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Definition Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome.
Accession NC_010516
Length 3,958,233

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The map label for this gene is bceB [H]

Identifier: 170756576

GI number: 170756576

Start: 2280530

End: 2282524

Strand: Reverse

Name: bceB [H]

Synonym: CLD_2497

Alternate gene names: 170756576

Gene position: 2282524-2280530 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170755326

Following gene: 170757642

Centisome position: 57.67

GC content: 24.11

Gene sequence:

>1995_bases
ATGTATTCTAAGATAGCTCTTAAAAATATAAAAAAGAGTTATAAAGATTATACTATATATTTTTTAACACTAATATTAGC
TGTTTGTATATTTTATAGCTTTAATTCAATAGAATCACAAAAGGTACTTATTGAAATAGAATTTATGTCTGCGATAATGA
AGGCTATTTCAGGTGTTTCAGTGCTAGTATCCATAATATTAGGTGGATTAATAGTGTATGCAAATAATTTTTTAATAAAA
AGACGTAAAAAAGAGTTAGGAATGTATATGATTTTAGGTATGGGAAAAAGAAAAATATCTAGAATTTTAGTGACAGAAAC
CTTTATAGTGGGAGTTATATCTTTAGTTGGTGGACTTATATTAGGAATTGGAGCATCACAAGGGTTATCTACATTTACTT
TAAAGTTATTTGATGTGGGGATGGATGAATATAAGTTTATAATTTCAATAAGTGCTATGGGTAAGACTATATTATACTTT
GGAACAATGTTTTTGCTTGTTATGATATTTAATGTATTTGTTATTTCTAAATATAAGGTAATTGATCTATTAATAGCCAA
CATAAAAAATGAAGACATAAAATTTAAAAATCCATTTATATATTTATTAACATTTGTTTTATGTCTAATATTTCTTGGAT
TTTCATATAAATCCTTGCTAGAGATACCTTTTGATTTAGAACGTAATTTAGAACGTAATATGTCTATACCAATAGCTCTT
GCAATAGTTGGTACAGTATTATTTTTCTTTAGCTTAGCTGGAGTTATATTATATGTAACAAATAAAAACAAAAAGATATA
TTTTAAAGGGTTAAATATGTTTGTATTAAAACAAATGAACAGTAAAGTTAATACAAACTTTATATCAATGTCTTTAATAT
GTTTAATGCTATTTATTACAATAGTAGTATTATCTACAGGAATAAATTTTAAAAAAGTTGAAGAAGAAGGACGTAGAAAA
ATTACTCCCTTTGATGCCAGTGTAACGTTATACAATAAAGATGAAAACAAAAATCAAAAGAATCATATAGAAGATATGCT
AAATAAAATTGATTTTAAAAAGAGTAAAAATGAAAAATATGCAATTTACAATGATTATTATACAGGGTTAAAGGCAAGTG
AATTATTAAAGATTAAGGAAAGAAACTTTGCACGTTACAATGTATATTTTAGTAAAATATCTGATTATAATAAAATTTTA
AAATTAAAGGGTGAAAAAGAAATAGCTTTAAATAAGAGTGAAGTTTTAATTTTATCAAGTTCAGGTGGTGCCATTAATCT
AATTAATGAAAAATTAAAAAGTAATAGAAGAATTAATATAAAAGGAAAAGAATATTTGATTAAAAATGATAAAGTTATAG
AAGAGAATCTTAAAACATCTTCCCGTGCGGATAACCCTTGCACAGTAGTTATAAATGATGAGCTTGTGTCTGATTATAAA
ATTAGCTCCTCAGTACTTAATGTAATATATTTAGATACAAATAGAGAAGAGAATAATAAAAAATATAATAAAATTAATGA
TAATTATATTAAAGATGGGTATAAGAATTTAGATATTTCTATAGATACCATTACCAAGGATGAGGTGTATTCTAAAAGTA
ATGGAATAACAAGTATGATGCTATTTATTGCAATATATTTAGGTATAGTATTTTTAATGACTAGTATGGCTGTATTAGCT
CTTCAACAATTATCAGAGGCTAGTGATAGCATAGAAAGATATAAAGCTTTAAAGAGAATTGGGGCAAACAAAAAAATGAT
AGACAAAACAATTTTCATTCAAACCTTAATGTATTTTAGTCTTCCAGTGATTCTTGCATTAATTCATTCAATGGTCGTAA
TTAAGATAATTAATGATCTTACCAGCATGATTATTAATACAGCTAATTTTAGGTATTCAATTTTAATAACTGTTTTAATA
TTTATTATAGTTTATTTGGAATATTTCTATATAACCTATGCAGGATATAAAAATATAGTAAAAAGGAATATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTACATGAGATGAAGTTAAAAAATCTACTTTAAGTTATGCGCATAGAATTCTTTAGTAGAATTATAGAAGTTATACCTCT
TCTTGGAGGTGATGATAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTGTTATATGTAAAATATGAAGATATTAAATAAGACATATGAAAGGATAATAAAACTATGAAAATTTCAGTTGAAAAT
TTAAATATGATATATAAAGC

Product: ABC transporter, permease protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 664; Mature: 664

Protein sequence:

>664_residues
MYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVSVLVSIILGGLIVYANNFLIK
RRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLILGIGASQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIISISAMGKTILYF
GTMFLLVMIFNVFVISKYKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIPIAL
AIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFITIVVLSTGINFKKVEEEGRRK
ITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKYAIYNDYYTGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKIL
KLKGEKEIALNKSEVLILSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVSDYK
ISSSVLNVIYLDTNREENNKKYNKINDNYIKDGYKNLDISIDTITKDEVYSKSNGITSMMLFIAIYLGIVFLMTSMAVLA
LQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLI
FIIVYLEYFYITYAGYKNIVKRNI

Sequences:

>Translated_664_residues
MYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVSVLVSIILGGLIVYANNFLIK
RRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLILGIGASQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIISISAMGKTILYF
GTMFLLVMIFNVFVISKYKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIPIAL
AIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFITIVVLSTGINFKKVEEEGRRK
ITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKYAIYNDYYTGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKIL
KLKGEKEIALNKSEVLILSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVSDYK
ISSSVLNVIYLDTNREENNKKYNKINDNYIKDGYKNLDISIDTITKDEVYSKSNGITSMMLFIAIYLGIVFLMTSMAVLA
LQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLI
FIIVYLEYFYITYAGYKNIVKRNI
>Mature_664_residues
MYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVSVLVSIILGGLIVYANNFLIK
RRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLILGIGASQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIISISAMGKTILYF
GTMFLLVMIFNVFVISKYKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIPIAL
AIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFITIVVLSTGINFKKVEEEGRRK
ITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKYAIYNDYYTGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKIL
KLKGEKEIALNKSEVLILSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVSDYK
ISSSVLNVIYLDTNREENNKKYNKINDNYIKDGYKNLDISIDTITKDEVYSKSNGITSMMLFIAIYLGIVFLMTSMAVLA
LQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLI
FIIVYLEYFYITYAGYKNIVKRNI

Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76036; Mature: 76036

Theoretical pI: Translated: 9.99; Mature: 9.99

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
VLVSIILGGLIVYANNFLIKRRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLI
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGIGASQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIISISAMGKTILYFGTMFLLVMIFNVFVISKYKV
HHCCCCCCCHHEEEEHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIPIAL
HHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHCCHHCCCCCCHHH
AIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFIT
HHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IVVLSTGINFKKVEEEGRRKITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKY
HHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCE
AIYNDYYTGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKILKLKGEKEIALNKSEVLILSS
EEEECHHCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHEECCCCCEEECCCEEEEEEC
SGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVSDYK
CCCEEEHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHCCHH
ISSSVLNVIYLDTNREENNKKYNKINDNYIKDGYKNLDISIDTITKDEVYSKSNGITSMM
HCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHCCCCCCHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHH
LFIAIYLGIVFLMTSMAVLALQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLIFIIVYLEYFYITYAGYKNIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRNI
HCCC
>Mature Secondary Structure
MYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
VLVSIILGGLIVYANNFLIKRRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLI
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGIGASQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIISISAMGKTILYFGTMFLLVMIFNVFVISKYKV
HHCCCCCCCHHEEEEHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIPIAL
HHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHCCHHCCCCCCHHH
AIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFIT
HHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IVVLSTGINFKKVEEEGRRKITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKY
HHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCE
AIYNDYYTGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKILKLKGEKEIALNKSEVLILSS
EEEECHHCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHEECCCCCEEECCCEEEEEEC
SGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVSDYK
CCCEEEHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHCCHH
ISSSVLNVIYLDTNREENNKKYNKINDNYIKDGYKNLDISIDTITKDEVYSKSNGITSMM
HCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHCCCCCCHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHH
LFIAIYLGIVFLMTSMAVLALQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLIFIIVYLEYFYITYAGYKNIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRNI
HCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9387221; 9384377; 14612242; 12890034 [H]