| Definition | Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010320 |
| Length | 2,457,259 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 167040900
Identifier: 167040900
GI number: 167040900
Start: 2294395
End: 2295753
Strand: Reverse
Name: 167040900
Synonym: Teth514_2284
Alternate gene names: NA
Gene position: 2295753-2294395 (Counterclockwise)
Preceding gene: 167040901
Following gene: 167040899
Centisome position: 93.43
GC content: 27.81
Gene sequence:
>1359_bases TTGGCAGATTTTACATTAGTTTTAGTATTTATAACTGTATTTTTTATATTTTTATTAACTTCGCTACTCATATCAAAAAA GATGCTATATAAGATTGCAGTATTAACTTCGGTTTTTCAAATTTATACTTTTTCCCTAATGGGTATTTATCCATCATTAA GTTTTTTGTTTTCACTTACCTTGTGGACATCATTTATAAGGAATTTAAAAAATATATTAGGTTTTAAGCCTATAAGAACC TACGTTTTTCTAATAATTGTTCAGATGCTGAGCATAGTTTGGTCAAGTGATATATACTTAGGTATACGAACGGTTTCTTA TTTATTGCCATTTTTGTTTATATTTTTAACCACATATGAGATTTCAAAAAATAATTCAGAATTGTATTTTATAAAAATAT TGGTAGTATATTCGTTTTTTTTAGTAGTAGAAGCTGTTTTAGTTATACTATTCCGTTTACAGCCCAACCTAGAAACATTA TTTTTAAATTCAAATATAAGTCAAATATTTATTAAACCCAATGTAATAACTCAATTCGGTACAGTAATTCGAAATAATGT TTTAGATCCTACAAAATCAGGCGGATTTTTTTTAAACGCAAATGTGGCAGCAGCTTTTTTAGGAATAAATATGTATGTTT TATATGGAATCTATAAAGCATATAGTAGTAAAGTTTTAAAAAATATATCAATTTTTTTATGGATAGCAATTTTATTCACA GGGTCTAAAATAGGGATAATTTTAGATATATTATTTCCTTTAACTGCCTTTTTGATAGTGAATTTTAAAGTATTTAATAA AGTGACTTATAGCAATTTAGTGAAATTTCTTTTCCTAATAATTATATTAGCCATAGGTATATTCGGGATAGTATCTTATG CTGAAGGTAAATTCTTTATATATGATGCGGAACATACATTCAATGTACGATTAATGATATGGAAGCATGCATGGTTTCAA TTTCAATTGCATCCGATTTTAGGACAAGGATTCGGTGGATGGGAGGCAACATATCCCCAATATGCACAAACAGTTGGTTT ATCACCTTCTTATCCTCCTCATAATACATTGATTTATTTATGGTCGCAGAGCGGTATTTTAGCATTCGTTTTAGGGGTTT TGTTTATTATTGATATTATACTGTTTTTTTGGAATGGATTAAGAAATGATGATAAGCAAGTAAAGATTTTATCACTATAT TTTATGTTTGCGTTTTTATGGCTTTTTATTCAAGGATTTGGTGAGAATTATGGAATAATTGGAGAAGAACATATGCAGCC TATATTGGCAGTAGCTTTGGGATTATTGTATACAAAAACACACTTTTATGAAAATGGGGGACGAAAGAATGAAGCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AACTAATTGTACGAAATCATAATTTAGTATAATTAGGTGGATGTAATCGCAATTAAGGAAAAATTAAACGGACATATGAT AATAGAAGGATGGGATAGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATACTCATATATCGACATCAATTATTTAAACCGTCGGAAGTTTTTATTTTGCAGCAAGCTGAGAGTTTAAAAGAGTTTA ATCCAATATATGTTGGGAGA
Product: O-antigen polymerase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 452; Mature: 451
Protein sequence:
>452_residues MADFTLVLVFITVFFIFLLTSLLISKKMLYKIAVLTSVFQIYTFSLMGIYPSLSFLFSLTLWTSFIRNLKNILGFKPIRT YVFLIIVQMLSIVWSSDIYLGIRTVSYLLPFLFIFLTTYEISKNNSELYFIKILVVYSFFLVVEAVLVILFRLQPNLETL FLNSNISQIFIKPNVITQFGTVIRNNVLDPTKSGGFFLNANVAAAFLGINMYVLYGIYKAYSSKVLKNISIFLWIAILFT GSKIGIILDILFPLTAFLIVNFKVFNKVTYSNLVKFLFLIIILAIGIFGIVSYAEGKFFIYDAEHTFNVRLMIWKHAWFQ FQLHPILGQGFGGWEATYPQYAQTVGLSPSYPPHNTLIYLWSQSGILAFVLGVLFIIDIILFFWNGLRNDDKQVKILSLY FMFAFLWLFIQGFGENYGIIGEEHMQPILAVALGLLYTKTHFYENGGRKNEA
Sequences:
>Translated_452_residues MADFTLVLVFITVFFIFLLTSLLISKKMLYKIAVLTSVFQIYTFSLMGIYPSLSFLFSLTLWTSFIRNLKNILGFKPIRT YVFLIIVQMLSIVWSSDIYLGIRTVSYLLPFLFIFLTTYEISKNNSELYFIKILVVYSFFLVVEAVLVILFRLQPNLETL FLNSNISQIFIKPNVITQFGTVIRNNVLDPTKSGGFFLNANVAAAFLGINMYVLYGIYKAYSSKVLKNISIFLWIAILFT GSKIGIILDILFPLTAFLIVNFKVFNKVTYSNLVKFLFLIIILAIGIFGIVSYAEGKFFIYDAEHTFNVRLMIWKHAWFQ FQLHPILGQGFGGWEATYPQYAQTVGLSPSYPPHNTLIYLWSQSGILAFVLGVLFIIDIILFFWNGLRNDDKQVKILSLY FMFAFLWLFIQGFGENYGIIGEEHMQPILAVALGLLYTKTHFYENGGRKNEA >Mature_451_residues ADFTLVLVFITVFFIFLLTSLLISKKMLYKIAVLTSVFQIYTFSLMGIYPSLSFLFSLTLWTSFIRNLKNILGFKPIRTY VFLIIVQMLSIVWSSDIYLGIRTVSYLLPFLFIFLTTYEISKNNSELYFIKILVVYSFFLVVEAVLVILFRLQPNLETLF LNSNISQIFIKPNVITQFGTVIRNNVLDPTKSGGFFLNANVAAAFLGINMYVLYGIYKAYSSKVLKNISIFLWIAILFTG SKIGIILDILFPLTAFLIVNFKVFNKVTYSNLVKFLFLIIILAIGIFGIVSYAEGKFFIYDAEHTFNVRLMIWKHAWFQF QLHPILGQGFGGWEATYPQYAQTVGLSPSYPPHNTLIYLWSQSGILAFVLGVLFIIDIILFFWNGLRNDDKQVKILSLYF MFAFLWLFIQGFGENYGIIGEEHMQPILAVALGLLYTKTHFYENGGRKNEA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 51970; Mature: 51838
Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MADFTLVLVFITVFFIFLLTSLLISKKMLYKIAVLTSVFQIYTFSLMGIYPSLSFLFSLT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LWTSFIRNLKNILGFKPIRTYVFLIIVQMLSIVWSSDIYLGIRTVSYLLPFLFIFLTTYE HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE ISKNNSELYFIKILVVYSFFLVVEAVLVILFRLQPNLETLFLNSNISQIFIKPNVITQFG ECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCHHHHHH TVIRNNVLDPTKSGGFFLNANVAAAFLGINMYVLYGIYKAYSSKVLKNISIFLWIAILFT HHHHHCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GSKIGIILDILFPLTAFLIVNFKVFNKVTYSNLVKFLFLIIILAIGIFGIVSYAEGKFFI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE YDAEHTFNVRLMIWKHAWFQFQLHPILGQGFGGWEATYPQYAQTVGLSPSYPPHNTLIYL EECCCEEEEEEEEEECCEEEEEEEHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEE WSQSGILAFVLGVLFIIDIILFFWNGLRNDDKQVKILSLYFMFAFLWLFIQGFGENYGII EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC GEEHMQPILAVALGLLYTKTHFYENGGRKNEA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure ADFTLVLVFITVFFIFLLTSLLISKKMLYKIAVLTSVFQIYTFSLMGIYPSLSFLFSLT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LWTSFIRNLKNILGFKPIRTYVFLIIVQMLSIVWSSDIYLGIRTVSYLLPFLFIFLTTYE HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE ISKNNSELYFIKILVVYSFFLVVEAVLVILFRLQPNLETLFLNSNISQIFIKPNVITQFG ECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCHHHHHH TVIRNNVLDPTKSGGFFLNANVAAAFLGINMYVLYGIYKAYSSKVLKNISIFLWIAILFT HHHHHCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GSKIGIILDILFPLTAFLIVNFKVFNKVTYSNLVKFLFLIIILAIGIFGIVSYAEGKFFI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE YDAEHTFNVRLMIWKHAWFQFQLHPILGQGFGGWEATYPQYAQTVGLSPSYPPHNTLIYL EECCCEEEEEEEEEECCEEEEEEEHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEE WSQSGILAFVLGVLFIIDIILFFWNGLRNDDKQVKILSLYFMFAFLWLFIQGFGENYGII EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC GEEHMQPILAVALGLLYTKTHFYENGGRKNEA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA