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The map label for this gene is cstA [H]

Identifier: 188527953

GI number: 188527953

Start: 1186421

End: 1188496

Strand: Reverse

Name: cstA [H]

Synonym: HPSH_06040

Alternate gene names: 188527953

Gene position: 1188496-1186421 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188527960

Following gene: 188527952

Centisome position: 73.89

GC content: 44.36

Gene sequence:

>2076_bases
ATGCAAAAAAGTTTAGTTTCTTTGGCTTGGGTTTTTGCCGCTATTTTAGGGGCGATCTGTTTAGGGGTGTTAGCCTTACA
CAAGGGCGAGAGCATTAACACGCTATGGCTTGTAGTAGCGAGCGCTTGCATTTATAGCATAGGCTATCGTTTTTATAGCC
ATTTTATCGCTTATAGGGTGTTAAAGCTAGATGACAACAGAGCCACGCCCGCATGCGTAAGGAATGATGGCAGGGATTTT
GTGCCAACCGATAAAGCGATCACTTTTGGGCATCATTTCGCCGCTATTGCTGGGGCTGGCCCTTTAGTAGGCCCGATACT
GGCCGCTCAAATGGGTTACTTGCCCTCTATCTTATGGATTTTGATAGGCTCGGTTTTAGGGGGTTGCGTGCATGATTTTG
TGGTGCTTTTTGCTTCCATTAGGCGCGATGGCAAGTCTTTGGGCGAAATGATCAAGCTTGAAATGGGCCAATTTGTAGGC
ATGATCGCAAGTCTGGGTATTTTAGGGATCATGCTCATTATCATTGCGATTTTGGCGATGGTGGTGGTGAAGGCTTTAGC
GCATTCGCCTTGGGGCTTTTTTACGATCGCTATGACCATTCCCATTGCGATTCTTATGGGGCTTTACATGCGGTTTTTCA
GGCCGCATAAGATTTTAGAAGTTTCTGTTATTGGCTTTATCCTATTGATTATAGCGATTTATGCGGGTAAATATGTTTCT
TTAGATCCTAAATTAGCGTCAATATTCACCTTTGATGCCAACTCTTTAGCGTGGATGATCATGGGCTATGGTTTTGTGGC
TTCTATTTTACCGGTATGGTTTTTACTCGCTCCACGAGATTATTTAAGCACTTTTTTAAAAATTGGCGTTATAGGGGTGT
TGGTTGTGGCTATTATTTTTGTCGCTCCGCCTTTACAAATCCCTAAAATCACGCCCTTTGTAGATGGCAGTGGGCCTGTG
TTTGCAGGAAGCGTGTTCCCTTTCTTGTTTATCACGGTGGCTTGCGGGACGATTAGCGGCTTTCATGCTTTAATTTCTTC
AGGCACGACTCCTAAAATGCTCGCTAAAGAAAGCGACGCAAGGCTAGTGGGCTATGGCTCTATGGTGATGGAGAGCGTTG
TGGCTCTTATGGCGTTGGTGTGCGCAGGGATTTTACACCCAGGGCTTTATTTCGCTATCAATTCACCAGAAGTGAGCATC
GGTAAAGATATAGCTGATGCGGCTTCGGTGATTAGCTCATGGGGGTTTAGTATCAGCGCTGAAGAAATCAATGAGATGAC
CAAAAACATCGGCGAAAGCTCCATTTTGAGCCGCACCGGTGGGGCGCCCACTTTTGCGATTGGTTTGGCGATGATTGTGT
ATCACATTTTAGGGGATCCAAGCGTGATGGCGTTTTGGTATCATTTTGCGATTTTGTTTGAAGCTTTGTTCATTTTAACC
GCTGTGGATGCTGGCACACGAACCGCTCGTTTCATGATCCAAGATTTGCTCGGTAATGTTTATAAGCCTTTGGGCAATCT
TAGCTCTTATAAGGCTGGGATTTTTGCCACTATTTTGTGCGTGGCAGGGTGGGGGTATTTCTTGTATCAAGGCACGATTG
ATCCTAAAGGGGGGATTTATACGCTATGGCCTTTATTTGGCGTGAGCAATCAGATGTTAGCGGGCATGGCGTTGTTGCTG
GTTACGGTGGTGTTGTTTAAAATGGGGCGTTTTAAGGGGGCGATAATAAGCGCCTTGCCGGCAGTTTTGATTTTATCCAT
CACTTTTTATAGCGGTATTTTAAAAGTGGTGCCAAAAAGTAATGATAGCGTGCTGAATAACGTTTCGCATGTGGCACAAA
TGCAAATCATCAAAGAAAAAATGGCTACCACTACCGATGAAAAAGCGCTAAAAACGCTCCAAAAATCCTTTTTTAACCAC
GCTATTGATGCGATTTTGTGCGTGTTTTTCATGCTTGTAGCGCTACTGGTTTTAATCGTGAGCGTTAGGATTTGCTCAAA
CGCTTATTTTAAAAATCAAATTTACCCACCGCTGGCTGAAACGCCCTATATCAAAGCCAATAAAAAGGGGTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATGAGCCATTCAGTCCTTATTCAAAGAAAATTTGAATTATAATAAAAAAACTGGCTGAAATTAACAACAATGGTTAAAC
AACCATTAAATGGAGAGGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCCCCTTTAAATCCATGGAAAAAAGTTTGATTTTGTTTGTGAAGTGTGCAAACGCTAAAGGTGTTTGGGGTTTCTGTTCT
TGGCTCTTAAAAAAGCTATC

Product: carbon starvation protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 691; Mature: 691

Protein sequence:

>691_residues
MQKSLVSLAWVFAAILGAICLGVLALHKGESINTLWLVVASACIYSIGYRFYSHFIAYRVLKLDDNRATPACVRNDGRDF
VPTDKAITFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSILWILIGSVLGGCVHDFVVLFASIRRDGKSLGEMIKLEMGQFVG
MIASLGILGIMLIIIAILAMVVVKALAHSPWGFFTIAMTIPIAILMGLYMRFFRPHKILEVSVIGFILLIIAIYAGKYVS
LDPKLASIFTFDANSLAWMIMGYGFVASILPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIGVLVVAIIFVAPPLQIPKITPFVDGSGPV
FAGSVFPFLFITVACGTISGFHALISSGTTPKMLAKESDARLVGYGSMVMESVVALMALVCAGILHPGLYFAINSPEVSI
GKDIADAASVISSWGFSISAEEINEMTKNIGESSILSRTGGAPTFAIGLAMIVYHILGDPSVMAFWYHFAILFEALFILT
AVDAGTRTARFMIQDLLGNVYKPLGNLSSYKAGIFATILCVAGWGYFLYQGTIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALLL
VTVVLFKMGRFKGAIISALPAVLILSITFYSGILKVVPKSNDSVLNNVSHVAQMQIIKEKMATTTDEKALKTLQKSFFNH
AIDAILCVFFMLVALLVLIVSVRICSNAYFKNQIYPPLAETPYIKANKKGF

Sequences:

>Translated_691_residues
MQKSLVSLAWVFAAILGAICLGVLALHKGESINTLWLVVASACIYSIGYRFYSHFIAYRVLKLDDNRATPACVRNDGRDF
VPTDKAITFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSILWILIGSVLGGCVHDFVVLFASIRRDGKSLGEMIKLEMGQFVG
MIASLGILGIMLIIIAILAMVVVKALAHSPWGFFTIAMTIPIAILMGLYMRFFRPHKILEVSVIGFILLIIAIYAGKYVS
LDPKLASIFTFDANSLAWMIMGYGFVASILPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIGVLVVAIIFVAPPLQIPKITPFVDGSGPV
FAGSVFPFLFITVACGTISGFHALISSGTTPKMLAKESDARLVGYGSMVMESVVALMALVCAGILHPGLYFAINSPEVSI
GKDIADAASVISSWGFSISAEEINEMTKNIGESSILSRTGGAPTFAIGLAMIVYHILGDPSVMAFWYHFAILFEALFILT
AVDAGTRTARFMIQDLLGNVYKPLGNLSSYKAGIFATILCVAGWGYFLYQGTIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALLL
VTVVLFKMGRFKGAIISALPAVLILSITFYSGILKVVPKSNDSVLNNVSHVAQMQIIKEKMATTTDEKALKTLQKSFFNH
AIDAILCVFFMLVALLVLIVSVRICSNAYFKNQIYPPLAETPYIKANKKGF
>Mature_691_residues
MQKSLVSLAWVFAAILGAICLGVLALHKGESINTLWLVVASACIYSIGYRFYSHFIAYRVLKLDDNRATPACVRNDGRDF
VPTDKAITFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSILWILIGSVLGGCVHDFVVLFASIRRDGKSLGEMIKLEMGQFVG
MIASLGILGIMLIIIAILAMVVVKALAHSPWGFFTIAMTIPIAILMGLYMRFFRPHKILEVSVIGFILLIIAIYAGKYVS
LDPKLASIFTFDANSLAWMIMGYGFVASILPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIGVLVVAIIFVAPPLQIPKITPFVDGSGPV
FAGSVFPFLFITVACGTISGFHALISSGTTPKMLAKESDARLVGYGSMVMESVVALMALVCAGILHPGLYFAINSPEVSI
GKDIADAASVISSWGFSISAEEINEMTKNIGESSILSRTGGAPTFAIGLAMIVYHILGDPSVMAFWYHFAILFEALFILT
AVDAGTRTARFMIQDLLGNVYKPLGNLSSYKAGIFATILCVAGWGYFLYQGTIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALLL
VTVVLFKMGRFKGAIISALPAVLILSITFYSGILKVVPKSNDSVLNNVSHVAQMQIIKEKMATTTDEKALKTLQKSFFNH
AIDAILCVFFMLVALLVLIVSVRICSNAYFKNQIYPPLAETPYIKANKKGF

Specific function: Peptide Utilization During Carbon Starvation. [C]

COG id: COG1966

COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CstA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=688, Percent_Identity=54.9418604651163, Blast_Score=738, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=713, Percent_Identity=50.6311360448808, Blast_Score=694, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003706 [H]

Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74673; Mature: 74673

Theoretical pI: Translated: 9.23; Mature: 9.23

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
5.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
5.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQKSLVSLAWVFAAILGAICLGVLALHKGESINTLWLVVASACIYSIGYRFYSHFIAYRV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKLDDNRATPACVRNDGRDFVPTDKAITFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSILWI
HEECCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIGSVLGGCVHDFVVLFASIRRDGKSLGEMIKLEMGQFVGMIASLGILGIMLIIIAILAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVVKALAHSPWGFFTIAMTIPIAILMGLYMRFFRPHKILEVSVIGFILLIIAIYAGKYVS
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
LDPKLASIFTFDANSLAWMIMGYGFVASILPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIGVLVVAIIF
CCCCHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAPPLQIPKITPFVDGSGPVFAGSVFPFLFITVACGTISGFHALISSGTTPKMLAKESDA
HCCCCCCCCCCCEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCC
RLVGYGSMVMESVVALMALVCAGILHPGLYFAINSPEVSIGKDIADAASVISSWGFSISA
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCH
EEINEMTKNIGESSILSRTGGAPTFAIGLAMIVYHILGDPSVMAFWYHFAILFEALFILT
HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVDAGTRTARFMIQDLLGNVYKPLGNLSSYKAGIFATILCVAGWGYFLYQGTIDPKGGIY
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCCCCCCEE
TLWPLFGVSNQMLAGMALLLVTVVLFKMGRFKGAIISALPAVLILSITFYSGILKVVPKS
EEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NDSVLNNVSHVAQMQIIKEKMATTTDEKALKTLQKSFFNHAIDAILCVFFMLVALLVLIV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVRICSNAYFKNQIYPPLAETPYIKANKKGF
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MQKSLVSLAWVFAAILGAICLGVLALHKGESINTLWLVVASACIYSIGYRFYSHFIAYRV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKLDDNRATPACVRNDGRDFVPTDKAITFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSILWI
HEECCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIGSVLGGCVHDFVVLFASIRRDGKSLGEMIKLEMGQFVGMIASLGILGIMLIIIAILAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVVKALAHSPWGFFTIAMTIPIAILMGLYMRFFRPHKILEVSVIGFILLIIAIYAGKYVS
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
LDPKLASIFTFDANSLAWMIMGYGFVASILPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIGVLVVAIIF
CCCCHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAPPLQIPKITPFVDGSGPVFAGSVFPFLFITVACGTISGFHALISSGTTPKMLAKESDA
HCCCCCCCCCCCEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCC
RLVGYGSMVMESVVALMALVCAGILHPGLYFAINSPEVSIGKDIADAASVISSWGFSISA
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCH
EEINEMTKNIGESSILSRTGGAPTFAIGLAMIVYHILGDPSVMAFWYHFAILFEALFILT
HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVDAGTRTARFMIQDLLGNVYKPLGNLSSYKAGIFATILCVAGWGYFLYQGTIDPKGGIY
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCCCCCCEE
TLWPLFGVSNQMLAGMALLLVTVVLFKMGRFKGAIISALPAVLILSITFYSGILKVVPKS
EEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NDSVLNNVSHVAQMQIIKEKMATTTDEKALKTLQKSFFNHAIDAILCVFFMLVALLVLIV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVRICSNAYFKNQIYPPLAETPYIKANKKGF
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9923682 [H]