Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 160873988

Identifier: 160873988

GI number: 160873988

Start: 1020708

End: 1023377

Strand: Reverse

Name: 160873988

Synonym: Sbal195_0867

Alternate gene names: NA

Gene position: 1023377-1020708 (Counterclockwise)

Preceding gene: 160873989

Following gene: 160873987

Centisome position: 19.14

GC content: 50.04

Gene sequence:

>2670_bases
ATGAACAATAAACCGCTCACTAAGTCGACTCCCACAGAGCTTAAGCAGATAGAACTTAAGCAAACTGGACTTAAGCAAAC
TTGGCTTAAGCAAACTTGGCTGAGGCTGACGTGGCCCAGCCTAAAGGTGTTTATCGCCCATTATCGTCATGCGCCCTTGC
AGGCGGGCGCGATTCTGCTTGGTATCGCCTTGGCCGTGACTCTGCTGATTGGGGTTAAAGCGACCAACGATAATGCGGTG
CGCAGTTATAGCGATGCGACTGAGCTTTTGAGCCAGCGTGCCGATGTACTACTTACTCCGCCCCTTGGACAAAACGCCTT
AGATGAATCTGTTTATTTCGACTTAAGACGGGCCGGATTAAGTCAGAGTCTCGCCGTGGTTAATGGCAAAATCTCCGGCA
AGAATGGTCAGTTTTGGCAACTGGAAGGCAGCGATTTGATTGCCGCATTAACGCTACAAAAATCGAGAAGTAACGCCTCG
ACTGAAACGCAGTCAACAACCGCGCCGCAGATGAATGAGTTACCGCTTGCCGATCTACTCAACGGTGCCCCCACTGTGAT
AATGAGCCGCAGCCTAGCGGCCAAAGTTGCGCCAGACGGTAAACTTGTTTTAGAAAATAACACCTTAGATGTCATTGCAA
TTGATGATAGTTTTGGCCTCGGCAGCGCCATCTTGGCCGATATTTCCCTCGCCCAGCAATTACTGAACATGCAAGGCCGA
TTAAGCTATATCGCCATGTTCAGCGAGCGAGAAAACTTACCTCAACTAAAATCCCAACTCGACGCTTTAGGGATTACGCC
GCAAAAGGCCAGTTTTAGCCAGCAAGATCAAGGCCAAGCACTGATAGCGCTGACCCGCAGTTTTCACCTTAATCTCAATG
CAATGAGCATGTTAGCCTTCGTTGTCGGCCTCTTTATCGCCTACAACGGTGTGCGCTACAGCCTAATGAAACGGCAAAAA
CTGTTAGTTCAGTTATTACAACAGGGAATCGAGCGCCGCGCCTTGATGACGGCGCTAATGTTAGAATTAATTTTGTTGGT
TGTCATAGGCTCAAGTTTGGGCTTTATCAGTGGCTTGCAACTCAGCCACTGGCTGCAACCTATGGTCGCCATGACCCTTG
AGCAAATGTATGGCGCCCACTTACTCCCCGGTATTTGGCAATGGGCTTGGCTTATCGAGGCGATAGCCCTCACCTTAGGC
GCAGCATTTGCCGCTTGCTTGCCCTTGTATTTAGATCTGACGCGCCAAGCATTGGCACAAGGGGCGAATCGTTATCAGCA
AATGCAAGCGCACCGCAAAACCCATAGCATTCAATTTGCCTTAGCCTGTGGTTTACTGACCGTAGCGGCGCTGCTGTTTC
CCTTCAGTCAAAGCTATAACATCAGCTTAGTGTTGCTCGGTATCGTCGCTATCGCGATCCCCTTGTTGTTGCCGCAATTA
CTGCATTGGGGCGTCAGTGCGTTAATGCCCTTGGCGCGCCCTGGACTTTGGCAATATCTGCTCGCCGAAACCCGCGAGCT
TATTGCACCGCTTTCCTTGGCTATGATGGCAATCTTGCTGGCGCTCAGTGCCAATGTGTCGATGAACACCCTAGTAGGTA
GCTTTGAGCAAACCCTGCGGACTTGGCTAGAAACCCGCTTACATGCCGATCTCTATATCCGCCCACCGAGCCAGCGCATC
GACACGATTCAAACCCAACTGATGCACGATCCAAGAGTCAGTGGTATTTATCAGCAGTGGCAAATTGAAGCCCAGCTTTC
ACTCCCTGCATCGACAAATAATTCAAGCGAGTTGACGATTCCAATTAGCCTACTTAGCCGTGATGAATATTCGATTCGCC
ACACCAGCGCCCTAAAAGAAAGCCTGCCCACGTTGTGGCAATCCTACTTTAATGCCCCCGTGATCTTAGTGAGCGAGCCC
TTAGCCATCAAATACCAATTGCAGCTTGGCGATAGCGTGTCATTGGATGCGCTTAAGAAAACCGGTAGCAGCAAAGCCAT
TATCGGCGGCATTTATTATGACCACGGTAATACCCGCAACGAGGTGATTATCAGTCAGCCACTCTGGCAAAAGGCACAAT
TACCTGTACTGCCAATCAGTTTGGCGGCGAATTTTTACGGTAAAGAGCAAGGCCGCAAGATCAGTGAAGCAGAGCTCGAT
GAACTGCAAATCCAACTGGCTGCCGAGTTAGGCTTATCGCAAGCGCAAATCTACAGCCAAACTAAGATTAAAACCCAAGC
TATCGCCATGTTTAAGCGGACTTTTTCGATTACCTTAGTGCTGAATAGTTTGACGCTGATTGTCGCCGCGATTGGGCTCT
TTAGTGCCTGTTTAATGTTAACTCAGGCACGGCAAGCGCCACTGGCACGACTGTATTCCTTAGGCGTGAGTCGTAATGCG
CTGCGCGGTATGGTGTTTATGCAGATGCTGATTGTGGTGCTGATCACTTGCCTGCTCGCTATGCCAACGGGTGCGCTGCT
AGGTTACCTGCTCATCAACAAGATCACCTTGCAAGCCTTTGGCTGGACGATAAAAATGATTTGGGATTGGCAAGCCTATG
GCAAAGCAATACTGATTGCCTTAACCACCTGCACCTTAGCCGTGCTCTTACCGCTGTATTGGCAAACTCGCAAACCACTG
GTCGCCAGTCTGCAGCAGGAGACCCTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGGGAAAGCCAAACCAGTATCTTAATGGTTACCCACAGCGAAGAGTGCGCCGCCTTCATGCAAAAACGTTGGCACTTATC
CCAAGGTGCAGTCGCTATCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAACACTCAGTATTGTATGGGCAGTGGTTGGGTTAATGCTGATCGGCGGCTGCGATAAAACGCCATCTCCCCAAAAT
ACTCAGTCAAAATCGATGGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 889; Mature: 889

Protein sequence:

>889_residues
MNNKPLTKSTPTELKQIELKQTGLKQTWLKQTWLRLTWPSLKVFIAHYRHAPLQAGAILLGIALAVTLLIGVKATNDNAV
RSYSDATELLSQRADVLLTPPLGQNALDESVYFDLRRAGLSQSLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSNAS
TETQSTTAPQMNELPLADLLNGAPTVIMSRSLAAKVAPDGKLVLENNTLDVIAIDDSFGLGSAILADISLAQQLLNMQGR
LSYIAMFSERENLPQLKSQLDALGITPQKASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNGVRYSLMKRQK
LLVQLLQQGIERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWAWLIEAIALTLG
AAFAACLPLYLDLTRQALAQGANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQL
LHWGVSALMPLARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHADLYIRPPSQRI
DTIQTQLMHDPRVSGIYQQWQIEAQLSLPASTNNSSELTIPISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEP
LAIKYQLQLGDSVSLDALKKTGSSKAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKEQGRKISEAELD
ELQIQLAAELGLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYSLGVSRNA
LRGMVFMQMLIVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPL
VASLQQETL

Sequences:

>Translated_889_residues
MNNKPLTKSTPTELKQIELKQTGLKQTWLKQTWLRLTWPSLKVFIAHYRHAPLQAGAILLGIALAVTLLIGVKATNDNAV
RSYSDATELLSQRADVLLTPPLGQNALDESVYFDLRRAGLSQSLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSNAS
TETQSTTAPQMNELPLADLLNGAPTVIMSRSLAAKVAPDGKLVLENNTLDVIAIDDSFGLGSAILADISLAQQLLNMQGR
LSYIAMFSERENLPQLKSQLDALGITPQKASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNGVRYSLMKRQK
LLVQLLQQGIERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWAWLIEAIALTLG
AAFAACLPLYLDLTRQALAQGANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQL
LHWGVSALMPLARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHADLYIRPPSQRI
DTIQTQLMHDPRVSGIYQQWQIEAQLSLPASTNNSSELTIPISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEP
LAIKYQLQLGDSVSLDALKKTGSSKAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKEQGRKISEAELD
ELQIQLAAELGLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYSLGVSRNA
LRGMVFMQMLIVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPL
VASLQQETL
>Mature_889_residues
MNNKPLTKSTPTELKQIELKQTGLKQTWLKQTWLRLTWPSLKVFIAHYRHAPLQAGAILLGIALAVTLLIGVKATNDNAV
RSYSDATELLSQRADVLLTPPLGQNALDESVYFDLRRAGLSQSLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSNAS
TETQSTTAPQMNELPLADLLNGAPTVIMSRSLAAKVAPDGKLVLENNTLDVIAIDDSFGLGSAILADISLAQQLLNMQGR
LSYIAMFSERENLPQLKSQLDALGITPQKASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNGVRYSLMKRQK
LLVQLLQQGIERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWAWLIEAIALTLG
AAFAACLPLYLDLTRQALAQGANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQL
LHWGVSALMPLARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHADLYIRPPSQRI
DTIQTQLMHDPRVSGIYQQWQIEAQLSLPASTNNSSELTIPISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEP
LAIKYQLQLGDSVSLDALKKTGSSKAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKEQGRKISEAELD
ELQIQLAAELGLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYSLGVSRNA
LRGMVFMQMLIVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPL
VASLQQETL

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 97936; Mature: 97936

Theoretical pI: Translated: 9.64; Mature: 9.64

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNKPLTKSTPTELKQIELKQTGLKQTWLKQTWLRLTWPSLKVFIAHYRHAPLQAGAILL
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
GIALAVTLLIGVKATNDNAVRSYSDATELLSQRADVLLTPPLGQNALDESVYFDLRRAGL
HHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
SQSLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSNASTETQSTTAPQMNELPLADLL
CCCCCEEECEEECCCCCEEEECCCCEEEEEEEHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
NGAPTVIMSRSLAAKVAPDGKLVLENNTLDVIAIDDSFGLGSAILADISLAQQLLNMQGR
CCCCHHHHHHHHHHEECCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LSYIAMFSERENLPQLKSQLDALGITPQKASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAF
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHH
VVGLFIAYNGVRYSLMKRQKLLVQLLQQGIERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQ
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC
LSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWAWLIEAIALTLGAAFAACLPLYLDLTRQALAQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LHWGVSALMPLARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLR
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
TWLETRLHADLYIRPPSQRIDTIQTQLMHDPRVSGIYQQWQIEAQLSLPASTNNSSELTI
HHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCCEEEE
PISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLGDSVSLDALKK
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEEEECCCCCCHHHHHH
TGSSKAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKEQGRKISEAELD
CCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCHHHCCCCCHHHHH
ELQIQLAAELGLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLML
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TQARQAPLARLYSLGVSRNALRGMVFMQMLIVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAF
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL
CEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNNKPLTKSTPTELKQIELKQTGLKQTWLKQTWLRLTWPSLKVFIAHYRHAPLQAGAILL
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
GIALAVTLLIGVKATNDNAVRSYSDATELLSQRADVLLTPPLGQNALDESVYFDLRRAGL
HHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
SQSLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSNASTETQSTTAPQMNELPLADLL
CCCCCEEECEEECCCCCEEEECCCCEEEEEEEHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
NGAPTVIMSRSLAAKVAPDGKLVLENNTLDVIAIDDSFGLGSAILADISLAQQLLNMQGR
CCCCHHHHHHHHHHEECCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LSYIAMFSERENLPQLKSQLDALGITPQKASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAF
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHH
VVGLFIAYNGVRYSLMKRQKLLVQLLQQGIERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQ
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC
LSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWAWLIEAIALTLGAAFAACLPLYLDLTRQALAQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LHWGVSALMPLARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLR
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
TWLETRLHADLYIRPPSQRIDTIQTQLMHDPRVSGIYQQWQIEAQLSLPASTNNSSELTI
HHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCCEEEE
PISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLGDSVSLDALKK
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEEEECCCCCCHHHHHH
TGSSKAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKEQGRKISEAELD
CCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCHHHCCCCCHHHHH
ELQIQLAAELGLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLML
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TQARQAPLARLYSLGVSRNALRGMVFMQMLIVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAF
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL
CEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA