| Definition | Leptospira biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)' chromosome chromosome I, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_010602 |
| Length | 3,599,677 |
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The map label for this gene is 183221377
Identifier: 183221377
GI number: 183221377
Start: 2075994
End: 2077940
Strand: Reverse
Name: 183221377
Synonym: LEPBI_I1995
Alternate gene names: NA
Gene position: 2077940-2075994 (Counterclockwise)
Preceding gene: 183221378
Following gene: 183221376
Centisome position: 57.73
GC content: 30.1
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases CATATTATCCATTTCAACATCTTTGCAAATAAGAGAGATTTTTTCAAAAAAACTCTTCCAGAAAAGTACATTCCGAAGAC AGCCAATTGGTTATAAACCA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAAACTACTGTAACGATTGTCATTCCTTGTCTTAATGAAGAACTAACGTTACCTTACGTTTTAAAGAAATTGGTGCAA GTTAAAAAAGAGAATTCAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 648; Mature: 648
Protein sequence:
>648_residues MKRFFPFLIDAFLLFGISFLFQSYTNQKNFRIDILGISIFSFILYTAIRWKSFKENPFPFWTLFLTVLLLSFVFLKIAEY DPIQLFPQKLGIKIIALTWILFLLFSFHFVSTETFLILAPFLAVVPVISFVDFMAYPSIPIAIALFLTMRDPKNLDLKNS KTIFLLSILVIFAIIVRDWWDDFALQRAVLLLEAFLFYCVIKKWDRSQVIYLLKAILLFFLLNSLSIYFGIFKDPNFQVT SYHEEIYLIPVSLLASNSLLMIMISMMLWFETNQSRLERGFYVLVLLASLIWFGITVSRNSIGSFLLFLLLVIFLIQKPK NKRLVSYLIVFLVLGIGAYFLFYSEKSILSLGSTSVRFSIWKYYILATIQSNPLFGFGMYPENKIPFVITSGFDSGSLYY IKDYIYNFASFPLAHNLYIQFFGSFGIVGSITFLSILCFSFLRKGTSLKKALKNNLMLTLIFFVWLIHEFYDFNSLEISN LFLLISLLVLYKVPEKNQEIFRSNNYNLLPKMIIGFVLIFLTIVSVRFAYIDHYTLKYAKLVTPNNFEYYISKKEELNQT QVNTPMSFAENIFFGNKLFFYHYAIEQNFESKLKLLRYCFDLQSYPAICYSKLNQFQTGNRYFPELKPYFEFFLDMYDPF AIYKRGEL
Sequences:
>Translated_648_residues MKRFFPFLIDAFLLFGISFLFQSYTNQKNFRIDILGISIFSFILYTAIRWKSFKENPFPFWTLFLTVLLLSFVFLKIAEY DPIQLFPQKLGIKIIALTWILFLLFSFHFVSTETFLILAPFLAVVPVISFVDFMAYPSIPIAIALFLTMRDPKNLDLKNS KTIFLLSILVIFAIIVRDWWDDFALQRAVLLLEAFLFYCVIKKWDRSQVIYLLKAILLFFLLNSLSIYFGIFKDPNFQVT SYHEEIYLIPVSLLASNSLLMIMISMMLWFETNQSRLERGFYVLVLLASLIWFGITVSRNSIGSFLLFLLLVIFLIQKPK NKRLVSYLIVFLVLGIGAYFLFYSEKSILSLGSTSVRFSIWKYYILATIQSNPLFGFGMYPENKIPFVITSGFDSGSLYY IKDYIYNFASFPLAHNLYIQFFGSFGIVGSITFLSILCFSFLRKGTSLKKALKNNLMLTLIFFVWLIHEFYDFNSLEISN LFLLISLLVLYKVPEKNQEIFRSNNYNLLPKMIIGFVLIFLTIVSVRFAYIDHYTLKYAKLVTPNNFEYYISKKEELNQT QVNTPMSFAENIFFGNKLFFYHYAIEQNFESKLKLLRYCFDLQSYPAICYSKLNQFQTGNRYFPELKPYFEFFLDMYDPF AIYKRGEL >Mature_648_residues MKRFFPFLIDAFLLFGISFLFQSYTNQKNFRIDILGISIFSFILYTAIRWKSFKENPFPFWTLFLTVLLLSFVFLKIAEY DPIQLFPQKLGIKIIALTWILFLLFSFHFVSTETFLILAPFLAVVPVISFVDFMAYPSIPIAIALFLTMRDPKNLDLKNS KTIFLLSILVIFAIIVRDWWDDFALQRAVLLLEAFLFYCVIKKWDRSQVIYLLKAILLFFLLNSLSIYFGIFKDPNFQVT SYHEEIYLIPVSLLASNSLLMIMISMMLWFETNQSRLERGFYVLVLLASLIWFGITVSRNSIGSFLLFLLLVIFLIQKPK NKRLVSYLIVFLVLGIGAYFLFYSEKSILSLGSTSVRFSIWKYYILATIQSNPLFGFGMYPENKIPFVITSGFDSGSLYY IKDYIYNFASFPLAHNLYIQFFGSFGIVGSITFLSILCFSFLRKGTSLKKALKNNLMLTLIFFVWLIHEFYDFNSLEISN LFLLISLLVLYKVPEKNQEIFRSNNYNLLPKMIIGFVLIFLTIVSVRFAYIDHYTLKYAKLVTPNNFEYYISKKEELNQT QVNTPMSFAENIFFGNKLFFYHYAIEQNFESKLKLLRYCFDLQSYPAICYSKLNQFQTGNRYFPELKPYFEFFLDMYDPF AIYKRGEL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76233; Mature: 76233
Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKRFFPFLIDAFLLFGISFLFQSYTNQKNFRIDILGISIFSFILYTAIRWKSFKENPFPF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH WTLFLTVLLLSFVFLKIAEYDPIQLFPQKLGIKIIALTWILFLLFSFHFVSTETFLILAP HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLAVVPVISFVDFMAYPSIPIAIALFLTMRDPKNLDLKNSKTIFLLSILVIFAIIVRDWW HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DDFALQRAVLLLEAFLFYCVIKKWDRSQVIYLLKAILLFFLLNSLSIYFGIFKDPNFQVT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEE SYHEEIYLIPVSLLASNSLLMIMISMMLWFETNQSRLERGFYVLVLLASLIWFGITVSRN EECCEEEEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SIGSFLLFLLLVIFLIQKPKNKRLVSYLIVFLVLGIGAYFLFYSEKSILSLGSTSVRFSI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHH WKYYILATIQSNPLFGFGMYPENKIPFVITSGFDSGSLYYIKDYIYNFASFPLAHNLYIQ HHEEEEEEEECCCCEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH FFGSFGIVGSITFLSILCFSFLRKGTSLKKALKNNLMLTLIFFVWLIHEFYDFNSLEISN HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH LFLLISLLVLYKVPEKNQEIFRSNNYNLLPKMIIGFVLIFLTIVSVRFAYIDHYTLKYAK HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE LVTPNNFEYYISKKEELNQTQVNTPMSFAENIFFGNKLFFYHYAIEQNFESKLKLLRYCF EECCCCCEEEECCHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHH DLQSYPAICYSKLNQFQTGNRYFPELKPYFEFFLDMYDPFAIYKRGEL HHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MKRFFPFLIDAFLLFGISFLFQSYTNQKNFRIDILGISIFSFILYTAIRWKSFKENPFPF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH WTLFLTVLLLSFVFLKIAEYDPIQLFPQKLGIKIIALTWILFLLFSFHFVSTETFLILAP HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLAVVPVISFVDFMAYPSIPIAIALFLTMRDPKNLDLKNSKTIFLLSILVIFAIIVRDWW HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DDFALQRAVLLLEAFLFYCVIKKWDRSQVIYLLKAILLFFLLNSLSIYFGIFKDPNFQVT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEE SYHEEIYLIPVSLLASNSLLMIMISMMLWFETNQSRLERGFYVLVLLASLIWFGITVSRN EECCEEEEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SIGSFLLFLLLVIFLIQKPKNKRLVSYLIVFLVLGIGAYFLFYSEKSILSLGSTSVRFSI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHH WKYYILATIQSNPLFGFGMYPENKIPFVITSGFDSGSLYYIKDYIYNFASFPLAHNLYIQ HHEEEEEEEECCCCEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH FFGSFGIVGSITFLSILCFSFLRKGTSLKKALKNNLMLTLIFFVWLIHEFYDFNSLEISN HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH LFLLISLLVLYKVPEKNQEIFRSNNYNLLPKMIIGFVLIFLTIVSVRFAYIDHYTLKYAK HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE LVTPNNFEYYISKKEELNQTQVNTPMSFAENIFFGNKLFFYHYAIEQNFESKLKLLRYCF EECCCCCEEEECCHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHH DLQSYPAICYSKLNQFQTGNRYFPELKPYFEFFLDMYDPFAIYKRGEL HHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA