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The map label for this gene is pepF2

Identifier: 170762436

GI number: 170762436

Start: 645297

End: 647132

Strand: Reverse

Name: pepF2

Synonym: UPA3_0558

Alternate gene names: 170762436

Gene position: 647132-645297 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170761888

Following gene: 170761936

Centisome position: 86.09

GC content: 22.44

Gene sequence:

>1836_bases
ATGAATGATATTAATGATAAAAAATATGATTGAGATATAGATTCATTATTAAAAGGCAAGAAACTAGATATTTTGTTCAA
TGAATTTGTTGAATCAAATAATGAATTAATAAAAGCTTTTGAAAAGTGGATTAATAGTTTAAATGATTTTATTAATTTTC
ACGAAGTTTCAGAAAAAAATTTATTAATTAGTAATCGAATTAACAATTATGTTTCAAATAAATTGCAAACAAATTTAATC
GATAATGAAATGCTTGCTTGGTCTCAAAAAATTGAACATGAACAACATCGTGTAGCTAAAATTTTTATTAATTTTGAAAA
TTTAGCAATAAAAAATAAAGATTTAATTAATTCATATTTAAAAAATTCTTCATTAATTAAATACCAATTAGAATATGAAG
AATTATGACGTTACGAAAAACATATTTTAAATGAACAACAACAAAAAGTTGTTACAGCTATTAGCCGTTTTAGTTCAAGT
TTTGGTGATATTTTTGATGTTTTATTAGATTCAGATATGCAGTATCAGGATGGTATAAACTATAAAAAACAAAAAGTTTG
TTTTAAAAATCAAACTGATCTTTATGTTGCATCTAAATCAAATGATCGTGCTTTACGAAAATCAGCTTATGAATCTCATT
TTAAAGCGATATATGATTTACGTAATACTTTTAGTAAATTATTATATTATGAATATGTTAAACAAAACGAGTTAGCAAAA
TTACATAATTTTAAGGATTATATTTCTGCGGATGCTTTTAGTGATAAGGTTGATAAAAATTTTATAAATCATATTTATAC
ACAAACAAAAAAATTTGCTAAAGGAATTAATAGATATACAAAATATCGAACATTATTTCTAAAACAACAATATCAATTAA
CTAAAGTTGAACCATGAGATAAAAATTTAGATATAATTGATAAAAAAAACATGTTTAGTATTGAATCTGCTAAAAACTTA
ACTTTAGAAGCTTTGGCATTATTAGGTAGTGAATATATAAATGTTGTACAAAGAGCGTTCAATGAGCAATGAATATCATG
AATGCCAAATAATAATAAAATTTCTGGAGCATATTCTATAAGTAACACTAAAGGCTTAGATAAAATTTTTATTTTAATGA
ATTATGATGAAACTTATAATTCTATTTTAACATTAGTTCATGAATTAGGGCATTCTGTACACACTTATTTTGCTAATCAA
TCACAAGAAGTATATAATGAATATGAAACCTTTTATGCAGAAATTGCTTCCATTACTAATGAGATCTTAATGAATTACCA
TTTATTAAAGAAATACGAAAATGATGATTTAATGCGTCTTTATATTTTAGATGAAATGATTAGTGGTTTTATTGCTACAA
CTACACGCCAAGCGATTTTTTCAAATTTTGAGTGAGTTGCCAATGAATGAATTAATCAAGGTGAAGAATTTAGCTGAAAT
AAAATAGTTTTAGCTTATCTAGAAATAAATCATGATTATACAGGATATAAATATAATAAAAACAAAATCAGTAAATATGA
TGAAGCAAACGCTTTAATTTTAATTAACATTCCACATTTTTATACTGGTAATTTTTATGTATATAAATATGTTATTGGAC
AAATTTGTGGATTAATTAATGCGATAAGAATTTTCAATAATAAAGCAAACGCTAAAGAAAAATATTTCTGTTTTTTTAAA
TCTGGAGGGAGTTTGTCTCCTCTTGAAACAATTAATATTTTAGATATAAAAATTAATGAGAACGATGTTTGAGAAGAAGT
TAATATAATTTTTAATAGTTGAATCGATGATTATATAAAAATAATTAAAAAATTTTTAATAAATAAAAAAATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTAATAATTTTAAAAAAACAAAAAACAAAAAATGACTAAGTCTTTTAGTAAACTTGGTCATTTTTTTCTATAACTCTA
TAAAAGGAAATTTAGTTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTAGTATATTTTATGATATAATCTATATGGTGTTTTTATATAAAAGGGGGAGATTTAATTTGGAAGAACAGAAACAA
ATGAAAGTTATTAAAAAATC

Product: oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 611; Mature: 611

Protein sequence:

>611_residues
MNDINDKKYDWDIDSLLKGKKLDILFNEFVESNNELIKAFEKWINSLNDFINFHEVSEKNLLISNRINNYVSNKLQTNLI
DNEMLAWSQKIEHEQHRVAKIFINFENLAIKNKDLINSYLKNSSLIKYQLEYEELWRYEKHILNEQQQKVVTAISRFSSS
FGDIFDVLLDSDMQYQDGINYKKQKVCFKNQTDLYVASKSNDRALRKSAYESHFKAIYDLRNTFSKLLYYEYVKQNELAK
LHNFKDYISADAFSDKVDKNFINHIYTQTKKFAKGINRYTKYRTLFLKQQYQLTKVEPWDKNLDIIDKKNMFSIESAKNL
TLEALALLGSEYINVVQRAFNEQWISWMPNNNKISGAYSISNTKGLDKIFILMNYDETYNSILTLVHELGHSVHTYFANQ
SQEVYNEYETFYAEIASITNEILMNYHLLKKYENDDLMRLYILDEMISGFIATTTRQAIFSNFEWVANEWINQGEEFSWN
KIVLAYLEINHDYTGYKYNKNKISKYDEANALILINIPHFYTGNFYVYKYVIGQICGLINAIRIFNNKANAKEKYFCFFK
SGGSLSPLETINILDIKINENDVWEEVNIIFNSWIDDYIKIIKKFLINKKI

Sequences:

>Translated_611_residues
MNDINDKKYD*DIDSLLKGKKLDILFNEFVESNNELIKAFEKWINSLNDFINFHEVSEKNLLISNRINNYVSNKLQTNLI
DNEMLAWSQKIEHEQHRVAKIFINFENLAIKNKDLINSYLKNSSLIKYQLEYEEL*RYEKHILNEQQQKVVTAISRFSSS
FGDIFDVLLDSDMQYQDGINYKKQKVCFKNQTDLYVASKSNDRALRKSAYESHFKAIYDLRNTFSKLLYYEYVKQNELAK
LHNFKDYISADAFSDKVDKNFINHIYTQTKKFAKGINRYTKYRTLFLKQQYQLTKVEP*DKNLDIIDKKNMFSIESAKNL
TLEALALLGSEYINVVQRAFNEQ*IS*MPNNNKISGAYSISNTKGLDKIFILMNYDETYNSILTLVHELGHSVHTYFANQ
SQEVYNEYETFYAEIASITNEILMNYHLLKKYENDDLMRLYILDEMISGFIATTTRQAIFSNFE*VANE*INQGEEFS*N
KIVLAYLEINHDYTGYKYNKNKISKYDEANALILINIPHFYTGNFYVYKYVIGQICGLINAIRIFNNKANAKEKYFCFFK
SGGSLSPLETINILDIKINENDV*EEVNIIFNS*IDDYIKIIKKFLINKKI
>Mature_611_residues
MNDINDKKYD*DIDSLLKGKKLDILFNEFVESNNELIKAFEKWINSLNDFINFHEVSEKNLLISNRINNYVSNKLQTNLI
DNEMLAWSQKIEHEQHRVAKIFINFENLAIKNKDLINSYLKNSSLIKYQLEYEEL*RYEKHILNEQQQKVVTAISRFSSS
FGDIFDVLLDSDMQYQDGINYKKQKVCFKNQTDLYVASKSNDRALRKSAYESHFKAIYDLRNTFSKLLYYEYVKQNELAK
LHNFKDYISADAFSDKVDKNFINHIYTQTKKFAKGINRYTKYRTLFLKQQYQLTKVEP*DKNLDIIDKKNMFSIESAKNL
TLEALALLGSEYINVVQRAFNEQ*IS*MPNNNKISGAYSISNTKGLDKIFILMNYDETYNSILTLVHELGHSVHTYFANQ
SQEVYNEYETFYAEIASITNEILMNYHLLKKYENDDLMRLYILDEMISGFIATTTRQAIFSNFE*VANE*INQGEEFS*N
KIVLAYLEINHDYTGYKYNKNKISKYDEANALILINIPHFYTGNFYVYKYVIGQICGLINAIRIFNNKANAKEKYFCFFK
SGGSLSPLETINILDIKINENDV*EEVNIIFNS*IDDYIKIIKKFLINKKI

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70433; Mature: 70433

Theoretical pI: Translated: 6.85; Mature: 6.85

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNDINDKKYDDIDSLLKGKKLDILFNEFVESNNELIKAFEKWINSLNDFINFHEVSEKNL
CCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
LISNRINNYVSNKLQTNLIDNEMLAWSQKIEHEQHRVAKIFINFENLAIKNKDLINSYLK
EHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEEEHHHEECCHHHHHHHHC
NSSLIKYQLEYEELRYEKHILNEQQQKVVTAISRFSSSFGDIFDVLLDSDMQYQDGINYK
CCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCC
KQKVCFKNQTDLYVASKSNDRALRKSAYESHFKAIYDLRNTFSKLLYYEYVKQNELAKLH
HHHHHCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFKDYISADAFSDKVDKNFINHIYTQTKKFAKGINRYTKYRTLFLKQQYQLTKVEPDKNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCC
DIIDKKNMFSIESAKNLTLEALALLGSEYINVVQRAFNEQISMPNNNKISGAYSISNTKG
CEECCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCC
LDKIFILMNYDETYNSILTLVHELGHSVHTYFANQSQEVYNEYETFYAEIASITNEILMN
CCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YHLLKKYENDDLMRLYILDEMISGFIATTTRQAIFSNFEVANEINQGEEFSNKIVLAYLE
HHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCEEEEEEE
INHDYTGYKYNKNKISKYDEANALILINIPHFYTGNFYVYKYVIGQICGLINAIRIFNNK
ECCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ANAKEKYFCFFKSGGSLSPLETINILDIKINENDVEEVNIIFNSIDDYIKIIKKFLINKK
CCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
I
C
>Mature Secondary Structure
MNDINDKKYDDIDSLLKGKKLDILFNEFVESNNELIKAFEKWINSLNDFINFHEVSEKNL
CCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
LISNRINNYVSNKLQTNLIDNEMLAWSQKIEHEQHRVAKIFINFENLAIKNKDLINSYLK
EHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEEEHHHEECCHHHHHHHHC
NSSLIKYQLEYEELRYEKHILNEQQQKVVTAISRFSSSFGDIFDVLLDSDMQYQDGINYK
CCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCC
KQKVCFKNQTDLYVASKSNDRALRKSAYESHFKAIYDLRNTFSKLLYYEYVKQNELAKLH
HHHHHCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFKDYISADAFSDKVDKNFINHIYTQTKKFAKGINRYTKYRTLFLKQQYQLTKVEPDKNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCC
DIIDKKNMFSIESAKNLTLEALALLGSEYINVVQRAFNEQISMPNNNKISGAYSISNTKG
CEECCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCC
LDKIFILMNYDETYNSILTLVHELGHSVHTYFANQSQEVYNEYETFYAEIASITNEILMN
CCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YHLLKKYENDDLMRLYILDEMISGFIATTTRQAIFSNFEVANEINQGEEFSNKIVLAYLE
HHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCEEEEEEE
INHDYTGYKYNKNKISKYDEANALILINIPHFYTGNFYVYKYVIGQICGLINAIRIFNNK
ECCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ANAKEKYFCFFKSGGSLSPLETINILDIKINENDVEEVNIIFNSIDDYIKIIKKFLINKK
CCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
I
C

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8604303; 8948633 [H]