The gene/protein map for NC_002179 is currently unavailable.
Definition Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome.
Accession NC_010320
Length 2,457,259

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 167040900

Identifier: 167040900

GI number: 167040900

Start: 2294395

End: 2295753

Strand: Reverse

Name: 167040900

Synonym: Teth514_2284

Alternate gene names: NA

Gene position: 2295753-2294395 (Counterclockwise)

Preceding gene: 167040901

Following gene: 167040899

Centisome position: 93.43

GC content: 27.81

Gene sequence:

>1359_bases
TTGGCAGATTTTACATTAGTTTTAGTATTTATAACTGTATTTTTTATATTTTTATTAACTTCGCTACTCATATCAAAAAA
GATGCTATATAAGATTGCAGTATTAACTTCGGTTTTTCAAATTTATACTTTTTCCCTAATGGGTATTTATCCATCATTAA
GTTTTTTGTTTTCACTTACCTTGTGGACATCATTTATAAGGAATTTAAAAAATATATTAGGTTTTAAGCCTATAAGAACC
TACGTTTTTCTAATAATTGTTCAGATGCTGAGCATAGTTTGGTCAAGTGATATATACTTAGGTATACGAACGGTTTCTTA
TTTATTGCCATTTTTGTTTATATTTTTAACCACATATGAGATTTCAAAAAATAATTCAGAATTGTATTTTATAAAAATAT
TGGTAGTATATTCGTTTTTTTTAGTAGTAGAAGCTGTTTTAGTTATACTATTCCGTTTACAGCCCAACCTAGAAACATTA
TTTTTAAATTCAAATATAAGTCAAATATTTATTAAACCCAATGTAATAACTCAATTCGGTACAGTAATTCGAAATAATGT
TTTAGATCCTACAAAATCAGGCGGATTTTTTTTAAACGCAAATGTGGCAGCAGCTTTTTTAGGAATAAATATGTATGTTT
TATATGGAATCTATAAAGCATATAGTAGTAAAGTTTTAAAAAATATATCAATTTTTTTATGGATAGCAATTTTATTCACA
GGGTCTAAAATAGGGATAATTTTAGATATATTATTTCCTTTAACTGCCTTTTTGATAGTGAATTTTAAAGTATTTAATAA
AGTGACTTATAGCAATTTAGTGAAATTTCTTTTCCTAATAATTATATTAGCCATAGGTATATTCGGGATAGTATCTTATG
CTGAAGGTAAATTCTTTATATATGATGCGGAACATACATTCAATGTACGATTAATGATATGGAAGCATGCATGGTTTCAA
TTTCAATTGCATCCGATTTTAGGACAAGGATTCGGTGGATGGGAGGCAACATATCCCCAATATGCACAAACAGTTGGTTT
ATCACCTTCTTATCCTCCTCATAATACATTGATTTATTTATGGTCGCAGAGCGGTATTTTAGCATTCGTTTTAGGGGTTT
TGTTTATTATTGATATTATACTGTTTTTTTGGAATGGATTAAGAAATGATGATAAGCAAGTAAAGATTTTATCACTATAT
TTTATGTTTGCGTTTTTATGGCTTTTTATTCAAGGATTTGGTGAGAATTATGGAATAATTGGAGAAGAACATATGCAGCC
TATATTGGCAGTAGCTTTGGGATTATTGTATACAAAAACACACTTTTATGAAAATGGGGGACGAAAGAATGAAGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACTAATTGTACGAAATCATAATTTAGTATAATTAGGTGGATGTAATCGCAATTAAGGAAAAATTAAACGGACATATGAT
AATAGAAGGATGGGATAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATACTCATATATCGACATCAATTATTTAAACCGTCGGAAGTTTTTATTTTGCAGCAAGCTGAGAGTTTAAAAGAGTTTA
ATCCAATATATGTTGGGAGA

Product: O-antigen polymerase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 452; Mature: 451

Protein sequence:

>452_residues
MADFTLVLVFITVFFIFLLTSLLISKKMLYKIAVLTSVFQIYTFSLMGIYPSLSFLFSLTLWTSFIRNLKNILGFKPIRT
YVFLIIVQMLSIVWSSDIYLGIRTVSYLLPFLFIFLTTYEISKNNSELYFIKILVVYSFFLVVEAVLVILFRLQPNLETL
FLNSNISQIFIKPNVITQFGTVIRNNVLDPTKSGGFFLNANVAAAFLGINMYVLYGIYKAYSSKVLKNISIFLWIAILFT
GSKIGIILDILFPLTAFLIVNFKVFNKVTYSNLVKFLFLIIILAIGIFGIVSYAEGKFFIYDAEHTFNVRLMIWKHAWFQ
FQLHPILGQGFGGWEATYPQYAQTVGLSPSYPPHNTLIYLWSQSGILAFVLGVLFIIDIILFFWNGLRNDDKQVKILSLY
FMFAFLWLFIQGFGENYGIIGEEHMQPILAVALGLLYTKTHFYENGGRKNEA

Sequences:

>Translated_452_residues
MADFTLVLVFITVFFIFLLTSLLISKKMLYKIAVLTSVFQIYTFSLMGIYPSLSFLFSLTLWTSFIRNLKNILGFKPIRT
YVFLIIVQMLSIVWSSDIYLGIRTVSYLLPFLFIFLTTYEISKNNSELYFIKILVVYSFFLVVEAVLVILFRLQPNLETL
FLNSNISQIFIKPNVITQFGTVIRNNVLDPTKSGGFFLNANVAAAFLGINMYVLYGIYKAYSSKVLKNISIFLWIAILFT
GSKIGIILDILFPLTAFLIVNFKVFNKVTYSNLVKFLFLIIILAIGIFGIVSYAEGKFFIYDAEHTFNVRLMIWKHAWFQ
FQLHPILGQGFGGWEATYPQYAQTVGLSPSYPPHNTLIYLWSQSGILAFVLGVLFIIDIILFFWNGLRNDDKQVKILSLY
FMFAFLWLFIQGFGENYGIIGEEHMQPILAVALGLLYTKTHFYENGGRKNEA
>Mature_451_residues
ADFTLVLVFITVFFIFLLTSLLISKKMLYKIAVLTSVFQIYTFSLMGIYPSLSFLFSLTLWTSFIRNLKNILGFKPIRTY
VFLIIVQMLSIVWSSDIYLGIRTVSYLLPFLFIFLTTYEISKNNSELYFIKILVVYSFFLVVEAVLVILFRLQPNLETLF
LNSNISQIFIKPNVITQFGTVIRNNVLDPTKSGGFFLNANVAAAFLGINMYVLYGIYKAYSSKVLKNISIFLWIAILFTG
SKIGIILDILFPLTAFLIVNFKVFNKVTYSNLVKFLFLIIILAIGIFGIVSYAEGKFFIYDAEHTFNVRLMIWKHAWFQF
QLHPILGQGFGGWEATYPQYAQTVGLSPSYPPHNTLIYLWSQSGILAFVLGVLFIIDIILFFWNGLRNDDKQVKILSLYF
MFAFLWLFIQGFGENYGIIGEEHMQPILAVALGLLYTKTHFYENGGRKNEA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51970; Mature: 51838

Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MADFTLVLVFITVFFIFLLTSLLISKKMLYKIAVLTSVFQIYTFSLMGIYPSLSFLFSLT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LWTSFIRNLKNILGFKPIRTYVFLIIVQMLSIVWSSDIYLGIRTVSYLLPFLFIFLTTYE
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
ISKNNSELYFIKILVVYSFFLVVEAVLVILFRLQPNLETLFLNSNISQIFIKPNVITQFG
ECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCHHHHHH
TVIRNNVLDPTKSGGFFLNANVAAAFLGINMYVLYGIYKAYSSKVLKNISIFLWIAILFT
HHHHHCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GSKIGIILDILFPLTAFLIVNFKVFNKVTYSNLVKFLFLIIILAIGIFGIVSYAEGKFFI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
YDAEHTFNVRLMIWKHAWFQFQLHPILGQGFGGWEATYPQYAQTVGLSPSYPPHNTLIYL
EECCCEEEEEEEEEECCEEEEEEEHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEE
WSQSGILAFVLGVLFIIDIILFFWNGLRNDDKQVKILSLYFMFAFLWLFIQGFGENYGII
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
GEEHMQPILAVALGLLYTKTHFYENGGRKNEA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ADFTLVLVFITVFFIFLLTSLLISKKMLYKIAVLTSVFQIYTFSLMGIYPSLSFLFSLT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LWTSFIRNLKNILGFKPIRTYVFLIIVQMLSIVWSSDIYLGIRTVSYLLPFLFIFLTTYE
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
ISKNNSELYFIKILVVYSFFLVVEAVLVILFRLQPNLETLFLNSNISQIFIKPNVITQFG
ECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCHHHHHH
TVIRNNVLDPTKSGGFFLNANVAAAFLGINMYVLYGIYKAYSSKVLKNISIFLWIAILFT
HHHHHCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GSKIGIILDILFPLTAFLIVNFKVFNKVTYSNLVKFLFLIIILAIGIFGIVSYAEGKFFI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
YDAEHTFNVRLMIWKHAWFQFQLHPILGQGFGGWEATYPQYAQTVGLSPSYPPHNTLIYL
EECCCEEEEEEEEEECCEEEEEEEHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEE
WSQSGILAFVLGVLFIIDIILFFWNGLRNDDKQVKILSLYFMFAFLWLFIQGFGENYGII
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
GEEHMQPILAVALGLLYTKTHFYENGGRKNEA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA