGGTATTTTATAATCGGGAAG ATGGTTGGGATATACCCACAGAAAGTTACGGAGAAACAAGTATTGAAATGGAACCTTATTATGCCACCTTAAATTTACCT GATACAGACGAACCTGAATTTGTTTTGATGCAACCTTTCACACCAGTACAGAGAAATAACATGATTTCTTGGCTTGGTGC TCGAAATGATGGAGATAAATATGGTGAATTAGTACTTTATCGCTTTCCTTCTGGACGCCATGTTTACGGACCCAGGCAAA TTGATGCCAGGATAGACCAACATCCTGACATTTCAGAACAGCTGTCACTCTGGGATGGCCAAGGCTCACGGGTTATCAGG GGTAACTTACTGGTAATACCACTAGAGGACGGTGTTCTATATATTGAACCCCTTTATTTACAGGCCGAGGATAGTAGTTA CCCGGAAATGAGAAGGGTAATAGCTGCCTGGGGAGACTTGCTTGTTATGGAAGACAGCTTGGAAGAAGCTTTAGATGCCC TGGGTACCACAGCGGAAGATGTAGACACCGAAGTTATGGAAGAAGAGTTACCCGAACGAGAAGTAGAAGAAGTGGAAGAA CTGGTTGAACAAGAATTTGAAACTATAGGTGAACTTGTAGATGAAGCGCTTAGGCTTGAAAGAGAAGCTGAAGCAGCTAT TAGTGAAGGAAATTGGGGAGAGTACGGAGAATTACAAACTGAACTAAGTGAAATTTTAAAAGAACTAGAGGAGAGACTAG ATACAACCATAGAAGATGAAGACAGTGATGATCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGGCCGGAATTTTCTAATGTCAATTACCGATGTGATTTGATATAATATATTACTGAATGAGTTTAAAATGGGAAGAGGGA ATTTATTAGGAGGGTTGAGC
Downstream 100 bases:
>100_bases ACCACTATTATGAGGTGAATATTATGTGGAAAGGAATAGTGAATTATTATCGTGAGTTTTTACCCGTGGATGAAGATTTT CCTCAATGCTCTTTGCAAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 945; Mature: 945
Protein sequence:
>945_residues MRNKFIILMFVVIFLLFSMGSIANFITEWQWFSSLGYLDLFVMPFVIQVVISIAAFIVGTVFVYFNLNTLSNYLLTPKEQ VKLYESKYAELIDKFQSFGKWAKIGISAFLGLIWAGLFQGLWLRIVYFIHGEATGELEPVYNLDLAFYLFRLPMYQQIVT ALISLVLFTLIAVVVIYLARGFLSWNTIKDDGGFPAGRLALRHINILLGIFLLVLALNAILGRYELLFSARGAVFGAGYT DIHVTRLVYTGLGVIGTLGFVISLANLKLAKYKLVFFSLGAFFLVSILGGVAGQIVQSTIVSPNELTRERPFIENHLEMT RTAYGLADIQEETWDVDVEGELEDDAVEEGEDIEEELEEIESELPPPELDEVTYNNMRLLDYRPVQDVYREAQEYRRYYH FNDVNLARYRIDDEYHQVMVSPREMDVDRIPSEAQTPVNRHLKYTHGYGLVMSPVGQFTDGGMPEYYLKDMPIEDDLGLG IERPELYFGELTNDFVLVNTDVEEFHYPGQEEVDLTYQGETGIDMSLLNRILFAIRERSSFLLFSQEYSSDSQILINRNI HDRVERLAPFLEYDNDPYIAAANGELYWIMDAYVTSDNFPYSRPFQGDDNYIKNPVKVVIDAYTGETSFYLVEDDEPLTQ AISNAFPDLFSDPQELSDELRAQFRYPHNFFTIQANMLKNYHMTNPVVFYNREDGWDIPTESYGETSIEMEPYYATLNLP DTDEPEFVLMQPFTPVQRNNMISWLGARNDGDKYGELVLYRFPSGRHVYGPRQIDARIDQHPDISEQLSLWDGQGSRVIR GNLLVIPLEDGVLYIEPLYLQAEDSSYPEMRRVIAAWGDLLVMEDSLEEALDALGTTAEDVDTEVMEEELPEREVEEVEE LVEQEFETIGELVDEALRLEREAEAAISEGNWGEYGELQTELSEILKELEERLDTTIEDEDSDDQ
Sequences:
>Translated_945_residues MRNKFIILMFVVIFLLFSMGSIANFITEWQWFSSLGYLDLFVMPFVIQVVISIAAFIVGTVFVYFNLNTLSNYLLTPKEQ VKLYESKYAELIDKFQSFGKWAKIGISAFLGLIWAGLFQGLWLRIVYFIHGEATGELEPVYNLDLAFYLFRLPMYQQIVT ALISLVLFTLIAVVVIYLARGFLSWNTIKDDGGFPAGRLALRHINILLGIFLLVLALNAILGRYELLFSARGAVFGAGYT DIHVTRLVYTGLGVIGTLGFVISLANLKLAKYKLVFFSLGAFFLVSILGGVAGQIVQSTIVSPNELTRERPFIENHLEMT RTAYGLADIQEETWDVDVEGELEDDAVEEGEDIEEELEEIESELPPPELDEVTYNNMRLLDYRPVQDVYREAQEYRRYYH FNDVNLARYRIDDEYHQVMVSPREMDVDRIPSEAQTPVNRHLKYTHGYGLVMSPVGQFTDGGMPEYYLKDMPIEDDLGLG IERPELYFGELTNDFVLVNTDVEEFHYPGQEEVDLTYQGETGIDMSLLNRILFAIRERSSFLLFSQEYSSDSQILINRNI HDRVERLAPFLEYDNDPYIAAANGELYWIMDAYVTSDNFPYSRPFQGDDNYIKNPVKVVIDAYTGETSFYLVEDDEPLTQ AISNAFPDLFSDPQELSDELRAQFRYPHNFFTIQANMLKNYHMTNPVVFYNREDGWDIPTESYGETSIEMEPYYATLNLP DTDEPEFVLMQPFTPVQRNNMISWLGARNDGDKYGELVLYRFPSGRHVYGPRQIDARIDQHPDISEQLSLWDGQGSRVIR GNLLVIPLEDGVLYIEPLYLQAEDSSYPEMRRVIAAWGDLLVMEDSLEEALDALGTTAEDVDTEVMEEELPEREVEEVEE LVEQEFETIGELVDEALRLEREAEAAISEGNWGEYGELQTELSEILKELEERLDTTIEDEDSDDQ >Mature_945_residues MRNKFIILMFVVIFLLFSMGSIANFITEWQWFSSLGYLDLFVMPFVIQVVISIAAFIVGTVFVYFNLNTLSNYLLTPKEQ VKLYESKYAELIDKFQSFGKWAKIGISAFLGLIWAGLFQGLWLRIVYFIHGEATGELEPVYNLDLAFYLFRLPMYQQIVT ALISLVLFTLIAVVVIYLARGFLSWNTIKDDGGFPAGRLALRHINILLGIFLLVLALNAILGRYELLFSARGAVFGAGYT DIHVTRLVYTGLGVIGTLGFVISLANLKLAKYKLVFFSLGAFFLVSILGGVAGQIVQSTIVSPNELTRERPFIENHLEMT RTAYGLADIQEETWDVDVEGELEDDAVEEGEDIEEELEEIESELPPPELDEVTYNNMRLLDYRPVQDVYREAQEYRRYYH FNDVNLARYRIDDEYHQVMVSPREMDVDRIPSEAQTPVNRHLKYTHGYGLVMSPVGQFTDGGMPEYYLKDMPIEDDLGLG IERPELYFGELTNDFVLVNTDVEEFHYPGQEEVDLTYQGETGIDMSLLNRILFAIRERSSFLLFSQEYSSDSQILINRNI HDRVERLAPFLEYDNDPYIAAANGELYWIMDAYVTSDNFPYSRPFQGDDNYIKNPVKVVIDAYTGETSFYLVEDDEPLTQ AISNAFPDLFSDPQELSDELRAQFRYPHNFFTIQANMLKNYHMTNPVVFYNREDGWDIPTESYGETSIEMEPYYATLNLP DTDEPEFVLMQPFTPVQRNNMISWLGARNDGDKYGELVLYRFPSGRHVYGPRQIDARIDQHPDISEQLSLWDGQGSRVIR GNLLVIPLEDGVLYIEPLYLQAEDSSYPEMRRVIAAWGDLLVMEDSLEEALDALGTTAEDVDTEVMEEELPEREVEEVEE LVEQEFETIGELVDEALRLEREAEAAISEGNWGEYGELQTELSEILKELEERLDTTIEDEDSDDQ
Specific function: Unknown
COG id: COG1615
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the UPF0182 family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR005372 [H]
Pfam domain/function: PF03699 UPF0182 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 108526; Mature: 108526
Theoretical pI: Translated: 3.99; Mature: 3.99
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRNKFIILMFVVIFLLFSMGSIANFITEWQWFSSLGYLDLFVMPFVIQVVISIAAFIVGT CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFVYFNLNTLSNYLLTPKEQVKLYESKYAELIDKFQSFGKWAKIGISAFLGLIWAGLFQG HHHEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LWLRIVYFIHGEATGELEPVYNLDLAFYLFRLPMYQQIVTALISLVLFTLIAVVVIYLAR HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GFLSWNTIKDDGGFPAGRLALRHINILLGIFLLVLALNAILGRYELLFSARGAVFGAGYT HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCC DIHVTRLVYTGLGVIGTLGFVISLANLKLAKYKLVFFSLGAFFLVSILGGVAGQIVQSTI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC VSPNELTRERPFIENHLEMTRTAYGLADIQEETWDVDVEGELEDDAVEEGEDIEEELEEI CCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHH ESELPPPELDEVTYNNMRLLDYRPVQDVYREAQEYRRYYHFNDVNLARYRIDDEYHQVMV HHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHCC SPREMDVDRIPSEAQTPVNRHLKYTHGYGLVMSPVGQFTDGGMPEYYLKDMPIEDDLGLG CCCCCCHHHCCCCCCCCHHHCEEEECCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCC IERPELYFGELTNDFVLVNTDVEEFHYPGQEEVDLTYQGETGIDMSLLNRILFAIRERSS CCCCCCEECCCCCCEEEEECCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC FLLFSQEYSSDSQILINRNIHDRVERLAPFLEYDNDPYIAAANGELYWIMDAYVTSDNFP EEEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCC YSRPFQGDDNYIKNPVKVVIDAYTGETSFYLVEDDEPLTQAISNAFPDLFSDPQELSDEL CCCCCCCCCCHHCCCEEEEEEEECCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHH RAQFRYPHNFFTIQANMLKNYHMTNPVVFYNREDGWDIPTESYGETSIEMEPYYATLNLP HHHHCCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCEEEEEECC DTDEPEFVLMQPFTPVQRNNMISWLGARNDGDKYGELVLYRFPSGRHVYGPRQIDARIDQ CCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEECCCHHHHCCCCC HPDISEQLSLWDGQGSRVIRGNLLVIPLEDGVLYIEPLYLQAEDSSYPEMRRVIAAWGDL CCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCC LVMEDSLEEALDALGTTAEDVDTEVMEEELPEREVEEVEELVEQEFETIGELVDEALRLE EEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH REAEAAISEGNWGEYGELQTELSEILKELEERLDTTIEDEDSDDQ HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MRNKFIILMFVVIFLLFSMGSIANFITEWQWFSSLGYLDLFVMPFVIQVVISIAAFIVGT CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFVYFNLNTLSNYLLTPKEQVKLYESKYAELIDKFQSFGKWAKIGISAFLGLIWAGLFQG HHHEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LWLRIVYFIHGEATGELEPVYNLDLAFYLFRLPMYQQIVTALISLVLFTLIAVVVIYLAR HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GFLSWNTIKDDGGFPAGRLALRHINILLGIFLLVLALNAILGRYELLFSARGAVFGAGYT HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCC DIHVTRLVYTGLGVIGTLGFVISLANLKLAKYKLVFFSLGAFFLVSILGGVAGQIVQSTI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC VSPNELTRERPFIENHLEMTRTAYGLADIQEETWDVDVEGELEDDAVEEGEDIEEELEEI CCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHH ESELPPPELDEVTYNNMRLLDYRPVQDVYREAQEYRRYYHFNDVNLARYRIDDEYHQVMV HHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHCC SPREMDVDRIPSEAQTPVNRHLKYTHGYGLVMSPVGQFTDGGMPEYYLKDMPIEDDLGLG CCCCCCHHHCCCCCCCCHHHCEEEECCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCC IERPELYFGELTNDFVLVNTDVEEFHYPGQEEVDLTYQGETGIDMSLLNRILFAIRERSS CCCCCCEECCCCCCEEEEECCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC FLLFSQEYSSDSQILINRNIHDRVERLAPFLEYDNDPYIAAANGELYWIMDAYVTSDNFP EEEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCC YSRPFQGDDNYIKNPVKVVIDAYTGETSFYLVEDDEPLTQAISNAFPDLFSDPQELSDEL CCCCCCCCCCHHCCCEEEEEEEECCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHH RAQFRYPHNFFTIQANMLKNYHMTNPVVFYNREDGWDIPTESYGETSIEMEPYYATLNLP HHHHCCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCEEEEEECC DTDEPEFVLMQPFTPVQRNNMISWLGARNDGDKYGELVLYRFPSGRHVYGPRQIDARIDQ CCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEECCCHHHHCCCCC HPDISEQLSLWDGQGSRVIRGNLLVIPLEDGVLYIEPLYLQAEDSSYPEMRRVIAAWGDL CCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCC LVMEDSLEEALDALGTTAEDVDTEVMEEELPEREVEEVEELVEQEFETIGELVDEALRLE EEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH REAEAAISEGNWGEYGELQTELSEILKELEERLDTTIEDEDSDDQ HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA