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The map label for this gene is yebA [H]

Identifier: 188585079

GI number: 188585079

Start: 462154

End: 464400

Strand: Direct

Name: yebA [H]

Synonym: Nther_0440

Alternate gene names: 188585079

Gene position: 462154-464400 (Clockwise)

Preceding gene: 188585078

Following gene: 188585080

Centisome position: 14.6

GC content: 35.47

Gene sequence:

>2247_bases
TTGACCAAGAGCGGTGAAGGCGGTGGATACTTAGAGTTTATCTTATTACTAATTACTAATTGCTTTTTGGTTTCATCCTT
TGTTGACTTTTTTGGATATTCTCCTCAATGGACATGGCTAGTAGTTGCTGGAGCTATTGCTTTGATGGTGTTTTATTTTC
CTAAAGTCAGTGGAATAAGTATTTTAGTAGCTATCTCGTTTATATGCATAATGGTGTATTTTTCAGACCCCATCAGAGAG
TTGTTTATCCAGGTAGGGGGAGATTTTTTAACAGAAACAGCAGTTTGGATTAACCATGGAATTGCTGGAACTTCAGTTGC
TACAGGGATTAGTGTTTTGGTATTGTTTGGATTAATGTTAATACAGCTGATTTTTATTAATAGAGGAAAGACGAATTTTC
ACCTGGTGATAGTTGGTTCACTTGCTTATATAGGTTTATGGTTTCAACATTATCCAAGGGCCGAACAAGAATTGATTTTA
TTTTTATTATTGGCTGTTCCCACTTCAGCCCTATTTCATTTGAGAACTAAATCATATTCCTATGCTAAATTGTCTTATAA
GATTGGAATTTTAATTTTGGGTCTGATTACATCATTAGTAGTAGCTGCATTTCCAAAAGATATGGGTCCAGTTACTTTTG
AAACTGGTTATCGCTTTGTTGAAACATATTTTCCCTTTTTGCAGGAACTACGAAGTGCCGAAACCAATGGCGAAATAACA
GTAGGTGAGGGGGAAGAAGAGGAACAATTAGAAGATGAAAAAAATGTTGAAAAAACCGAGGATACGGAAGTCGAGCGGGA
AGTAGGTTATCAGCCAGGTGGTGATTTGGGTGGAGCCCTAACTACTTCTACCGATATTGTAGCTGAAATAATTTTAGAAT
CAGGGTCATTTCCTATAGCCTTATACTTAAGAGGACAGGGGAATGATTATTACGATGGTTCTTCATGGGATGCGGTTCAA
TCTGAGGATAGTGAAGACTTGGAGGAAGCTTTTCGATATGTAGATGTTTATCAAGAAGAACTGGAAGTAACTGTGTCTTA
TAAACAAGGTGAACAAGACATTTTTGGTTTATTTCCGACTAACAATGTAGAGCTTGGAAAAGAGCAGGAATATTATAACT
TAGAGATAGATAGTTATGGGAACATGACTTATTCCGAAGGGAAATTTAAGGGTGATTACAAACTGAAAGGGAAAATAATC
AGTGATGTAAATCTGGATAATATTGAACCTCAAGAGGAACTTGAAAAAAGCATTGTAAACCTTTTTCCATATATTCAACT
TCCAGAACACTTACCAGAGCGAGTTAAACAACTTTCTAATGAAATTACGGAAGAAGCTGAAAATAATTTGGAAAAAGCTC
GGCTTGTTGAGAACTATTTAAGCACGGAATATTCATACGAAACTGATATGCCGGAACATCCGCCTAAAGAAGACTTCGTA
GATAAATTTTTATTTGAGCATGAAAAAGGTTATTGTACTTATTTTGCCTCTGCCATGGCTGTTTTGCTAAGGGTACAAGA
TGTTCCTACGAGATATGTAGAAGGATATAGAGTTCCTCTCTATCCGGAAGATGAAGATTTGATAGATGCCGAAATAGCAG
ATACAATTGAAACTGATCGCATGTTAGCACAAAGCAATCATGCCCATGCTTGGGTAGAAGTATTTTTGGATGGTTACGGG
TGGGTTGTTTTTGAATCAACTCAACCTTATGAAATTACTACTGGTTTAATAGATCAAGAAGAACATCTAGAGGACACAGA
ATCTGAAAAAGATGAGGATGAAATTGTCCAACCTAGAGAAAAACAGCCTGTTTTTGTTGAACCACTCTGGTTTTCCTTGT
TTATAATTCCGGTGGCAATCTTAGGCGGTGGTACATTAGTCGTAATAACTAATCTTTCCCAAGTTAAAGATCCTATAGAT
TTGTATGAAAAGATGATACTTTTGAGAAAACTATACTATAAAGAACCTAAACCTGATGAAACCCCAGCTAAAATTATTTC
CCAGTACCAGGTCGAGATTCCCGAGTTAGCAAAAGATATGGATGATTTGAAAAGATATTACGAAATCAGTTATTATTCTT
CTAATAGTGATATAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAGAAACGGAACTAAATAAACTACCTCTAAAAACTGCAAAAGTTTAT
TTATCTAGGGTTGGACTGTTGAGATTTTCTATAGGAATTATTAGGCTTGGTATTAAATTATTATTGTCTAAACTAACAGG
AGTGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACCAGAAAGGCAAAAATATTGATATAAAAGATTTAACAATTCCTGCTTATCAATTGAACTATTACAGGGGTCAAGTTGCA
ATTAAGGAGGTGTTCACCTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTACATGAAAATGACCAAAGCTTTTATGCTTAGAGTATTGGGTAGATATGCTCCCTTTCCTGCTAAAAATAGTAACTGTT
CAGGTTATCTACTAACAGCG

Product: transglutaminase domain protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 748; Mature: 747

Protein sequence:

>748_residues
MTKSGEGGGYLEFILLLITNCFLVSSFVDFFGYSPQWTWLVVAGAIALMVFYFPKVSGISILVAISFICIMVYFSDPIRE
LFIQVGGDFLTETAVWINHGIAGTSVATGISVLVLFGLMLIQLIFINRGKTNFHLVIVGSLAYIGLWFQHYPRAEQELIL
FLLLAVPTSALFHLRTKSYSYAKLSYKIGILILGLITSLVVAAFPKDMGPVTFETGYRFVETYFPFLQELRSAETNGEIT
VGEGEEEEQLEDEKNVEKTEDTEVEREVGYQPGGDLGGALTTSTDIVAEIILESGSFPIALYLRGQGNDYYDGSSWDAVQ
SEDSEDLEEAFRYVDVYQEELEVTVSYKQGEQDIFGLFPTNNVELGKEQEYYNLEIDSYGNMTYSEGKFKGDYKLKGKII
SDVNLDNIEPQEELEKSIVNLFPYIQLPEHLPERVKQLSNEITEEAENNLEKARLVENYLSTEYSYETDMPEHPPKEDFV
DKFLFEHEKGYCTYFASAMAVLLRVQDVPTRYVEGYRVPLYPEDEDLIDAEIADTIETDRMLAQSNHAHAWVEVFLDGYG
WVVFESTQPYEITTGLIDQEEHLEDTESEKDEDEIVQPREKQPVFVEPLWFSLFIIPVAILGGGTLVVITNLSQVKDPID
LYEKMILLRKLYYKEPKPDETPAKIISQYQVEIPELAKDMDDLKRYYEISYYSSNSDIVISKRFKETELNKLPLKTAKVY
LSRVGLLRFSIGIIRLGIKLLLSKLTGV

Sequences:

>Translated_748_residues
MTKSGEGGGYLEFILLLITNCFLVSSFVDFFGYSPQWTWLVVAGAIALMVFYFPKVSGISILVAISFICIMVYFSDPIRE
LFIQVGGDFLTETAVWINHGIAGTSVATGISVLVLFGLMLIQLIFINRGKTNFHLVIVGSLAYIGLWFQHYPRAEQELIL
FLLLAVPTSALFHLRTKSYSYAKLSYKIGILILGLITSLVVAAFPKDMGPVTFETGYRFVETYFPFLQELRSAETNGEIT
VGEGEEEEQLEDEKNVEKTEDTEVEREVGYQPGGDLGGALTTSTDIVAEIILESGSFPIALYLRGQGNDYYDGSSWDAVQ
SEDSEDLEEAFRYVDVYQEELEVTVSYKQGEQDIFGLFPTNNVELGKEQEYYNLEIDSYGNMTYSEGKFKGDYKLKGKII
SDVNLDNIEPQEELEKSIVNLFPYIQLPEHLPERVKQLSNEITEEAENNLEKARLVENYLSTEYSYETDMPEHPPKEDFV
DKFLFEHEKGYCTYFASAMAVLLRVQDVPTRYVEGYRVPLYPEDEDLIDAEIADTIETDRMLAQSNHAHAWVEVFLDGYG
WVVFESTQPYEITTGLIDQEEHLEDTESEKDEDEIVQPREKQPVFVEPLWFSLFIIPVAILGGGTLVVITNLSQVKDPID
LYEKMILLRKLYYKEPKPDETPAKIISQYQVEIPELAKDMDDLKRYYEISYYSSNSDIVISKRFKETELNKLPLKTAKVY
LSRVGLLRFSIGIIRLGIKLLLSKLTGV
>Mature_747_residues
TKSGEGGGYLEFILLLITNCFLVSSFVDFFGYSPQWTWLVVAGAIALMVFYFPKVSGISILVAISFICIMVYFSDPIREL
FIQVGGDFLTETAVWINHGIAGTSVATGISVLVLFGLMLIQLIFINRGKTNFHLVIVGSLAYIGLWFQHYPRAEQELILF
LLLAVPTSALFHLRTKSYSYAKLSYKIGILILGLITSLVVAAFPKDMGPVTFETGYRFVETYFPFLQELRSAETNGEITV
GEGEEEEQLEDEKNVEKTEDTEVEREVGYQPGGDLGGALTTSTDIVAEIILESGSFPIALYLRGQGNDYYDGSSWDAVQS
EDSEDLEEAFRYVDVYQEELEVTVSYKQGEQDIFGLFPTNNVELGKEQEYYNLEIDSYGNMTYSEGKFKGDYKLKGKIIS
DVNLDNIEPQEELEKSIVNLFPYIQLPEHLPERVKQLSNEITEEAENNLEKARLVENYLSTEYSYETDMPEHPPKEDFVD
KFLFEHEKGYCTYFASAMAVLLRVQDVPTRYVEGYRVPLYPEDEDLIDAEIADTIETDRMLAQSNHAHAWVEVFLDGYGW
VVFESTQPYEITTGLIDQEEHLEDTESEKDEDEIVQPREKQPVFVEPLWFSLFIIPVAILGGGTLVVITNLSQVKDPIDL
YEKMILLRKLYYKEPKPDETPAKIISQYQVEIPELAKDMDDLKRYYEISYYSSNSDIVISKRFKETELNKLPLKTAKVYL
SRVGLLRFSIGIIRLGIKLLLSKLTGV

Specific function: Unknown

COG id: COG1305

COG function: function code E; Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002931 [H]

Pfam domain/function: PF01841 Transglut_core [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 85119; Mature: 84988

Theoretical pI: Translated: 4.19; Mature: 4.19

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKSGEGGGYLEFILLLITNCFLVSSFVDFFGYSPQWTWLVVAGAIALMVFYFPKVSGIS
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
ILVAISFICIMVYFSDPIRELFIQVGGDFLTETAVWINHGIAGTSVATGISVLVLFGLML
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQLIFINRGKTNFHLVIVGSLAYIGLWFQHYPRAEQELILFLLLAVPTSALFHLRTKSYS
HHHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
YAKLSYKIGILILGLITSLVVAAFPKDMGPVTFETGYRFVETYFPFLQELRSAETNGEIT
EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
VGEGEEEEQLEDEKNVEKTEDTEVEREVGYQPGGDLGGALTTSTDIVAEIILESGSFPIA
ECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEE
LYLRGQGNDYYDGSSWDAVQSEDSEDLEEAFRYVDVYQEELEVTVSYKQGEQDIFGLFPT
EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCEEEECCC
NNVELGKEQEYYNLEIDSYGNMTYSEGKFKGDYKLKGKIISDVNLDNIEPQEELEKSIVN
CCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEECCCCCCCCEEEECEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LFPYIQLPEHLPERVKQLSNEITEEAENNLEKARLVENYLSTEYSYETDMPEHPPKEDFV
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
DKFLFEHEKGYCTYFASAMAVLLRVQDVPTRYVEGYRVPLYPEDEDLIDAEIADTIETDR
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
MLAQSNHAHAWVEVFLDGYGWVVFESTQPYEITTGLIDQEEHLEDTESEKDEDEIVQPRE
HHHHCCCCCEEEHEEECCCCEEEECCCCCEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCC
KQPVFVEPLWFSLFIIPVAILGGGTLVVITNLSQVKDPIDLYEKMILLRKLYYKEPKPDE
CCCEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
TPAKIISQYQVEIPELAKDMDDLKRYYEISYYSSNSDIVISKRFKETELNKLPLKTAKVY
CHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEECCCHHCCCCCCHHHHHHH
LSRVGLLRFSIGIIRLGIKLLLSKLTGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TKSGEGGGYLEFILLLITNCFLVSSFVDFFGYSPQWTWLVVAGAIALMVFYFPKVSGIS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
ILVAISFICIMVYFSDPIRELFIQVGGDFLTETAVWINHGIAGTSVATGISVLVLFGLML
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQLIFINRGKTNFHLVIVGSLAYIGLWFQHYPRAEQELILFLLLAVPTSALFHLRTKSYS
HHHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
YAKLSYKIGILILGLITSLVVAAFPKDMGPVTFETGYRFVETYFPFLQELRSAETNGEIT
EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
VGEGEEEEQLEDEKNVEKTEDTEVEREVGYQPGGDLGGALTTSTDIVAEIILESGSFPIA
ECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEE
LYLRGQGNDYYDGSSWDAVQSEDSEDLEEAFRYVDVYQEELEVTVSYKQGEQDIFGLFPT
EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCEEEECCC
NNVELGKEQEYYNLEIDSYGNMTYSEGKFKGDYKLKGKIISDVNLDNIEPQEELEKSIVN
CCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEECCCCCCCCEEEECEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LFPYIQLPEHLPERVKQLSNEITEEAENNLEKARLVENYLSTEYSYETDMPEHPPKEDFV
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
DKFLFEHEKGYCTYFASAMAVLLRVQDVPTRYVEGYRVPLYPEDEDLIDAEIADTIETDR
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
MLAQSNHAHAWVEVFLDGYGWVVFESTQPYEITTGLIDQEEHLEDTESEKDEDEIVQPRE
HHHHCCCCCEEEHEEECCCCEEEECCCCCEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCC
KQPVFVEPLWFSLFIIPVAILGGGTLVVITNLSQVKDPIDLYEKMILLRKLYYKEPKPDE
CCCEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
TPAKIISQYQVEIPELAKDMDDLKRYYEISYYSSNSDIVISKRFKETELNKLPLKTAKVY
CHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEECCCHHCCCCCCHHHHHHH
LSRVGLLRFSIGIIRLGIKLLLSKLTGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969499; 9384377 [H]