| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010503 |
| Length | 751,679 |
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The map label for this gene is 170761936
Identifier: 170761936
GI number: 170761936
Start: 643432
End: 645234
Strand: Reverse
Name: 170761936
Synonym: UPA3_0557
Alternate gene names: NA
Gene position: 645234-643432 (Counterclockwise)
Preceding gene: 170762436
Following gene: 170761969
Centisome position: 85.84
GC content: 25.96
Gene sequence:
>1803_bases TTGGAAGAACAGAAACAAATGAAAGTTATTAAAAAATCCGATTCTTATTTTAAAAAAAATCTTACCGTTTTTAGAACACT TTTAGAACTTTTAAAAGAAAGCTCGCCATTTATCGCTGCAAGTGTTTTTACAGGACTATCATTAATTTTAATTGTTGTAA TTGTTGCTCATCATAAAGATATTGGTGCTTATGCAGCAACTAGTATTAGTTATTTAACTATCTTTCAGTTAAGTTTTTTA CAATTAGGAACAACCTTTGGCATTGTTTTTGCGATTTGGTCAAAAAGATCATTTAAAGATGGTAAGTATAAGTTTGAACC TACAAATGATACAGTAAATGCTGCTAGTTTTTATTCATTTATCTTTGGTTTAGTAGTTTTATTAATTTATTTTACAACCT CTTACATTTATAATCATTTTGCAAATGATCACCAAAATACAGTGATTAATCAAAGTGTAGGTAGTGCATATATTGTTTCA GGATTAGCAGTTGTTGGTTTAGCACCTTTGCGAAACTATTTATTGATGTTAATAAGATCAACCAAGTCCATTAATGTTTT ATTAGCAATTGTTTTAGATTTTTGTACATGAACAACCGCATTAATTGCAGCTTTTTTATTAGGTAGTTATAGTGTTTTAA ATTATTGGGGCTATGGCCTTGGTATGTCAATTGGTTTTGTTTTTTGAACTATTATTATTGGTATGACTACAATTGAAAAA GCCCAAATTGTTTTACGTCCATTATATATTTCAAAAAGATTATTTGTTTTAAGTATTAAATTATTATGAATTCAAACGAT TTTATCATCATTAAAATCAGTTGGTAAAATGTTTATTTTGTTAATTACATTTGTGGTAATTAACTCACGTGTAGTTGGTT CATCATTATTAGATTTTCAATCAACGAGAATTCTAATGTACCAATCAATGATTTTCATACAAATGTTAAATTTAGGATTG TCAGATTTTTTATTTTATTTATATCAAAAACAAGAAGTCAGAGACTGTCGTTATCATTCAAGACAATTATTTTTTTGAGT TTTTATATTAGGTATTTTATTTGCTTTAATTACTTCAGTTATTTTTGGTTTTTCTGTAAAACAATTAGTCCAATTGTATA CAAGTGAACAAAGTCCATCTTATATATTTTTAGAAAAGCAAGTTCCCGAACATTTCTATCAATCTTTAAGAAAAATTTTA ATTAATGATGAAAAATTATTAGATATTATTACTAGTCATGTGAATATTGGTCGCCAAGAAGTTGTTAATGCTTTATCATC AAATGATAAAAATATTTGATTACCAATGGCGCAAAAAGTGATTGATCCAATATGAAAACTAGGTGATAAATTTGAAACGA TATATCAAATGAAAAATCCTTTTACACATCGATTTGTTGATATTTCAGCTTCAAATATTTATAGTTATTTAATTAAAAAT AATGCTTATATTTTATTATCATTCTTTTGTACATTCTTTTCTTTTTCTTCTATTTTAAGTCGTTATGTAGGATTAATTGC CCGACGACAACGTCCTCCATATGTAATGATTGTTATTCAATTAGTTATGGTTGCGTTTACTTCTGGATTTGGGTTAACAC ACCAATCAGATCCACATTTCATTGGTTTAATGGCTTGATCATTTCCTTTATTTATATCAAGTATTTTTATTTTAGGATAT AGCACTTATAAAATTTTACGTATTTATCGTAAATATTTAAAGAATCATAAGTACAATGATGAAAAATTATCAATTATGCC TAAAAAACAATTAGAACAACAAATTAAGGTTCGTCAAAATTAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TATTATTTAATATCCACATATTAAATAATATTTTTATATTAATGGTATAATTTTTAAATGTATTACTTATTTTGAAAAGG AGAAAATTATGACATCATCG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 600; Mature: 600
Protein sequence:
>600_residues MEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSISYLTIFQLSFL QLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVS GLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCTWTTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVFWTIIIGMTTIEK AQIVLRPLYISKRLFVLSIKLLWIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQSMIFIQMLNLGL SDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFWVFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKIL INDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNIWLPMAQKVIDPIWKLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYSYLIKN NAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMAWSFPLFISSIFILGY STYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN
Sequences:
>Translated_600_residues MEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSISYLTIFQLSFL QLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVS GLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCT*TTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVF*TIIIGMTTIEK AQIVLRPLYISKRLFVLSIKLL*IQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQSMIFIQMLNLGL SDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFF*VFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKIL INDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNI*LPMAQKVIDPI*KLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYSYLIKN NAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMA*SFPLFISSIFILGY STYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN >Mature_600_residues MEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSISYLTIFQLSFL QLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVS GLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCT*TTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVF*TIIIGMTTIEK AQIVLRPLYISKRLFVLSIKLL*IQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQSMIFIQMLNLGL SDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFF*VFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKIL INDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNI*LPMAQKVIDPI*KLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYSYLIKN NAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMA*SFPLFISSIFILGY STYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 67745; Mature: 67745
Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKD CCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC IGAYAATSISYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHH IFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVSGLAVVGLAPLRNYLLMLIRS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TKSINVLLAIVLDFCTTTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVFTIIIGMTTIEKAQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVLRPLYISKRLFVLSIKLLIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH ILMYQSMIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFVFILGILFALITSVIFGF HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKILINDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNA CHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH LSSNDKNILPMAQKVIDPIKLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYSYLIKNNAYILL HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHEEECHHHHHHHHHHHCCCHHHH SFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHH FPLFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKD CCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC IGAYAATSISYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHH IFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVSGLAVVGLAPLRNYLLMLIRS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TKSINVLLAIVLDFCTTTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVFTIIIGMTTIEKAQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVLRPLYISKRLFVLSIKLLIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH ILMYQSMIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFVFILGILFALITSVIFGF HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKILINDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNA CHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH LSSNDKNILPMAQKVIDPIKLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYSYLIKNNAYILL HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHEEECHHHHHHHHHHHCCCHHHH SFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHH FPLFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA