Definition Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome.
Accession NC_010516
Length 3,958,233

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The map label for this gene is 170755751

Identifier: 170755751

GI number: 170755751

Start: 3348866

End: 3350284

Strand: Reverse

Name: 170755751

Synonym: CLD_1437

Alternate gene names: NA

Gene position: 3350284-3348866 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170754542

Following gene: 170756338

Centisome position: 84.64

GC content: 22.55

Gene sequence:

>1419_bases
TTGATATATAATTTATTTATGGTATTTTTTACATTTGCTATATCTTGTATTTTATTTAAAAAAGCTAGTGGAACTCTAAA
ACCCAACAAACTAAATCTTATTTCTTATATATTTTATCTATTTATATTGCAAAGCTTTATAGGAAGCAGTTTAATTTATT
TAGGTTTTAGGGAACATTATTTAATACAAAAGGTAACTAATTTTTCCACTATAGGTAAAACATATGATATGATATGTTTT
ACTGCCATAGCCCTACCCTTAACTATTCTTTTAGTATATAAAATATTTAATATAAATATGAGTAAAGATTATAATGATTA
CTTAAATAAAGAAGTAATTTTAGAATATGAGGACAATATTTTTGTAATAACAGTATTAATAAGTATAGTATGCTTAATAT
TCACATTAATTTTGTTTATCAAAATGAGATCAATTCCATTGATTGATTTGATAATTCATAGAAGTTCAGGAAATATAGGA
AATAAAAGAATCAATATATCACATGGTAATTATATGAATCAATATATACAAAATCTATTAGTTTTAGGACTAACGCCTAT
ACTATCTTATCTTTCATATATTTATTACAAATGTACCAAGGCAAATAGATGGAGGATTTTATTTTTTATTTTGTTTATAG
CATCTATATTTTTAAAAACTTATAATTATGCAAAGACACCTGTAGTATTTTACATATTTGTTTTCATACTAATAAATATA
GTAATAGAAGGTAGTATACCTATAAGGAAATTATTAACAGTATTAGTTTTATGTGTTTTTATAATATTATTAATGTATAT
AAAAATAGGATATGACTTTAATAAAGGATTAGATATATATAATGGTCCAATAGGGAGGACTATATTCACTCAAGTAGGAA
CTTTGTTTTTACATGTAGATTTATTTCCTTATTATATTCCATATTTAGGTGGGAGAAGTTTTTCTCCAACTATTTTAAAA
TTATTTTTAGGAGGAGTATCACAATTTAGATCAGGAAGAGTAGTTATGAATTTTTATAGTCCTGAAAAAGTTGTAGGTGG
AACTGCTGGTGTTATGAATTCATTATTTATAGGAGAGGCTTATGCTAATTTTGGTACTATAGGAGTGTTATCATCAGTAT
TGTACATTGGACTTTTGTTAAGTATAATATTAATTATTTTTGTGAAAATTAAGAAAACTCCTATAAATATTGTAATATAT
GTTACAATAACATCTATATTAGCATCCGCATCTCAAGGTGGATTTATAGATTTTGTATATAATTTTAATATAATATTTAT
TACGGTTACACTAATATTAATTAGTTTATTTGCTAAATATATGGATAAAATTAAAATTTTAAAACATATAAAAGTTTATG
TACTAAAATTTACTTCCTTAAATATTAAAATTAAGAAAGAGGATAAAAATGAGTGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACCTATAGAAAATATGAAAAATCAGTTAAAAAATGCTGATTCATATACTAAAGCTAAACTTTTGAATAAAGAAATTTTT
AAATGATGGGATGATGAGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAATTGTATTTTTCATATACCTTACTATTTAGATTTAAAATGGCCTTCAGGTTCTAATATTAGACCAATAAAAATGATAA
AGGCATTTGAAAGTATAGGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 472; Mature: 472

Protein sequence:

>472_residues
MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHYLIQKVTNFSTIGKTYDMICF
TAIALPLTILLVYKIFNINMSKDYNDYLNKEVILEYEDNIFVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIG
NKRINISHGNYMNQYIQNLLVLGLTPILSYLSYIYYKCTKANRWRILFFILFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI
VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVDLFPYYIPYLGGRSFSPTILK
LFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEAYANFGTIGVLSSVLYIGLLLSIILIIFVKIKKTPINIVIY
VTITSILASASQGGFIDFVYNFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKILKHIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC

Sequences:

>Translated_472_residues
MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHYLIQKVTNFSTIGKTYDMICF
TAIALPLTILLVYKIFNINMSKDYNDYLNKEVILEYEDNIFVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIG
NKRINISHGNYMNQYIQNLLVLGLTPILSYLSYIYYKCTKANRWRILFFILFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI
VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVDLFPYYIPYLGGRSFSPTILK
LFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEAYANFGTIGVLSSVLYIGLLLSIILIIFVKIKKTPINIVIY
VTITSILASASQGGFIDFVYNFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKILKHIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC
>Mature_472_residues
MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHYLIQKVTNFSTIGKTYDMICF
TAIALPLTILLVYKIFNINMSKDYNDYLNKEVILEYEDNIFVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIG
NKRINISHGNYMNQYIQNLLVLGLTPILSYLSYIYYKCTKANRWRILFFILFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI
VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVDLFPYYIPYLGGRSFSPTILK
LFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEAYANFGTIGVLSSVLYIGLLLSIILIIFVKIKKTPINIVIY
VTITSILASASQGGFIDFVYNFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKILKHIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54088; Mature: 54088

Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHH
LIQKVTNFSTIGKTYDMICFTAIALPLTILLVYKIFNINMSKDYNDYLNKEVILEYEDNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCEEEEEECCCE
FVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIGNKRINISHGNYMNQYIQNLL
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHH
VLGLTPILSYLSYIYYKCTKANRWRILFFILFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVD
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LFPYYIPYLGGRSFSPTILKLFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEA
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
YANFGTIGVLSSVLYIGLLLSIILIIFVKIKKTPINIVIYVTITSILASASQGGFIDFVY
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEE
NFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKILKHIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC
ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHH
LIQKVTNFSTIGKTYDMICFTAIALPLTILLVYKIFNINMSKDYNDYLNKEVILEYEDNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCEEEEEECCCE
FVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIGNKRINISHGNYMNQYIQNLL
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHH
VLGLTPILSYLSYIYYKCTKANRWRILFFILFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVD
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LFPYYIPYLGGRSFSPTILKLFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEA
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
YANFGTIGVLSSVLYIGLLLSIILIIFVKIKKTPINIVIYVTITSILASASQGGFIDFVY
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEE
NFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKILKHIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC
ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA