Definition Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome, complete genome.
Accession NC_010334
Length 5,226,917

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The map label for this gene is 167622506

Identifier: 167622506

GI number: 167622506

Start: 679313

End: 682120

Strand: Direct

Name: 167622506

Synonym: Shal_0566

Alternate gene names: NA

Gene position: 679313-682120 (Clockwise)

Preceding gene: 167622504

Following gene: 167622507

Centisome position: 13.0

GC content: 48.72

Gene sequence:

>2808_bases
ATGGCCCAGTTTGATAAGTATGTTTCCATCGTTGTCGATCCAAGTTCTGCAGAGAGTATTGCCAATGCACTGGCCGAGTA
TCGCCAGCGCCTAGAGAACGGTTCGGCGTTTCGCTTAACCATGAACCTGTTACTCAATGTGCAGTTTATTAAGCCTGACG
GCAGCGCTTTGACTTTGGACGATGCTGGGAGTAACCACGCTTTGGTAGAGCAGGCCATTAATGCCTGTCGCGATGAACAG
AAGTTGAGCTATATCAGCGAGCCTGTGTTGTTTGGTGCTGCGTTAAACTTCTCCGAGTTGATACCTGCGGTGGTTGAAAC
GATTGAAGCTTTGGTGGCGTTTGCTCGTAGCCGTAACGATTCTAACGATCTCTGGATAGATGACTGCAACGCGCTCGGTA
TCGAAGCCTTGTATATGCTGATAGAAAGCGATGCTTCTTATAGCCCGCTGCTAGGTCGCTTCCTTGTGCCTTACTGGGAT
ACCCAGACCATGACTGCACCGCTGTGCTTGCTTAGCAATTTAGTTAACAAGCATGGCTGGAGCCGTGATTTGATCAAGGC
TTATGTGTGGTGCGATGGGGCTGAGGTGCGCCGCTACTTCTATGAAAGCGACTCTTTTGAAGATGAGGGTTATAACGCGG
CGCAGCCAGACTTGTTAGCGCACCTACAATCTCACCCTGACGATTACAGCTATTTTAAACATGAGCTATTAGCGCGATTG
CAGATCAGCCCTATTTTGGTGTTTGCTGACGAGTCGACCTCTCTAGCAGAGATGTTGTTTGAATATTATGACAGCATGGG
CGTTTGGTCTGTGGGATGCGAGCGCTGGGAGCTAGAAGAACAGCAAGAAGAGTGGCAAGACAGGGTAAAGCAGCAGCTTA
TTTGTGGCGCTAAAGTTGAAGACGAAATCATAGCGTTGGCGGCAACGCTCACTGAAACTCGCAACGAGTCTGAGTATTTC
TCGGTAGCAGAAGCTCAGTTAAATGGGCTTGATAACGCTTATCAGGTTTGGATGGAGCCGGCTGAAGTTGAAGCAGAGGA
AGAAAGTGAACAAGAATCCCTGTCTGAACTAGCACAAGTAGAGCCGATTTTGTGGGATGAAAAAAGCGGCCGTTCATTCT
TTAGCTGTCTCAACCCAAGACTCGAACTGCTGACGCAAAACCGTCTTGAGCGCCTGAGTGATGAGCTTGGTTATCGCGGT
GGTCTAGAGATTGTTGAAGCCTTACCTTATATGCCGCTGCATCTAGGTAGTAGTGCTTATCTTGCACATAGGTTGCTCCA
GCAACCAAGTTTTGCGGAGCGTGATGCGATTGAGCAATGGCTTGAGCTGCACTTGAGTAAGCTACTCACTGATTTTGTCC
TCAAGTATTGCGATGTAGCAGAAGCTGATACTGAGGTGTTACGCCAGTGGCTGACGTATGTAGAAAAGTCTGGTGTTGGC
TCTGATGCTGAAGCTACTCAACAGAACGACGCAGAAATGATCGAGCTGGTGCGCGCTGGCATGGCAAAAGATGGAGGTAA
GTCTGGGCCTGAAATTAGCGCGAAACAGGCGGCTTATTGGACCTTGTTTAACTATGATGGTGGTCAACGCTGCATGTTAA
CCACCTTGTTATTACAAAGCGCGGGTAAACTAAATCAGGGTGAAGGTTCTAGCCCAGTCGTGCAGCTAGCCAAAAGGCAC
TGGCAACTCTGGCTATCGATTGCACCCCAGCGAGTGATAAATCGCATTGTAAAATTTAAGGCCGATTACCCGCTTTATGC
CGCGATTAATGATCAAGATACCGAGACTGCTTTATTCAATTTATTGCATCAACATGGCGTATCTGAAGCCATGCTTGAGG
CTTTTACTCTGATGACAGATCAACAAGTCGCTGATTACCGCCCAGCCGATCCTAGATTTGCCCGCCGCTACACTGACAAA
GTTGCGCAATATGCGGCATTAGATAGTGCAGATACCAGCATGATAGGGCGTCAGCAGCTAAAGCAATTTGAGACGCTATT
ACAGCAACTTGAGTATTGCCGTGAAGATCAGGTTTTGGAATTTTTTCAGCATGTTAAGGCGGTTAACCCTGAGATTGAGT
TACCGATAATGCCGATGTTTGAAGCGGCTTTAATCAATACGCTAAAAGAAGATTTTGACGATGCTACCGCGCAAACTGTG
TATGACAAACTGATGGCCTATCTTGTCAGCGGTGAAGGCTTACAGGAGTTGAGCCCACAGGCGCTGAAATTATCAAAACT
TCAGGGGTGGAACCCCTATCCTATGTATCGCGGCAAAGTGGGGCCTGCCGATTTTGTCTGGCTGCTGCCAAGTGAAATGG
CAGAGCATTTGACGCTGTTTTTAGCACAGTTAGGTAAGCGTGGTCTGCACTGGCTGGGTCGATGCTCTGTGGAGGAGGCC
TATGTGACCTCTAGAATCCAAAGCGGTGAAATCACAATGGCAGAGCGTTGGAGTCACTGCGAGGTCGGCAATGAGCGCCA
TGGAGATTGTGATATGGACAGTGCACTGGATGTGGCTAAACAAAGCTGGGCATTAAATTGGCTCGACAGGGCAGGAGTAC
CGGAAACATCGCTAGTGTACTTTGCCGTACACGAGGGCTACGAACAGCAGGAGTTTGTACTCAGGTTGGCAGCTGAAAAC
CGCTTGCCGGATATGCAAGATAGGCTGACGGCGAATGAACGAGTGCAACTACTCGAGATGCTGCAAGGCGCTGAGTCACT
GACCGACATCACTGCACAGAGCTTCTTGCAGGACTGTTCTAGCGCAGTAAAACAGTTGGCGGGAAAGTTATTTAGTAACC
GCTCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCCCTACGATTTTTATTCGCATTTTATTGTGCACAGAGATAATCTTCGGTCGCTTTATCTATTTGTTTTCTTATTCTAT
TCCACCGCCAAGGATGCCGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGCTGACAGTTCTGGGTGGCTTTATTACAGCTGTTATTATAACAATGCTGTGATTAAGCTGTAATAAAGCCATCCTCTG
CAATCATCTTTAAAAAGGCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 935; Mature: 934

Protein sequence:

>935_residues
MAQFDKYVSIVVDPSSAESIANALAEYRQRLENGSAFRLTMNLLLNVQFIKPDGSALTLDDAGSNHALVEQAINACRDEQ
KLSYISEPVLFGAALNFSELIPAVVETIEALVAFARSRNDSNDLWIDDCNALGIEALYMLIESDASYSPLLGRFLVPYWD
TQTMTAPLCLLSNLVNKHGWSRDLIKAYVWCDGAEVRRYFYESDSFEDEGYNAAQPDLLAHLQSHPDDYSYFKHELLARL
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GLEIVEALPYMPLHLGSSAYLAHRLLQQPSFAERDAIEQWLELHLSKLLTDFVLKYCDVAEADTEVLRQWLTYVEKSGVG
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YDKLMAYLVSGEGLQELSPQALKLSKLQGWNPYPMYRGKVGPADFVWLLPSEMAEHLTLFLAQLGKRGLHWLGRCSVEEA
YVTSRIQSGEITMAERWSHCEVGNERHGDCDMDSALDVAKQSWALNWLDRAGVPETSLVYFAVHEGYEQQEFVLRLAAEN
RLPDMQDRLTANERVQLLEMLQGAESLTDITAQSFLQDCSSAVKQLAGKLFSNRS

Sequences:

>Translated_935_residues
MAQFDKYVSIVVDPSSAESIANALAEYRQRLENGSAFRLTMNLLLNVQFIKPDGSALTLDDAGSNHALVEQAINACRDEQ
KLSYISEPVLFGAALNFSELIPAVVETIEALVAFARSRNDSNDLWIDDCNALGIEALYMLIESDASYSPLLGRFLVPYWD
TQTMTAPLCLLSNLVNKHGWSRDLIKAYVWCDGAEVRRYFYESDSFEDEGYNAAQPDLLAHLQSHPDDYSYFKHELLARL
QISPILVFADESTSLAEMLFEYYDSMGVWSVGCERWELEEQQEEWQDRVKQQLICGAKVEDEIIALAATLTETRNESEYF
SVAEAQLNGLDNAYQVWMEPAEVEAEEESEQESLSELAQVEPILWDEKSGRSFFSCLNPRLELLTQNRLERLSDELGYRG
GLEIVEALPYMPLHLGSSAYLAHRLLQQPSFAERDAIEQWLELHLSKLLTDFVLKYCDVAEADTEVLRQWLTYVEKSGVG
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WQLWLSIAPQRVINRIVKFKADYPLYAAINDQDTETALFNLLHQHGVSEAMLEAFTLMTDQQVADYRPADPRFARRYTDK
VAQYAALDSADTSMIGRQQLKQFETLLQQLEYCREDQVLEFFQHVKAVNPEIELPIMPMFEAALINTLKEDFDDATAQTV
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YVTSRIQSGEITMAERWSHCEVGNERHGDCDMDSALDVAKQSWALNWLDRAGVPETSLVYFAVHEGYEQQEFVLRLAAEN
RLPDMQDRLTANERVQLLEMLQGAESLTDITAQSFLQDCSSAVKQLAGKLFSNRS
>Mature_934_residues
AQFDKYVSIVVDPSSAESIANALAEYRQRLENGSAFRLTMNLLLNVQFIKPDGSALTLDDAGSNHALVEQAINACRDEQK
LSYISEPVLFGAALNFSELIPAVVETIEALVAFARSRNDSNDLWIDDCNALGIEALYMLIESDASYSPLLGRFLVPYWDT
QTMTAPLCLLSNLVNKHGWSRDLIKAYVWCDGAEVRRYFYESDSFEDEGYNAAQPDLLAHLQSHPDDYSYFKHELLARLQ
ISPILVFADESTSLAEMLFEYYDSMGVWSVGCERWELEEQQEEWQDRVKQQLICGAKVEDEIIALAATLTETRNESEYFS
VAEAQLNGLDNAYQVWMEPAEVEAEEESEQESLSELAQVEPILWDEKSGRSFFSCLNPRLELLTQNRLERLSDELGYRGG
LEIVEALPYMPLHLGSSAYLAHRLLQQPSFAERDAIEQWLELHLSKLLTDFVLKYCDVAEADTEVLRQWLTYVEKSGVGS
DAEATQQNDAEMIELVRAGMAKDGGKSGPEISAKQAAYWTLFNYDGGQRCMLTTLLLQSAGKLNQGEGSSPVVQLAKRHW
QLWLSIAPQRVINRIVKFKADYPLYAAINDQDTETALFNLLHQHGVSEAMLEAFTLMTDQQVADYRPADPRFARRYTDKV
AQYAALDSADTSMIGRQQLKQFETLLQQLEYCREDQVLEFFQHVKAVNPEIELPIMPMFEAALINTLKEDFDDATAQTVY
DKLMAYLVSGEGLQELSPQALKLSKLQGWNPYPMYRGKVGPADFVWLLPSEMAEHLTLFLAQLGKRGLHWLGRCSVEEAY
VTSRIQSGEITMAERWSHCEVGNERHGDCDMDSALDVAKQSWALNWLDRAGVPETSLVYFAVHEGYEQQEFVLRLAAENR
LPDMQDRLTANERVQLLEMLQGAESLTDITAQSFLQDCSSAVKQLAGKLFSNRS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 105742; Mature: 105611

Theoretical pI: Translated: 4.28; Mature: 4.28

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAQFDKYVSIVVDPSSAESIANALAEYRQRLENGSAFRLTMNLLLNVQFIKPDGSALTLD
CCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEHEEEEEECCCCCEEEEC
DAGSNHALVEQAINACRDEQKLSYISEPVLFGAALNFSELIPAVVETIEALVAFARSRND
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SNDLWIDDCNALGIEALYMLIESDASYSPLLGRFLVPYWDTQTMTAPLCLLSNLVNKHGW
CCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SRDLIKAYVWCDGAEVRRYFYESDSFEDEGYNAAQPDLLAHLQSHPDDYSYFKHELLARL
CHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
QISPILVFADESTSLAEMLFEYYDSMGVWSVGCERWELEEQQEEWQDRVKQQLICGAKVE
CCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
DEIIALAATLTETRNESEYFSVAEAQLNGLDNAYQVWMEPAEVEAEEESEQESLSELAQV
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EPILWDEKSGRSFFSCLNPRLELLTQNRLERLSDELGYRGGLEIVEALPYMPLHLGSSAY
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEECCCHHH
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SDAEATQQNDAEMIELVRAGMAKDGGKSGPEISAKQAAYWTLFNYDGGQRCMLTTLLLQS
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CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHH
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HHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
QSWALNWLDRAGVPETSLVYFAVHEGYEQQEFVLRLAAENRLPDMQDRLTANERVQLLEM
HHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHH
LQGAESLTDITAQSFLQDCSSAVKQLAGKLFSNRS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
AQFDKYVSIVVDPSSAESIANALAEYRQRLENGSAFRLTMNLLLNVQFIKPDGSALTLD
CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEHEEEEEECCCCCEEEEC
DAGSNHALVEQAINACRDEQKLSYISEPVLFGAALNFSELIPAVVETIEALVAFARSRND
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
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CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEECCCHHH
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CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHH
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HHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
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QSWALNWLDRAGVPETSLVYFAVHEGYEQQEFVLRLAAENRLPDMQDRLTANERVQLLEM
HHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHH
LQGAESLTDITAQSFLQDCSSAVKQLAGKLFSNRS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA