Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yhgE [H]

Identifier: 170755338

GI number: 170755338

Start: 1100121

End: 1102280

Strand: Direct

Name: yhgE [H]

Synonym: CLD_3573

Alternate gene names: 170755338

Gene position: 1100121-1102280 (Clockwise)

Preceding gene: 170755572

Following gene: 170756934

Centisome position: 27.79

GC content: 27.64

Gene sequence:

>2160_bases
ATGAAAAAGGCATTTAGAATATTTTCAAGAGATTTAAAAAATATAGTTAAACATCCTGCAGCAATTATAGTAGTATTAGG
ATTATCTTTTATCCCTTCTTTGTATGCATGGATCAATATAAAGGCTTGTTGGGATCCCTATGCTAATACGGGAAATTTGC
CTATAGCTATAGTTAATAGGGATGAAGGTATGATGCTTAGAGGGAAATATACAAATGTAGGAAATGGCATTGTTGAAAAT
TTAAAGGGCAATAAAAACATGGGCTGGGTTTTTGTAGATGAATGGCAAGCAAATTATGGACTTAATGAAGGTAAATATTA
TGCGCTTATAGAAATACCTTCCAATTTTACTCGTGGACTAGCAAGTTTAAAAACTACAGATCCCCAAAAACCAAATATTA
TATATAGAGCTAATGAAAAATCAAATGCCATAGCAACTAAAATAACTAATGCAGCAAAAGGAAGCTTGGCTAAGCAAATT
CAAACAAATTTTGTTTATACAGTAAACAAAGAAGCTTTTAAGTTATTGAATAATACAGGTGGTCAATTAGAAAAGAATAA
ATCTAAGATACTTGGCATAAAATCTACTTTAGAGCTTGGAAATAAAAGTATTGGAGAAGTAAAAAATATAATAGATGATG
CTAGTAAAGATTCAGAAAGCTTGAAACAGTATTTTAACGATACAAAGGACAAGCTACCACTTATAACAGATCAAATAAAT
AATCTACAGAAGGCAACAGAAGCTAGCAAAAATCTAGTAAATGAAACAGAACGAGATTTAAATGGCATAGCAAAAAATAT
TAATAATGATATGATATATAGAGAAAGCACAAATAGTAAAATTAATAGCATATTAACAAATTTAAAAGAATATAACAATG
TTAGTAATAATTCAGAAATGATTAAACTTGTAGATGAAGCATCAAAATTATGTGATTCTATAAATAGTAATATAGATGGG
ACTATAAAATCATTAGAAATAGTAAATATTTTAAAACCTAATAAAATAATTGAGGAATTAATAAATAGTTTAAAAAATTT
ACAAGAAAAAGTTAATGGTGAAAAAAATAAATTAGCTGAACTAAAGAATAAAATTTCTACTTCAAACAATAATAAACAAA
ATATAAATCAGGTTGTAGAATCTATATTACTATTAAATGATGAGATAAATAAAAATATGAGAAATACATCTAATATTTTT
TATAATCAAACAACTATGATAATAGAAAATACTGCTAAAGGATTAAACAATAGATTAGATACAGCTAATGACGTATTAGA
TACTACCAAATTAGTAATACCTCAATTAAAGGCTTTGGGGGATTTTGGAGTAGGAACTAGTGATGCAGCTTTAAAAGATG
GGAAAAAAATAAATAATAAATTAGCAGAATTTAAAAAAACAATAAATAAACTAGAGGAAAAAACATCTTCTTTAACTGAG
GATAATTTAGATAAAATAATAAATTTAACTCAGAAAAATCCAGAACAAATGGCTTCATTTATATCTTCTCCAATAAATAT
TAAAGAAGAGGAGATATATAATACAGGAATATTTGGAGTAGGATTAACTCCATTTTATACAGTTTTAGCTATATGGGTAG
GAGTTCTATTAATGAGTTCATTGATATCTGTAGAAGCAGAAGAATTTGAGGGAGAGAAAAAGCTTACTCATCTTCAAGTA
TATTTTGGAAAATTGCTTTTATTTTTATCAATAGCTATAATACAAGGAATTATTGTAACCTTAGGTGATGTATTTATCTT
AGGGATTGAACCAGCAAGTATGGGATTGTTGATGGTATTTACTATAGTAACAGCTATAACTTTCACTTTTATAATATACA
CCCTAGTATCTATTTTTGGAAACCTTGGAAAGGCTATTGCAGTAGTTATAATGGTATTTCAAATAGCTGGTGCAGGGGGA
ATATATCCAATACAAACTAATCCTAAAATATTTGGTGTATTGCAGCCTTTATGGCCTTTTACTTATGCCATAGCAGGATT
TAGAGAAGCTATAGCAGGGCCTGTACGAGCCGCTGTAATTAAAAATTTAGGAGCTTTATTTATATTTTCTATAGGCTCAT
TATTATTAGTTGTTCTTAAAAAGCCGTTACATAAGGTTACTGAATATATGAACGATAAATTTATAGAAACAGGATTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTTAAAATCTCCATTACATCATAAAATTAGTAAGTTTGACGAAGACTTTAAGGCTTCAGGAATATCAGAATAAATATAG
AAAATAAAGAGGTGAGGCAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAGATTATAACTTAACAGTCTTTAAAGGTTCAAAATTAAAACAAGAAATACTTTTAGTCAATAGATAGCTATAAAAATA
AAGAATACTAATATTTGTGC

Product: putative phage infection protein

Products: NA

Alternate protein names: ORFB [H]

Number of amino acids: Translated: 719; Mature: 719

Protein sequence:

>719_residues
MKKAFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLSFIPSLYAWINIKACWDPYANTGNLPIAIVNRDEGMMLRGKYTNVGNGIVEN
LKGNKNMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTRGLASLKTTDPQKPNIIYRANEKSNAIATKITNAAKGSLAKQI
QTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQIN
NLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMIKLVDEASKLCDSINSNIDG
TIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLAELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMRNTSNIF
YNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDVLDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTE
DNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQV
YFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIEPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGG
IYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL

Sequences:

>Translated_719_residues
MKKAFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLSFIPSLYAWINIKACWDPYANTGNLPIAIVNRDEGMMLRGKYTNVGNGIVEN
LKGNKNMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTRGLASLKTTDPQKPNIIYRANEKSNAIATKITNAAKGSLAKQI
QTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQIN
NLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMIKLVDEASKLCDSINSNIDG
TIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLAELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMRNTSNIF
YNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDVLDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTE
DNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQV
YFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIEPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGG
IYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL
>Mature_719_residues
MKKAFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLSFIPSLYAWINIKACWDPYANTGNLPIAIVNRDEGMMLRGKYTNVGNGIVEN
LKGNKNMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTRGLASLKTTDPQKPNIIYRANEKSNAIATKITNAAKGSLAKQI
QTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQIN
NLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMIKLVDEASKLCDSINSNIDG
TIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLAELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMRNTSNIF
YNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDVLDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTE
DNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQV
YFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIEPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGG
IYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL

Specific function: Unknown

COG id: COG1511

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013525
- InterPro:   IPR022703
- InterPro:   IPR017501
- InterPro:   IPR017500 [H]

Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 79687; Mature: 79687

Theoretical pI: Translated: 9.51; Mature: 9.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKAFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLSFIPSLYAWINIKACWDPYANTGNLPIAIVNR
CCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEC
DEGMMLRGKYTNVGNGIVENLKGNKNMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTRGL
CCCEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHH
ASLKTTDPQKPNIIYRANEKSNAIATKITNAAKGSLAKQIQTNFVYTVNKEAFKLLNNTG
HHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHCCC
GQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQIN
CCCCCCCHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHH
NLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
IKLVDEASKLCDSINSNIDGTIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLAE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
LKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMRNTSNIFYNQTTMIIENTAKGLNNRLD
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCEEECCEEEEEEHHHHHHHHCCC
TANDVLDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
DNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSS
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISVEAEEFEGEKKLTHLQVYFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIEPASMGLLMVF
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHH
TIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGGIYPIQTNPKIFGVLQPLWPF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHH
TYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKKAFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLSFIPSLYAWINIKACWDPYANTGNLPIAIVNR
CCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEC
DEGMMLRGKYTNVGNGIVENLKGNKNMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTRGL
CCCEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHH
ASLKTTDPQKPNIIYRANEKSNAIATKITNAAKGSLAKQIQTNFVYTVNKEAFKLLNNTG
HHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHCCC
GQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQIN
CCCCCCCHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHH
NLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
IKLVDEASKLCDSINSNIDGTIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLAE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
LKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMRNTSNIFYNQTTMIIENTAKGLNNRLD
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCEEECCEEEEEEHHHHHHHHCCC
TANDVLDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
DNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSS
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISVEAEEFEGEKKLTHLQVYFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIEPASMGLLMVF
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHH
TIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGGIYPIQTNPKIFGVLQPLWPF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHH
TYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]