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The map label for this gene is 188527684

Identifier: 188527684

GI number: 188527684

Start: 894298

End: 896205

Strand: Reverse

Name: 188527684

Synonym: HPSH_04530

Alternate gene names: NA

Gene position: 896205-894298 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188527687

Following gene: 188527679

Centisome position: 55.72

GC content: 30.19

Gene sequence:

>1908_bases
ATGGCGTTAGAAAAAAGTTATAAAGACTTTGAAAGCGATGAGCTTTTTGATTATGAGATCATCAAGCCCAAAAAGACGCT
TAAGGTACAATACACTTATGCTAAACGCTACTATAAAGAAGTGGAAAAGTTTGCTAAAAATTTAACCCAACTGGCACAAG
AAGAATTCATGCGTTTAAGAGATCCGCAAAAACAAGTGGTCATCAAAAACATAGGCAATATGACACGCTTGCATTCAAAA
AGGGCGATGGATTATATCGCTAAACATGGTGAGCTAGTGAGAGATGAATTTTTTAATGAAGTTAATTATAATGATATAGC
AGAGCAATGGAATGAGCAATTTGAAAAATTATTAGAAAATAAGAGCCGTGTTAAAAATTGCGCTTTACATCTAGTGTTTA
GCATTGATGAAAATTGTAATGAAAAAAATTTAAAAGCTTTAGAATTAAGCGTGTATCAAACACTCACTAACACGCTAGGT
TATGATTATCCTTTTATAATGAAACTCCATACACACCAAAACAATCCGCATGCACATGTGATTATCAACAAGACTAACAG
AATTACCAATAAGCAACTACGCTTTAATTCTAAAGACAGCTGTAAAGAGTTTTACCACACACTAAGAGAAACATTTAAAG
ATTATTTATTTGCTAACTCAAAAGGCGAATTGCAATATTCTAACACGCCTAATATTTATAAGGTGATTAAAGACATAGAA
ACAGAGTTAGATACGCTAGAAAAACAGGCTAGAAACAATAAGAGTTTTAGGCATGAAAACTATTTCTATAAAGTTTTGGG
CAGTGCAACTTCTCAAATAGAAAGCTTGAAAAAAAGAGAAAATGCCCTATCTGATCATTTAGATAGTCTAAAAAGTTTAT
TAGAAAAAACACATTGGGAAAAAGAAAAATTCACGCCCCTAATAAATGAAAAAGAACTTAACCAACAACTTAAAGAAATA
AAATGGTTAAATAAAGAATCTTTAACCCCTAAAAACACTTATAAAAAAACTCAAAAATTGGTTGTCTGTAAAAGCCCTTT
AATAAAAGATTATCTTTATACTACCAAAAAACTTTTTGCCACACAGAAAAAGATTATAGCTTTAGAGAAAGATTATAAAG
ATTTAAAAGTCTTGAAGGAAGAATTTAGCAAAGATTTAGAAGCTGATTTATCCCATTCAAAAAAACGCTTTGAGCTTTAC
ACTAGACTAAAAAGCATGAGCAAAGTTTTTATAAGCAAAAGCATTGTTAAAAATTTAGAAAAAATTGCTTTAAATTTTAA
AAGCGATAGACATAGTATTTCGCAAAGAGCTTTTGAATTTTTTAGGTATATGAATTATCAAAATTTAAGCTTGACTGATA
AAGGCAATATGTTTTTAGTGGCTAAGTTTTTTAAAGATAGCGCTTTACTTGTTAATATTGCTAGGTTTGAAATGAAAAAG
ATAGATGATAGTGTTAAAAATTCTAACGCACAAGGCAATTTATTAGACAAACAAGCTTGGCTTAATCTTTTAGAACATTT
AAAAAGACTTGAAGAGGAAAACTATTGTTTTGCTAAGAAGCGAAAAGAATTCTTAGAAACTAGAGCTATGGAGCTATCAA
AAGATTTAAAATTTTTAACACAGGTCAATGAAAATGATTTGCCTATTTATGAAAGAGGGCAAAGGGATAAAATCATTAAA
CGCTGTGAAAAATCGCTTAATTTTTTGCAGAAAGAATTACAATGCTTTAAAACCTTATTGAAAAGTGCAAGTATAGCTTT
AGAAAACTTGCAAAGCAACCATCAAATCACAGCCGTTACACAAGACACACAAGAAAACACAAACGCACTCAAAAATACCA
CTCAAGATTTTAACAAAACTACCAATGAACCCACAAACCCTAACAATAACCATGAAATGGATTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTGTTATCCTGCACTTTAAAAAGGGGGAATAATAATGTAGAATAAGAGCTAAAAATTAAAACAAGTGGCAAAGTTTTTGG
GAGGATAAAATTACAATAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACCATCCATAAAATTAAATAATTTTACTTAGCGTATTTTTTAACCAATTCTTCTAAAGTGAAGCCCAAGGCTTTGTTAT
CGTCTCTCAATTGCTCTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Relaxase

Number of amino acids: Translated: 635; Mature: 634

Protein sequence:

>635_residues
MALEKSYKDFESDELFDYEIIKPKKTLKVQYTYAKRYYKEVEKFAKNLTQLAQEEFMRLRDPQKQVVIKNIGNMTRLHSK
RAMDYIAKHGELVRDEFFNEVNYNDIAEQWNEQFEKLLENKSRVKNCALHLVFSIDENCNEKNLKALELSVYQTLTNTLG
YDYPFIMKLHTHQNNPHAHVIINKTNRITNKQLRFNSKDSCKEFYHTLRETFKDYLFANSKGELQYSNTPNIYKVIKDIE
TELDTLEKQARNNKSFRHENYFYKVLGSATSQIESLKKRENALSDHLDSLKSLLEKTHWEKEKFTPLINEKELNQQLKEI
KWLNKESLTPKNTYKKTQKLVVCKSPLIKDYLYTTKKLFATQKKIIALEKDYKDLKVLKEEFSKDLEADLSHSKKRFELY
TRLKSMSKVFISKSIVKNLEKIALNFKSDRHSISQRAFEFFRYMNYQNLSLTDKGNMFLVAKFFKDSALLVNIARFEMKK
IDDSVKNSNAQGNLLDKQAWLNLLEHLKRLEEENYCFAKKRKEFLETRAMELSKDLKFLTQVNENDLPIYERGQRDKIIK
RCEKSLNFLQKELQCFKTLLKSASIALENLQSNHQITAVTQDTQENTNALKNTTQDFNKTTNEPTNPNNNHEMDF

Sequences:

>Translated_635_residues
MALEKSYKDFESDELFDYEIIKPKKTLKVQYTYAKRYYKEVEKFAKNLTQLAQEEFMRLRDPQKQVVIKNIGNMTRLHSK
RAMDYIAKHGELVRDEFFNEVNYNDIAEQWNEQFEKLLENKSRVKNCALHLVFSIDENCNEKNLKALELSVYQTLTNTLG
YDYPFIMKLHTHQNNPHAHVIINKTNRITNKQLRFNSKDSCKEFYHTLRETFKDYLFANSKGELQYSNTPNIYKVIKDIE
TELDTLEKQARNNKSFRHENYFYKVLGSATSQIESLKKRENALSDHLDSLKSLLEKTHWEKEKFTPLINEKELNQQLKEI
KWLNKESLTPKNTYKKTQKLVVCKSPLIKDYLYTTKKLFATQKKIIALEKDYKDLKVLKEEFSKDLEADLSHSKKRFELY
TRLKSMSKVFISKSIVKNLEKIALNFKSDRHSISQRAFEFFRYMNYQNLSLTDKGNMFLVAKFFKDSALLVNIARFEMKK
IDDSVKNSNAQGNLLDKQAWLNLLEHLKRLEEENYCFAKKRKEFLETRAMELSKDLKFLTQVNENDLPIYERGQRDKIIK
RCEKSLNFLQKELQCFKTLLKSASIALENLQSNHQITAVTQDTQENTNALKNTTQDFNKTTNEPTNPNNNHEMDF
>Mature_634_residues
ALEKSYKDFESDELFDYEIIKPKKTLKVQYTYAKRYYKEVEKFAKNLTQLAQEEFMRLRDPQKQVVIKNIGNMTRLHSKR
AMDYIAKHGELVRDEFFNEVNYNDIAEQWNEQFEKLLENKSRVKNCALHLVFSIDENCNEKNLKALELSVYQTLTNTLGY
DYPFIMKLHTHQNNPHAHVIINKTNRITNKQLRFNSKDSCKEFYHTLRETFKDYLFANSKGELQYSNTPNIYKVIKDIET
ELDTLEKQARNNKSFRHENYFYKVLGSATSQIESLKKRENALSDHLDSLKSLLEKTHWEKEKFTPLINEKELNQQLKEIK
WLNKESLTPKNTYKKTQKLVVCKSPLIKDYLYTTKKLFATQKKIIALEKDYKDLKVLKEEFSKDLEADLSHSKKRFELYT
RLKSMSKVFISKSIVKNLEKIALNFKSDRHSISQRAFEFFRYMNYQNLSLTDKGNMFLVAKFFKDSALLVNIARFEMKKI
DDSVKNSNAQGNLLDKQAWLNLLEHLKRLEEENYCFAKKRKEFLETRAMELSKDLKFLTQVNENDLPIYERGQRDKIIKR
CEKSLNFLQKELQCFKTLLKSASIALENLQSNHQITAVTQDTQENTNALKNTTQDFNKTTNEPTNPNNNHEMDF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75349; Mature: 75218

Theoretical pI: Translated: 9.69; Mature: 9.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MALEKSYKDFESDELFDYEIIKPKKTLKVQYTYAKRYYKEVEKFAKNLTQLAQEEFMRLR
CCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DPQKQVVIKNIGNMTRLHSKRAMDYIAKHGELVRDEFFNEVNYNDIAEQWNEQFEKLLEN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSRVKNCALHLVFSIDENCNEKNLKALELSVYQTLTNTLGYDYPFIMKLHTHQNNPHAHV
HHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCEEE
IINKTNRITNKQLRFNSKDSCKEFYHTLRETFKDYLFANSKGELQYSNTPNIYKVIKDIE
EEECCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHH
TELDTLEKQARNNKSFRHENYFYKVLGSATSQIESLKKRENALSDHLDSLKSLLEKTHWE
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KEKFTPLINEKELNQQLKEIKWLNKESLTPKNTYKKTQKLVVCKSPLIKDYLYTTKKLFA
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
TQKKIIALEKDYKDLKVLKEEFSKDLEADLSHSKKRFELYTRLKSMSKVFISKSIVKNLE
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIALNFKSDRHSISQRAFEFFRYMNYQNLSLTDKGNMFLVAKFFKDSALLVNIARFEMKK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCEEEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IDDSVKNSNAQGNLLDKQAWLNLLEHLKRLEEENYCFAKKRKEFLETRAMELSKDLKFLT
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVNENDLPIYERGQRDKIIKRCEKSLNFLQKELQCFKTLLKSASIALENLQSNHQITAVT
HCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
QDTQENTNALKNTTQDFNKTTNEPTNPNNNHEMDF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ALEKSYKDFESDELFDYEIIKPKKTLKVQYTYAKRYYKEVEKFAKNLTQLAQEEFMRLR
CCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DPQKQVVIKNIGNMTRLHSKRAMDYIAKHGELVRDEFFNEVNYNDIAEQWNEQFEKLLEN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSRVKNCALHLVFSIDENCNEKNLKALELSVYQTLTNTLGYDYPFIMKLHTHQNNPHAHV
HHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCEEE
IINKTNRITNKQLRFNSKDSCKEFYHTLRETFKDYLFANSKGELQYSNTPNIYKVIKDIE
EEECCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHH
TELDTLEKQARNNKSFRHENYFYKVLGSATSQIESLKKRENALSDHLDSLKSLLEKTHWE
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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TQKKIIALEKDYKDLKVLKEEFSKDLEADLSHSKKRFELYTRLKSMSKVFISKSIVKNLE
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KIALNFKSDRHSISQRAFEFFRYMNYQNLSLTDKGNMFLVAKFFKDSALLVNIARFEMKK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCEEEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IDDSVKNSNAQGNLLDKQAWLNLLEHLKRLEEENYCFAKKRKEFLETRAMELSKDLKFLT
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVNENDLPIYERGQRDKIIKRCEKSLNFLQKELQCFKTLLKSASIALENLQSNHQITAVT
HCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
QDTQENTNALKNTTQDFNKTTNEPTNPNNNHEMDF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA