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The map label for this gene is 188584964

Identifier: 188584964

GI number: 188584964

Start: 339199

End: 340803

Strand: Direct

Name: 188584964

Synonym: Nther_0324

Alternate gene names: NA

Gene position: 339199-340803 (Clockwise)

Preceding gene: 188584963

Following gene: 188584966

Centisome position: 10.72

GC content: 38.44

Gene sequence:

>1605_bases
ATGGCAGATAAAATGTATAGTAATACAGGTCAACTTGTACGTTTTATATTGCGTCGTGATCGGATTAGTATTCCAATATG
GTTAACAGCAGTTATTTTAATTTCCATGATTACTGCCCAAGGTTTTGTTGAGTTATATCCAACCGAACTAGAACGACAGG
CTATTGCACAAACCATGAGAAACCCTGCTATGACAGCAATGGTAGGTCCAGGTTATGGCTTAAATAATTATACTATCGGA
GCTATGATGGGACATCAAATGCTACTGTTTACGGCAATTGCCGTAGCAATTATGAATATTTTATTTATTATCAAACACAC
CAGGGCTGACGAAGAAGAGGGTAGGATAGAAATGATTCGCTCCCTACCCGTTGGAAGGCTTTCCAATGTTTTAAGCACTA
TAATAGTTTCTTTTGGAATAAATGTTATTTTAGCCCTTTGTTTAGGTTTTGGACTATTTGCTTTAGGTATTGAAAATATG
GAATTAGAAGGGTCACTACTATACGGGGCAGTAGTCGGGGTGACTGGGATGATTTTTGCAGCCTCTACCACTTTATTTGC
CCAGTTGTCCGCAAATACCCGGAGCACGATTGGACTTTCTTTTGGATTTTTGGGTCTAGCTTATCTTGTTCGTGCTATTG
GTGATGTGAGCAATGAAACCCTATCTATGTTCTCTCCTTTAGGTTGGGTGTTAAGATCAGAAGTATATGTAAATAATTAC
TGGTGGCCTATATTACTAACTTTAGCAGCAGCTTTTGGAATCGTAGCCTACTCCCTGTATTTAAATTCAATTAGAGATTT
GGGAGCTGGTTTTATACCGGCCAGGCCAGGTAGAAGGAAGGCAACACCTTTTTTACTAAGCCCTTTAGGCCTAGGGTTGA
GACTGCAACGTACTAGTATAATTGCTTGGGCTATTGGGATGCTAGTTTTAGGTGCATCTTATGGCTCTGTTTTCGGTGAT
TTAGAAGCCTTTTTCACTGACAATGAAATAATGCAGCAAATTCTGCCTCCCGGACAGGGTCATACTTTAACGGAACAGTT
TTTGACCCTTTTAATGGTAGTGATTTCAATATTAAGTACTGTACCAGCTTTAATGATGATCTTGAAATTAAGAGGAGAAG
AAAACAAGAATCGAACAGAAAATCTCTTGACTCGAGCTGTTTCACGAAATCAATTAATGGCAAGTATGTTGGTGATTTCA
CTTTTTACTGGCTTCATTATGCTTTTACTTGCTATGCTGGGTTTATGGTCAGCAGGAACAGTAGTAATGGAGGAGCCTAT
TCCATTTTATACTGCCTTTAATTCTGCCATGGTATATTTACCTGCTATGTGGGTTATGATTGGAGCAGCAGTACTACTGA
TTGGTATTTGGCCTCAAGCTACAGTATTAACTTGGTTGTATTTAGGTTTTTCTTTTTTCGTGGTATATCTGAGTGGTATA
TTACAACTTCCCGAATGGCTGGCTAAATTGTCGCCCTTTGGCAATATTCCACAACTGCCCGTAGAAGAAATGAATTATTT
TAGTGTTATAGTGATGACGGTATTTGCACTTGTTTTAATGATAGTTGGATTTAAGGGATATAATAATCGAGATATACAGG
GATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATATCTTAGTCAATTTGACATAATCAAATTGGAAAGTGCTCCACCTAAATTAGAAGACTTGTTTATGCGCTATTACAG
TGAAGATAGGGTGAGTTCTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAGGACGGCCGCACTTAGCTAGTTCAACAACTAAATATAATAGCGACAATAATTTAAAAATAAAAATTCCCGCCTATAG
CCTATAGGTGGGAATTTTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Exporter Of Polyketide Antibiotics; ABC Transporter Membrane-Spanning Protein; Anibiotic ABC Transporter Efflux Pump; ABC Transporter Membrane Protein; ABC Transporter; ABC Transporter Permease Protein; Exporter Of Polyketide Antibiotics- Like Protein; ABC Antibiotics Transporter; ABC Transporter Permease; Tetronasin Resistance Transmembrane Protein; Abc Transporter Integral Membrane Subunit; ABC-2 Type Transport System Permease Protein; ABC Transporter Transmembrane Subunit; TnrB3 Protein; Polyketide Antibiotics Exporter; ABC Transporter Polyketide Tetronasin Permease; ABC Type Transport System Permease Protein; Tetronasin-Transport Membrane Protein ABC Transporter; Amino Acid Permease

Number of amino acids: Translated: 534; Mature: 533

Protein sequence:

>534_residues
MADKMYSNTGQLVRFILRRDRISIPIWLTAVILISMITAQGFVELYPTELERQAIAQTMRNPAMTAMVGPGYGLNNYTIG
AMMGHQMLLFTAIAVAIMNILFIIKHTRADEEEGRIEMIRSLPVGRLSNVLSTIIVSFGINVILALCLGFGLFALGIENM
ELEGSLLYGAVVGVTGMIFAASTTLFAQLSANTRSTIGLSFGFLGLAYLVRAIGDVSNETLSMFSPLGWVLRSEVYVNNY
WWPILLTLAAAFGIVAYSLYLNSIRDLGAGFIPARPGRRKATPFLLSPLGLGLRLQRTSIIAWAIGMLVLGASYGSVFGD
LEAFFTDNEIMQQILPPGQGHTLTEQFLTLLMVVISILSTVPALMMILKLRGEENKNRTENLLTRAVSRNQLMASMLVIS
LFTGFIMLLLAMLGLWSAGTVVMEEPIPFYTAFNSAMVYLPAMWVMIGAAVLLIGIWPQATVLTWLYLGFSFFVVYLSGI
LQLPEWLAKLSPFGNIPQLPVEEMNYFSVIVMTVFALVLMIVGFKGYNNRDIQG

Sequences:

>Translated_534_residues
MADKMYSNTGQLVRFILRRDRISIPIWLTAVILISMITAQGFVELYPTELERQAIAQTMRNPAMTAMVGPGYGLNNYTIG
AMMGHQMLLFTAIAVAIMNILFIIKHTRADEEEGRIEMIRSLPVGRLSNVLSTIIVSFGINVILALCLGFGLFALGIENM
ELEGSLLYGAVVGVTGMIFAASTTLFAQLSANTRSTIGLSFGFLGLAYLVRAIGDVSNETLSMFSPLGWVLRSEVYVNNY
WWPILLTLAAAFGIVAYSLYLNSIRDLGAGFIPARPGRRKATPFLLSPLGLGLRLQRTSIIAWAIGMLVLGASYGSVFGD
LEAFFTDNEIMQQILPPGQGHTLTEQFLTLLMVVISILSTVPALMMILKLRGEENKNRTENLLTRAVSRNQLMASMLVIS
LFTGFIMLLLAMLGLWSAGTVVMEEPIPFYTAFNSAMVYLPAMWVMIGAAVLLIGIWPQATVLTWLYLGFSFFVVYLSGI
LQLPEWLAKLSPFGNIPQLPVEEMNYFSVIVMTVFALVLMIVGFKGYNNRDIQG
>Mature_533_residues
ADKMYSNTGQLVRFILRRDRISIPIWLTAVILISMITAQGFVELYPTELERQAIAQTMRNPAMTAMVGPGYGLNNYTIGA
MMGHQMLLFTAIAVAIMNILFIIKHTRADEEEGRIEMIRSLPVGRLSNVLSTIIVSFGINVILALCLGFGLFALGIENME
LEGSLLYGAVVGVTGMIFAASTTLFAQLSANTRSTIGLSFGFLGLAYLVRAIGDVSNETLSMFSPLGWVLRSEVYVNNYW
WPILLTLAAAFGIVAYSLYLNSIRDLGAGFIPARPGRRKATPFLLSPLGLGLRLQRTSIIAWAIGMLVLGASYGSVFGDL
EAFFTDNEIMQQILPPGQGHTLTEQFLTLLMVVISILSTVPALMMILKLRGEENKNRTENLLTRAVSRNQLMASMLVISL
FTGFIMLLLAMLGLWSAGTVVMEEPIPFYTAFNSAMVYLPAMWVMIGAAVLLIGIWPQATVLTWLYLGFSFFVVYLSGIL
QLPEWLAKLSPFGNIPQLPVEEMNYFSVIVMTVFALVLMIVGFKGYNNRDIQG

Specific function: Unknown

COG id: COG3559

COG function: function code M; Putative exporter of polyketide antibiotics

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58811; Mature: 58680

Theoretical pI: Translated: 7.57; Mature: 7.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
5.6 %Met     (Translated Protein)
5.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
5.4 %Met     (Mature Protein)
5.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MADKMYSNTGQLVRFILRRDRISIPIWLTAVILISMITAQGFVELYPTELERQAIAQTMR
CCCCHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHC
NPAMTAMVGPGYGLNNYTIGAMMGHQMLLFTAIAVAIMNILFIIKHTRADEEEGRIEMIR
CCCCEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
SLPVGRLSNVLSTIIVSFGINVILALCLGFGLFALGIENMELEGSLLYGAVVGVTGMIFA
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ASTTLFAQLSANTRSTIGLSFGFLGLAYLVRAIGDVSNETLSMFSPLGWVLRSEVYVNNY
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
WWPILLTLAAAFGIVAYSLYLNSIRDLGAGFIPARPGRRKATPFLLSPLGLGLRLQRTSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCEEEHHHHH
IAWAIGMLVLGASYGSVFGDLEAFFTDNEIMQQILPPGQGHTLTEQFLTLLMVVISILST
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VPALMMILKLRGEENKNRTENLLTRAVSRNQLMASMLVISLFTGFIMLLLAMLGLWSAGT
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
VVMEEPIPFYTAFNSAMVYLPAMWVMIGAAVLLIGIWPQATVLTWLYLGFSFFVVYLSGI
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQLPEWLAKLSPFGNIPQLPVEEMNYFSVIVMTVFALVLMIVGFKGYNNRDIQG
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ADKMYSNTGQLVRFILRRDRISIPIWLTAVILISMITAQGFVELYPTELERQAIAQTMR
CCCHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHC
NPAMTAMVGPGYGLNNYTIGAMMGHQMLLFTAIAVAIMNILFIIKHTRADEEEGRIEMIR
CCCCEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
SLPVGRLSNVLSTIIVSFGINVILALCLGFGLFALGIENMELEGSLLYGAVVGVTGMIFA
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ASTTLFAQLSANTRSTIGLSFGFLGLAYLVRAIGDVSNETLSMFSPLGWVLRSEVYVNNY
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
WWPILLTLAAAFGIVAYSLYLNSIRDLGAGFIPARPGRRKATPFLLSPLGLGLRLQRTSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCEEEHHHHH
IAWAIGMLVLGASYGSVFGDLEAFFTDNEIMQQILPPGQGHTLTEQFLTLLMVVISILST
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VPALMMILKLRGEENKNRTENLLTRAVSRNQLMASMLVISLFTGFIMLLLAMLGLWSAGT
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
VVMEEPIPFYTAFNSAMVYLPAMWVMIGAAVLLIGIWPQATVLTWLYLGFSFFVVYLSGI
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQLPEWLAKLSPFGNIPQLPVEEMNYFSVIVMTVFALVLMIVGFKGYNNRDIQG
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA