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The map label for this gene is secA

Identifier: 197294595

GI number: 197294595

Start: 557807

End: 560305

Strand: Reverse

Name: secA

Synonym: PAa_0551

Alternate gene names: 197294595

Gene position: 560305-557807 (Counterclockwise)

Preceding gene: 197294596

Following gene: 197294594

Centisome position: 63.67

GC content: 30.37

Gene sequence:

>2499_bases
ATGTTTAAGTTTTTAAAAAAAATATTTAATTCTTCTAAAAAAGCTTTAAGAAAAGCAAGAGTTATCGCTAATAAAGTCCA
AAACCTTACAGAAACTATGTCTTTGTTAAAAGATCAAGATTTTGTTGTCAAAACTAACGAATTAAAGCAAAGGTATCAAA
AAGGAGAAACCCTTAATCAGTTATTGCCTGAAGCCTACGCTTTAGTGAGGGAGGCAACTAAAAGAGTAACGGGACTCACT
CCTTATTATGTTCAAATTTTAGGCGCTATTATTTTGCATCAAGGAAATATTGCCGAAATGAAAACTGGAGAAGGAAAAAC
TTTAACAGCTATTATGCCTGCTTATTTAAATGCTTTGAGTGGCGATCCGGTTCATATTGTGACAGTTAATGAATATTTAG
CTAAAAGGGAATTCGAAGGAAAAATCGGAGAAGTTTTTCTTTTTTTAGGCCTTTCAGTTGGCATTAATATTAAAGACAAC
AACACCGAAGAGAAGCAAAAAGCTTATTTGTGTGACGTCCTTTATACTACTAATTCGGAACTTGGGTTTGATTATTTAAG
GGATAATATGGAAATTGATGCTAATAATTTAGTGATGAAACGTCCTTATAGCTATGCTATTATCGATGAAGTAGATTCTA
TTTTAATCGATGAAGCTCGCACTCCCTTAATTATTTCTCAAAGCGCCAAAGAAACCAAAAATTTATATAAAGAAGCTAAT
CGTTTTGTTAAAACCCTTAAAAGCAAACATTATCTTATTGAATTAGAAAGCAAAACAATTGAATTAACCGAAGAAGGAAT
TAACAAAGCTGAAAGTTTTTTTCAAATCAAAAATTTATATGATGTTCAACATTCTTCATTGCTCCACCATATCAAAAACG
CTTTAAAAGCTTTTTTTACAATGCATAAAAACAAAGATTATTTAGTGAACCAAAACCAAGTTTTAATTATTGATCAATTT
ACCGGAAGAGTTTTAAAAGGTCGTCAATTTAGTGATGGCCTACATCAAGCTTTAGAAGCGAAAGAAGGGGTTTTAATCAA
AGAAGAAACTTCTATCGGAGCAACAATTACTTATCAAAATTTCTTCCGACTTTATCATAAATTATCAGGCATGACAGGGA
CCGCTAAAACAGAAGAAGATGAATTTAGGGATATTTACAATATGGAAGTAATTGAAATTCCTACCAATCTTCCTATGATT
AGGGTTGATGAACCTGATTTTATTTTTGTAACGATCCAAGAAAAATATGACGCCTTAATTAAAACAACGTTGGAAAGACA
CAAATTAGGACAACCTATTTTAATAGGAACAACTACGGTTGAAGTATCTGAGATTATTTCCAAAAAACTAGCTAAAAATT
TTATTAAGCATGAAATATTAAATGCGAAAAACCACTTTAAAGAAGCAGAAATCATCGCCAAAGCAGGCTTAAAAAATTCA
GTTACAATTGCAACTAATATGGCAGGAAGAGGAACTGATATTCGTTTAGGCGAAGGAGTTGCAGATTTAGGTGGCTTGGC
TGTTTTAGGAACCGAAAGACATGAATCAAGAAGAATTGATAACCAATTAAGAGGCCGTGCTGGACGTCAAGGCGACCCTG
GTTATTCTCGTTTTTTTATTTCTAGTGAAGATGAACTAGCACAAAGATTTGGCGGCAAAAGAATTGAAAAAATTATTTCT
TTGTTACAACAAATCAACACCAGCGGAAAAGAAACTTCTTCTAAAATGGTTACTAATTTTTTCACTAAAATCCAGAAAAA
AGTAGAATCTTCTAATTTTGATTATCGTAAATATCTTTTGAAATATGATGATATTTTAAGAATTCAAAGAGAAATCATTT
ATGATCAAAGAAAAGGGATTTTAAATAGTCCTCATCCAGAAAAAATAGCTTTAAATCTGATGGAAAAAACCATTAATCAA
GCTGTTGTTCCTTTTTTCACTAACACAAAAAAAACCAATCAACCAGAAGAATTAATTCTTTTTTTAGAAAAATCTTTTTT
TCCTAAAGGGACTTTTGATTTAAAAGAAGTTCAAGCCATTTTTGAACAATCACCTAATACAGCTCTAACTGAATTTAGAA
AATATTTATCAAACAAAATGACAGTTATTTTGGAACAACAAAAAGATTCTTTTGAAAAAGAAAACAATGATATTAATTTT
TTTGATCAAGTTATAAGATGGTTTATGTTAAAAATAATTGATAATTATTATAAACGCCATATTAATGATATGAGTGTTTT
AAGACAAGGCGTTGGTTTTGTTGGTTACGGTCAGCAAGATTCTTTTATTGAATATCAAAAAGAAGGACAAATTTTATTCA
ATAAAATGGTTGATCAAATAGTTATGGATATCACAACCGCTATTTTAAGATTTCCTTTGCCGCAAAGTTTTCAAACCCCT
CCTCAACAAGAAAAAATGATTTTGAATGATAACAATTCTGATAACAATATTACCAAAAGAAGAAGAAAAGTTCGCATTTC
TAAAAAACCTTGGAATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTATCATAAATTAAAAAAATAAATAAATTTTTAGTCATCTTTAAAAGATTTAATTTTTGTAGAATTAATTAAAAGAA
AAAAAAGGATTAAAATCGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTATGGAAAAGTATGAAATCAACCAACATTTAGAAAACATAGCTCAAAATTTAAGAGATTTAAAAGAAGCTATTAATCT
TTCCCAAAGCTACCAAACTT

Product: preprotein translocase subunit SecA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 832; Mature: 832

Protein sequence:

>832_residues
MFKFLKKIFNSSKKALRKARVIANKVQNLTETMSLLKDQDFVVKTNELKQRYQKGETLNQLLPEAYALVREATKRVTGLT
PYYVQILGAIILHQGNIAEMKTGEGKTLTAIMPAYLNALSGDPVHIVTVNEYLAKREFEGKIGEVFLFLGLSVGINIKDN
NTEEKQKAYLCDVLYTTNSELGFDYLRDNMEIDANNLVMKRPYSYAIIDEVDSILIDEARTPLIISQSAKETKNLYKEAN
RFVKTLKSKHYLIELESKTIELTEEGINKAESFFQIKNLYDVQHSSLLHHIKNALKAFFTMHKNKDYLVNQNQVLIIDQF
TGRVLKGRQFSDGLHQALEAKEGVLIKEETSIGATITYQNFFRLYHKLSGMTGTAKTEEDEFRDIYNMEVIEIPTNLPMI
RVDEPDFIFVTIQEKYDALIKTTLERHKLGQPILIGTTTVEVSEIISKKLAKNFIKHEILNAKNHFKEAEIIAKAGLKNS
VTIATNMAGRGTDIRLGEGVADLGGLAVLGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGYSRFFISSEDELAQRFGGKRIEKIIS
LLQQINTSGKETSSKMVTNFFTKIQKKVESSNFDYRKYLLKYDDILRIQREIIYDQRKGILNSPHPEKIALNLMEKTINQ
AVVPFFTNTKKTNQPEELILFLEKSFFPKGTFDLKEVQAIFEQSPNTALTEFRKYLSNKMTVILEQQKDSFEKENNDINF
FDQVIRWFMLKIIDNYYKRHINDMSVLRQGVGFVGYGQQDSFIEYQKEGQILFNKMVDQIVMDITTAILRFPLPQSFQTP
PQQEKMILNDNNSDNNITKRRRKVRISKKPWN

Sequences:

>Translated_832_residues
MFKFLKKIFNSSKKALRKARVIANKVQNLTETMSLLKDQDFVVKTNELKQRYQKGETLNQLLPEAYALVREATKRVTGLT
PYYVQILGAIILHQGNIAEMKTGEGKTLTAIMPAYLNALSGDPVHIVTVNEYLAKREFEGKIGEVFLFLGLSVGINIKDN
NTEEKQKAYLCDVLYTTNSELGFDYLRDNMEIDANNLVMKRPYSYAIIDEVDSILIDEARTPLIISQSAKETKNLYKEAN
RFVKTLKSKHYLIELESKTIELTEEGINKAESFFQIKNLYDVQHSSLLHHIKNALKAFFTMHKNKDYLVNQNQVLIIDQF
TGRVLKGRQFSDGLHQALEAKEGVLIKEETSIGATITYQNFFRLYHKLSGMTGTAKTEEDEFRDIYNMEVIEIPTNLPMI
RVDEPDFIFVTIQEKYDALIKTTLERHKLGQPILIGTTTVEVSEIISKKLAKNFIKHEILNAKNHFKEAEIIAKAGLKNS
VTIATNMAGRGTDIRLGEGVADLGGLAVLGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGYSRFFISSEDELAQRFGGKRIEKIIS
LLQQINTSGKETSSKMVTNFFTKIQKKVESSNFDYRKYLLKYDDILRIQREIIYDQRKGILNSPHPEKIALNLMEKTINQ
AVVPFFTNTKKTNQPEELILFLEKSFFPKGTFDLKEVQAIFEQSPNTALTEFRKYLSNKMTVILEQQKDSFEKENNDINF
FDQVIRWFMLKIIDNYYKRHINDMSVLRQGVGFVGYGQQDSFIEYQKEGQILFNKMVDQIVMDITTAILRFPLPQSFQTP
PQQEKMILNDNNSDNNITKRRRKVRISKKPWN
>Mature_832_residues
MFKFLKKIFNSSKKALRKARVIANKVQNLTETMSLLKDQDFVVKTNELKQRYQKGETLNQLLPEAYALVREATKRVTGLT
PYYVQILGAIILHQGNIAEMKTGEGKTLTAIMPAYLNALSGDPVHIVTVNEYLAKREFEGKIGEVFLFLGLSVGINIKDN
NTEEKQKAYLCDVLYTTNSELGFDYLRDNMEIDANNLVMKRPYSYAIIDEVDSILIDEARTPLIISQSAKETKNLYKEAN
RFVKTLKSKHYLIELESKTIELTEEGINKAESFFQIKNLYDVQHSSLLHHIKNALKAFFTMHKNKDYLVNQNQVLIIDQF
TGRVLKGRQFSDGLHQALEAKEGVLIKEETSIGATITYQNFFRLYHKLSGMTGTAKTEEDEFRDIYNMEVIEIPTNLPMI
RVDEPDFIFVTIQEKYDALIKTTLERHKLGQPILIGTTTVEVSEIISKKLAKNFIKHEILNAKNHFKEAEIIAKAGLKNS
VTIATNMAGRGTDIRLGEGVADLGGLAVLGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGYSRFFISSEDELAQRFGGKRIEKIIS
LLQQINTSGKETSSKMVTNFFTKIQKKVESSNFDYRKYLLKYDDILRIQREIIYDQRKGILNSPHPEKIALNLMEKTINQ
AVVPFFTNTKKTNQPEELILFLEKSFFPKGTFDLKEVQAIFEQSPNTALTEFRKYLSNKMTVILEQQKDSFEKENNDINF
FDQVIRWFMLKIIDNYYKRHINDMSVLRQGVGFVGYGQQDSFIEYQKEGQILFNKMVDQIVMDITTAILRFPLPQSFQTP
PQQEKMILNDNNSDNNITKRRRKVRISKKPWN

Specific function: Part of the Sec protein translocase complex. Interacts with the secYEG preprotein conducting channel. Has a central role in coupling the hydrolysis of ATP to the transfer of proteins into and across the cell membrane, serving as an ATP-driven molecular mo

COG id: COG0653

COG function: function code U; Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Cytoplasm (By similarity). Note=Distribution is 50-50 (By similarity)

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the secA family

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786287, Length=862, Percent_Identity=40.0232018561485, Blast_Score=613, Evalue=1e-176,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): SECA_PHYAS (B1VAB2)

Other databases:

- EMBL:   AM422018
- RefSeq:   YP_001799136.1
- ProteinModelPortal:   B1VAB2
- SMR:   B1VAB2
- GeneID:   6798990
- GenomeReviews:   AM422018_GR
- HOGENOM:   HBG284200
- OMA:   SANIREQ
- ProtClustDB:   PRK12904
- GO:   GO:0005737
- HAMAP:   MF_01382
- InterPro:   IPR014001
- InterPro:   IPR000185
- InterPro:   IPR020937
- InterPro:   IPR011115
- InterPro:   IPR014018
- InterPro:   IPR011130
- InterPro:   IPR011116
- Gene3D:   G3DSA:1.10.3060.10
- PRINTS:   PR00906
- SMART:   SM00487
- SMART:   SM00957
- SMART:   SM00958
- TIGRFAMs:   TIGR00963

Pfam domain/function: PF07517 SecA_DEAD; PF01043 SecA_PP_bind; PF07516 SecA_SW; SSF81767 SecA_PP_bd; SSF81886 SecA_SW

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95821; Mature: 95821

Theoretical pI: Translated: 9.62; Mature: 9.62

Prosite motif: PS01312 SECA; PS51196 SECA_MOTOR_DEAD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFKFLKKIFNSSKKALRKARVIANKVQNLTETMSLLKDQDFVVKTNELKQRYQKGETLNQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCHHHH
LLPEAYALVREATKRVTGLTPYYVQILGAIILHQGNIAEMKTGEGKTLTAIMPAYLNALS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCEEHHHHHHHHHHCC
GDPVHIVTVNEYLAKREFEGKIGEVFLFLGLSVGINIKDNNTEEKQKAYLCDVLYTTNSE
CCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEEHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCC
LGFDYLRDNMEIDANNLVMKRPYSYAIIDEVDSILIDEARTPLIISQSAKETKNLYKEAN
CCHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHH
RFVKTLKSKHYLIELESKTIELTEEGINKAESFFQIKNLYDVQHSSLLHHIKNALKAFFT
HHHHHHCCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MHKNKDYLVNQNQVLIIDQFTGRVLKGRQFSDGLHQALEAKEGVLIKEETSIGATITYQN
HCCCCCEEECCCCEEEEECCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCEEEEHHH
FFRLYHKLSGMTGTAKTEEDEFRDIYNMEVIEIPTNLPMIRVDEPDFIFVTIQEKYDALI
HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCEEEEECCCCCEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHH
KTTLERHKLGQPILIGTTTVEVSEIISKKLAKNFIKHEILNAKNHFKEAEIIAKAGLKNS
HHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
VTIATNMAGRGTDIRLGEGVADLGGLAVLGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGYSRFFI
EEEEEECCCCCCCEEECCCCHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEE
SSEDELAQRFGGKRIEKIISLLQQINTSGKETSSKMVTNFFTKIQKKVESSNFDYRKYLL
CCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
KYDDILRIQREIIYDQRKGILNSPHPEKIALNLMEKTINQAVVPFFTNTKKTNQPEELIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCHHHHHH
FLEKSFFPKGTFDLKEVQAIFEQSPNTALTEFRKYLSNKMTVILEQQKDSFEKENNDINF
HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHCCCCCHH
FDQVIRWFMLKIIDNYYKRHINDMSVLRQGVGFVGYGQQDSFIEYQKEGQILFNKMVDQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCEEECCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
VMDITTAILRFPLPQSFQTPPQQEKMILNDNNSDNNITKRRRKVRISKKPWN
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFKFLKKIFNSSKKALRKARVIANKVQNLTETMSLLKDQDFVVKTNELKQRYQKGETLNQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCHHHH
LLPEAYALVREATKRVTGLTPYYVQILGAIILHQGNIAEMKTGEGKTLTAIMPAYLNALS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCEEHHHHHHHHHHCC
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CCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEEHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCC
LGFDYLRDNMEIDANNLVMKRPYSYAIIDEVDSILIDEARTPLIISQSAKETKNLYKEAN
CCHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHH
RFVKTLKSKHYLIELESKTIELTEEGINKAESFFQIKNLYDVQHSSLLHHIKNALKAFFT
HHHHHHCCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MHKNKDYLVNQNQVLIIDQFTGRVLKGRQFSDGLHQALEAKEGVLIKEETSIGATITYQN
HCCCCCEEECCCCEEEEECCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCEEEEHHH
FFRLYHKLSGMTGTAKTEEDEFRDIYNMEVIEIPTNLPMIRVDEPDFIFVTIQEKYDALI
HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCEEEEECCCCCEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHH
KTTLERHKLGQPILIGTTTVEVSEIISKKLAKNFIKHEILNAKNHFKEAEIIAKAGLKNS
HHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
VTIATNMAGRGTDIRLGEGVADLGGLAVLGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGYSRFFI
EEEEEECCCCCCCEEECCCCHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEE
SSEDELAQRFGGKRIEKIISLLQQINTSGKETSSKMVTNFFTKIQKKVESSNFDYRKYLL
CCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
KYDDILRIQREIIYDQRKGILNSPHPEKIALNLMEKTINQAVVPFFTNTKKTNQPEELIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCHHHHHH
FLEKSFFPKGTFDLKEVQAIFEQSPNTALTEFRKYLSNKMTVILEQQKDSFEKENNDINF
HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHCCCCCHH
FDQVIRWFMLKIIDNYYKRHINDMSVLRQGVGFVGYGQQDSFIEYQKEGQILFNKMVDQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCEEECCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
VMDITTAILRFPLPQSFQTPPQQEKMILNDNNSDNNITKRRRKVRISKKPWN
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA