| Definition | Escherichia coli SMS-3-5 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010498 |
| Length | 5,068,389 |
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The map label for this gene is 170682597
Identifier: 170682597
GI number: 170682597
Start: 311216
End: 314491
Strand: Reverse
Name: 170682597
Synonym: EcSMS35_0303
Alternate gene names: NA
Gene position: 314491-311216 (Counterclockwise)
Preceding gene: 170684180
Following gene: 170680899
Centisome position: 6.2
GC content: 30.46
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAATTCTTCTTGTTGAGGATATTGAATATAAGCGTGATAAGGTGATCGGTTTACTAGAGTCTATTTCTGCCGATGTATCA GTCGATGTAGCTAAATCTTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1091; Mature: 1091
Protein sequence:
>1091_residues MKKNSLNVILDTVFSAKSINGEKSHSFISYKLVKAVENLSGYDLDLFLNRAINHPNFPSNMDFSLRTVFTIEQSNTIEFK NFISELVWYKHIFIRYKKHLNDILSAKARLEKLVLFATGSECIKYLDEIESSYGVSFWSIDARLLINKVLLNESNGLYVK SILSKTHYKLTEFMLQQLLFKHQVHNFDDFSKNLIKILDDMRTTQDNGYARNLADGISSFLIPLEFDKNIDLKNRTLAPF TNLPLIDQFIIFQRTISDLQLHGNGLRNSELSLIAEINSFIKNNYLNNILDGRERNIENIDEHYKSVIRRYTIGDYTGCI SEINSVRTQKTILPLIEIYAKSHVYLDKKISDSCIFNKLTNWLIAIIKCDRRAGKYIDEFELLASKIYFNSNSSSLFFTL YNLISDNHNKLNISRINLTKNGSFVTSLHLNITIKELWTELGIKENEIPKYRLFKFKDLANLSFDEIKKHYEVYNDNVII RSEYLKDYTNFLLENEKYELCIQFIAENCIGNPANYYYFPIRKIIDFVKDNIFDYASVALSILIDIFVKSTSNTSNELLL ESYESLVDISNINRPSTHYCSKQLTPLEHYFLKFICIPSVMDSDPSFTGTDDLKKERIAIIDLLLKEHDDADLLKEKDEI IDEISFEEIKTKYETGKIFVDIENLKRAKLERYRYYFDALKDSLILGLEPPEDFALITDDGNITAIPSGDTNSIIHELLK ELISDFVKNENYGLDKYLSADIRHGVFENQLRSSAEKSQLITDMDGTGQYSKSNLIIETYPLINPIINNEIGTAIADFSY HFDIELAKANSWFNVKTMLISESQQGMIDFLISVDMFNSFKAAVSNQASFEKFFDACINFMWERTFRCLNDIKERLHYEF KRNILDLIATLRHQIDIYRRRSSMREIQEKIDLLAESINKEIATVCDWLNVLEYNEEKIYKISSVMQACRKTFFNIHHCS DDAIVFDSMYHDDEPKLSYKEAKPLITSIITALNNAMAYGNKKIFISIKPEEKSWKITIRNLIIETKNRTTNQILQEIDD KIKRGDNSLNIKEGGAGIYKIYDLLCSLPQRFNVNHCIQNNEFILNIEIKK
Sequences:
>Translated_1091_residues MKKNSLNVILDTVFSAKSINGEKSHSFISYKLVKAVENLSGYDLDLFLNRAINHPNFPSNMDFSLRTVFTIEQSNTIEFK NFISELVWYKHIFIRYKKHLNDILSAKARLEKLVLFATGSECIKYLDEIESSYGVSFWSIDARLLINKVLLNESNGLYVK SILSKTHYKLTEFMLQQLLFKHQVHNFDDFSKNLIKILDDMRTTQDNGYARNLADGISSFLIPLEFDKNIDLKNRTLAPF TNLPLIDQFIIFQRTISDLQLHGNGLRNSELSLIAEINSFIKNNYLNNILDGRERNIENIDEHYKSVIRRYTIGDYTGCI SEINSVRTQKTILPLIEIYAKSHVYLDKKISDSCIFNKLTNWLIAIIKCDRRAGKYIDEFELLASKIYFNSNSSSLFFTL YNLISDNHNKLNISRINLTKNGSFVTSLHLNITIKELWTELGIKENEIPKYRLFKFKDLANLSFDEIKKHYEVYNDNVII RSEYLKDYTNFLLENEKYELCIQFIAENCIGNPANYYYFPIRKIIDFVKDNIFDYASVALSILIDIFVKSTSNTSNELLL ESYESLVDISNINRPSTHYCSKQLTPLEHYFLKFICIPSVMDSDPSFTGTDDLKKERIAIIDLLLKEHDDADLLKEKDEI IDEISFEEIKTKYETGKIFVDIENLKRAKLERYRYYFDALKDSLILGLEPPEDFALITDDGNITAIPSGDTNSIIHELLK ELISDFVKNENYGLDKYLSADIRHGVFENQLRSSAEKSQLITDMDGTGQYSKSNLIIETYPLINPIINNEIGTAIADFSY HFDIELAKANSWFNVKTMLISESQQGMIDFLISVDMFNSFKAAVSNQASFEKFFDACINFMWERTFRCLNDIKERLHYEF KRNILDLIATLRHQIDIYRRRSSMREIQEKIDLLAESINKEIATVCDWLNVLEYNEEKIYKISSVMQACRKTFFNIHHCS DDAIVFDSMYHDDEPKLSYKEAKPLITSIITALNNAMAYGNKKIFISIKPEEKSWKITIRNLIIETKNRTTNQILQEIDD KIKRGDNSLNIKEGGAGIYKIYDLLCSLPQRFNVNHCIQNNEFILNIEIKK >Mature_1091_residues MKKNSLNVILDTVFSAKSINGEKSHSFISYKLVKAVENLSGYDLDLFLNRAINHPNFPSNMDFSLRTVFTIEQSNTIEFK NFISELVWYKHIFIRYKKHLNDILSAKARLEKLVLFATGSECIKYLDEIESSYGVSFWSIDARLLINKVLLNESNGLYVK SILSKTHYKLTEFMLQQLLFKHQVHNFDDFSKNLIKILDDMRTTQDNGYARNLADGISSFLIPLEFDKNIDLKNRTLAPF TNLPLIDQFIIFQRTISDLQLHGNGLRNSELSLIAEINSFIKNNYLNNILDGRERNIENIDEHYKSVIRRYTIGDYTGCI SEINSVRTQKTILPLIEIYAKSHVYLDKKISDSCIFNKLTNWLIAIIKCDRRAGKYIDEFELLASKIYFNSNSSSLFFTL YNLISDNHNKLNISRINLTKNGSFVTSLHLNITIKELWTELGIKENEIPKYRLFKFKDLANLSFDEIKKHYEVYNDNVII RSEYLKDYTNFLLENEKYELCIQFIAENCIGNPANYYYFPIRKIIDFVKDNIFDYASVALSILIDIFVKSTSNTSNELLL ESYESLVDISNINRPSTHYCSKQLTPLEHYFLKFICIPSVMDSDPSFTGTDDLKKERIAIIDLLLKEHDDADLLKEKDEI IDEISFEEIKTKYETGKIFVDIENLKRAKLERYRYYFDALKDSLILGLEPPEDFALITDDGNITAIPSGDTNSIIHELLK ELISDFVKNENYGLDKYLSADIRHGVFENQLRSSAEKSQLITDMDGTGQYSKSNLIIETYPLINPIINNEIGTAIADFSY HFDIELAKANSWFNVKTMLISESQQGMIDFLISVDMFNSFKAAVSNQASFEKFFDACINFMWERTFRCLNDIKERLHYEF KRNILDLIATLRHQIDIYRRRSSMREIQEKIDLLAESINKEIATVCDWLNVLEYNEEKIYKISSVMQACRKTFFNIHHCS DDAIVFDSMYHDDEPKLSYKEAKPLITSIITALNNAMAYGNKKIFISIKPEEKSWKITIRNLIIETKNRTTNQILQEIDD KIKRGDNSLNIKEGGAGIYKIYDLLCSLPQRFNVNHCIQNNEFILNIEIKK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 126874; Mature: 126874
Theoretical pI: Translated: 6.03; Mature: 6.03
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKNSLNVILDTVFSAKSINGEKSHSFISYKLVKAVENLSGYDLDLFLNRAINHPNFPSN CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCC MDFSLRTVFTIEQSNTIEFKNFISELVWYKHIFIRYKKHLNDILSAKARLEKLVLFATGS CCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCH ECIKYLDEIESSYGVSFWSIDARLLINKVLLNESNGLYVKSILSKTHYKLTEFMLQQLLF HHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHQVHNFDDFSKNLIKILDDMRTTQDNGYARNLADGISSFLIPLEFDKNIDLKNRTLAPF HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCCCCCCCCCCC TNLPLIDQFIIFQRTISDLQLHGNGLRNSELSLIAEINSFIKNNYLNNILDGRERNIENI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH DEHYKSVIRRYTIGDYTGCISEINSVRTQKTILPLIEIYAKSHVYLDKKISDSCIFNKLT HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHH NWLIAIIKCDRRAGKYIDEFELLASKIYFNSNSSSLFFTLYNLISDNHNKLNISRINLTK HHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEC NGSFVTSLHLNITIKELWTELGIKENEIPKYRLFKFKDLANLSFDEIKKHYEVYNDNVII CCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEE RSEYLKDYTNFLLENEKYELCIQFIAENCIGNPANYYYFPIRKIIDFVKDNIFDYASVAL EHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SILIDIFVKSTSNTSNELLLESYESLVDISNINRPSTHYCSKQLTPLEHYFLKFICIPSV HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCHH MDSDPSFTGTDDLKKERIAIIDLLLKEHDDADLLKEKDEIIDEISFEEIKTKYETGKIFV CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEE DIENLKRAKLERYRYYFDALKDSLILGLEPPEDFALITDDGNITAIPSGDTNSIIHELLK EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCHHHHHHHHHH ELISDFVKNENYGLDKYLSADIRHGVFENQLRSSAEKSQLITDMDGTGQYSKSNLIIETY HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEC PLINPIINNEIGTAIADFSYHFDIELAKANSWFNVKTMLISESQQGMIDFLISVDMFNSF CHHHHHHCCCHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH KAAVSNQASFEKFFDACINFMWERTFRCLNDIKERLHYEFKRNILDLIATLRHQIDIYRR HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSSMREIQEKIDLLAESINKEIATVCDWLNVLEYNEEKIYKISSVMQACRKTFFNIHHCS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECC DDAIVFDSMYHDDEPKLSYKEAKPLITSIITALNNAMAYGNKKIFISIKPEEKSWKITIR CCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEE NLIIETKNRTTNQILQEIDDKIKRGDNSLNIKEGGAGIYKIYDLLCSLPQRFNVNHCIQN HHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEECC NEFILNIEIKK CCEEEEEEECC >Mature Secondary Structure MKKNSLNVILDTVFSAKSINGEKSHSFISYKLVKAVENLSGYDLDLFLNRAINHPNFPSN CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCC MDFSLRTVFTIEQSNTIEFKNFISELVWYKHIFIRYKKHLNDILSAKARLEKLVLFATGS CCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCH ECIKYLDEIESSYGVSFWSIDARLLINKVLLNESNGLYVKSILSKTHYKLTEFMLQQLLF HHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHQVHNFDDFSKNLIKILDDMRTTQDNGYARNLADGISSFLIPLEFDKNIDLKNRTLAPF HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCCCCCCCCCCC TNLPLIDQFIIFQRTISDLQLHGNGLRNSELSLIAEINSFIKNNYLNNILDGRERNIENI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH DEHYKSVIRRYTIGDYTGCISEINSVRTQKTILPLIEIYAKSHVYLDKKISDSCIFNKLT HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHH NWLIAIIKCDRRAGKYIDEFELLASKIYFNSNSSSLFFTLYNLISDNHNKLNISRINLTK HHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEC NGSFVTSLHLNITIKELWTELGIKENEIPKYRLFKFKDLANLSFDEIKKHYEVYNDNVII CCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEE RSEYLKDYTNFLLENEKYELCIQFIAENCIGNPANYYYFPIRKIIDFVKDNIFDYASVAL EHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SILIDIFVKSTSNTSNELLLESYESLVDISNINRPSTHYCSKQLTPLEHYFLKFICIPSV HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCHH MDSDPSFTGTDDLKKERIAIIDLLLKEHDDADLLKEKDEIIDEISFEEIKTKYETGKIFV CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEE DIENLKRAKLERYRYYFDALKDSLILGLEPPEDFALITDDGNITAIPSGDTNSIIHELLK EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCHHHHHHHHHH ELISDFVKNENYGLDKYLSADIRHGVFENQLRSSAEKSQLITDMDGTGQYSKSNLIIETY HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEC PLINPIINNEIGTAIADFSYHFDIELAKANSWFNVKTMLISESQQGMIDFLISVDMFNSF CHHHHHHCCCHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH KAAVSNQASFEKFFDACINFMWERTFRCLNDIKERLHYEFKRNILDLIATLRHQIDIYRR HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSSMREIQEKIDLLAESINKEIATVCDWLNVLEYNEEKIYKISSVMQACRKTFFNIHHCS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECC DDAIVFDSMYHDDEPKLSYKEAKPLITSIITALNNAMAYGNKKIFISIKPEEKSWKITIR CCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEE NLIIETKNRTTNQILQEIDDKIKRGDNSLNIKEGGAGIYKIYDLLCSLPQRFNVNHCIQN HHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEECC NEFILNIEIKK CCEEEEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9163424 [H]