Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome.
Accession NC_010503
Length 751,679

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The map label for this gene is 170761936

Identifier: 170761936

GI number: 170761936

Start: 643432

End: 645234

Strand: Reverse

Name: 170761936

Synonym: UPA3_0557

Alternate gene names: NA

Gene position: 645234-643432 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170762436

Following gene: 170761969

Centisome position: 85.84

GC content: 25.96

Gene sequence:

>1803_bases
TTGGAAGAACAGAAACAAATGAAAGTTATTAAAAAATCCGATTCTTATTTTAAAAAAAATCTTACCGTTTTTAGAACACT
TTTAGAACTTTTAAAAGAAAGCTCGCCATTTATCGCTGCAAGTGTTTTTACAGGACTATCATTAATTTTAATTGTTGTAA
TTGTTGCTCATCATAAAGATATTGGTGCTTATGCAGCAACTAGTATTAGTTATTTAACTATCTTTCAGTTAAGTTTTTTA
CAATTAGGAACAACCTTTGGCATTGTTTTTGCGATTTGGTCAAAAAGATCATTTAAAGATGGTAAGTATAAGTTTGAACC
TACAAATGATACAGTAAATGCTGCTAGTTTTTATTCATTTATCTTTGGTTTAGTAGTTTTATTAATTTATTTTACAACCT
CTTACATTTATAATCATTTTGCAAATGATCACCAAAATACAGTGATTAATCAAAGTGTAGGTAGTGCATATATTGTTTCA
GGATTAGCAGTTGTTGGTTTAGCACCTTTGCGAAACTATTTATTGATGTTAATAAGATCAACCAAGTCCATTAATGTTTT
ATTAGCAATTGTTTTAGATTTTTGTACATGAACAACCGCATTAATTGCAGCTTTTTTATTAGGTAGTTATAGTGTTTTAA
ATTATTGGGGCTATGGCCTTGGTATGTCAATTGGTTTTGTTTTTTGAACTATTATTATTGGTATGACTACAATTGAAAAA
GCCCAAATTGTTTTACGTCCATTATATATTTCAAAAAGATTATTTGTTTTAAGTATTAAATTATTATGAATTCAAACGAT
TTTATCATCATTAAAATCAGTTGGTAAAATGTTTATTTTGTTAATTACATTTGTGGTAATTAACTCACGTGTAGTTGGTT
CATCATTATTAGATTTTCAATCAACGAGAATTCTAATGTACCAATCAATGATTTTCATACAAATGTTAAATTTAGGATTG
TCAGATTTTTTATTTTATTTATATCAAAAACAAGAAGTCAGAGACTGTCGTTATCATTCAAGACAATTATTTTTTTGAGT
TTTTATATTAGGTATTTTATTTGCTTTAATTACTTCAGTTATTTTTGGTTTTTCTGTAAAACAATTAGTCCAATTGTATA
CAAGTGAACAAAGTCCATCTTATATATTTTTAGAAAAGCAAGTTCCCGAACATTTCTATCAATCTTTAAGAAAAATTTTA
ATTAATGATGAAAAATTATTAGATATTATTACTAGTCATGTGAATATTGGTCGCCAAGAAGTTGTTAATGCTTTATCATC
AAATGATAAAAATATTTGATTACCAATGGCGCAAAAAGTGATTGATCCAATATGAAAACTAGGTGATAAATTTGAAACGA
TATATCAAATGAAAAATCCTTTTACACATCGATTTGTTGATATTTCAGCTTCAAATATTTATAGTTATTTAATTAAAAAT
AATGCTTATATTTTATTATCATTCTTTTGTACATTCTTTTCTTTTTCTTCTATTTTAAGTCGTTATGTAGGATTAATTGC
CCGACGACAACGTCCTCCATATGTAATGATTGTTATTCAATTAGTTATGGTTGCGTTTACTTCTGGATTTGGGTTAACAC
ACCAATCAGATCCACATTTCATTGGTTTAATGGCTTGATCATTTCCTTTATTTATATCAAGTATTTTTATTTTAGGATAT
AGCACTTATAAAATTTTACGTATTTATCGTAAATATTTAAAGAATCATAAGTACAATGATGAAAAATTATCAATTATGCC
TAAAAAACAATTAGAACAACAAATTAAGGTTCGTCAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATAATTAAAAAATTTTTAATAAATAAAAAAATATAATTTTTAGTATATTTTATGATATAATCTATATGGTGTTTTTAT
ATAAAAGGGGGAGATTTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTATTTAATATCCACATATTAAATAATATTTTTATATTAATGGTATAATTTTTAAATGTATTACTTATTTTGAAAAGG
AGAAAATTATGACATCATCG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 600; Mature: 600

Protein sequence:

>600_residues
MEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSISYLTIFQLSFL
QLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVS
GLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCTWTTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVFWTIIIGMTTIEK
AQIVLRPLYISKRLFVLSIKLLWIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQSMIFIQMLNLGL
SDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFWVFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKIL
INDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNIWLPMAQKVIDPIWKLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYSYLIKN
NAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMAWSFPLFISSIFILGY
STYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN

Sequences:

>Translated_600_residues
MEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSISYLTIFQLSFL
QLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVS
GLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCT*TTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVF*TIIIGMTTIEK
AQIVLRPLYISKRLFVLSIKLL*IQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQSMIFIQMLNLGL
SDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFF*VFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKIL
INDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNI*LPMAQKVIDPI*KLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYSYLIKN
NAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMA*SFPLFISSIFILGY
STYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN
>Mature_600_residues
MEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSISYLTIFQLSFL
QLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVS
GLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCT*TTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVF*TIIIGMTTIEK
AQIVLRPLYISKRLFVLSIKLL*IQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQSMIFIQMLNLGL
SDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFF*VFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKIL
INDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNI*LPMAQKVIDPI*KLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYSYLIKN
NAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMA*SFPLFISSIFILGY
STYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67745; Mature: 67745

Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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ILMYQSMIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFVFILGILFALITSVIFGF
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SFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHH
FPLFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA