| Definition | Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010516 |
| Length | 3,958,233 |
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The map label for this gene is 170754345
Identifier: 170754345
GI number: 170754345
Start: 1905198
End: 1906556
Strand: Reverse
Name: 170754345
Synonym: CLD_2850
Alternate gene names: NA
Gene position: 1906556-1905198 (Counterclockwise)
Preceding gene: 170755964
Following gene: 170756711
Centisome position: 48.17
GC content: 31.79
Gene sequence:
>1359_bases TTGGAAACTCAAAAAAATAACAAATATTCGTTTAGTGAATTATTTAAATTTATTTGCCCATCCTTAATAGGTTTTATACT GTTTATAATACCTATTTCTTATGATGGAGAAATAACAATACCTATTGCTGTACTTTCAAAAATTGTTTTAGCTGGGTTAG GTAGCATATTACCTCAACTTATGGGAATCATCATATGCATTACTTTTATTTGTACAGCAATTACAAAAATATTTAAACCT AAAGCTATTTTAGAAAATAAATTTTTTAACAATTTATTCAACGTGTCTCCTGTATGGGTACTAGCTAGAATATTAGGCTT TATATTTATTGTTTCTACCTTTTTTAAAATAGGACCTGAATGGATGTGGTCAAAAAACACAGGAGGCCTATTACTTTATG ATTTGCTTCCTATATTATTTTCAGTATTTATATTTGCAGGGATGTTACTTCCTTTATTGTTGGACTTTGGTTTATTAGAA TTTGTTGGGGCATTACTTACTAAGGTAATGAGACCAATATTTAATTTACCAGGACGTTCTTCTATAGACTGTATGGCTTC TTGGCTTGGTGATGGTACCATTGGTGTATTACTTACTAGCAAACAATATGAAGAGGGTTACTATAGCGAAAGAGAAGCTG CAGTTATAGGGACAACCTTCTCAGCAGTTTCTATAACTTTTAGTTTAGTTGTAATATCTCAGGTTAAACTTGCTCATATG TTTGTGCCTTTTTATTTAACAGTTTGCTTATCAGGTATAATTGCTGCTATCTTAATTCCTCGCATACCACCACTTTCAAG AAAACCAGATACTTATTTAAATGGTGGAGAAAGCAAAAATTCTGAAGCTCTTCCAGAAGGATATACACCTTTCACATGGG GGCTTGAAAAAGCTGTTGCTAAAGCCGGCTCCAATGATGATCCTCTTAATTTTATAAGACAAGGATTACAAAATGTATTG GATATGCTTTTAGGCGTAACTCCTGTAGTTATGGCTATGGGAACATCTGCTCTTATATTAGCTGAATATACCCCGCTTTT TAAATGGTTAGGTCTACCTTTTATACCACTACTAAACTTATTAAAAATACCAGAAGCCGCTTTAGCATCACAAACTATTG TAGTTGGTTTTGCAGATATGTTTTTACCTTCAGTTATTGCGGCCACTATACAAAGCGAAATGACAAGATTTATAATAGCT TGCCTTTCAGTTACTCAATTAATTTATATGTCTGAAGTAGGAGGACTATTATTAGGTTCTAAGATACCTGTTTCATTAAA AGATTTGGTTATTATATTTCTTGAAAGAACATTAGTAACTTTACCTATTATTACTTTAGTAGCTCACATATTATTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGTATTTCTGGATTCTGTCTGCTGATTAAACTTGTTTTTTTTATATTTATACATTATAATTTAAACTAACATTACTATAA ATTGCAAAGGAGATGAGGTC
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAACGTATTTAAAATTAATAAAAATAAATATTTAAAACATTCTAATGGCAATTTAGTAGGTTTATATTTTAAAACACTA TTAGAATAATTTTAAAATAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORF A [H]
Number of amino acids: Translated: 452; Mature: 452
Protein sequence:
>452_residues METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQLMGIIICITFICTAITKIFKP KAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPEWMWSKNTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLE FVGALLTKVMRPIFNLPGRSSIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHM FVPFYLTVCLSGIIAAILIPRIPPLSRKPDTYLNGGESKNSEALPEGYTPFTWGLEKAVAKAGSNDDPLNFIRQGLQNVL DMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNLLKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIA CLSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLVAHILF
Sequences:
>Translated_452_residues METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQLMGIIICITFICTAITKIFKP KAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPEWMWSKNTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLE FVGALLTKVMRPIFNLPGRSSIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHM FVPFYLTVCLSGIIAAILIPRIPPLSRKPDTYLNGGESKNSEALPEGYTPFTWGLEKAVAKAGSNDDPLNFIRQGLQNVL DMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNLLKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIA CLSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLVAHILF >Mature_452_residues METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQLMGIIICITFICTAITKIFKP KAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPEWMWSKNTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLE FVGALLTKVMRPIFNLPGRSSIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHM FVPFYLTVCLSGIIAAILIPRIPPLSRKPDTYLNGGESKNSEALPEGYTPFTWGLEKAVAKAGSNDDPLNFIRQGLQNVL DMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNLLKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIA CLSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLVAHILF
Specific function: Unknown
COG id: COG3314
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011642 [H]
Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49631; Mature: 49631
Theoretical pI: Translated: 7.21; Mature: 7.21
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 2.9 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQL CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MGIIICITFICTAITKIFKPKAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC WMWSKNTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLEFVGALLTKVMRPIFNLPGRS CEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC SIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHM CHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVPFYLTVCLSGIIAAILIPRIPPLSRKPDTYLNGGESKNSEALPEGYTPFTWGLEKAVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH KAGSNDDPLNFIRQGLQNVLDMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNL HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH LKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIACLSVTQLIYMSEVGGLLLGS HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCC KIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLVAHILF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQL CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MGIIICITFICTAITKIFKPKAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC WMWSKNTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLEFVGALLTKVMRPIFNLPGRS CEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC SIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHM CHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVPFYLTVCLSGIIAAILIPRIPPLSRKPDTYLNGGESKNSEALPEGYTPFTWGLEKAVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH KAGSNDDPLNFIRQGLQNVLDMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNL HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH LKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIACLSVTQLIYMSEVGGLLLGS HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCC KIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLVAHILF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA