Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yccS [H]

Identifier: 187932398

GI number: 187932398

Start: 3619722

End: 3621623

Strand: Reverse

Name: yccS [H]

Synonym: CLL_A3429

Alternate gene names: 187932398

Gene position: 3621623-3619722 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187933350

Following gene: 187933537

Centisome position: 95.3

GC content: 22.87

Gene sequence:

>1902_bases
ATGAAAAAGAAAATAATATCTCAAACCATGCTGTTTGCATGCATTTTAGTATTTATAATAGGTTTTAAAAGTGCATTTGG
AGATGAAAACATATTAATAGGAGTTACTACAGTAACTGCAATGCTTATGTTTTTAAGTAAGGATTTAACTTTGAATCCTG
TAAAAAATACAGTAGAATTAATAATTTTCAATGTATCAATGGGTATAATAACTTATTTAGCATCAACAAATATGTTCTTA
GCAATACCACTTAATTTTCTAAGTATGTTCTTTATAGCATATACTTTGTGCTATAACTTAAAATCACCTAGTTATATACC
ATTTACTCTTCAATATGTTTTTATATTAGCGTTTCCAATTTCAGCTGATCAGCTACCAAAAAGATTATTATCTTTAGCAT
TTGGAGCGCTTTCTATTATGGCAATTCAATTAATTGCTAATAGAAATAGAGTTTATAAAATTGGAAATAAACTTTTAGCT
AAAAGTTGTAGCAGTATGTTACAAAAAATAAGAGCTATTAGAAATGGTGAATCTTTTGAAAAAATAGATAATGAAATAAT
ATCTTCTATAAATGAATTTAGAAAAATTATTTATGATAAAAGATCAGAACATTTTTATATAACAGAAGAAAGTAGGATAA
AGCTTAATATATCTTTAGCTTTAGAAAAACTAAATGTGCTTTTAAATGACATTAATAAGATAAAACATGATAGTAACTTA
GAAGATTTAAGTGAAATTGAAGAAGATATAATAATATCTATAGATAATGCAAAAATATGTTTTGAAGATGAAAGTAATCT
AGAAAACTTAGATAAATTATTTAATGAGTTATTAGAAAAATATAAAATTAAGGATACTACTAATCTTATTATATTAAAGA
TGTTAAATTCTCTACATTTATTAAAAACTAGTTTATATGAATTGAAAGCATTAGATAAGAAAAAATATAATTTAATAAGT
AAAGAAGACAAAATACCAGAACAGTTTAAAATAATGAATGTTTATAAAAAACATTTTACGTTAGATTCATTAAGGTTTTC
CTATGCATTTAGATTGGGACTTGGAATTGCTATAGGTGCATTTATTTCAGATTATTTTCATTTAGCTGAGGGAAGATGGA
TTATATTTACTATACATTCATTAATTCAACCACATTATGAAGTATCTAAAGAAAAATTTAAGTATAGGATATTATCAACA
TTTGTAGGTACAGCGATAATTGCAACTATATTTTATATTTTTAAGGATTTAACTACAAGAACTATGATTCTTATGTTAGC
AGGTTATTTAAATGGATATGTAAAACAATATAAATATAGTACAATATTTGTTACTATATCTGCTATAGGTTCAGCAGCGC
TTATGGGAGGAACAGCCGTTTTAAGTGTTAATAGAATATTATTCGTAATAATAGGATCTGTTATTGCATTAATTTTAAGT
AAATTTGTATTACAATATAGAGGAAATGATGCTAAAAAGGATCTTATAGAAATGAATAATGAAGTTACAGCAGATTTATT
AAAGAGCATGGAAGAGTTAATGGATGGAATAAGACCAAACTATAATATTATAAGAAATAATATACTTGTATCAACAATGA
TTGAAGAAAAATTAAAATTTAATAATATTGATGAAAATAATGGAAAACTGATATGTTATATAGATAATCAAAGATTATTA
GTTACTAATATATATAATCTGTATACTTGGTTAGTAAAAGATAATATGAATAAAGATGTAATTGATATTGTTAAGAATAA
GGATATTAATATTAATAAAAAGATAACATCTTTAACAGAAAAATTAGACTCAATAAAAGAATTAAATTCAAAAGTAATTC
TTTCTGATTATATTGAAATTTTAAATGGAGTAAATAAGTTAAATAAGTTAGAAGTTATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTAATAAAAAATCATTCAATAATACGTTATTGTATGATTTTTTATTTTATGGTAAAATGCTTTTTAACTCTTAAAAATC
AAATGAGAAAAGGTGGTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTATTACATGTAAAATTAAATCTAAATATATTTACTATATAATGTAGGAATTATTTAATATTAATAAAAAGTACTACTT
AATTTTATGAATTGAGTAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 633; Mature: 633

Protein sequence:

>633_residues
MKKKIISQTMLFACILVFIIGFKSAFGDENILIGVTTVTAMLMFLSKDLTLNPVKNTVELIIFNVSMGIITYLASTNMFL
AIPLNFLSMFFIAYTLCYNLKSPSYIPFTLQYVFILAFPISADQLPKRLLSLAFGALSIMAIQLIANRNRVYKIGNKLLA
KSCSSMLQKIRAIRNGESFEKIDNEIISSINEFRKIIYDKRSEHFYITEESRIKLNISLALEKLNVLLNDINKIKHDSNL
EDLSEIEEDIIISIDNAKICFEDESNLENLDKLFNELLEKYKIKDTTNLIILKMLNSLHLLKTSLYELKALDKKKYNLIS
KEDKIPEQFKIMNVYKKHFTLDSLRFSYAFRLGLGIAIGAFISDYFHLAEGRWIIFTIHSLIQPHYEVSKEKFKYRILST
FVGTAIIATIFYIFKDLTTRTMILMLAGYLNGYVKQYKYSTIFVTISAIGSAALMGGTAVLSVNRILFVIIGSVIALILS
KFVLQYRGNDAKKDLIEMNNEVTADLLKSMEELMDGIRPNYNIIRNNILVSTMIEEKLKFNNIDENNGKLICYIDNQRLL
VTNIYNLYTWLVKDNMNKDVIDIVKNKDININKKITSLTEKLDSIKELNSKVILSDYIEILNGVNKLNKLEVI

Sequences:

>Translated_633_residues
MKKKIISQTMLFACILVFIIGFKSAFGDENILIGVTTVTAMLMFLSKDLTLNPVKNTVELIIFNVSMGIITYLASTNMFL
AIPLNFLSMFFIAYTLCYNLKSPSYIPFTLQYVFILAFPISADQLPKRLLSLAFGALSIMAIQLIANRNRVYKIGNKLLA
KSCSSMLQKIRAIRNGESFEKIDNEIISSINEFRKIIYDKRSEHFYITEESRIKLNISLALEKLNVLLNDINKIKHDSNL
EDLSEIEEDIIISIDNAKICFEDESNLENLDKLFNELLEKYKIKDTTNLIILKMLNSLHLLKTSLYELKALDKKKYNLIS
KEDKIPEQFKIMNVYKKHFTLDSLRFSYAFRLGLGIAIGAFISDYFHLAEGRWIIFTIHSLIQPHYEVSKEKFKYRILST
FVGTAIIATIFYIFKDLTTRTMILMLAGYLNGYVKQYKYSTIFVTISAIGSAALMGGTAVLSVNRILFVIIGSVIALILS
KFVLQYRGNDAKKDLIEMNNEVTADLLKSMEELMDGIRPNYNIIRNNILVSTMIEEKLKFNNIDENNGKLICYIDNQRLL
VTNIYNLYTWLVKDNMNKDVIDIVKNKDININKKITSLTEKLDSIKELNSKVILSDYIEILNGVNKLNKLEVI
>Mature_633_residues
MKKKIISQTMLFACILVFIIGFKSAFGDENILIGVTTVTAMLMFLSKDLTLNPVKNTVELIIFNVSMGIITYLASTNMFL
AIPLNFLSMFFIAYTLCYNLKSPSYIPFTLQYVFILAFPISADQLPKRLLSLAFGALSIMAIQLIANRNRVYKIGNKLLA
KSCSSMLQKIRAIRNGESFEKIDNEIISSINEFRKIIYDKRSEHFYITEESRIKLNISLALEKLNVLLNDINKIKHDSNL
EDLSEIEEDIIISIDNAKICFEDESNLENLDKLFNELLEKYKIKDTTNLIILKMLNSLHLLKTSLYELKALDKKKYNLIS
KEDKIPEQFKIMNVYKKHFTLDSLRFSYAFRLGLGIAIGAFISDYFHLAEGRWIIFTIHSLIQPHYEVSKEKFKYRILST
FVGTAIIATIFYIFKDLTTRTMILMLAGYLNGYVKQYKYSTIFVTISAIGSAALMGGTAVLSVNRILFVIIGSVIALILS
KFVLQYRGNDAKKDLIEMNNEVTADLLKSMEELMDGIRPNYNIIRNNILVSTMIEEKLKFNNIDENNGKLICYIDNQRLL
VTNIYNLYTWLVKDNMNKDVIDIVKNKDININKKITSLTEKLDSIKELNSKVILSDYIEILNGVNKLNKLEVI

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=234, Percent_Identity=25.6410256410256, Blast_Score=73, Evalue=7e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010019
- InterPro:   IPR010020 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 72630; Mature: 72630

Theoretical pI: Translated: 9.33; Mature: 9.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKKIISQTMLFACILVFIIGFKSAFGDENILIGVTTVTAMLMFLSKDLTLNPVKNTVEL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEE
IIFNVSMGIITYLASTNMFLAIPLNFLSMFFIAYTLCYNLKSPSYIPFTLQYVFILAFPI
EEEEHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
SADQLPKRLLSLAFGALSIMAIQLIANRNRVYKIGNKLLAKSCSSMLQKIRAIRNGESFE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
KIDNEIISSINEFRKIIYDKRSEHFYITEESRIKLNISLALEKLNVLLNDINKIKHDSNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
EDLSEIEEDIIISIDNAKICFEDESNLENLDKLFNELLEKYKIKDTTNLIILKMLNSLHL
HHHHHHCCCEEEEECCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LKTSLYELKALDKKKYNLISKEDKIPEQFKIMNVYKKHFTLDSLRFSYAFRLGLGIAIGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FISDYFHLAEGRWIIFTIHSLIQPHYEVSKEKFKYRILSTFVGTAIIATIFYIFKDLTTR
HHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TMILMLAGYLNGYVKQYKYSTIFVTISAIGSAALMGGTAVLSVNRILFVIIGSVIALILS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KFVLQYRGNDAKKDLIEMNNEVTADLLKSMEELMDGIRPNYNIIRNNILVSTMIEEKLKF
HHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NNIDENNGKLICYIDNQRLLVTNIYNLYTWLVKDNMNKDVIDIVKNKDININKKITSLTE
CCCCCCCCEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
KLDSIKELNSKVILSDYIEILNGVNKLNKLEVI
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKKKIISQTMLFACILVFIIGFKSAFGDENILIGVTTVTAMLMFLSKDLTLNPVKNTVEL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEE
IIFNVSMGIITYLASTNMFLAIPLNFLSMFFIAYTLCYNLKSPSYIPFTLQYVFILAFPI
EEEEHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
SADQLPKRLLSLAFGALSIMAIQLIANRNRVYKIGNKLLAKSCSSMLQKIRAIRNGESFE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
KIDNEIISSINEFRKIIYDKRSEHFYITEESRIKLNISLALEKLNVLLNDINKIKHDSNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
EDLSEIEEDIIISIDNAKICFEDESNLENLDKLFNELLEKYKIKDTTNLIILKMLNSLHL
HHHHHHCCCEEEEECCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LKTSLYELKALDKKKYNLISKEDKIPEQFKIMNVYKKHFTLDSLRFSYAFRLGLGIAIGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FISDYFHLAEGRWIIFTIHSLIQPHYEVSKEKFKYRILSTFVGTAIIATIFYIFKDLTTR
HHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TMILMLAGYLNGYVKQYKYSTIFVTISAIGSAALMGGTAVLSVNRILFVIIGSVIALILS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KFVLQYRGNDAKKDLIEMNNEVTADLLKSMEELMDGIRPNYNIIRNNILVSTMIEEKLKF
HHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NNIDENNGKLICYIDNQRLLVTNIYNLYTWLVKDNMNKDVIDIVKNKDININKKITSLTE
CCCCCCCCEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
KLDSIKELNSKVILSDYIEILNGVNKLNKLEVI
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905232; 9278503 [H]