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The map label for this gene is pepF [H]

Identifier: 188527254

GI number: 188527254

Start: 443444

End: 445180

Strand: Reverse

Name: pepF [H]

Synonym: HPSH_02305

Alternate gene names: 188527254

Gene position: 445180-443444 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188527255

Following gene: 188527253

Centisome position: 27.68

GC content: 38.63

Gene sequence:

>1737_bases
ATGAAAGAGCAAGAATGGGATTTAAGCGCTTTATTTGAAAATACAGAAAGTGCAGAAGAATTTTTAAAAACCTTACAAAC
AGAAGTGCAAGAATTTGAGAGCGCTTATCAAAACAACCTTAAGAATTTAGACGCTACAGGATTTGCCAACGCTCTTAAAC
ATTACGAAGATTTGTCAGAAAAGATTTCTAGGGTGATGACTTACGCTCAATTACTTTTTGCTAAGAACACTAAAGAAGCG
AAGTTTTATTCGCAATGCGAAATGGCTTGCACAAATATCCAACAACACCTTTTATTCTTTGAAATTGAATTTAAGAATTT
AGACGCCAAAAAACAACTCGCTTTCATTAAAAAATGCAAAGACCATGCTTTTTATTTGAACAATCTCATAGAAAGGAAAA
AACACACCCTAAATTTAGACGAAGAAAAGATCGCTCTAGCCCTTTCACCTGTGGGAGTGGGCGCGTTTAGCCGTCTTTTT
GATGAGCATTTTTCTTCTTTGAAAATCCCTTTTGAAGAGCAAAACTTAAGCGAAGAAGAAATTTTAGCCCTCTTGCACAA
CCCCAAACGCAAGATCCGTAAAAAATCTCAAAAAGCTTTCAGTAAAGCGTTAGAAAAATCTCGCCCTTTGCTCACTTACA
TTTTAAACATGGTGCGTAAAGACTTGCTCATTGAAACTAGGCTAAGAAAATACGATAAAAAAGAGAGTTTCCGCCACATT
GACAACCAGATCTCCCAAGAGAGCGTGGATAGCATGATAGAGATTGTGAACGCTAATTTTTCTTTAGTGCATCGTTACTA
CCATCAAAAAGTGCAAATTTTAGGGCATAAACTCAAAGATTACGATCGCTACGCCCCTTTAAGCGATGAACATACCACCA
TGACTTACTCTCAAGCTTTAGAAGAAGTGCTTAACACCCTTAAAGCCTTTAGCCCTGAATTCCACAAAATCGCTTCTAAA
GCGATCAAAGAAGGCTGGGTGGATTCACACCCTAAAGACTTTAAGCAAGGCGGGGCTTTTAGCCATGGCGGGGTGCCTAG
CGCCCACCCTTATGTGCTATTAAACTACACAGGAAATCGCCGAGACGCTTTCACTATCGCTCATGAATTTGGGCATATGA
TCCACCAAGAATTGTCCAAAAAACAAGGCGTATTGAACATGGATACGCCCTTAACCACCGCAGAAACCGCTTCCGTCTTT
TCTGAAATGCTGTTTTTTGAGCATTTAAAAAAGGGTTTAAAATCTGACGAACTCCTTTTCATGCTGGCCGGCAAGCTAGA
AGATATTTTTTCTACCCTTTTTAGGCAAGTGGTGATGACTAATTTTGAAAGAAGAATCCATGAAATTGATGAGGAACTGG
ACACCAAAGATTTTGATCGAATCTGGTTTGAAGAAAATCAAAGAATGTTTGAAAAGAGCGTGAAACTCACCAAAAACTAC
CATTTGTGGTGGAGCTATATCCCCCATTTTATCCATTCGCCTTTTTATTGCTACGCTTATAGTTACGGGCAGCTTTTAAC
TTTGGCGCTTTATGGGCTTTATAAAAAAAGCGACGCTAAAGAGTTTGTTAAAACTTACACGGAATTTTTGAGCTTAGGAG
GGTCAAAAAGCCCTAAAGAATTAGTGTCCATGTTTGGCTTTGACATTGATAGCAAAGAATTTTGGGAAATTGGCATGCAA
GAGGTGCGTCATTTGTTAGAAGAATTTGAAAGGTTGCTCGCATGCAAAGAGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAATTGCGTAAAAACCAAATGATAAGTTTGCTTGTATTGTCAGTGTTATGTTAAAATACCAGCGTATTGAACTCAAACT
ATTAAACAAAGGGGGCTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGCTTTTAAACAACAAGCATTGCATTGAATACTTGCAATTTTTGTCCAAAAACCATTTGAGTTTTAACCTTTTGTGCGAA
AGAGATGCGATTGATTTTTC

Product: oligoendopeptidase F (pepF)

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 578; Mature: 578

Protein sequence:

>578_residues
MKEQEWDLSALFENTESAEEFLKTLQTEVQEFESAYQNNLKNLDATGFANALKHYEDLSEKISRVMTYAQLLFAKNTKEA
KFYSQCEMACTNIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCKDHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLF
DEHFSSLKIPFEEQNLSEEEILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKVQILGHKLKDYDRYAPLSDEHTTMTYSQALEEVLNTLKAFSPEFHKIASK
AIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGGVPSAHPYVLLNYTGNRRDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVF
SEMLFFEHLKKGLKSDELLFMLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEIDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKELVSMFGFDIDSKEFWEIGMQ
EVRHLLEEFERLLACKEN

Sequences:

>Translated_578_residues
MKEQEWDLSALFENTESAEEFLKTLQTEVQEFESAYQNNLKNLDATGFANALKHYEDLSEKISRVMTYAQLLFAKNTKEA
KFYSQCEMACTNIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCKDHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLF
DEHFSSLKIPFEEQNLSEEEILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKVQILGHKLKDYDRYAPLSDEHTTMTYSQALEEVLNTLKAFSPEFHKIASK
AIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGGVPSAHPYVLLNYTGNRRDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVF
SEMLFFEHLKKGLKSDELLFMLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEIDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKELVSMFGFDIDSKEFWEIGMQ
EVRHLLEEFERLLACKEN
>Mature_578_residues
MKEQEWDLSALFENTESAEEFLKTLQTEVQEFESAYQNNLKNLDATGFANALKHYEDLSEKISRVMTYAQLLFAKNTKEA
KFYSQCEMACTNIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCKDHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLF
DEHFSSLKIPFEEQNLSEEEILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKVQILGHKLKDYDRYAPLSDEHTTMTYSQALEEVLNTLKAFSPEFHKIASK
AIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGGVPSAHPYVLLNYTGNRRDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVF
SEMLFFEHLKKGLKSDELLFMLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEIDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKELVSMFGFDIDSKEFWEIGMQ
EVRHLLEEFERLLACKEN

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67775; Mature: 67775

Theoretical pI: Translated: 6.80; Mature: 6.80

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKEQEWDLSALFENTESAEEFLKTLQTEVQEFESAYQNNLKNLDATGFANALKHYEDLSE
CCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
KISRVMTYAQLLFAKNTKEAKFYSQCEMACTNIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
DHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLFDEHFSSLKIPFEEQNLSEEE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCHHH
ILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKVQILGHKLKDYDRYAPLSDEHTTMTYSQAL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH
EEVLNTLKAFSPEFHKIASKAIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGGVPSAHPYVLLNYTGNR
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
RDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVFSEMLFFEHLKKGLKSDELLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
MLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEIDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKE
HHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LVSMFGFDIDSKEFWEIGMQEVRHLLEEFERLLACKEN
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKEQEWDLSALFENTESAEEFLKTLQTEVQEFESAYQNNLKNLDATGFANALKHYEDLSE
CCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
KISRVMTYAQLLFAKNTKEAKFYSQCEMACTNIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
DHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLFDEHFSSLKIPFEEQNLSEEE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCHHH
ILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKVQILGHKLKDYDRYAPLSDEHTTMTYSQAL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH
EEVLNTLKAFSPEFHKIASKAIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGGVPSAHPYVLLNYTGNR
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
RDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVFSEMLFFEHLKKGLKSDELLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
MLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEIDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKE
HHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LVSMFGFDIDSKEFWEIGMQEVRHLLEEFERLLACKEN
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9403685 [H]