| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160876102
Identifier: 160876102
GI number: 160876102
Start: 3558196
End: 3559764
Strand: Reverse
Name: 160876102
Synonym: Sbal195_2993
Alternate gene names: NA
Gene position: 3559764-3558196 (Counterclockwise)
Preceding gene: 160876103
Following gene: 160876099
Centisome position: 66.57
GC content: 44.49
Gene sequence:
>1569_bases ATGACTGTTATGAATTATGCCGATTCGGCACTTTCCTTGCTGCCGCCTGCGGTGGCTATTGTGTTGGCGATCTTAACTCG CCGTGTACTGCTTTCTTTGGGGTTAGGTATTTTAATTGGTGCTTTATTGCTCAATCAATTTTCACCTGTAGCGACGGGTG AATTTGTATTTAATGGCGTTAAAGGACTTGTTTGGACGGGCGAAGGCCTTAATTCGTGGAACTTATATATTCTCGGTTTC TTAATTGTACTGGGAATGATCACAGCGTTAATTACCGTCAGTGGCAGCGCGCGGGCTTTTGCCGATTGGGCGCGTTTACA TATACGTAATAAACGTGATGCTAAGCTATTAACCATGTTTTTAGGTTGTGTGGTTTTTATTGACGACTATTTCAATAGCT TAGTCGTAGGTTCGGTCGCTAGACCTGTTACCGACCGTTATTATATTTCCCGTGCTAAGTTAGCTTATTTATTAGATTCG ACTGCGGCACCTGTGTGCGTTATTTCTCCAGTATCAAGTTGGGGCGCGTATATTATTGCACTTATTGGTGGAATATTAAC GGCCCATGGTTTTGCTGATACTGGCCATTTGAGTATTTTTATTCAAATGATCCCAATGAACTTCTATGCAATTTTCTCCT TGTTATTATTACTTTTCGTTGTCTTTATGGGATTAGATGTTGGGCCAATGCGCGAGCATGAACTCAATGCCCAACGTGGT AATTTATACGATGAGACAAAGGGATTACCGCCTGGAGCCAATGCGGATTTACCTGAAGCCGAAACCGGTAAGATCTTAGG TTTATTCCTGCCGATTACTGTGTTGGTATTTGCGACCCTGTATTTTATGATCAATAGTGGCGCTCAAGTGCTTGCCACTG AAGGGATTGAATTTAATATTATTTCAGCGTTTGAGAAAACCGATGTCAGTTCATCCCTTTTCTTTGGTGCATTAATCGGT TTAGCGATTTCGCTGATATTGAATTTAGTCCAAGGCGTTGAGAAATCAATGATAGTCAAAGGCATAGTGCAGGGCGCTCG CTCTATGCTGCCAGCGATTTATATCCTGTTATTTGCTTGGACTATCGCAGGCGTGATTGGCCAGCTCGAAACCGGCAAGT TTATGGCGAGTCTCGCGACGGGTAATATTCCGTTCGCCTTTTTGCCAGCCCTAATGTTTGTATTAGCGGGTATTACTGCG TTCTCAACCGGTACTAGCTGGGGCACGTTCGGTATCATGTTGCCGATTGCTGCGGATATGGCGATGGGAAGTCACACTGG CATGATGCTACCTATGCTTGCTTCTGTGCTGGCGGGCGCGGTATTTGGCGATCACTGTTCACCGATTTCCGATACCACGA TTTTGTCGTCTACGGGCGCGAGTTGTCACCATATCGACCATGTGGTCACTCAGCTACCGTATGCATTGATTGCGGCGTTT ATTAGCTTAACGGGTTATGTCGTACTTGGATTTACTGAGTCAGTCGTCGCTGGTTTAGTGGCCTGTAGTGTGGTGTTTGT GGTTAGTATCATCGTACTTAAGATCAAATCTAAAGGCGCAATTAGCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTATGGAGCGCTACTGATAGGACAGGTGACCTTGGGTATCTATTGCCTTTCCCCACCAGTTCAGTCGCCCTCCATTCGTA TTTAACGAAGATAATAATCA
Downstream 100 bases:
>100_bases ACCTTAATTGAAGCTTTGCACGGCAAAGGTTCACTGCGAATAAGTCAAAATAAATCAGCCAGCATTATGCTGGCTGATTT TTTTGGTTAACGCTCTATCT
Product: Na+/H+ antiporter NhaC
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 522; Mature: 521
Protein sequence:
>522_residues MTVMNYADSALSLLPPAVAIVLAILTRRVLLSLGLGILIGALLLNQFSPVATGEFVFNGVKGLVWTGEGLNSWNLYILGF LIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDS TAAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADTGHLSIFIQMIPMNFYAIFSLLLLLFVVFMGLDVGPMREHELNAQRG NLYDETKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMINSGAQVLATEGIEFNIISAFEKTDVSSSLFFGALIG LAISLILNLVQGVEKSMIVKGIVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGITA FSTGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIAAF ISLTGYVVLGFTESVVAGLVACSVVFVVSIIVLKIKSKGAIS
Sequences:
>Translated_522_residues MTVMNYADSALSLLPPAVAIVLAILTRRVLLSLGLGILIGALLLNQFSPVATGEFVFNGVKGLVWTGEGLNSWNLYILGF LIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDS TAAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADTGHLSIFIQMIPMNFYAIFSLLLLLFVVFMGLDVGPMREHELNAQRG NLYDETKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMINSGAQVLATEGIEFNIISAFEKTDVSSSLFFGALIG LAISLILNLVQGVEKSMIVKGIVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGITA FSTGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIAAF ISLTGYVVLGFTESVVAGLVACSVVFVVSIIVLKIKSKGAIS >Mature_521_residues TVMNYADSALSLLPPAVAIVLAILTRRVLLSLGLGILIGALLLNQFSPVATGEFVFNGVKGLVWTGEGLNSWNLYILGFL IVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDST AAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADTGHLSIFIQMIPMNFYAIFSLLLLLFVVFMGLDVGPMREHELNAQRGN LYDETKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMINSGAQVLATEGIEFNIISAFEKTDVSSSLFFGALIGL AISLILNLVQGVEKSMIVKGIVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGITAF STGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIAAFI SLTGYVVLGFTESVVAGLVACSVVFVVSIIVLKIKSKGAIS
Specific function: Unknown
COG id: COG1757
COG function: function code C; Na+/H+ antiporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018461 [H]
Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 55384; Mature: 55253
Theoretical pI: Translated: 6.60; Mature: 6.60
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 4.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 4.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTVMNYADSALSLLPPAVAIVLAILTRRVLLSLGLGILIGALLLNQFSPVATGEFVFNGV CCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCC KGLVWTGEGLNSWNLYILGFLIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMF CCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH LGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDSTAAPVCVISPVSSWGAYIIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH LIGGILTAHGFADTGHLSIFIQMIPMNFYAIFSLLLLLFVVFMGLDVGPMREHELNAQRG HHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCC NLYDETKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMINSGAQVLATEGIEFNI CCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEE ISAFEKTDVSSSLFFGALIGLAISLILNLVQGVEKSMIVKGIVQGARSMLPAIYILLFAW EHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGITAFSTGTSWGTFGIMLPIAADM HHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH AMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIAAF HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLTGYVVLGFTESVVAGLVACSVVFVVSIIVLKIKSKGAIS HHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure TVMNYADSALSLLPPAVAIVLAILTRRVLLSLGLGILIGALLLNQFSPVATGEFVFNGV CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCC KGLVWTGEGLNSWNLYILGFLIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMF CCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH LGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDSTAAPVCVISPVSSWGAYIIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH LIGGILTAHGFADTGHLSIFIQMIPMNFYAIFSLLLLLFVVFMGLDVGPMREHELNAQRG HHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCC NLYDETKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMINSGAQVLATEGIEFNI CCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEE ISAFEKTDVSSSLFFGALIGLAISLILNLVQGVEKSMIVKGIVQGARSMLPAIYILLFAW EHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGITAFSTGTSWGTFGIMLPIAADM HHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH AMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIAAF HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLTGYVVLGFTESVVAGLVACSVVFVVSIIVLKIKSKGAIS HHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]